Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VAP1

Protein Details
Accession A0A409VAP1    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-96PEDTDAPKKRKRNTKPKDPNAPKRPASSBasic
256-275RGGSVKPASKDQKSKKGSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-65KRKA
74-92APKKRKRNTKPKDPNAPKR
194-196KPR
251-275APKKRRGGSVKPASKDQKSKKGSKA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTDQVSKFEAHRAQLSASLNAVADSMRSCAQLAESFAKIVSDASYTPEMAELVQDIDGAKGKRKAAFSPEDTDAPKKRKRNTKPKDPNAPKRPASSYILFQNEVRKQLKEQHPEFDNARLLSMIAEQWKNMPEEQKEASRVASPQLITYNQAMKNAKAQYSEEKKAYDNRTPAEIDAANAAAAEAQALKKANAKPRGPKPGVTPAQQASSVPARPPPPPEVTSPSVESSDEEDSAEDDASDDESEEEPEPAPKKRRGGSVKPASKDQKSKKGSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.29
4 0.26
5 0.23
6 0.19
7 0.17
8 0.16
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.15
19 0.18
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.18
25 0.16
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.11
37 0.11
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.11
45 0.12
46 0.16
47 0.2
48 0.23
49 0.27
50 0.29
51 0.32
52 0.35
53 0.42
54 0.41
55 0.42
56 0.42
57 0.4
58 0.41
59 0.43
60 0.43
61 0.43
62 0.46
63 0.48
64 0.54
65 0.61
66 0.7
67 0.75
68 0.79
69 0.83
70 0.87
71 0.9
72 0.93
73 0.92
74 0.92
75 0.9
76 0.89
77 0.8
78 0.74
79 0.68
80 0.61
81 0.55
82 0.46
83 0.4
84 0.38
85 0.37
86 0.33
87 0.3
88 0.34
89 0.31
90 0.35
91 0.34
92 0.29
93 0.28
94 0.37
95 0.44
96 0.45
97 0.45
98 0.45
99 0.45
100 0.47
101 0.46
102 0.4
103 0.34
104 0.25
105 0.23
106 0.17
107 0.15
108 0.12
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.16
119 0.13
120 0.17
121 0.19
122 0.2
123 0.2
124 0.2
125 0.2
126 0.17
127 0.16
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.18
137 0.17
138 0.21
139 0.21
140 0.2
141 0.26
142 0.26
143 0.26
144 0.22
145 0.23
146 0.27
147 0.34
148 0.37
149 0.33
150 0.32
151 0.32
152 0.38
153 0.42
154 0.38
155 0.35
156 0.32
157 0.34
158 0.33
159 0.31
160 0.27
161 0.22
162 0.17
163 0.14
164 0.13
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.14
177 0.19
178 0.28
179 0.36
180 0.41
181 0.48
182 0.57
183 0.67
184 0.63
185 0.61
186 0.59
187 0.61
188 0.6
189 0.54
190 0.5
191 0.42
192 0.42
193 0.39
194 0.33
195 0.26
196 0.26
197 0.25
198 0.21
199 0.23
200 0.23
201 0.25
202 0.3
203 0.31
204 0.32
205 0.33
206 0.37
207 0.39
208 0.4
209 0.41
210 0.4
211 0.36
212 0.31
213 0.29
214 0.26
215 0.22
216 0.21
217 0.18
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.14
222 0.13
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.16
236 0.2
237 0.26
238 0.33
239 0.37
240 0.44
241 0.49
242 0.59
243 0.63
244 0.69
245 0.73
246 0.76
247 0.79
248 0.75
249 0.79
250 0.77
251 0.76
252 0.77
253 0.76
254 0.75
255 0.75