FuNGI

A0A409YJS2

Protein Details

Accession

A0A409YJS2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-249	VPRVNQTKKRKAPGVRPSPT	Hydrophilic
745-764	RDSQRLKLPQKYFKHRRGEF	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MAMPKRLKSSISNPFLDVEAHVDNESEEENGDTDSADEDFIDNNMDFEYEPEPSSSTPLNRELSPSVSTSDAVDLTRYEDNDDPDSDLEDIIEDILADIPGLPYWRIACKAGMEQDVVDALETSAERYKQTVRSTFHPTLRTGWIYIQAQMTERLKRILLNTRGVLRRGKELVIRTSTPDEFLGVLRSDEINVKHSVNVDQWIGVARGAYKGDPAVVVSVDGDLVDVVVVPRVNQTKKRKAPGVRPSPTLFDAKEYQQVFPGKTVRSRGEDLFSVGACEFEFGLLRLSLAWEGVDPIHISLPTQILDLFQRSRHPAIKRAIYIPKPLEWCMGCGDKVLIPLKKQRGIISSVEATQVYVDVGDAGIAQTRWNAVRKAIGFGDYVEIGAGPCTGVMGWVVSQVEQTCIVIQSKEGTNEIEEIPVHVNWLKTATAPVHLPKPARVLNTTVKDYMPWRNARVIITKLKDPNKGKPGKVIDVVKHQDASRPGVRLVLELEDYNPNLPFSHITVDSEDVVDANTHLKLGQKGTSSSNPAPEMPTVNLPPPSLTPMHSTSFDDFTAPEPPSATPDLPCLSSSSDTNAVSSVSSPLPVHPLLNPLLADITLKATVTGSKYKNSKLDVKVVNVDGRLSLQHKTFRTWNTLEPAWVQPQHPHVSRDNSLRTIPICDGMGRICVLLGGIPGGHRHESSDEFEFEGTRDANVTATRGNPLTSSATAATRATPPSSKDSDASWIEVQDAAFDAIRDLRDSQRLKLPQKYFKHRRGEFPCVPVGISHGGGQPSPRRLTYEKNTSELLDSLIRKPCFQRIAGFTNSLFKTYFPRLHEYYDTTITNLVNWSSTTNLPIVKNYEHSAFACTSVNMGPRTYAFPHLDYGNLSFGLCALTALGDFNPDEGGHLALWDLRLAIRFPPGSTLFLPSAVMEHLNTPIQKDEERCSFAQYSAGGIFRWVDYGFRSEQAFFKSISEDEVRIQEEQEAKTNRWKKGLDMYSTISELRNRRLLT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.46
3	0.39
4	0.3
5	0.24
6	0.19
7	0.18
8	0.17
9	0.15
10	0.14
11	0.15
12	0.15
13	0.1
14	0.09
15	0.08
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.08
24	0.07
25	0.08
26	0.08
27	0.09
28	0.11
29	0.1
30	0.1
31	0.1
32	0.1
33	0.09
34	0.11
35	0.13
36	0.11
37	0.12
38	0.13
39	0.14
40	0.14
41	0.18
42	0.21
43	0.22
44	0.25
45	0.31
46	0.33
47	0.32
48	0.36
49	0.35
50	0.34
51	0.33
52	0.3
53	0.25
54	0.23
55	0.23
56	0.19
57	0.19
58	0.17
59	0.15
60	0.14
61	0.13
62	0.15
63	0.18
64	0.17
65	0.19
66	0.21
67	0.24
68	0.26
69	0.27
70	0.26
71	0.23
72	0.25
73	0.21
74	0.18
75	0.14
76	0.11
77	0.1
78	0.08
79	0.07
80	0.05
81	0.05
82	0.06
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.06
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.11
92	0.15
93	0.17
94	0.19
95	0.2
96	0.22
97	0.27
98	0.3
99	0.31
100	0.28
101	0.25
102	0.24
103	0.23
104	0.2
105	0.15
106	0.1
107	0.07
108	0.08
109	0.08
110	0.09
111	0.12
112	0.14
113	0.14
114	0.16
115	0.22
116	0.28
117	0.35
118	0.41
119	0.41
120	0.45
121	0.54
122	0.59
123	0.59
124	0.56
125	0.51
126	0.47
127	0.49
128	0.46
129	0.38
130	0.32
131	0.33
132	0.31
133	0.32
134	0.29
135	0.24
136	0.24
137	0.28
138	0.3
139	0.28
140	0.28
141	0.28
142	0.26
143	0.28
144	0.32
145	0.36
146	0.38
147	0.39
148	0.41
149	0.47
150	0.5
151	0.5
152	0.5
153	0.42
154	0.43
155	0.39
156	0.38
157	0.36
158	0.37
159	0.41
160	0.42
161	0.41
162	0.38
163	0.41
164	0.38
165	0.35
166	0.3
167	0.24
168	0.19
169	0.18
170	0.17
171	0.13
172	0.13
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.18
180	0.19
181	0.19
182	0.2
183	0.22
184	0.2
185	0.21
186	0.18
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.15
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.1
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.1
219	0.16
220	0.21
221	0.3
222	0.4
223	0.49
224	0.58
225	0.66
226	0.7
227	0.72
228	0.78
229	0.8
230	0.81
231	0.75
232	0.72
233	0.66
234	0.61
235	0.56
236	0.49
237	0.38
238	0.31
239	0.3
240	0.27
241	0.32
242	0.29
243	0.27
244	0.29
245	0.32
246	0.28
247	0.29
248	0.32
249	0.27
250	0.3
251	0.35
252	0.33
253	0.35
254	0.38
255	0.35
256	0.34
257	0.32
258	0.3
259	0.26
260	0.22
261	0.19
262	0.15
263	0.13
264	0.1
265	0.09
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.05
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.1
294	0.13
295	0.13
296	0.14
297	0.17
298	0.21
299	0.25
300	0.3
301	0.32
302	0.37
303	0.42
304	0.47
305	0.46
306	0.48
307	0.52
308	0.48
309	0.52
310	0.46
311	0.44
312	0.4
313	0.38
314	0.37
315	0.29
316	0.27
317	0.24
318	0.23
319	0.19
320	0.17
321	0.17
322	0.13
323	0.17
324	0.2
325	0.19
326	0.2
327	0.28
328	0.33
329	0.36
330	0.37
331	0.36
332	0.34
333	0.36
334	0.35
335	0.32
336	0.28
337	0.24
338	0.23
339	0.2
340	0.17
341	0.13
342	0.11
343	0.07
344	0.05
345	0.04
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.06
356	0.09
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.17
361	0.18
362	0.21
363	0.2
364	0.19
365	0.17
366	0.16
367	0.17
368	0.12
369	0.11
370	0.07
371	0.07
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.09
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.12
403	0.12
404	0.11
405	0.09
406	0.09
407	0.1
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.11
420	0.13
421	0.15
422	0.17
423	0.18
424	0.18
425	0.23
426	0.24
427	0.24
428	0.24
429	0.25
430	0.29
431	0.33
432	0.33
433	0.29
434	0.26
435	0.25
436	0.27
437	0.28
438	0.28
439	0.26
440	0.26
441	0.27
442	0.29
443	0.3
444	0.31
445	0.29
446	0.29
447	0.29
448	0.31
449	0.35
450	0.37
451	0.44
452	0.43
453	0.47
454	0.5
455	0.54
456	0.5
457	0.51
458	0.51
459	0.46
460	0.48
461	0.43
462	0.35
463	0.38
464	0.39
465	0.33
466	0.3
467	0.27
468	0.25
469	0.24
470	0.26
471	0.21
472	0.2
473	0.19
474	0.2
475	0.2
476	0.17
477	0.16
478	0.12
479	0.1
480	0.09
481	0.1
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.08
489	0.07
490	0.07
491	0.09
492	0.09
493	0.1
494	0.1
495	0.11
496	0.11
497	0.1
498	0.09
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.05
507	0.07
508	0.08
509	0.1
510	0.12
511	0.13
512	0.14
513	0.18
514	0.2
515	0.24
516	0.23
517	0.25
518	0.23
519	0.22
520	0.22
521	0.19
522	0.18
523	0.14
524	0.15
525	0.14
526	0.14
527	0.15
528	0.14
529	0.14
530	0.12
531	0.14
532	0.12
533	0.13
534	0.15
535	0.17
536	0.18
537	0.19
538	0.2
539	0.19
540	0.2
541	0.19
542	0.16
543	0.13
544	0.12
545	0.15
546	0.14
547	0.12
548	0.11
549	0.11
550	0.14
551	0.16
552	0.15
553	0.11
554	0.13
555	0.14
556	0.14
557	0.14
558	0.12
559	0.12
560	0.13
561	0.12
562	0.13
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.14
567	0.12
568	0.11
569	0.11
570	0.1
571	0.07
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.1
579	0.13
580	0.13
581	0.14
582	0.13
583	0.1
584	0.1
585	0.09
586	0.09
587	0.06
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.08
594	0.1
595	0.17
596	0.17
597	0.22
598	0.25
599	0.29
600	0.33
601	0.35
602	0.41
603	0.37
604	0.44
605	0.42
606	0.42
607	0.41
608	0.39
609	0.37
610	0.29
611	0.26
612	0.17
613	0.14
614	0.14
615	0.12
616	0.12
617	0.14
618	0.19
619	0.2
620	0.23
621	0.28
622	0.29
623	0.34
624	0.35
625	0.35
626	0.34
627	0.34
628	0.32
629	0.29
630	0.28
631	0.26
632	0.26
633	0.23
634	0.21
635	0.25
636	0.3
637	0.3
638	0.31
639	0.31
640	0.35
641	0.39
642	0.42
643	0.4
644	0.37
645	0.35
646	0.33
647	0.3
648	0.26
649	0.23
650	0.18
651	0.15
652	0.13
653	0.13
654	0.12
655	0.12
656	0.09
657	0.09
658	0.07
659	0.06
660	0.06
661	0.05
662	0.05
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.05
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.1
671	0.12
672	0.15
673	0.18
674	0.2
675	0.19
676	0.18
677	0.18
678	0.17
679	0.15
680	0.15
681	0.12
682	0.09
683	0.09
684	0.08
685	0.09
686	0.09
687	0.1
688	0.09
689	0.1
690	0.12
691	0.12
692	0.12
693	0.11
694	0.13
695	0.15
696	0.14
697	0.15
698	0.14
699	0.14
700	0.15
701	0.16
702	0.15
703	0.14
704	0.16
705	0.16
706	0.17
707	0.19
708	0.24
709	0.27
710	0.27
711	0.26
712	0.25
713	0.3
714	0.29
715	0.29
716	0.24
717	0.21
718	0.19
719	0.2
720	0.18
721	0.12
722	0.11
723	0.09
724	0.08
725	0.08
726	0.07
727	0.08
728	0.09
729	0.1
730	0.11
731	0.14
732	0.22
733	0.24
734	0.26
735	0.33
736	0.41
737	0.45
738	0.52
739	0.57
740	0.58
741	0.65
742	0.74
743	0.75
744	0.77
745	0.82
746	0.77
747	0.79
748	0.78
749	0.79
750	0.73
751	0.67
752	0.61
753	0.51
754	0.47
755	0.36
756	0.31
757	0.23
758	0.18
759	0.15
760	0.15
761	0.15
762	0.15
763	0.19
764	0.21
765	0.25
766	0.27
767	0.26
768	0.29
769	0.31
770	0.39
771	0.45
772	0.5
773	0.47
774	0.48
775	0.48
776	0.44
777	0.43
778	0.35
779	0.28
780	0.23
781	0.22
782	0.24
783	0.31
784	0.3
785	0.31
786	0.33
787	0.37
788	0.36
789	0.36
790	0.38
791	0.36
792	0.41
793	0.42
794	0.42
795	0.35
796	0.39
797	0.38
798	0.32
799	0.26
800	0.21
801	0.24
802	0.29
803	0.34
804	0.3
805	0.36
806	0.37
807	0.42
808	0.45
809	0.43
810	0.41
811	0.4
812	0.36
813	0.3
814	0.31
815	0.26
816	0.23
817	0.19
818	0.15
819	0.12
820	0.12
821	0.12
822	0.12
823	0.13
824	0.14
825	0.15
826	0.19
827	0.19
828	0.21
829	0.24
830	0.24
831	0.26
832	0.27
833	0.27
834	0.26
835	0.25
836	0.26
837	0.22
838	0.22
839	0.2
840	0.17
841	0.17
842	0.17
843	0.21
844	0.19
845	0.18
846	0.18
847	0.18
848	0.23
849	0.23
850	0.27
851	0.25
852	0.26
853	0.28
854	0.27
855	0.27
856	0.24
857	0.23
858	0.19
859	0.17
860	0.15
861	0.12
862	0.11
863	0.11
864	0.09
865	0.07
866	0.05
867	0.05
868	0.05
869	0.07
870	0.06
871	0.07
872	0.07
873	0.08
874	0.09
875	0.08
876	0.09
877	0.09
878	0.1
879	0.08
880	0.09
881	0.09
882	0.09
883	0.09
884	0.08
885	0.08
886	0.07
887	0.09
888	0.1
889	0.12
890	0.17
891	0.17
892	0.17
893	0.23
894	0.24
895	0.27
896	0.27
897	0.3
898	0.25
899	0.24
900	0.25
901	0.18
902	0.18
903	0.15
904	0.15
905	0.1
906	0.11
907	0.13
908	0.17
909	0.17
910	0.17
911	0.2
912	0.22
913	0.26
914	0.28
915	0.32
916	0.35
917	0.4
918	0.39
919	0.41
920	0.4
921	0.37
922	0.36
923	0.3
924	0.26
925	0.23
926	0.23
927	0.17
928	0.16
929	0.17
930	0.14
931	0.15
932	0.12
933	0.11
934	0.12
935	0.17
936	0.18
937	0.2
938	0.22
939	0.22
940	0.25
941	0.29
942	0.29
943	0.25
944	0.25
945	0.25
946	0.23
947	0.27
948	0.26
949	0.22
950	0.23
951	0.27
952	0.27
953	0.25
954	0.26
955	0.26
956	0.28
957	0.28
958	0.34
959	0.34
960	0.35
961	0.45
962	0.52
963	0.52
964	0.54
965	0.53
966	0.5
967	0.56
968	0.61
969	0.57
970	0.54
971	0.54
972	0.5
973	0.5
974	0.46
975	0.38
976	0.37
977	0.36
978	0.38

A0A409YJS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer