Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YBE7

Protein Details
Accession A0A409YBE7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-129KEEYQSYKKRMVKTRKEVDRVKEYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.333, cyto 7, cyto_mito 5.165
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044730  RNase_H-like_dom_plant  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13456  RVT_3  
CDD cd06222  RNase_H_like  
Amino Acid Sequences MDTVTTSQIQVDCQHSTDVSSCSHFKNTISDTNKSILQEIGAFVSLGGSENILGNLISKHLSWLVRQTFNHGVAVGRQAKTVEDEEVIAEYRRALQDVRSERDVAKEEYQSYKKRMVKTRKEVDRVKEYLNTLRWEDDEDLEGVSDDDSSHDEESVVSAEGAKTLESGVEEDEEGEPLNRTVDVGINNKAENNLDDDDKGVNKSQLDEVTQVQDVVLSPGLQPCGPFITGIYPWGLQVDRDSDTLTAPREETVTSTVKSDNTISQLPISPTKSDKLAIEVLQSISTSTSTTLAVQRTPGPATTCPTTKKGIKKLLRRIKEPGNHEIMKEAQEFLILAMATDKAKRTEGQEYLIAHWKVPTPTVSGGSSPEVTVDASAYGVGVIIKDVGWTCWRFTSSNSIPKGSNDSIVTSWAELVAAELGVRAAIDAGFRSCPLILRSDNQGVVKALKDGTWQEKHGLDDVLKRILKLCKRNFIVIKPRWIPTDDNPADDISRGNYPGKHDKFRPPSLPKVLSSLLKYVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.23
4 0.24
5 0.22
6 0.2
7 0.23
8 0.25
9 0.26
10 0.3
11 0.3
12 0.28
13 0.33
14 0.36
15 0.42
16 0.44
17 0.44
18 0.43
19 0.44
20 0.46
21 0.39
22 0.35
23 0.26
24 0.22
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.09
45 0.08
46 0.11
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.26
51 0.32
52 0.38
53 0.38
54 0.43
55 0.45
56 0.45
57 0.44
58 0.35
59 0.29
60 0.24
61 0.32
62 0.32
63 0.26
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.28
68 0.27
69 0.2
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.16
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.24
84 0.31
85 0.36
86 0.35
87 0.36
88 0.36
89 0.4
90 0.41
91 0.36
92 0.33
93 0.31
94 0.32
95 0.38
96 0.44
97 0.44
98 0.45
99 0.5
100 0.5
101 0.56
102 0.63
103 0.66
104 0.7
105 0.75
106 0.81
107 0.82
108 0.85
109 0.84
110 0.81
111 0.79
112 0.71
113 0.64
114 0.58
115 0.51
116 0.5
117 0.47
118 0.42
119 0.34
120 0.32
121 0.3
122 0.28
123 0.27
124 0.21
125 0.18
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.09
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.12
171 0.14
172 0.18
173 0.19
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.14
179 0.15
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.18
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.24
293 0.27
294 0.3
295 0.37
296 0.42
297 0.5
298 0.55
299 0.61
300 0.7
301 0.75
302 0.75
303 0.71
304 0.68
305 0.67
306 0.66
307 0.61
308 0.57
309 0.54
310 0.49
311 0.45
312 0.41
313 0.34
314 0.3
315 0.26
316 0.2
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.1
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.16
333 0.22
334 0.23
335 0.25
336 0.27
337 0.27
338 0.29
339 0.36
340 0.32
341 0.25
342 0.25
343 0.25
344 0.22
345 0.22
346 0.2
347 0.15
348 0.17
349 0.19
350 0.19
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.14
356 0.13
357 0.11
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.1
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.28
383 0.31
384 0.38
385 0.4
386 0.4
387 0.38
388 0.39
389 0.45
390 0.36
391 0.33
392 0.25
393 0.25
394 0.23
395 0.25
396 0.24
397 0.16
398 0.15
399 0.11
400 0.1
401 0.07
402 0.07
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.12
421 0.13
422 0.18
423 0.18
424 0.21
425 0.27
426 0.3
427 0.33
428 0.31
429 0.32
430 0.28
431 0.28
432 0.26
433 0.22
434 0.18
435 0.15
436 0.18
437 0.21
438 0.28
439 0.31
440 0.32
441 0.33
442 0.35
443 0.36
444 0.36
445 0.33
446 0.27
447 0.29
448 0.31
449 0.35
450 0.33
451 0.31
452 0.34
453 0.4
454 0.46
455 0.5
456 0.55
457 0.57
458 0.6
459 0.69
460 0.7
461 0.71
462 0.73
463 0.7
464 0.72
465 0.66
466 0.66
467 0.6
468 0.57
469 0.53
470 0.48
471 0.53
472 0.44
473 0.42
474 0.4
475 0.39
476 0.36
477 0.31
478 0.26
479 0.17
480 0.19
481 0.19
482 0.22
483 0.23
484 0.29
485 0.4
486 0.46
487 0.52
488 0.55
489 0.63
490 0.69
491 0.75
492 0.78
493 0.75
494 0.77
495 0.79
496 0.78
497 0.68
498 0.65
499 0.61
500 0.56
501 0.52