Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409WEN4

Protein Details
Accession A0A409WEN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPARLSRRRRSSHAIFTPAHydrophilic
87-115LENPTQQPTRKRCPPGKRRSQGYIPRPPNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPPARLSRRRRSSHAIFTPARPGTYGIPASARPVQFAPNVTPVTYTDPEEDDIDALAAAVSSGSLDPSALDSLSLSLDDNSSLFPPLENPTQQPTRKRCPPGKRRSQGYIPRPPNAFMLFRADFVKQKHVPGSIETNHGSLSKIIGTCWHNLPDSERRVWQNRAKIEKAKHKAQYPDYRFRPVHNKEKKAAAAAARAEADARTSSCSVNLTKHKQFADDEDERRCEDISQLLLSGKKGEELALAMKELDRQRERDTSASVYGSRDVSRAQTPSSGGVGLLPQVQHVTHVVAPQPVFNPNAFGGNGWASGFAMHRRSSSVPLPGDFSFGGMGGAGIALPSIPPLGFHSRPSSPLRISNQHFNAPTPFNNGFSNLPSSNSSSSFTTLNSNTSTLPSSTLSNLSSTLNNNNSRSLLGLRRPSSAQAILRRSWTMPGFEAFDNSAYMPHPAGYEEGVGMMPFDLNMNMGFGGMMGMNGIGAGMNGMGGGMNGMGGVFGGVGVDMNSYPDDEPLPEPETSLFESGFSLSGSNSSNTSASGGNGTASECPLSSPKVDQGVDPAAPISMPITQGVGMGMSPMHTPLDAVSPLTCDGSSAGTPVAGSVDEGSLDSIDPSMFGAHGMDGAHGLNGMGSYDTMTSGVGYGYHDVNVGVGGYGSEMGMGMEQYVC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.79
3 0.72
4 0.68
5 0.69
6 0.62
7 0.53
8 0.43
9 0.37
10 0.31
11 0.35
12 0.32
13 0.25
14 0.26
15 0.26
16 0.3
17 0.34
18 0.31
19 0.26
20 0.26
21 0.29
22 0.29
23 0.32
24 0.31
25 0.31
26 0.33
27 0.3
28 0.3
29 0.28
30 0.32
31 0.31
32 0.29
33 0.24
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.17
39 0.16
40 0.13
41 0.1
42 0.08
43 0.06
44 0.05
45 0.04
46 0.03
47 0.03
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.05
54 0.07
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.16
74 0.21
75 0.22
76 0.24
77 0.3
78 0.39
79 0.44
80 0.52
81 0.55
82 0.6
83 0.67
84 0.74
85 0.77
86 0.79
87 0.85
88 0.87
89 0.89
90 0.89
91 0.87
92 0.85
93 0.85
94 0.85
95 0.83
96 0.83
97 0.77
98 0.74
99 0.69
100 0.62
101 0.56
102 0.49
103 0.41
104 0.32
105 0.34
106 0.28
107 0.28
108 0.29
109 0.26
110 0.27
111 0.28
112 0.36
113 0.3
114 0.33
115 0.36
116 0.37
117 0.37
118 0.36
119 0.41
120 0.34
121 0.36
122 0.33
123 0.3
124 0.27
125 0.26
126 0.23
127 0.16
128 0.15
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.17
133 0.19
134 0.22
135 0.24
136 0.26
137 0.23
138 0.24
139 0.29
140 0.32
141 0.35
142 0.35
143 0.37
144 0.4
145 0.45
146 0.53
147 0.54
148 0.53
149 0.56
150 0.61
151 0.61
152 0.63
153 0.66
154 0.69
155 0.69
156 0.7
157 0.67
158 0.66
159 0.68
160 0.7
161 0.72
162 0.7
163 0.73
164 0.68
165 0.7
166 0.65
167 0.61
168 0.63
169 0.59
170 0.62
171 0.62
172 0.64
173 0.59
174 0.66
175 0.62
176 0.55
177 0.51
178 0.43
179 0.38
180 0.33
181 0.31
182 0.24
183 0.23
184 0.2
185 0.16
186 0.14
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.15
194 0.15
195 0.21
196 0.29
197 0.33
198 0.37
199 0.42
200 0.42
201 0.42
202 0.41
203 0.39
204 0.39
205 0.38
206 0.37
207 0.36
208 0.37
209 0.35
210 0.35
211 0.3
212 0.22
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.13
234 0.14
235 0.21
236 0.21
237 0.23
238 0.27
239 0.31
240 0.34
241 0.31
242 0.32
243 0.27
244 0.26
245 0.25
246 0.22
247 0.19
248 0.18
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.13
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.13
302 0.14
303 0.17
304 0.19
305 0.22
306 0.2
307 0.2
308 0.23
309 0.21
310 0.22
311 0.18
312 0.16
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.05
317 0.05
318 0.03
319 0.03
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.02
325 0.02
326 0.02
327 0.02
328 0.03
329 0.06
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.19
334 0.2
335 0.24
336 0.27
337 0.28
338 0.24
339 0.29
340 0.32
341 0.36
342 0.37
343 0.41
344 0.4
345 0.41
346 0.4
347 0.35
348 0.34
349 0.29
350 0.27
351 0.25
352 0.23
353 0.21
354 0.21
355 0.22
356 0.19
357 0.18
358 0.21
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.15
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.16
371 0.15
372 0.16
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.11
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.17
391 0.21
392 0.24
393 0.25
394 0.25
395 0.24
396 0.23
397 0.22
398 0.21
399 0.2
400 0.21
401 0.27
402 0.28
403 0.29
404 0.3
405 0.3
406 0.3
407 0.29
408 0.29
409 0.29
410 0.32
411 0.31
412 0.32
413 0.32
414 0.3
415 0.3
416 0.26
417 0.21
418 0.18
419 0.18
420 0.19
421 0.18
422 0.18
423 0.15
424 0.14
425 0.13
426 0.11
427 0.11
428 0.08
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.02
463 0.02
464 0.02
465 0.02
466 0.02
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.02
473 0.02
474 0.02
475 0.02
476 0.02
477 0.02
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.1
494 0.11
495 0.14
496 0.16
497 0.15
498 0.15
499 0.16
500 0.18
501 0.18
502 0.18
503 0.14
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.09
509 0.08
510 0.06
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.12
517 0.12
518 0.13
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.1
528 0.1
529 0.08
530 0.09
531 0.11
532 0.13
533 0.14
534 0.15
535 0.19
536 0.25
537 0.26
538 0.24
539 0.27
540 0.29
541 0.28
542 0.25
543 0.21
544 0.15
545 0.14
546 0.14
547 0.1
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.08
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.12
567 0.11
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.14
572 0.15
573 0.14
574 0.1
575 0.1
576 0.12
577 0.12
578 0.11
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.08
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.06
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.05
613 0.06
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.1
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.09
634 0.06
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05