Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VCM5

Protein Details
Accession A0A409VCM5    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-160VEVAKTPAPRRTRKRARKSASGDGLGHydrophilic
260-302ESESSTKSKSKPKSRSKSKPESKAKSSPKPESKSKPRSKAQSSHydrophilic
779-804RYSESSRDKGRWRDRDDGRRNGRRYTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-155TPAPRRTRKRARKSAS
198-208KEQRVGEKRKR
266-298KSKSKPKSRSKSKPESKAKSSPKPESKSKPRSK
745-801RDRGEKKGDRDRDRDRGGSSRNDSGFDRKKDGGSRYSESSRDKGRWRDRDDGRRNGR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAAPEIIDLTTTSAPSISPASPLASNQPKNNDNDAVSCVASADAKLNDSSISAKQSPSANSQRDPSKNAEPSAGSSTTSQNDLKLQSTAPSSKPVEVFDTTSSLVVPTESLPKPSKTGNAPDATVGEREPEKGVVEVAKTPAPRRTRKRARKSASGDGLGSASASGKEDNKEKNEGPSAKKENVVHGQRDGGASKNEKEQRVGEKRKRGADDDGEEGQSKSRLEDGEVLDAKMDVDVVEIEPPRRASSTLPDRDSKNVDESESSTKSKSKPKSRSKSKPESKAKSSPKPESKSKPRSKAQSSSQSQSQPQPKSQSKSTSKAQSPAPQPEKPVSREAGPDLFYIDVTPTAIPTVLVDTTPAIAIDVDESLDTKLLVPAHVTVLGSTPVEIIEKITREDGAEEGEEEEDYIDYLDYDDVKGITRYFETPPDASATLTRTVCKNCGAEGEHKTSACPVQICLTCGARNEHSTRSCPISKVCFTCGMKGHINANCPNRRSGRAMMSTRDQECDRCFSSFHKTPECPTWWRIYEYFSTEGQSETLKRRMEKKGLLLGKGGEAYVADDEWCYNCGSAGHWGDDCDDARIPPNDYSAFSSYNVMKSPFYDAGQEQQNKSKSTVKRNLVDELTQWPGDAPDLVGKKGKAKAKLALQQHVEKVVDTVDEDDWFGNRNKGRGGASGDRDRDKKNGPASTAQQPPKGTPTEPKKMRFAGISIKGMASKVQEPQTQAQGALLGRIDFPRSEKRDSDRDRGEKKGDRDRDRDRGGSSRNDSGFDRKKDGGSRYSESSRDKGRWRDRDDGRRNGRRYTGGYAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.16
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.17
8 0.18
9 0.2
10 0.27
11 0.34
12 0.38
13 0.42
14 0.49
15 0.51
16 0.56
17 0.6
18 0.56
19 0.48
20 0.45
21 0.43
22 0.37
23 0.32
24 0.26
25 0.2
26 0.16
27 0.15
28 0.13
29 0.14
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.17
37 0.16
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.25
42 0.3
43 0.32
44 0.38
45 0.44
46 0.43
47 0.44
48 0.51
49 0.56
50 0.56
51 0.57
52 0.54
53 0.55
54 0.55
55 0.53
56 0.51
57 0.43
58 0.42
59 0.44
60 0.38
61 0.29
62 0.26
63 0.28
64 0.26
65 0.29
66 0.25
67 0.21
68 0.25
69 0.26
70 0.26
71 0.23
72 0.22
73 0.21
74 0.26
75 0.29
76 0.26
77 0.31
78 0.32
79 0.34
80 0.35
81 0.34
82 0.33
83 0.31
84 0.32
85 0.26
86 0.27
87 0.24
88 0.22
89 0.2
90 0.16
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.08
95 0.16
96 0.16
97 0.22
98 0.25
99 0.27
100 0.29
101 0.31
102 0.36
103 0.34
104 0.41
105 0.44
106 0.43
107 0.42
108 0.41
109 0.39
110 0.35
111 0.3
112 0.22
113 0.18
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.16
121 0.14
122 0.15
123 0.16
124 0.17
125 0.19
126 0.2
127 0.23
128 0.29
129 0.35
130 0.44
131 0.5
132 0.59
133 0.67
134 0.77
135 0.85
136 0.89
137 0.88
138 0.89
139 0.88
140 0.86
141 0.82
142 0.74
143 0.63
144 0.53
145 0.45
146 0.34
147 0.26
148 0.16
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.1
154 0.14
155 0.2
156 0.26
157 0.29
158 0.35
159 0.35
160 0.39
161 0.45
162 0.48
163 0.48
164 0.51
165 0.54
166 0.5
167 0.55
168 0.5
169 0.49
170 0.52
171 0.53
172 0.45
173 0.41
174 0.4
175 0.36
176 0.36
177 0.3
178 0.23
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.31
183 0.35
184 0.35
185 0.36
186 0.39
187 0.44
188 0.52
189 0.6
190 0.6
191 0.64
192 0.69
193 0.73
194 0.72
195 0.65
196 0.61
197 0.58
198 0.53
199 0.48
200 0.44
201 0.37
202 0.34
203 0.31
204 0.25
205 0.2
206 0.17
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.19
212 0.19
213 0.25
214 0.25
215 0.25
216 0.22
217 0.22
218 0.2
219 0.14
220 0.12
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.22
235 0.32
236 0.37
237 0.4
238 0.42
239 0.43
240 0.47
241 0.48
242 0.41
243 0.35
244 0.29
245 0.26
246 0.24
247 0.25
248 0.28
249 0.27
250 0.26
251 0.23
252 0.26
253 0.3
254 0.38
255 0.44
256 0.48
257 0.56
258 0.65
259 0.75
260 0.83
261 0.89
262 0.9
263 0.92
264 0.91
265 0.91
266 0.9
267 0.88
268 0.84
269 0.83
270 0.82
271 0.8
272 0.78
273 0.77
274 0.76
275 0.74
276 0.75
277 0.76
278 0.78
279 0.79
280 0.81
281 0.81
282 0.78
283 0.81
284 0.8
285 0.77
286 0.75
287 0.74
288 0.7
289 0.64
290 0.62
291 0.57
292 0.52
293 0.52
294 0.51
295 0.44
296 0.43
297 0.48
298 0.49
299 0.5
300 0.52
301 0.55
302 0.53
303 0.55
304 0.58
305 0.57
306 0.54
307 0.53
308 0.53
309 0.5
310 0.49
311 0.53
312 0.53
313 0.46
314 0.45
315 0.47
316 0.47
317 0.42
318 0.41
319 0.32
320 0.28
321 0.28
322 0.28
323 0.25
324 0.22
325 0.19
326 0.16
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.14
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.14
418 0.14
419 0.13
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.19
427 0.18
428 0.14
429 0.17
430 0.19
431 0.22
432 0.25
433 0.29
434 0.28
435 0.27
436 0.26
437 0.24
438 0.23
439 0.19
440 0.15
441 0.1
442 0.14
443 0.15
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.17
448 0.18
449 0.2
450 0.17
451 0.19
452 0.21
453 0.25
454 0.25
455 0.27
456 0.27
457 0.3
458 0.3
459 0.28
460 0.28
461 0.29
462 0.31
463 0.31
464 0.31
465 0.33
466 0.32
467 0.35
468 0.35
469 0.33
470 0.31
471 0.31
472 0.34
473 0.29
474 0.32
475 0.33
476 0.38
477 0.39
478 0.38
479 0.41
480 0.39
481 0.4
482 0.41
483 0.39
484 0.38
485 0.41
486 0.42
487 0.41
488 0.42
489 0.44
490 0.4
491 0.38
492 0.32
493 0.26
494 0.26
495 0.28
496 0.25
497 0.2
498 0.2
499 0.2
500 0.29
501 0.33
502 0.35
503 0.37
504 0.37
505 0.39
506 0.45
507 0.46
508 0.41
509 0.38
510 0.4
511 0.35
512 0.38
513 0.36
514 0.32
515 0.3
516 0.3
517 0.3
518 0.24
519 0.23
520 0.19
521 0.19
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.17
526 0.22
527 0.24
528 0.26
529 0.34
530 0.4
531 0.46
532 0.47
533 0.48
534 0.52
535 0.52
536 0.51
537 0.44
538 0.38
539 0.32
540 0.27
541 0.21
542 0.12
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.14
558 0.15
559 0.16
560 0.15
561 0.16
562 0.17
563 0.19
564 0.18
565 0.14
566 0.13
567 0.12
568 0.15
569 0.17
570 0.18
571 0.17
572 0.19
573 0.18
574 0.19
575 0.23
576 0.22
577 0.22
578 0.2
579 0.23
580 0.21
581 0.22
582 0.22
583 0.2
584 0.17
585 0.16
586 0.21
587 0.2
588 0.19
589 0.2
590 0.19
591 0.23
592 0.32
593 0.34
594 0.31
595 0.36
596 0.4
597 0.39
598 0.41
599 0.44
600 0.43
601 0.49
602 0.57
603 0.57
604 0.6
605 0.61
606 0.63
607 0.57
608 0.51
609 0.42
610 0.37
611 0.33
612 0.26
613 0.23
614 0.17
615 0.15
616 0.14
617 0.13
618 0.1
619 0.12
620 0.14
621 0.15
622 0.18
623 0.19
624 0.24
625 0.3
626 0.35
627 0.36
628 0.39
629 0.44
630 0.49
631 0.56
632 0.56
633 0.57
634 0.57
635 0.55
636 0.52
637 0.5
638 0.41
639 0.34
640 0.28
641 0.22
642 0.17
643 0.13
644 0.13
645 0.1
646 0.1
647 0.11
648 0.1
649 0.1
650 0.13
651 0.14
652 0.18
653 0.19
654 0.21
655 0.22
656 0.25
657 0.27
658 0.28
659 0.34
660 0.35
661 0.41
662 0.46
663 0.49
664 0.51
665 0.53
666 0.52
667 0.5
668 0.47
669 0.47
670 0.48
671 0.48
672 0.47
673 0.5
674 0.52
675 0.55
676 0.59
677 0.56
678 0.53
679 0.49
680 0.48
681 0.47
682 0.45
683 0.39
684 0.39
685 0.44
686 0.5
687 0.56
688 0.58
689 0.6
690 0.59
691 0.6
692 0.53
693 0.47
694 0.46
695 0.46
696 0.44
697 0.38
698 0.36
699 0.34
700 0.32
701 0.3
702 0.24
703 0.2
704 0.23
705 0.28
706 0.3
707 0.34
708 0.38
709 0.42
710 0.39
711 0.36
712 0.31
713 0.28
714 0.25
715 0.22
716 0.19
717 0.13
718 0.13
719 0.15
720 0.16
721 0.14
722 0.19
723 0.27
724 0.31
725 0.36
726 0.41
727 0.46
728 0.55
729 0.61
730 0.66
731 0.67
732 0.71
733 0.71
734 0.72
735 0.75
736 0.72
737 0.73
738 0.74
739 0.74
740 0.72
741 0.76
742 0.78
743 0.79
744 0.77
745 0.73
746 0.67
747 0.65
748 0.62
749 0.63
750 0.59
751 0.57
752 0.52
753 0.51
754 0.49
755 0.51
756 0.55
757 0.51
758 0.52
759 0.46
760 0.51
761 0.55
762 0.58
763 0.56
764 0.53
765 0.53
766 0.54
767 0.56
768 0.57
769 0.55
770 0.55
771 0.55
772 0.55
773 0.59
774 0.63
775 0.68
776 0.72
777 0.74
778 0.78
779 0.8
780 0.85
781 0.85
782 0.86
783 0.86
784 0.86
785 0.83
786 0.79
787 0.75
788 0.7
789 0.66