Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YM09

Protein Details
Accession A0A409YM09    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-79APSSTATPPPKPKPIPKPSVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDNNPPTAEPLTTPQDDADRIRLKRLAKLQNAASSSSPASSSPSATPGTQSPRPPSAAPSSTATPPPKPKPIPKPSVATPPSVTPPPRQAAGLVKKKPTVVKLDIVAWEHETISTVLKVTLDHQVAEKSGYDIVWLKHLAAELVAESIPNDKLTLDILDRLLIARLELNPQVMTDELDYLPVMVSLPPQQTVFEYLVGCWKRLNAARSAVIKKNYTPVDRENAEKRLEKIRTLIISYAGLTLQEPEMFPQPTGRALGPPELVAPLLSLSALSAPLSSATPNPNTLTPSDIEQFLQDLAHRFEPDNEIDDVLGPVVKGLLFHPSLFRPEGLGGGDASWRGVISGLEVLVSIKSIATMITRMPEWIPENATAHNFEQFSLMGPLCRLGVFYPDWPGIAQTYFSEPERRTRDDVESSFASLRGTIKSLQSSLFQIFNTLVRASAESREAVLDYFARVISLNVKRAGLQVDPATVASDSFMYNMQSILLRFAEPFMDANFTKMDRIDPLYFVNCSRIDLKEETRIKATSEEAAKWDEANRKPGAPAPNFISNIFFLAIAMSHYGYLKTIQTYNNLNKHYDELQRHLDMLNGDGSWMGSPLQARTEAAIKHVKKEQAKIRSQQLAYDTGLLEPELMFRSIGFTNFLSTWLIRQVDPKKTHPNPLVTLPLPNEVPMSFRVLPEYIVEDIVDYLYYAVQTSPEKFEMAGKLELMTFVLTFLTSTWYIKNPFLKSKINDVLFMSIWGYGRERNGILGNMLNTHPLALKQLMPALMHFYIEVEQTGASSQFYDKFNARRNISYILKVVWDNPAHREALALEAKNVDKFVRFVNLMINDVTYLMDESLSELTQIHNIQVEMDDKETWSAQPQEYRREREGTLRSLERHASGYTTLGRSTVELLKIFTAETKAPFMMPEIVDRLAAMLDYNLQALVGPRCQDLKVREPEKLKFNPRALLADIIQVFLNLSDQPTFIKAVAGDGRSYSKELFDRAADIAIRRTIKPESEIALLRAFVVKVEEAKANLEAEEDLGEVPDEFLDPLMFTVMKEPVLLPSSKTILDLSTIKSHLLSDSKDPFNRAPLKIEDIVPVPELKARIEEFLIERRNRNKIMDAPPLEPLESTNAMDTSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.28
4 0.3
5 0.31
6 0.35
7 0.37
8 0.36
9 0.42
10 0.45
11 0.44
12 0.49
13 0.56
14 0.57
15 0.56
16 0.62
17 0.62
18 0.65
19 0.64
20 0.58
21 0.5
22 0.43
23 0.36
24 0.3
25 0.25
26 0.18
27 0.21
28 0.2
29 0.22
30 0.2
31 0.23
32 0.24
33 0.23
34 0.26
35 0.27
36 0.33
37 0.36
38 0.41
39 0.44
40 0.47
41 0.5
42 0.48
43 0.47
44 0.49
45 0.46
46 0.43
47 0.41
48 0.39
49 0.39
50 0.46
51 0.45
52 0.44
53 0.5
54 0.55
55 0.6
56 0.65
57 0.71
58 0.75
59 0.81
60 0.82
61 0.78
62 0.78
63 0.73
64 0.76
65 0.68
66 0.62
67 0.53
68 0.49
69 0.48
70 0.47
71 0.45
72 0.4
73 0.45
74 0.44
75 0.43
76 0.4
77 0.38
78 0.41
79 0.49
80 0.53
81 0.51
82 0.52
83 0.54
84 0.57
85 0.6
86 0.55
87 0.53
88 0.48
89 0.47
90 0.44
91 0.46
92 0.45
93 0.41
94 0.38
95 0.31
96 0.27
97 0.22
98 0.19
99 0.17
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.2
109 0.18
110 0.18
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.22
115 0.2
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.16
122 0.19
123 0.19
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.16
128 0.12
129 0.12
130 0.08
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.14
162 0.11
163 0.12
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.07
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.19
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.19
188 0.19
189 0.22
190 0.27
191 0.3
192 0.27
193 0.31
194 0.36
195 0.43
196 0.49
197 0.48
198 0.48
199 0.47
200 0.44
201 0.47
202 0.47
203 0.43
204 0.41
205 0.4
206 0.43
207 0.42
208 0.47
209 0.45
210 0.44
211 0.45
212 0.44
213 0.42
214 0.44
215 0.44
216 0.4
217 0.38
218 0.39
219 0.37
220 0.35
221 0.33
222 0.25
223 0.24
224 0.23
225 0.2
226 0.14
227 0.11
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.2
241 0.18
242 0.16
243 0.17
244 0.21
245 0.18
246 0.18
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.11
251 0.1
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.09
266 0.12
267 0.14
268 0.16
269 0.18
270 0.18
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.17
275 0.19
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.2
291 0.2
292 0.21
293 0.18
294 0.16
295 0.15
296 0.15
297 0.13
298 0.1
299 0.09
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.14
311 0.18
312 0.18
313 0.18
314 0.15
315 0.14
316 0.15
317 0.13
318 0.13
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.12
350 0.13
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.18
355 0.18
356 0.19
357 0.19
358 0.17
359 0.19
360 0.17
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.06
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.13
381 0.13
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.07
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.17
390 0.17
391 0.25
392 0.3
393 0.33
394 0.33
395 0.35
396 0.39
397 0.4
398 0.41
399 0.37
400 0.32
401 0.3
402 0.27
403 0.24
404 0.19
405 0.14
406 0.14
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.12
411 0.14
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.11
424 0.09
425 0.08
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.13
444 0.16
445 0.19
446 0.19
447 0.2
448 0.2
449 0.21
450 0.22
451 0.15
452 0.14
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.11
457 0.1
458 0.08
459 0.08
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.08
479 0.06
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.11
488 0.09
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.14
493 0.15
494 0.15
495 0.15
496 0.17
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.16
502 0.18
503 0.2
504 0.25
505 0.28
506 0.28
507 0.28
508 0.28
509 0.25
510 0.24
511 0.23
512 0.18
513 0.17
514 0.16
515 0.15
516 0.16
517 0.16
518 0.14
519 0.18
520 0.21
521 0.21
522 0.25
523 0.24
524 0.23
525 0.24
526 0.28
527 0.32
528 0.25
529 0.26
530 0.25
531 0.29
532 0.29
533 0.29
534 0.26
535 0.18
536 0.18
537 0.16
538 0.12
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.09
553 0.1
554 0.13
555 0.19
556 0.24
557 0.3
558 0.3
559 0.3
560 0.28
561 0.3
562 0.31
563 0.32
564 0.28
565 0.26
566 0.28
567 0.27
568 0.27
569 0.25
570 0.22
571 0.16
572 0.15
573 0.12
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.05
579 0.05
580 0.04
581 0.04
582 0.05
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.08
588 0.11
589 0.1
590 0.13
591 0.21
592 0.2
593 0.23
594 0.27
595 0.32
596 0.31
597 0.38
598 0.42
599 0.44
600 0.49
601 0.51
602 0.53
603 0.55
604 0.52
605 0.47
606 0.42
607 0.35
608 0.3
609 0.27
610 0.2
611 0.13
612 0.13
613 0.11
614 0.09
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.1
625 0.09
626 0.1
627 0.11
628 0.12
629 0.1
630 0.09
631 0.1
632 0.12
633 0.13
634 0.11
635 0.18
636 0.24
637 0.31
638 0.36
639 0.4
640 0.47
641 0.49
642 0.56
643 0.54
644 0.53
645 0.47
646 0.46
647 0.45
648 0.35
649 0.35
650 0.28
651 0.25
652 0.2
653 0.18
654 0.16
655 0.11
656 0.12
657 0.1
658 0.15
659 0.14
660 0.14
661 0.16
662 0.15
663 0.16
664 0.15
665 0.16
666 0.1
667 0.1
668 0.09
669 0.08
670 0.07
671 0.07
672 0.06
673 0.04
674 0.04
675 0.03
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.06
680 0.07
681 0.09
682 0.11
683 0.12
684 0.13
685 0.12
686 0.15
687 0.16
688 0.18
689 0.17
690 0.14
691 0.14
692 0.14
693 0.13
694 0.11
695 0.09
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.07
703 0.07
704 0.08
705 0.1
706 0.13
707 0.15
708 0.19
709 0.25
710 0.25
711 0.31
712 0.35
713 0.4
714 0.4
715 0.46
716 0.5
717 0.44
718 0.42
719 0.37
720 0.35
721 0.28
722 0.26
723 0.18
724 0.12
725 0.11
726 0.11
727 0.11
728 0.1
729 0.11
730 0.12
731 0.12
732 0.12
733 0.14
734 0.13
735 0.13
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.12
740 0.11
741 0.1
742 0.1
743 0.09
744 0.08
745 0.1
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.15
754 0.14
755 0.13
756 0.12
757 0.11
758 0.1
759 0.1
760 0.1
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.07
765 0.06
766 0.05
767 0.06
768 0.07
769 0.11
770 0.12
771 0.15
772 0.18
773 0.24
774 0.33
775 0.4
776 0.42
777 0.4
778 0.42
779 0.46
780 0.45
781 0.42
782 0.34
783 0.28
784 0.27
785 0.25
786 0.23
787 0.22
788 0.22
789 0.21
790 0.22
791 0.24
792 0.22
793 0.22
794 0.21
795 0.15
796 0.19
797 0.21
798 0.18
799 0.16
800 0.19
801 0.19
802 0.19
803 0.2
804 0.14
805 0.11
806 0.12
807 0.13
808 0.15
809 0.15
810 0.15
811 0.2
812 0.21
813 0.21
814 0.2
815 0.19
816 0.14
817 0.14
818 0.13
819 0.08
820 0.07
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.06
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.11
831 0.11
832 0.1
833 0.11
834 0.11
835 0.11
836 0.12
837 0.14
838 0.12
839 0.13
840 0.13
841 0.11
842 0.13
843 0.13
844 0.12
845 0.14
846 0.17
847 0.17
848 0.25
849 0.28
850 0.37
851 0.44
852 0.5
853 0.49
854 0.49
855 0.49
856 0.5
857 0.52
858 0.47
859 0.46
860 0.44
861 0.43
862 0.42
863 0.43
864 0.35
865 0.32
866 0.27
867 0.22
868 0.19
869 0.19
870 0.19
871 0.19
872 0.17
873 0.15
874 0.15
875 0.14
876 0.17
877 0.18
878 0.17
879 0.16
880 0.17
881 0.18
882 0.18
883 0.17
884 0.15
885 0.14
886 0.13
887 0.14
888 0.16
889 0.16
890 0.15
891 0.16
892 0.16
893 0.18
894 0.17
895 0.17
896 0.17
897 0.18
898 0.17
899 0.17
900 0.15
901 0.1
902 0.1
903 0.07
904 0.05
905 0.06
906 0.06
907 0.07
908 0.06
909 0.06
910 0.06
911 0.09
912 0.11
913 0.12
914 0.13
915 0.14
916 0.16
917 0.18
918 0.23
919 0.26
920 0.33
921 0.41
922 0.42
923 0.47
924 0.51
925 0.56
926 0.59
927 0.62
928 0.61
929 0.6
930 0.61
931 0.6
932 0.56
933 0.55
934 0.48
935 0.43
936 0.35
937 0.32
938 0.28
939 0.24
940 0.21
941 0.17
942 0.15
943 0.11
944 0.12
945 0.07
946 0.08
947 0.08
948 0.08
949 0.1
950 0.11
951 0.12
952 0.11
953 0.13
954 0.11
955 0.15
956 0.19
957 0.2
958 0.19
959 0.19
960 0.22
961 0.22
962 0.24
963 0.2
964 0.2
965 0.21
966 0.23
967 0.24
968 0.22
969 0.22
970 0.21
971 0.23
972 0.2
973 0.2
974 0.21
975 0.24
976 0.25
977 0.23
978 0.26
979 0.27
980 0.28
981 0.3
982 0.3
983 0.28
984 0.3
985 0.31
986 0.29
987 0.28
988 0.25
989 0.22
990 0.21
991 0.17
992 0.13
993 0.13
994 0.12
995 0.13
996 0.16
997 0.17
998 0.16
999 0.18
1000 0.19
1001 0.18
1002 0.17
1003 0.16
1004 0.13
1005 0.11
1006 0.11
1007 0.09
1008 0.08
1009 0.07
1010 0.07
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.08
1021 0.08
1022 0.08
1023 0.11
1024 0.12
1025 0.12
1026 0.13
1027 0.13
1028 0.15
1029 0.19
1030 0.19
1031 0.18
1032 0.2
1033 0.23
1034 0.22
1035 0.23
1036 0.2
1037 0.17
1038 0.2
1039 0.21
1040 0.21
1041 0.25
1042 0.25
1043 0.24
1044 0.24
1045 0.24
1046 0.24
1047 0.26
1048 0.25
1049 0.27
1050 0.34
1051 0.41
1052 0.43
1053 0.47
1054 0.45
1055 0.5
1056 0.55
1057 0.49
1058 0.47
1059 0.44
1060 0.48
1061 0.47
1062 0.46
1063 0.4
1064 0.35
1065 0.34
1066 0.3
1067 0.26
1068 0.2
1069 0.2
1070 0.2
1071 0.18
1072 0.2
1073 0.19
1074 0.21
1075 0.21
1076 0.23
1077 0.24
1078 0.31
1079 0.39
1080 0.39
1081 0.45
1082 0.5
1083 0.57
1084 0.57
1085 0.58
1086 0.56
1087 0.57
1088 0.6
1089 0.63
1090 0.61
1091 0.55
1092 0.56
1093 0.54
1094 0.47
1095 0.38
1096 0.31
1097 0.26
1098 0.25
1099 0.23
1100 0.2