FuNGI

A0A409VN90

Protein Details

Accession

A0A409VN90

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
134-159	ALHKEKDAPGTKRKRRWDVEEPADEN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
144-148	TKRKR
181-183	KKR

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 14, nucl 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSAPGSPRLVDSYTVPKDILQEFHDLAEEEDVDPFAETASKRQIASRQSDYHNRRFNRVAVDSADAFNADEGKDVEGGYKDAMRLARLEQEELRVKRAIEEKQRKEREEDQMKMDLDKTPPREEIEAAERELAALHKEKDAPGTKRKRRWDVEEPADENVDPNKKDKGEWSKEAIEESAPKKRRSRWDATPAEAAVGETPKRSRWDQTPAPTPDAPPVPIIMNAPGIQQDDKHNRYLTDEELDAVLPATGYAIVTPPPGYAVSVAPRKFMAPAVTEVGGFQIQESSDAAAMAAAAGLAPELPTEIPGVGNLAFFKAEDAQYFAKILKEEDETELSVEEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKAREFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAVLPHLRNLVDCIAHGLSDEQQKVRTMTALGLAALAEAAAPYGIESFDNVLKPLWLGIRLHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTIILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTPQYIKQDILPDFFKAFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKAGVSEIVGRIVNELKDEAEPYRKMVMETITKVVATLGASDIDERLEVRLVDGIIYSFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGIRVKPYLTQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKGIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALSFVFEYVGPQSAYYCDSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASTIVKHLALGVAGLGCEDSMLHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMEAIEAMRVTLGPGVLLSYVLQGLFHPARKVREVYWRIYNALYLGAEDALVPFYPDLGELTEGQNVYDRHPLQVFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.29
4	0.32
5	0.34
6	0.33
7	0.26
8	0.27
9	0.27
10	0.27
11	0.27
12	0.23
13	0.21
14	0.19
15	0.18
16	0.13
17	0.13
18	0.12
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.08
23	0.11
24	0.11
25	0.15
26	0.23
27	0.26
28	0.26
29	0.31
30	0.38
31	0.41
32	0.49
33	0.52
34	0.51
35	0.55
36	0.65
37	0.69
38	0.72
39	0.74
40	0.69
41	0.68
42	0.66
43	0.64
44	0.62
45	0.57
46	0.51
47	0.44
48	0.46
49	0.41
50	0.37
51	0.32
52	0.23
53	0.2
54	0.17
55	0.15
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.13
63	0.13
64	0.14
65	0.14
66	0.15
67	0.14
68	0.17
69	0.18
70	0.17
71	0.17
72	0.18
73	0.25
74	0.24
75	0.28
76	0.26
77	0.32
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.37
82	0.35
83	0.38
84	0.43
85	0.44
86	0.46
87	0.56
88	0.62
89	0.7
90	0.79
91	0.76
92	0.76
93	0.76
94	0.75
95	0.74
96	0.69
97	0.63
98	0.61
99	0.59
100	0.53
101	0.46
102	0.4
103	0.35
104	0.38
105	0.38
106	0.36
107	0.37
108	0.39
109	0.4
110	0.36
111	0.36
112	0.36
113	0.34
114	0.3
115	0.29
116	0.25
117	0.23
118	0.22
119	0.18
120	0.14
121	0.16
122	0.16
123	0.19
124	0.21
125	0.22
126	0.29
127	0.37
128	0.4
129	0.46
130	0.56
131	0.63
132	0.7
133	0.79
134	0.82
135	0.81
136	0.83
137	0.83
138	0.82
139	0.82
140	0.82
141	0.74
142	0.65
143	0.59
144	0.49
145	0.4
146	0.36
147	0.32
148	0.24
149	0.25
150	0.29
151	0.29
152	0.3
153	0.38
154	0.43
155	0.46
156	0.5
157	0.54
158	0.53
159	0.53
160	0.53
161	0.44
162	0.36
163	0.34
164	0.33
165	0.36
166	0.37
167	0.42
168	0.47
169	0.55
170	0.63
171	0.65
172	0.7
173	0.7
174	0.75
175	0.76
176	0.74
177	0.7
178	0.59
179	0.51
180	0.42
181	0.32
182	0.23
183	0.2
184	0.16
185	0.14
186	0.16
187	0.19
188	0.23
189	0.26
190	0.3
191	0.33
192	0.42
193	0.48
194	0.55
195	0.61
196	0.61
197	0.64
198	0.59
199	0.53
200	0.49
201	0.43
202	0.36
203	0.27
204	0.24
205	0.19
206	0.19
207	0.19
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.14
212	0.14
213	0.15
214	0.14
215	0.15
216	0.23
217	0.3
218	0.32
219	0.36
220	0.36
221	0.35
222	0.38
223	0.39
224	0.33
225	0.27
226	0.24
227	0.2
228	0.19
229	0.19
230	0.15
231	0.12
232	0.09
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.11
249	0.16
250	0.23
251	0.23
252	0.23
253	0.24
254	0.24
255	0.23
256	0.24
257	0.2
258	0.15
259	0.18
260	0.2
261	0.2
262	0.19
263	0.18
264	0.17
265	0.14
266	0.11
267	0.09
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.08
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.04
279	0.04
280	0.03
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.02
285	0.02
286	0.02
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.13
314	0.14
315	0.15
316	0.17
317	0.19
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.14
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.12
327	0.16
328	0.16
329	0.18
330	0.21
331	0.26
332	0.28
333	0.36
334	0.43
335	0.45
336	0.51
337	0.51
338	0.49
339	0.51
340	0.5
341	0.47
342	0.47
343	0.45
344	0.44
345	0.47
346	0.46
347	0.44
348	0.5
349	0.52
350	0.48
351	0.46
352	0.46
353	0.5
354	0.56
355	0.53
356	0.44
357	0.35
358	0.33
359	0.31
360	0.29
361	0.24
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.15
368	0.11
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.14
385	0.15
386	0.14
387	0.18
388	0.2
389	0.18
390	0.19
391	0.19
392	0.19
393	0.19
394	0.19
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.15
399	0.16
400	0.18
401	0.17
402	0.18
403	0.2
404	0.2
405	0.17
406	0.16
407	0.14
408	0.14
409	0.15
410	0.14
411	0.13
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.06
417	0.05
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.08
427	0.1
428	0.12
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.15
433	0.15
434	0.13
435	0.11
436	0.08
437	0.08
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.17
458	0.15
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.08
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.03
476	0.03
477	0.04
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.09
483	0.13
484	0.19
485	0.25
486	0.28
487	0.31
488	0.38
489	0.48
490	0.54
491	0.59
492	0.6
493	0.61
494	0.64
495	0.68
496	0.63
497	0.57
498	0.49
499	0.45
500	0.41
501	0.34
502	0.28
503	0.21
504	0.19
505	0.15
506	0.12
507	0.07
508	0.05
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.09
529	0.13
530	0.14
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.15
535	0.15
536	0.13
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.05
546	0.04
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.02
555	0.03
556	0.03
557	0.04
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.1
569	0.2
570	0.21
571	0.22
572	0.22
573	0.22
574	0.2
575	0.21
576	0.22
577	0.13
578	0.13
579	0.12
580	0.11
581	0.11
582	0.1
583	0.09
584	0.06
585	0.04
586	0.03
587	0.04
588	0.03
589	0.04
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.08
595	0.08
596	0.09
597	0.1
598	0.09
599	0.09
600	0.1
601	0.09
602	0.07
603	0.07
604	0.08
605	0.09
606	0.09
607	0.12
608	0.12
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.15
615	0.13
616	0.13
617	0.12
618	0.13
619	0.14
620	0.12
621	0.14
622	0.14
623	0.16
624	0.22
625	0.27
626	0.3
627	0.29
628	0.29
629	0.27
630	0.27
631	0.24
632	0.19
633	0.14
634	0.12
635	0.12
636	0.12
637	0.11
638	0.12
639	0.12
640	0.11
641	0.11
642	0.16
643	0.17
644	0.19
645	0.2
646	0.18
647	0.18
648	0.18
649	0.18
650	0.14
651	0.15
652	0.16
653	0.19
654	0.18
655	0.2
656	0.27
657	0.3
658	0.35
659	0.43
660	0.45
661	0.47
662	0.53
663	0.51
664	0.45
665	0.45
666	0.39
667	0.35
668	0.3
669	0.25
670	0.2
671	0.21
672	0.2
673	0.15
674	0.14
675	0.1
676	0.08
677	0.08
678	0.06
679	0.04
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.07
684	0.07
685	0.06
686	0.07
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.08
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.14
696	0.14
697	0.16
698	0.18
699	0.18
700	0.18
701	0.18
702	0.2
703	0.19
704	0.21
705	0.21
706	0.18
707	0.17
708	0.17
709	0.15
710	0.13
711	0.08
712	0.07
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.06
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.07
736	0.07
737	0.1
738	0.12
739	0.12
740	0.11
741	0.1
742	0.11
743	0.1
744	0.09
745	0.07
746	0.04
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.05
756	0.06
757	0.07
758	0.08
759	0.08
760	0.09
761	0.12
762	0.17
763	0.15
764	0.16
765	0.15
766	0.18
767	0.18
768	0.18
769	0.17
770	0.14
771	0.16
772	0.17
773	0.19
774	0.24
775	0.29
776	0.31
777	0.38
778	0.43
779	0.49
780	0.54
781	0.56
782	0.49
783	0.49
784	0.5
785	0.44
786	0.42
787	0.33
788	0.28
789	0.23
790	0.21
791	0.16
792	0.14
793	0.12
794	0.09
795	0.13
796	0.13
797	0.14
798	0.14
799	0.15
800	0.16
801	0.15
802	0.15
803	0.13
804	0.14
805	0.13
806	0.13
807	0.13
808	0.12
809	0.12
810	0.1
811	0.09
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.06
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.02
835	0.02
836	0.02
837	0.02
838	0.02
839	0.03
840	0.04
841	0.05
842	0.11
843	0.13
844	0.13
845	0.15
846	0.18
847	0.18
848	0.21
849	0.22
850	0.23
851	0.23
852	0.24
853	0.27
854	0.28
855	0.33
856	0.36
857	0.44
858	0.45
859	0.5
860	0.52
861	0.58
862	0.58
863	0.57
864	0.53
865	0.52
866	0.49
867	0.43
868	0.41
869	0.35
870	0.32
871	0.27
872	0.24
873	0.15
874	0.12
875	0.12
876	0.1
877	0.08
878	0.08
879	0.1
880	0.09
881	0.13
882	0.12
883	0.12
884	0.13
885	0.15
886	0.16
887	0.18
888	0.18
889	0.16
890	0.22
891	0.23
892	0.22
893	0.19
894	0.18
895	0.2
896	0.2
897	0.21
898	0.15
899	0.18
900	0.21
901	0.21
902	0.24
903	0.21
904	0.26
905	0.33
906	0.42
907	0.47
908	0.46
909	0.51
910	0.56
911	0.61
912	0.56
913	0.49
914	0.41
915	0.33
916	0.3
917	0.25
918	0.18
919	0.12
920	0.12
921	0.13
922	0.12
923	0.13
924	0.12
925	0.12
926	0.12
927	0.12
928	0.1
929	0.09
930	0.08
931	0.09
932	0.1
933	0.1
934	0.13
935	0.14
936	0.15
937	0.17
938	0.26
939	0.31
940	0.37
941	0.41
942	0.41
943	0.41
944	0.41
945	0.4
946	0.32
947	0.29
948	0.23
949	0.19
950	0.14
951	0.12
952	0.12
953	0.11
954	0.1
955	0.05
956	0.05
957	0.05
958	0.07
959	0.07
960	0.08
961	0.1
962	0.11
963	0.11
964	0.13
965	0.18
966	0.19
967	0.2
968	0.22
969	0.22
970	0.22
971	0.23
972	0.23
973	0.21
974	0.21
975	0.24
976	0.22
977	0.22
978	0.22
979	0.21
980	0.2
981	0.18
982	0.16
983	0.13
984	0.14
985	0.16
986	0.16
987	0.16
988	0.16
989	0.14
990	0.16
991	0.15
992	0.16
993	0.13
994	0.12
995	0.12
996	0.12
997	0.14
998	0.13
999	0.12
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.08
1007	0.07
1008	0.07
1009	0.08
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.07
1013	0.07
1014	0.11
1015	0.14
1016	0.16
1017	0.2
1018	0.2
1019	0.2
1020	0.21
1021	0.28
1022	0.28
1023	0.26
1024	0.27
1025	0.25
1026	0.25
1027	0.24
1028	0.23
1029	0.17
1030	0.13
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.07
1034	0.06
1035	0.06
1036	0.05
1037	0.04
1038	0.04
1039	0.04
1040	0.04
1041	0.06
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.14
1047	0.2
1048	0.19
1049	0.19
1050	0.18
1051	0.21
1052	0.22
1053	0.22
1054	0.18
1055	0.19
1056	0.26
1057	0.27
1058	0.26
1059	0.24
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.22
1063	0.17
1064	0.09
1065	0.07
1066	0.07
1067	0.06
1068	0.07
1069	0.06
1070	0.05
1071	0.04
1072	0.04
1073	0.05
1074	0.06
1075	0.06
1076	0.06
1077	0.06
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.07
1081	0.07
1082	0.07
1083	0.08
1084	0.07
1085	0.08
1086	0.07
1087	0.14
1088	0.18
1089	0.21
1090	0.25
1091	0.29
1092	0.35
1093	0.4
1094	0.43
1095	0.4
1096	0.47
1097	0.49
1098	0.5
1099	0.55
1100	0.53
1101	0.5
1102	0.48
1103	0.44
1104	0.34
1105	0.31
1106	0.25
1107	0.16
1108	0.14
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.1
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.08
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.07
1119	0.08
1120	0.08
1121	0.09
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.14
1125	0.17
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.21
1129	0.2
1130	0.21
1131	0.29
1132	0.28
1133	0.29

A0A409VN90

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer