Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y6L1

Protein Details
Accession A0A409Y6L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22SAAVVNKKRKRDSSPEPRFVVHydrophilic
42-63PPQSTHFKCYARKKSKTEAEDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-430KPRLRKKNK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSAAVVNKKRKRDSSPEPRFVVSTSSLGKTGPLLVSYPAVSPPQSTHFKCYARKKSKTEAEDGKEDQRNLLVVGETKAVEFTTNDEETQKAADSGCRYLIAVHNKRTGETSLIPSSKSPQILSHTVKALKSLPVSAAPSKLQYLAAKNALGETFGTKKQKASIRAQERNRIDVSAMEGVMNYVMDSIDKGAEGLMTAEETKEAADSNRLIPPFSAEATDPADIYPLHSIIPEAEWKALSIAPFDAASDMKQKKAMLPYQRSSWVNEHLKNLDTSTSKNKKNIKILLYISALLAFRQAGFKPIDKEKLYERLSAVPSITVDSFLNRFAEQPRGQTSFQMTTATGTNLLTHIFALCLKVDGFATNTKVIAHDLSMPVTQVNDLFKSLGCKITKLSDKERAQLGLAASAAEDKRAVLTAPVEFPKPRLRKKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.84
3 0.84
4 0.79
5 0.73
6 0.65
7 0.56
8 0.49
9 0.4
10 0.34
11 0.29
12 0.27
13 0.26
14 0.24
15 0.24
16 0.2
17 0.21
18 0.17
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.16
29 0.18
30 0.23
31 0.31
32 0.32
33 0.37
34 0.43
35 0.5
36 0.57
37 0.65
38 0.69
39 0.71
40 0.78
41 0.78
42 0.81
43 0.84
44 0.8
45 0.78
46 0.77
47 0.72
48 0.7
49 0.66
50 0.64
51 0.6
52 0.55
53 0.46
54 0.38
55 0.33
56 0.26
57 0.24
58 0.16
59 0.13
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.11
69 0.16
70 0.16
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.16
77 0.11
78 0.1
79 0.14
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.17
86 0.23
87 0.3
88 0.34
89 0.38
90 0.42
91 0.42
92 0.43
93 0.43
94 0.39
95 0.32
96 0.29
97 0.29
98 0.29
99 0.3
100 0.3
101 0.28
102 0.31
103 0.3
104 0.29
105 0.24
106 0.21
107 0.25
108 0.32
109 0.36
110 0.35
111 0.36
112 0.38
113 0.37
114 0.36
115 0.32
116 0.28
117 0.24
118 0.22
119 0.18
120 0.18
121 0.21
122 0.2
123 0.21
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.22
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.17
137 0.15
138 0.12
139 0.1
140 0.12
141 0.16
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.26
146 0.32
147 0.36
148 0.41
149 0.47
150 0.54
151 0.62
152 0.66
153 0.69
154 0.65
155 0.63
156 0.54
157 0.45
158 0.34
159 0.26
160 0.25
161 0.17
162 0.15
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.05
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.07
193 0.09
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.08
203 0.1
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.18
238 0.18
239 0.21
240 0.27
241 0.32
242 0.33
243 0.4
244 0.41
245 0.43
246 0.49
247 0.46
248 0.44
249 0.41
250 0.41
251 0.4
252 0.4
253 0.4
254 0.35
255 0.36
256 0.32
257 0.3
258 0.24
259 0.19
260 0.19
261 0.27
262 0.33
263 0.36
264 0.42
265 0.5
266 0.53
267 0.6
268 0.64
269 0.57
270 0.56
271 0.54
272 0.51
273 0.45
274 0.38
275 0.3
276 0.25
277 0.21
278 0.14
279 0.13
280 0.08
281 0.07
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.14
286 0.17
287 0.21
288 0.26
289 0.32
290 0.31
291 0.33
292 0.34
293 0.41
294 0.41
295 0.39
296 0.36
297 0.35
298 0.36
299 0.35
300 0.31
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.17
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.14
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.23
315 0.22
316 0.26
317 0.3
318 0.33
319 0.33
320 0.34
321 0.37
322 0.32
323 0.31
324 0.29
325 0.23
326 0.2
327 0.21
328 0.19
329 0.15
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.14
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.16
352 0.17
353 0.17
354 0.16
355 0.14
356 0.15
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.16
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.12
365 0.14
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.19
371 0.2
372 0.25
373 0.23
374 0.23
375 0.25
376 0.33
377 0.41
378 0.43
379 0.49
380 0.52
381 0.55
382 0.59
383 0.61
384 0.53
385 0.46
386 0.43
387 0.36
388 0.28
389 0.24
390 0.19
391 0.15
392 0.18
393 0.16
394 0.14
395 0.13
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.1
401 0.13
402 0.16
403 0.21
404 0.24
405 0.26
406 0.26
407 0.3
408 0.39
409 0.46
410 0.53