FuNGI

A0A409WVB4

Protein Details

Accession

A0A409WVB4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-47	THALKNKWTIYSRKKGKQRANAFIDDQ	Hydrophilic
107-127	LLERAYSRSRIRRNRIPCAIE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 11, pero 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

RSSEEEVQDQHSGDEYHSTQTHALKNKWTIYSRKKGKQRANAFIDDQAVDDEGGEDEEEDMDVSDNDDFIDNSGNEIGHPTANDALRLCNSLQADNKTVRETYWESLLERAYSRSRIRRNRIPCAIETSEHEVEYDIQSEDRLWVVPCKAGMEEQAVMSIFNRATHPTSPNIAAPSATYNPSLPGRIFIEAFMYAIAQATIEGVAGLTPSQLTLVPWLDRRSCLSTHSRAMPLWVRIRDARRKWKQVNGSVGLVTPHLNENGRPVNWSILVSWQDSSEPSTTKFKSVHFNDIRFIFDLNSLPTISNLQRFSDHSFVDNSQLVILYERIYRSNIRPGARVHIQQGEHSGSIGVVVECSSFTATIILKDNQSIEDVPLQYIRRHFEIGDQACIITLPWLGTTGWITNVEGNSITIWSDSQQKEYRVSAIEAEFFSPSLQQQPMVASSAKRLKTLVRDPYAPFVGRRVYVTSRQHLKGRRGCITNTNPDGRIWVQLEAGFSNKQHIFNAEDISVIEEGMDWLLLLPGVLRLPYSIKFLQTETEQSGAPEITSADSNADMVASPSSELPIVDDFIDFPETEPIAYQAPVEPPWLVDDCFAQRIKLAFFHDPNHIVELVGRGTAPGLVKVRDRMRYIELPIDQVNALPPKDKNDIVVVLRGEMTGKIFKVVGVDGLETQVKRAGYVLRKGEVNPVFSTDQLAQAFGAYK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.19
3	0.22
4	0.23
5	0.24
6	0.26
7	0.31
8	0.38
9	0.4
10	0.43
11	0.45
12	0.51
13	0.56
14	0.59
15	0.59
16	0.62
17	0.64
18	0.72
19	0.74
20	0.77
21	0.8
22	0.84
23	0.88
24	0.88
25	0.88
26	0.87
27	0.84
28	0.8
29	0.73
30	0.66
31	0.58
32	0.48
33	0.38
34	0.29
35	0.22
36	0.16
37	0.13
38	0.11
39	0.08
40	0.08
41	0.07
42	0.07
43	0.06
44	0.07
45	0.07
46	0.06
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.07
54	0.08
55	0.07
56	0.07
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.13
63	0.15
64	0.16
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.16
69	0.17
70	0.19
71	0.17
72	0.19
73	0.19
74	0.22
75	0.2
76	0.19
77	0.2
78	0.23
79	0.28
80	0.3
81	0.33
82	0.35
83	0.37
84	0.35
85	0.34
86	0.29
87	0.3
88	0.3
89	0.27
90	0.28
91	0.28
92	0.26
93	0.29
94	0.3
95	0.25
96	0.22
97	0.24
98	0.22
99	0.27
100	0.34
101	0.4
102	0.49
103	0.58
104	0.66
105	0.72
106	0.77
107	0.8
108	0.82
109	0.77
110	0.7
111	0.68
112	0.61
113	0.53
114	0.49
115	0.46
116	0.39
117	0.34
118	0.31
119	0.24
120	0.22
121	0.22
122	0.19
123	0.12
124	0.1
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.1
129	0.1
130	0.09
131	0.12
132	0.14
133	0.15
134	0.15
135	0.16
136	0.16
137	0.15
138	0.16
139	0.16
140	0.15
141	0.14
142	0.15
143	0.13
144	0.13
145	0.12
146	0.13
147	0.1
148	0.1
149	0.12
150	0.13
151	0.16
152	0.2
153	0.22
154	0.22
155	0.26
156	0.26
157	0.27
158	0.26
159	0.23
160	0.2
161	0.18
162	0.19
163	0.18
164	0.18
165	0.17
166	0.15
167	0.18
168	0.19
169	0.2
170	0.15
171	0.16
172	0.17
173	0.18
174	0.18
175	0.15
176	0.16
177	0.14
178	0.14
179	0.1
180	0.08
181	0.07
182	0.06
183	0.06
184	0.04
185	0.03
186	0.04
187	0.04
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.07
201	0.09
202	0.11
203	0.15
204	0.18
205	0.19
206	0.2
207	0.24
208	0.25
209	0.24
210	0.26
211	0.3
212	0.32
213	0.35
214	0.38
215	0.36
216	0.32
217	0.35
218	0.35
219	0.34
220	0.35
221	0.32
222	0.31
223	0.34
224	0.41
225	0.47
226	0.51
227	0.57
228	0.6
229	0.69
230	0.71
231	0.74
232	0.75
233	0.73
234	0.72
235	0.65
236	0.57
237	0.47
238	0.42
239	0.34
240	0.26
241	0.19
242	0.12
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.14
248	0.18
249	0.17
250	0.18
251	0.18
252	0.18
253	0.18
254	0.19
255	0.14
256	0.14
257	0.16
258	0.15
259	0.15
260	0.13
261	0.13
262	0.12
263	0.14
264	0.12
265	0.11
266	0.13
267	0.19
268	0.2
269	0.22
270	0.24
271	0.24
272	0.32
273	0.34
274	0.42
275	0.41
276	0.41
