Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YMB1

Protein Details
Accession A0A409YMB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
499-520KALLRRIKGMFRRKHASKNATVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
489-515PRRKPSMGWMKALLRRIKGMFRRKHAS
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006073  GTP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
CDD cd00882  Ras_like_GTPase  
Amino Acid Sequences MSKLPLKRLKIDGQAFVKPLVDTTRYDHQDRLFFLLVGPTGAGKSSFIEALANDHTLGISKDQLESFTQTVTAYEIVNVYFDQYRISLLDCPGFSDTSLSELEIIEMVNTWMKANRVSYIDIILYFCPITDTRLPGTRRKTMEMWKSLVSSSSKSSYPAGRKDEVAVTIVTTMWDQVWCERVEQRAEKNYNQLKDGVWKEMIDKGSGITKFKNTQESALGNIDDALEKFVDVDDTAYNISWFAVQDVPLMNTGHGVFLYEELTSRIEAVRKRRLTLQLDLHASLGDPTLQSLFQKEHKHNECLLEKYEQQLTLLKSPPEPGRYTIGPEIDLVVSGSSDEESILSSSSHDPAPPSPTAHDETAIDDELVPSSRNSAAPSNDPDVASPAATVPVDSTTSNAPLDPITASFTTSTQLSPQSSVVHSGDAALVPASREVAILPQHPLPLTPSHLLHNHINAPQAEAAMVSSTEPTHAPHASSARTLDDAGRLPRRKPSMGWMKALLRRIKGMFRRKHASKNATVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.55
3 0.49
4 0.43
5 0.33
6 0.3
7 0.26
8 0.24
9 0.21
10 0.25
11 0.34
12 0.37
13 0.4
14 0.42
15 0.42
16 0.45
17 0.45
18 0.46
19 0.38
20 0.33
21 0.31
22 0.3
23 0.25
24 0.2
25 0.18
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.15
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.18
52 0.21
53 0.2
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.19
77 0.17
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.16
83 0.15
84 0.13
85 0.14
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.15
102 0.17
103 0.18
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.18
110 0.14
111 0.13
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.13
117 0.15
118 0.18
119 0.19
120 0.27
121 0.3
122 0.35
123 0.41
124 0.44
125 0.45
126 0.47
127 0.5
128 0.51
129 0.58
130 0.56
131 0.53
132 0.47
133 0.45
134 0.4
135 0.38
136 0.31
137 0.24
138 0.22
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.23
143 0.26
144 0.31
145 0.36
146 0.39
147 0.37
148 0.38
149 0.39
150 0.38
151 0.32
152 0.27
153 0.19
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.15
168 0.17
169 0.23
170 0.26
171 0.3
172 0.36
173 0.4
174 0.4
175 0.47
176 0.49
177 0.45
178 0.43
179 0.38
180 0.3
181 0.34
182 0.34
183 0.27
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.24
188 0.24
189 0.17
190 0.15
191 0.12
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.15
196 0.18
197 0.22
198 0.24
199 0.3
200 0.26
201 0.26
202 0.29
203 0.28
204 0.27
205 0.24
206 0.22
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.1
254 0.13
255 0.2
256 0.28
257 0.29
258 0.3
259 0.35
260 0.42
261 0.43
262 0.46
263 0.45
264 0.4
265 0.41
266 0.4
267 0.35
268 0.27
269 0.23
270 0.17
271 0.11
272 0.07
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.08
280 0.14
281 0.21
282 0.24
283 0.33
284 0.37
285 0.41
286 0.42
287 0.46
288 0.43
289 0.39
290 0.38
291 0.32
292 0.28
293 0.27
294 0.27
295 0.2
296 0.18
297 0.2
298 0.19
299 0.21
300 0.23
301 0.22
302 0.2
303 0.24
304 0.27
305 0.26
306 0.26
307 0.23
308 0.25
309 0.25
310 0.28
311 0.27
312 0.24
313 0.21
314 0.19
315 0.18
316 0.13
317 0.13
318 0.09
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.13
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.21
343 0.24
344 0.23
345 0.22
346 0.18
347 0.19
348 0.19
349 0.18
350 0.14
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.09
356 0.07
357 0.08
358 0.1
359 0.11
360 0.13
361 0.16
362 0.18
363 0.22
364 0.26
365 0.28
366 0.28
367 0.27
368 0.25
369 0.24
370 0.22
371 0.18
372 0.13
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.09
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.17
404 0.19
405 0.19
406 0.23
407 0.21
408 0.18
409 0.17
410 0.16
411 0.15
412 0.12
413 0.11
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.1
423 0.13
424 0.14
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.2
430 0.19
431 0.19
432 0.22
433 0.23
434 0.23
435 0.26
436 0.28
437 0.32
438 0.33
439 0.34
440 0.35
441 0.33
442 0.36
443 0.32
444 0.32
445 0.29
446 0.25
447 0.2
448 0.15
449 0.14
450 0.1
451 0.09
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.14
459 0.16
460 0.16
461 0.2
462 0.25
463 0.26
464 0.28
465 0.27
466 0.25
467 0.25
468 0.25
469 0.22
470 0.22
471 0.25
472 0.3
473 0.38
474 0.39
475 0.4
476 0.48
477 0.53
478 0.52
479 0.5
480 0.53
481 0.54
482 0.57
483 0.59
484 0.57
485 0.59
486 0.61
487 0.67
488 0.62
489 0.53
490 0.54
491 0.53
492 0.56
493 0.57
494 0.63
495 0.64
496 0.67
497 0.74
498 0.75
499 0.81
500 0.82
501 0.81