FuNGI

A0A409Y8B5

Protein Details

Accession

A0A409Y8B5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MSNNSRQSKSNRKQPQDQNSSRRPNAW	Hydrophilic
38-61	SSANAPPPRQQQQQQQQHHPQPSN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 4.832, mito 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD

Amino Acid Sequences

MSNNSRQSKSNRKQPQDQNSSRRPNAWGSGARASPTFSSANAPPPRQQQQQQQQHHPQPSNQPHNFQSLTQTNGSRTDNSRDRVLQSLSGLTGTTVTLTNKSGQRYEGVVGSTSGEGDTPGVTLKDVKEVGVPGAPLKDSLFIASANIDTFTSGPADARPTNGDSFRTDTDISQKKGLGGKERELQAWAPSGDPGSALGGLGDDDTFALGSNSGASWDQFTANEQLFGVKASFDEDVYTTKLDRNAPDFKERERKAQKIANEIINAATNNPHIAEERGHVIDDSGVNEEDRYGAVVRGQNAYIPPGARKAANIPPPAASQPAQAPESNAPKAEIPKVSVNGPDGTSVAAHAQSPPSSKAASPAPTASSATAPKPPADPLPAFRDFVANEKQRLTQKRQTLVKNDMDKRMAELVKFSQSFKLNKPIPEDLVPILAKDEEKQKLIKEKAKQDAASGDARAIGPSTPATASRGVAVVGNKALPKPAASPADGKPAAPPATAALKKASATGTTSDPPNKPTTTPIPPTTGTTSAATSTSTKKISMVIQSIPPFKGGKAKPAAASTSNTPTAAPGTSNGPSAPTINTNTAGSNGGVNRGGSTLATPISPNTAANRLNVNASSFRPNPKANAFNPVAPTPTKGGPPNAAAASNSVSPKPKQDSPATPNPFFGTRPMKKSAPVHVKDDFNPFKHNKVVDASQVSAMWPYSGKRYMQMFPAPQHPPAQHPPHMGPPMPPPMPPPSYEEDSAAQAATRGAYVYAYPPYGYPAQPMMPGMAPPGPPGAYMPGPYMQHMPYPPGMPPPNVAMYSPAMGQMPPPQAYMPPPPGAYPPPPNGVGPRPSMPPTPIPAHAHPYYHQSPQLQHAYPMMVPPHPPPNMPPHGYDGGPAPPVQMSGHA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.89
3	0.89
4	0.89
5	0.89
6	0.88
7	0.9
8	0.83
9	0.76
10	0.69
11	0.64
12	0.59
13	0.57
14	0.52
15	0.48
16	0.51
17	0.49
18	0.46
19	0.41
20	0.38
21	0.31
22	0.29
23	0.24
24	0.18
25	0.21
26	0.22
27	0.31
28	0.36
29	0.39
30	0.41
31	0.49
32	0.56
33	0.59
34	0.64
35	0.65
36	0.69
37	0.77
38	0.8
39	0.82
40	0.84
41	0.85
42	0.87
43	0.8
44	0.75
45	0.75
46	0.77
47	0.77
48	0.71
49	0.68
50	0.61
51	0.64
52	0.6
53	0.5
54	0.47
55	0.41
56	0.41
57	0.4
58	0.4
59	0.34
60	0.38
61	0.4
62	0.36
63	0.36
64	0.4
65	0.44
66	0.45
67	0.49
68	0.47
69	0.47
70	0.48
71	0.46
72	0.39
73	0.33
74	0.32
75	0.26
76	0.23
77	0.2
78	0.14
79	0.12
80	0.1
81	0.09
82	0.09
83	0.1
84	0.12
85	0.14
86	0.2
87	0.23
88	0.26
89	0.27
90	0.27
91	0.28
92	0.28
93	0.29
94	0.25
95	0.23
96	0.2
97	0.18
98	0.19
99	0.16
100	0.14
101	0.12
102	0.09
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.1
111	0.11
112	0.16
113	0.16
114	0.17
115	0.18
116	0.18
117	0.2
118	0.19
119	0.18
120	0.14
121	0.15
122	0.15
123	0.13
124	0.13
125	0.14
126	0.12
127	0.13
128	0.12
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.09
134	0.1
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.14
144	0.14
145	0.16
146	0.18
147	0.2
148	0.24
149	0.26
150	0.26
151	0.24
152	0.28
153	0.28
154	0.28
155	0.26
156	0.23
157	0.31
158	0.36
159	0.36
160	0.35
161	0.34
162	0.34
163	0.38
164	0.4
165	0.4
166	0.37
167	0.4
168	0.44
169	0.45
170	0.42
171	0.4
172	0.37
173	0.29
174	0.29
175	0.24
176	0.18
177	0.16
178	0.16
179	0.14
180	0.13
181	0.11
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.08
204	0.09
205	0.1
206	0.09
207	0.12
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.13
212	0.13
213	0.12
214	0.13
215	0.11
216	0.07
217	0.06
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.12
225	0.13
226	0.11
227	0.14
228	0.17
229	0.2
230	0.21
231	0.25
232	0.31
233	0.34
234	0.41
235	0.41
236	0.43
237	0.51
238	0.5
239	0.55
240	0.56
241	0.57
242	0.56
243	0.59
244	0.56
245	0.55
246	0.57
247	0.51
248	0.44
249	0.4
250	0.34
251	0.3
252	0.26
253	0.18
254	0.15
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.15
264	0.15
265	0.14
266	0.13
267	0.12
268	0.13
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.1
282	0.12
283	0.13
284	0.15
285	0.15
286	0.15
287	0.14
288	0.16
289	0.14
290	0.13
291	0.12
292	0.13
293	0.15
294	0.13
295	0.14
296	0.18
297	0.23
298	0.29
299	0.3
300	0.28
301	0.29
302	0.3
303	0.31
304	0.28
305	0.21
306	0.16
307	0.17
308	0.19
309	0.19
310	0.17
311	0.19
312	0.21
313	0.25
314	0.24
315	0.22
316	0.2
317	0.2
318	0.22
319	0.24
320	0.2
321	0.18
322	0.21
323	0.22
324	0.22
325	0.22
326	0.21
327	0.19
328	0.18
329	0.16
330	0.12
331	0.11
332	0.1
333	0.09
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.11
341	0.12
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.15
346	0.18
347	0.19
348	0.19
349	0.18
350	0.18
351	0.18
352	0.19
353	0.17
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.17
358	0.17
359	0.17
360	0.17
361	0.18
362	0.17
363	0.2
364	0.2
365	0.19
366	0.25
367	0.25
368	0.25
369	0.24
370	0.24
371	0.2
372	0.23
373	0.28
374	0.24
375	0.23
376	0.24
377	0.28
378	0.33
379	0.38
380	0.42
381	0.41
382	0.45
383	0.51
384	0.56
385	0.57
386	0.57
387	0.58
388	0.57
389	0.59
390	0.56
391	0.52
392	0.47
393	0.42
394	0.38
395	0.36
396	0.3
397	0.21
398	0.2
399	0.18
400	0.21
401	0.22
402	0.21
403	0.2
404	0.23
405	0.26
406	0.27
407	0.34
408	0.32
409	0.34
410	0.38
411	0.35
412	0.33
413	0.32
414	0.31
415	0.22
416	0.22
417	0.19
418	0.14
419	0.13
420	0.11
421	0.1
422	0.09
423	0.15
424	0.13
425	0.15
426	0.16
427	0.18
428	0.26
429	0.31
430	0.36
431	0.36
432	0.42
433	0.47
434	0.5
435	0.48
436	0.41
437	0.37
438	0.34
439	0.29
440	0.21
441	0.15
442	0.12
443	0.11
444	0.1
445	0.09
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.09
466	0.07
467	0.08
468	0.09
469	0.14
470	0.15
471	0.16
472	0.19
473	0.2
474	0.28
475	0.27
476	0.25
477	0.21
478	0.23
479	0.23
480	0.19
481	0.18
482	0.11
483	0.18
484	0.18
485	0.19
486	0.16
487	0.16
488	0.16
489	0.18
490	0.16
491	0.1
492	0.11
493	0.12
494	0.14
495	0.14
496	0.16
497	0.2
498	0.2
499	0.22
500	0.24
501	0.23
502	0.21
503	0.24
504	0.28
505	0.3
506	0.34
507	0.33
508	0.34
509	0.33
510	0.35
511	0.34
512	0.29
513	0.25
514	0.21
515	0.19
516	0.16
517	0.16
518	0.14
519	0.13
520	0.14
521	0.16
522	0.16
523	0.16
524	0.15
525	0.17
526	0.19
527	0.21
528	0.21
529	0.19
530	0.23
531	0.26
532	0.28
533	0.26
534	0.25
535	0.21
536	0.19
537	0.26
538	0.22
539	0.27
540	0.29
541	0.31
542	0.31
543	0.33
544	0.35
545	0.28
546	0.29
547	0.24
548	0.24
549	0.23
550	0.2
551	0.19
552	0.17
553	0.16
554	0.14
555	0.12
556	0.08
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.12
561	0.11
562	0.12
563	0.13
564	0.13
565	0.12
566	0.14
567	0.15
568	0.16
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.15
573	0.12
574	0.12
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.07
583	0.08
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.11
593	0.16
594	0.17
595	0.19
596	0.21
597	0.19
598	0.2
599	0.2
600	0.2
601	0.17
602	0.18
603	0.23
604	0.23
605	0.27
606	0.3
607	0.31
608	0.33
609	0.37
610	0.42
611	0.37
612	0.43
613	0.4
614	0.37
615	0.39
616	0.36
617	0.32
618	0.25
619	0.26
620	0.21
621	0.21
622	0.22
623	0.21
624	0.23
625	0.24
626	0.25
627	0.26
628	0.24
629	0.22
630	0.19
631	0.18
632	0.17
633	0.17
634	0.17
635	0.16
636	0.18
637	0.19
638	0.25
639	0.29
640	0.31
641	0.34
642	0.4
643	0.47
644	0.52
645	0.61
646	0.62
647	0.57
648	0.54
649	0.5
650	0.45
651	0.36
652	0.35
653	0.35
654	0.34
655	0.38
656	0.42
657	0.42
658	0.46
659	0.5
660	0.53
661	0.54
662	0.51
663	0.52
664	0.51
665	0.53
666	0.5
667	0.56
668	0.51
669	0.42
670	0.47
671	0.43
672	0.42
673	0.44
674	0.42
675	0.35
676	0.34
677	0.35
678	0.32
679	0.34
680	0.31
681	0.27
682	0.26
683	0.24
684	0.2
685	0.17
686	0.12
687	0.1
688	0.1
689	0.14
690	0.18
691	0.18
692	0.22
693	0.27
694	0.29
695	0.33
696	0.39
697	0.38
698	0.37
699	0.44
700	0.42
701	0.4
702	0.42
703	0.38
704	0.38
705	0.43
706	0.47
707	0.44
708	0.46
709	0.47
710	0.5
711	0.53
712	0.47
713	0.41
714	0.4
715	0.43
716	0.39
717	0.36
718	0.32
719	0.35
720	0.36
721	0.35
722	0.34
723	0.32
724	0.36
725	0.36
726	0.35
727	0.3
728	0.3
729	0.29
730	0.24
731	0.17
732	0.13
733	0.12
734	0.1
735	0.08
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.07
740	0.09
741	0.11
742	0.12
743	0.12
744	0.12
745	0.15
746	0.18
747	0.18
748	0.18
749	0.19
750	0.2
751	0.21
752	0.21
753	0.19
754	0.17
755	0.17
756	0.16
757	0.16
758	0.15
759	0.15
760	0.17
761	0.15
762	0.14
763	0.15
764	0.18
765	0.16
766	0.17
767	0.18
768	0.2
769	0.21
770	0.22
771	0.25
772	0.21
773	0.24
774	0.24
775	0.25
776	0.24
777	0.25
778	0.24
779	0.3
780	0.32
781	0.29
782	0.3
783	0.3
784	0.32
785	0.31
786	0.3
787	0.24
788	0.23
789	0.23
790	0.21
791	0.18
792	0.14
793	0.14
794	0.15
795	0.19
796	0.22
797	0.22
798	0.23
799	0.22
800	0.24
801	0.28
802	0.34
803	0.32
804	0.31
805	0.3
806	0.31
807	0.34
808	0.38
809	0.4
810	0.39
811	0.39
812	0.4
813	0.41
814	0.41
815	0.43
816	0.44
817	0.42
818	0.4
819	0.38
820	0.38
821	0.4
822	0.42
823	0.4
824	0.39
825	0.4
826	0.4
827	0.43
828	0.45
829	0.45
830	0.49
831	0.48
832	0.46
833	0.42
834	0.45
835	0.43
836	0.42
837	0.43
838	0.39
839	0.4
840	0.45
841	0.52
842	0.44
843	0.42
844	0.39
845	0.37
846	0.34
847	0.35
848	0.3
849	0.24
850	0.24
851	0.27
852	0.34
853	0.33
854	0.33
855	0.33
856	0.4
857	0.47
858	0.47
859	0.45
860	0.43
861	0.45
862	0.44
863	0.41
864	0.34
865	0.29
866	0.28
867	0.25
868	0.19
869	0.16
870	0.18

A0A409Y8B5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer