Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YIP4

Protein Details
Accession A0A409YIP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-27PSLPSLPPASKRRKIVKQNDFAASLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-265PPKPKKS
Subcellular Location(s) mito 8, nucl 7, cyto 3, plas 3, golg 3, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPPSLPSLPPASKRRKIVKQNDFAASLKALEDKVTEAVAKNGSLNPLADLLELMYGATDAHDTSKGIYAAYRVFVIIIANGKLGLGGDDAAKVVKAWIWERLQAYVDFLGGLLQDEEKFLRTSALQIMFSLLKHLSTSYSKSANTSKPQPQFHVSHFRKIVSALLLCPRSQRKSPGNKKGEGIIDGDVLDLFYETWFSVHDDIRWFFLRDSATLLSNHPHETYPNLATNLLSILERLTTFPTDPEELNSWWVSEFSAKPPKPKKSKSGGDESGSENDESEEPSTTNDAGDDDWRKFFEDEKPTEESKGPSARLHQMTMHQSLYSLNSHKAVFTRTWLMLLPRLSTGGAGEAEDERRKGLATRALNVMHRGVLPHLTRPFLVMDWISSCVDLGGSVGLLALNALFVLIKEYNLDYPSFYTRLYAFLDRDVLHLKHRARFFRLTELFLSSTHLPAALLASFIKRLSRLSLSAPPAAIVMIIPFTYNVLKRHPALMYMIHRVDDSDEGNDPFVATETDPMNTNAIDSSLWELMTHATHYHAPVSTMAKIFSEAFTKPNYGMEDFLDHTYNTLFETEINRKIKKEPALAMIDASVKMELFPTHQAGVVDSAPSSSSEAGSEGESEDENEDDDDEGGKNESGSEGESESGSEDKKMALDVKMNTALGRRDVVAELWGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.78
3 0.83
4 0.85
5 0.86
6 0.86
7 0.86
8 0.81
9 0.75
10 0.65
11 0.57
12 0.47
13 0.37
14 0.28
15 0.23
16 0.18
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.16
23 0.14
24 0.17
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.19
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.07
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.19
58 0.17
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.11
83 0.12
84 0.19
85 0.21
86 0.26
87 0.27
88 0.29
89 0.3
90 0.27
91 0.28
92 0.21
93 0.19
94 0.14
95 0.12
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.13
110 0.19
111 0.22
112 0.2
113 0.2
114 0.22
115 0.22
116 0.21
117 0.21
118 0.15
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.15
124 0.2
125 0.22
126 0.25
127 0.25
128 0.29
129 0.35
130 0.38
131 0.42
132 0.46
133 0.51
134 0.55
135 0.58
136 0.59
137 0.59
138 0.56
139 0.55
140 0.58
141 0.52
142 0.52
143 0.51
144 0.47
145 0.42
146 0.38
147 0.35
148 0.27
149 0.26
150 0.19
151 0.24
152 0.24
153 0.24
154 0.29
155 0.32
156 0.34
157 0.36
158 0.43
159 0.46
160 0.56
161 0.66
162 0.71
163 0.72
164 0.71
165 0.68
166 0.65
167 0.58
168 0.48
169 0.39
170 0.29
171 0.23
172 0.19
173 0.18
174 0.12
175 0.09
176 0.07
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.13
188 0.16
189 0.17
190 0.2
191 0.22
192 0.21
193 0.19
194 0.22
195 0.21
196 0.17
197 0.2
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.16
217 0.12
218 0.09
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.15
243 0.25
244 0.26
245 0.35
246 0.43
247 0.52
248 0.59
249 0.64
250 0.67
251 0.67
252 0.75
253 0.71
254 0.72
255 0.67
256 0.6
257 0.56
258 0.49
259 0.41
260 0.34
261 0.28
262 0.19
263 0.15
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.1
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.15
283 0.17
284 0.21
285 0.26
286 0.27
287 0.3
288 0.34
289 0.33
290 0.34
291 0.33
292 0.27
293 0.24
294 0.25
295 0.23
296 0.2
297 0.23
298 0.28
299 0.28
300 0.28
301 0.24
302 0.25
303 0.28
304 0.29
305 0.26
306 0.19
307 0.18
308 0.17
309 0.18
310 0.15
311 0.13
312 0.11
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.16
347 0.17
348 0.19
349 0.22
350 0.24
351 0.25
352 0.25
353 0.22
354 0.15
355 0.14
356 0.12
357 0.1
358 0.13
359 0.13
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.13
367 0.14
368 0.09
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.1
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.07
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.1
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.13
406 0.12
407 0.14
408 0.16
409 0.17
410 0.15
411 0.15
412 0.18
413 0.17
414 0.18
415 0.2
416 0.18
417 0.18
418 0.24
419 0.26
420 0.28
421 0.34
422 0.36
423 0.37
424 0.42
425 0.42
426 0.46
427 0.45
428 0.42
429 0.38
430 0.37
431 0.33
432 0.27
433 0.28
434 0.18
435 0.17
436 0.14
437 0.13
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.13
451 0.15
452 0.16
453 0.19
454 0.26
455 0.28
456 0.29
457 0.28
458 0.25
459 0.22
460 0.2
461 0.16
462 0.08
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.06
469 0.08
470 0.12
471 0.13
472 0.17
473 0.2
474 0.22
475 0.26
476 0.25
477 0.24
478 0.23
479 0.27
480 0.27
481 0.3
482 0.29
483 0.26
484 0.25
485 0.24
486 0.23
487 0.19
488 0.16
489 0.12
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.14
494 0.12
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.07
499 0.1
500 0.1
501 0.11
502 0.12
503 0.13
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.11
518 0.12
519 0.09
520 0.1
521 0.12
522 0.13
523 0.15
524 0.14
525 0.14
526 0.17
527 0.19
528 0.2
529 0.2
530 0.19
531 0.17
532 0.19
533 0.18
534 0.17
535 0.17
536 0.14
537 0.15
538 0.17
539 0.18
540 0.17
541 0.2
542 0.22
543 0.2
544 0.2
545 0.2
546 0.21
547 0.21
548 0.23
549 0.2
550 0.17
551 0.16
552 0.16
553 0.14
554 0.11
555 0.1
556 0.08
557 0.09
558 0.16
559 0.21
560 0.29
561 0.35
562 0.36
563 0.38
564 0.42
565 0.47
566 0.49
567 0.5
568 0.46
569 0.48
570 0.5
571 0.49
572 0.44
573 0.38
574 0.32
575 0.25
576 0.22
577 0.15
578 0.1
579 0.09
580 0.1
581 0.09
582 0.1
583 0.14
584 0.16
585 0.16
586 0.18
587 0.19
588 0.18
589 0.21
590 0.19
591 0.15
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.11
606 0.1
607 0.11
608 0.11
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.09
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.1
618 0.11
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.1
625 0.11
626 0.1
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.12
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.13
637 0.15
638 0.17
639 0.18
640 0.24
641 0.25
642 0.31
643 0.34
644 0.34
645 0.32
646 0.33
647 0.33
648 0.29
649 0.29
650 0.23
651 0.22
652 0.23
653 0.22