Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VQP9

Protein Details
Accession A0A409VQP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-83QPPSKPPSSVSKPPSTKRKPSTQKSRPEPKKLRKSKKRLPNDSMDVFRHydrophilic
800-819GVIGGDKKRIRRNLMRKGQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-73SKPPSTKRKPSTQKSRPEPKKLRKSKKR
806-813KKRIRRNL
Subcellular Location(s) extr 10, nucl 6, mito 5, cyto 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MISAVAARKAALAAQQAASTSQVPADRDASTSTVEQPPSKPPSSVSKPPSTKRKPSTQKSRPEPKKLRKSKKRLPNDSMDVFREQTDVIDLGSGDSDEDVMDIGMSEDSDADFDSEQNIPSNRQSKRAWSPSMPLKDGSNSDSSLDDDDINGSEPFAGLDVTTLLPTSRNTRGPHIPQNEGVLSASTFEPSIDENLFFLTEEETQTLGYTGTSTLVGLNFHDTLCLLGTCTFVLVQGSLEVNGVCIRPSSQRHQMFAPRSSALPFFKCGSEKLPPFPLPASISPRLQELFGHRVVIMFQSLQTGVESLGKACRTFENVFELPRWPNDCGQKPFKIPGLSMVSKQTKDLQPFSPLASWSKALHDLAPSTSTHTGVYLIKGPKNTGKSTFSRNIVNHLLTQYRQVAYLECDIGQSEFTPGGMVALNIVSSPIFGPPFTHPTVPFSSHYVGHTTPRSSPSYYLDCILACIQKYRSEIQVCPDDMDDEMDSRISEFIPLVVNTMGWTKGLGADLTQKIQAMVEPTDIFDIQPTSHHATPHALPPVIGHQGQYTAYQNGSLIPDQGARTHILEQAPPTSLAGFTSADHRAISMLSYFFATFKPTKPGFTGTGDVGQWEVSGWDVSRPLCAIPPYSIDCSVAFDKVVLTGAGTEDVVASEIGRVLNGAIVGLVSCEAGALDIDDGLSDGQGNLSSGIPYSQQALPPLPQASNCIGIALVRGVSDPIVTENMTGTRAQPTTNLHLLTPLPPPLLSQANARILVKGELELPVWGMLDFRHDRDGDLGYVAGVERDKVPYLQWGKGPEGVIGGDKKRIRRNLMRKGQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.21
6 0.18
7 0.14
8 0.14
9 0.17
10 0.18
11 0.2
12 0.22
13 0.21
14 0.21
15 0.23
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.23
20 0.26
21 0.29
22 0.3
23 0.31
24 0.38
25 0.43
26 0.43
27 0.39
28 0.37
29 0.44
30 0.5
31 0.57
32 0.56
33 0.59
34 0.65
35 0.73
36 0.81
37 0.8
38 0.82
39 0.81
40 0.84
41 0.85
42 0.87
43 0.9
44 0.88
45 0.89
46 0.89
47 0.92
48 0.91
49 0.92
50 0.92
51 0.92
52 0.93
53 0.94
54 0.94
55 0.94
56 0.95
57 0.94
58 0.94
59 0.94
60 0.93
61 0.9
62 0.89
63 0.86
64 0.81
65 0.76
66 0.69
67 0.61
68 0.51
69 0.44
70 0.34
71 0.26
72 0.2
73 0.17
74 0.14
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.24
108 0.33
109 0.32
110 0.38
111 0.4
112 0.45
113 0.54
114 0.6
115 0.59
116 0.54
117 0.6
118 0.63
119 0.67
120 0.6
121 0.51
122 0.45
123 0.42
124 0.41
125 0.36
126 0.3
127 0.24
128 0.22
129 0.22
130 0.21
131 0.19
132 0.18
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.09
154 0.14
155 0.19
156 0.24
157 0.27
158 0.33
159 0.42
160 0.48
161 0.56
162 0.56
163 0.54
164 0.5
165 0.51
166 0.45
167 0.37
168 0.3
169 0.21
170 0.16
171 0.14
172 0.12
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.13
235 0.18
236 0.24
237 0.33
238 0.37
239 0.39
240 0.44
241 0.5
242 0.5
243 0.49
244 0.46
245 0.37
246 0.33
247 0.33
248 0.32
249 0.27
250 0.23
251 0.22
252 0.2
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.22
257 0.27
258 0.27
259 0.29
260 0.33
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.31
265 0.26
266 0.28
267 0.31
268 0.28
269 0.28
270 0.26
271 0.27
272 0.25
273 0.22
274 0.2
275 0.18
276 0.2
277 0.19
278 0.2
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.12
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.22
304 0.22
305 0.23
306 0.23
307 0.25
308 0.21
309 0.23
310 0.24
311 0.18
312 0.22
313 0.29
314 0.35
315 0.38
316 0.43
317 0.43
318 0.43
319 0.44
320 0.44
321 0.37
322 0.3
323 0.3
324 0.32
325 0.3
326 0.29
327 0.33
328 0.32
329 0.31
330 0.32
331 0.31
332 0.28
333 0.3
334 0.33
335 0.28
336 0.28
337 0.29
338 0.29
339 0.25
340 0.22
341 0.2
342 0.18
343 0.18
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.13
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.12
360 0.11
361 0.12
362 0.15
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.19
367 0.22
368 0.25
369 0.26
370 0.24
371 0.27
372 0.27
373 0.34
374 0.38
375 0.35
376 0.37
377 0.35
378 0.36
379 0.35
380 0.33
381 0.27
382 0.23
383 0.22
384 0.17
385 0.19
386 0.16
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.12
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.07
420 0.09
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.19
426 0.22
427 0.23
428 0.22
429 0.2
430 0.21
431 0.2
432 0.21
433 0.2
434 0.18
435 0.18
436 0.2
437 0.18
438 0.19
439 0.21
440 0.23
441 0.21
442 0.22
443 0.23
444 0.25
445 0.24
446 0.23
447 0.2
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.14
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.16
456 0.18
457 0.19
458 0.23
459 0.24
460 0.25
461 0.26
462 0.31
463 0.28
464 0.27
465 0.25
466 0.2
467 0.17
468 0.17
469 0.13
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.07
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.12
496 0.13
497 0.14
498 0.14
499 0.13
500 0.12
501 0.13
502 0.13
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.12
516 0.16
517 0.18
518 0.18
519 0.19
520 0.21
521 0.22
522 0.26
523 0.26
524 0.21
525 0.19
526 0.19
527 0.22
528 0.22
529 0.21
530 0.16
531 0.12
532 0.14
533 0.15
534 0.16
535 0.14
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.13
550 0.14
551 0.15
552 0.17
553 0.16
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.17
558 0.16
559 0.14
560 0.12
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.08
566 0.12
567 0.13
568 0.13
569 0.13
570 0.13
571 0.11
572 0.1
573 0.11
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.08
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.13
582 0.13
583 0.15
584 0.23
585 0.23
586 0.25
587 0.27
588 0.31
589 0.3
590 0.31
591 0.32
592 0.25
593 0.27
594 0.24
595 0.22
596 0.18
597 0.15
598 0.11
599 0.08
600 0.07
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.07
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.11
609 0.1
610 0.13
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.18
615 0.21
616 0.23
617 0.23
618 0.22
619 0.21
620 0.23
621 0.23
622 0.19
623 0.16
624 0.13
625 0.12
626 0.11
627 0.12
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.07
634 0.06
635 0.05
636 0.05
637 0.06
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.03
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.12
681 0.13
682 0.15
683 0.17
684 0.2
685 0.21
686 0.24
687 0.26
688 0.23
689 0.21
690 0.24
691 0.23
692 0.24
693 0.23
694 0.19
695 0.16
696 0.15
697 0.16
698 0.13
699 0.11
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.08
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.11
711 0.12
712 0.13
713 0.13
714 0.12
715 0.16
716 0.17
717 0.17
718 0.2
719 0.24
720 0.3
721 0.34
722 0.34
723 0.28
724 0.3
725 0.31
726 0.3
727 0.28
728 0.24
729 0.2
730 0.19
731 0.2
732 0.22
733 0.24
734 0.23
735 0.24
736 0.28
737 0.33
738 0.35
739 0.35
740 0.32
741 0.29
742 0.3
743 0.26
744 0.2
745 0.16
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.13
750 0.11
751 0.11
752 0.1
753 0.09
754 0.07
755 0.15
756 0.18
757 0.19
758 0.24
759 0.23
760 0.25
761 0.27
762 0.3
763 0.23
764 0.21
765 0.19
766 0.13
767 0.14
768 0.13
769 0.11
770 0.09
771 0.09
772 0.1
773 0.12
774 0.14
775 0.14
776 0.16
777 0.24
778 0.28
779 0.31
780 0.34
781 0.35
782 0.37
783 0.41
784 0.4
785 0.31
786 0.28
787 0.25
788 0.26
789 0.27
790 0.26
791 0.29
792 0.33
793 0.4
794 0.47
795 0.55
796 0.6
797 0.65
798 0.74
799 0.77