277	0.41
278	0.4
279	0.39
280	0.3
281	0.27
282	0.17
283	0.14
284	0.13
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.12
291	0.11
292	0.15
293	0.15
294	0.15
295	0.16
296	0.18
297	0.22
298	0.22
299	0.21
300	0.18
301	0.19
302	0.18
303	0.2
304	0.18
305	0.14
306	0.11
307	0.11
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.1
316	0.13
317	0.14
318	0.22
319	0.26
320	0.26
321	0.28
322	0.29
323	0.33
324	0.34
325	0.34
326	0.28
327	0.28
328	0.27
329	0.24
330	0.26
331	0.22
332	0.18
333	0.17
334	0.14
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.05
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.07
350	0.1
351	0.11
352	0.11
353	0.12
354	0.12
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.08
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.13
363	0.14
364	0.15
365	0.17
366	0.18
367	0.16
368	0.17
369	0.17
370	0.17
371	0.25
372	0.24
373	0.23
374	0.21
375	0.19
376	0.18
377	0.18
378	0.15
379	0.07
380	0.06
381	0.04
382	0.04
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.13
403	0.14
404	0.19
405	0.23
406	0.24
407	0.27
408	0.27
409	0.28
410	0.22
411	0.22
412	0.19
413	0.16
414	0.17
415	0.14
416	0.14
417	0.12
418	0.11
419	0.1
420	0.08
421	0.08
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.13
429	0.14
430	0.1
431	0.15
432	0.22
433	0.23
434	0.22
435	0.22
436	0.23
437	0.3
438	0.38
439	0.41
440	0.37
441	0.4
442	0.41
443	0.45
444	0.44
445	0.37
446	0.3
447	0.24
448	0.23
449	0.2
450	0.2
451	0.2
452	0.2
453	0.28
454	0.33
455	0.37
456	0.42
457	0.44
458	0.49
459	0.52
460	0.58
461	0.56
462	0.58
463	0.57
464	0.53
465	0.52
466	0.55
467	0.55
468	0.54
469	0.53
470	0.49
471	0.43
472	0.4
473	0.42
474	0.33
475	0.31
476	0.23
477	0.19
478	0.17
479	0.17
480	0.18
481	0.15
482	0.16
483	0.13
484	0.12
485	0.17
486	0.18
487	0.18
488	0.18
489	0.19
490	0.2
491	0.21
492	0.23
493	0.17
494	0.15
495	0.14
496	0.15
497	0.13
498	0.1
499	0.08
500	0.06
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.08
516	0.1
517	0.15
518	0.16
519	0.17
520	0.19
521	0.19
522	0.21
523	0.21
524	0.23
525	0.2
526	0.2
527	0.18
528	0.17
529	0.18
530	0.15
531	0.13
532	0.1
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.06
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.09
557	0.1
558	0.12
559	0.1
560	0.1
561	0.12
562	0.12
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.12
569	0.11
570	0.13
571	0.14
572	0.15
573	0.14
574	0.13
575	0.16
576	0.17
577	0.15
578	0.13
579	0.16
580	0.17
581	0.22
582	0.22
583	0.19
584	0.2
585	0.21
586	0.22
587	0.23
588	0.25
589	0.28
590	0.3
591	0.33
592	0.37
593	0.37
594	0.37
595	0.35
596	0.31
597	0.23
598	0.22
599	0.21
600	0.16
601	0.13
602	0.12
603	0.09
604	0.09
605	0.11
606	0.11
607	0.13
608	0.15
609	0.17
610	0.21
611	0.28
612	0.34
613	0.38
614	0.4
615	0.4
616	0.44
617	0.47
618	0.48
619	0.48
620	0.43
621	0.4
622	0.39
623	0.36
624	0.29
625	0.24
626	0.26
627	0.23
628	0.22
629	0.22
630	0.23
631	0.27
632	0.32
633	0.32
634	0.3
635	0.3
636	0.35
637	0.32
638	0.36
639	0.31
640	0.27
641	0.27
642	0.24
643	0.2
644	0.16
645	0.17
646	0.16
647	0.15
648	0.16
649	0.16
650	0.16
651	0.17
652	0.17
653	0.17
654	0.14
655	0.15
656	0.14
657	0.16
658	0.2
659	0.18
660	0.18
661	0.19
662	0.17
663	0.16
664	0.19
665	0.24
666	0.28
667	0.36
668	0.4
669	0.4
670	0.43
671	0.43
672	0.51
673	0.47
674	0.43
675	0.36
676	0.36
677	0.33
678	0.31
679	0.34
680	0.26
681	0.28
682	0.24
683	0.24
684	0.18

A0A409WVB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer