Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409W1G6

Protein Details
Accession A0A409W1G6    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-133IAKPSDQKDKEKKEKKAKRRPGRRGSKAVPGEBasic
152-178ASGEAAKPKKKKKKAARKAKKPAEESABasic
194-217SATEAKKPRARKPKAPRPARPAGEBasic
254-274VSARIVRRRWGQPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-128KDKEKKEKKAKRRPGRRGSK
156-174AAKPKKKKKKAARKAKKPA
198-214AKKPRARKPKAPRPARP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDARDAPVTENGAPQVAQEKVEEAPGFKVFAGNLAYTTTNDGLKAFFAPAGGEILSAQVILRGTRSAGYGFVAFATAEAAQKAVDALDKKELDGRQVIVEIAKPSDQKDKEKKEKKAKRRPGRRGSKAVPGEVSEAEANGDGAKTDDAAPASGEAAKPKKKKKKAARKAKKPAEESAAASGTDAPAPAEGETSATEAKKPRARKPKAPRPARPAGEDPAGEPSKNMLFVANLGFSVDDAALSALFTEAGINVVSARIVRRRWGQPRKSKGYGFVDVGSEEEQKKAIAALEGKDVGGRAIAVKVAVNTPAPEEASADAPAPAATTDGANPATTTATTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.17
6 0.15
7 0.16
8 0.15
9 0.2
10 0.2
11 0.17
12 0.19
13 0.19
14 0.19
15 0.17
16 0.18
17 0.13
18 0.17
19 0.17
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.15
25 0.19
26 0.17
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.11
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.24
79 0.24
80 0.23
81 0.24
82 0.23
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.13
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.23
94 0.25
95 0.33
96 0.42
97 0.51
98 0.6
99 0.69
100 0.77
101 0.79
102 0.87
103 0.89
104 0.9
105 0.91
106 0.91
107 0.92
108 0.93
109 0.93
110 0.94
111 0.91
112 0.89
113 0.82
114 0.8
115 0.72
116 0.62
117 0.52
118 0.42
119 0.36
120 0.26
121 0.24
122 0.14
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.14
144 0.21
145 0.27
146 0.37
147 0.47
148 0.55
149 0.65
150 0.73
151 0.79
152 0.83
153 0.88
154 0.9
155 0.91
156 0.94
157 0.92
158 0.88
159 0.8
160 0.73
161 0.66
162 0.57
163 0.46
164 0.38
165 0.3
166 0.22
167 0.18
168 0.15
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.13
185 0.19
186 0.23
187 0.29
188 0.37
189 0.46
190 0.53
191 0.62
192 0.7
193 0.75
194 0.8
195 0.85
196 0.84
197 0.82
198 0.84
199 0.77
200 0.7
201 0.63
202 0.57
203 0.5
204 0.41
205 0.33
206 0.31
207 0.29
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.08
244 0.13
245 0.14
246 0.19
247 0.27
248 0.36
249 0.47
250 0.57
251 0.65
252 0.7
253 0.8
254 0.84
255 0.83
256 0.76
257 0.73
258 0.7
259 0.64
260 0.56
261 0.47
262 0.39
263 0.32
264 0.31
265 0.25
266 0.21
267 0.17
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.15
277 0.19
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.18
282 0.14
283 0.11
284 0.1
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.16
302 0.16
303 0.14
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.14