FuNGI

A0A409X3N3

Protein Details

Accession

A0A409X3N3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
252-275	NNSGNRGKKKSRDSKSKPKYHCDH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
257-269	RGKKKSRDSKSKP

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, pero 6

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MGPGKSDNYSGFLKLKEDGTNWPAYKVEVLQHMYARGIIDNLDSPIFPPEQLVVHNKQIYRASDTKFEKPLDRETAKALQAERREFLKADGTGTEILIATVPVSVFVQLRHYTTLAERWQALCKIFEHRGEDVSSDMWEKFHDLRFPGGSVHAFISKMSDMRDQLILNDADLTDKQFVTAIRRAFRQSEYNEYLASVCAGIRNAGKEITPAILIQELKTEANSRHGASAISPNVKTSEALASSSSESHGSTNNSGNRGKKKSRDSKSKPKYHCDHCGKDGHSEQRCWAPGGGGYDSAPQWWRDKQAELKKSSSSHSNVAESHESACALNESRSAKLDHVALLTGLVAAHTTPHSIDSTTVDNGDAHSHTQSLPDHATLIKTLQFLINYLGESAFPYTESLDAKPEHIALALHNLPCNPNVHEAPSYALHSMSSQYLGAVLDCGASDHFTPCRNSLTNFKSIKETTRVADGRIVDALGKGDLTIDVPCGSLGTTKVTLSDVLYVPTFSFTLVSIARILTNSNCHVLFKKTPHPTALLLTNDNVVFGRIPLSRGLFRISDPNGSSNDTSLTLYAQSPTRKISMSEFHILMGHRSFHDLRRMVKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.28
4	0.28
5	0.31
6	0.33
7	0.4
8	0.39
9	0.38
10	0.35
11	0.32
12	0.32
13	0.28
14	0.27
15	0.26
16	0.29
17	0.3
18	0.31
19	0.31
20	0.29
21	0.28
22	0.25
23	0.18
24	0.15
25	0.12
26	0.12
27	0.13
28	0.14
29	0.14
30	0.12
31	0.13
32	0.16
33	0.16
34	0.14
35	0.13
36	0.13
37	0.14
38	0.18
39	0.24
40	0.25
41	0.32
42	0.37
43	0.36
44	0.39
45	0.44
46	0.43
47	0.44
48	0.46
49	0.42
50	0.46
51	0.51
52	0.53
53	0.53
54	0.53
55	0.52
56	0.5
57	0.54
58	0.54
59	0.52
60	0.47
61	0.46
62	0.5
63	0.45
64	0.44
65	0.39
66	0.36
67	0.41
68	0.43
69	0.4
70	0.36
71	0.36
72	0.33
73	0.32
74	0.33
75	0.27
76	0.25
77	0.22
78	0.23
79	0.21
80	0.2
81	0.18
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.08
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.05
90	0.06
91	0.07
92	0.08
93	0.08
94	0.14
95	0.15
96	0.17
97	0.18
98	0.19
99	0.19
100	0.2
101	0.26
102	0.24
103	0.25
104	0.25
105	0.25
106	0.29
107	0.31
108	0.3
109	0.26
110	0.24
111	0.28
112	0.31
113	0.33
114	0.32
115	0.31
116	0.32
117	0.31
118	0.3
119	0.24
120	0.2
121	0.17
122	0.15
123	0.13
124	0.11
125	0.11
126	0.13
127	0.15
128	0.18
129	0.21
130	0.21
131	0.24
132	0.25
133	0.25
134	0.23
135	0.22
136	0.19
137	0.16
138	0.16
139	0.15
140	0.13
141	0.12
142	0.14
143	0.13
144	0.14
145	0.15
146	0.17
147	0.16
148	0.18
149	0.21
150	0.18
151	0.17
152	0.21
153	0.19
154	0.15
155	0.15
156	0.13
157	0.11
158	0.11
159	0.13
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.12
165	0.17
166	0.21
167	0.23
168	0.24
169	0.27
170	0.3
171	0.31
172	0.33
173	0.34
174	0.32
175	0.37
176	0.38
177	0.37
178	0.34
179	0.32
180	0.29
181	0.22
182	0.19
183	0.1
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.08
188	0.08
189	0.1
190	0.1
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.13
207	0.11
208	0.17
209	0.18
210	0.17
211	0.17
212	0.17
213	0.17
214	0.16
215	0.21
216	0.19
217	0.2
218	0.19
219	0.19
220	0.2
221	0.2
222	0.19
223	0.14
224	0.14
225	0.11
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.12
231	0.12
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.11
236	0.12
237	0.13
238	0.19
239	0.21
240	0.24
241	0.26
242	0.31
243	0.36
244	0.42
245	0.45
246	0.47
247	0.55
248	0.62
249	0.68
250	0.74
251	0.76
252	0.8
253	0.85
254	0.87
255	0.82
256	0.81
257	0.79
258	0.74
259	0.76
260	0.73
261	0.67
262	0.62
263	0.63
264	0.55
265	0.52
266	0.5
267	0.48
268	0.42
269	0.38
270	0.35
271	0.33
272	0.32
273	0.29
274	0.24
275	0.16
276	0.14
277	0.16
278	0.15
279	0.11
280	0.1
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.1
285	0.09
286	0.11
287	0.12
288	0.15
289	0.16
290	0.19
291	0.27
292	0.35
293	0.41
294	0.42
295	0.43
296	0.42
297	0.42
298	0.4
299	0.38
300	0.31
301	0.28
302	0.26
303	0.26
304	0.24
305	0.25
306	0.25
307	0.2
308	0.18
309	0.14
310	0.13
311	0.11
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.07
316	0.1
317	0.11
318	0.12
319	0.13
320	0.14
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.12
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.04
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.11
345	0.11
346	0.12
347	0.11
348	0.1
349	0.11
350	0.12
351	0.1
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.11
357	0.11
358	0.12
359	0.13
360	0.12
361	0.13
362	0.13
363	0.13
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.11
372	0.13
373	0.12
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.08
385	0.1
386	0.1
387	0.13
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.14
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.08
396	0.13
397	0.15
398	0.15
399	0.16
400	0.16
401	0.16
402	0.18
403	0.19
404	0.16
405	0.17
406	0.18
407	0.2
408	0.21
409	0.2
410	0.21
411	0.21
412	0.21
413	0.16
414	0.15
415	0.12
416	0.12
417	0.13
418	0.11
419	0.1
420	0.08
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.05
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.1
435	0.14
436	0.16
437	0.17
438	0.22
439	0.23
440	0.25
441	0.32
442	0.35
443	0.41
444	0.41
445	0.41
446	0.42
447	0.42
448	0.45
449	0.41
450	0.39
451	0.31
452	0.38
453	0.37
454	0.32
455	0.35
456	0.31
457	0.27
458	0.25
459	0.23
460	0.14
461	0.14
462	0.13
463	0.09
464	0.08
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.12
479	0.13
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.15
484	0.14
485	0.17
486	0.14
487	0.14
488	0.14
489	0.14
490	0.13
491	0.14
492	0.13
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.11
497	0.11
498	0.12
499	0.11
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.13
504	0.12
505	0.17
506	0.18
507	0.21
508	0.21
509	0.22
510	0.24
511	0.29
512	0.33
513	0.35
514	0.43
515	0.48
516	0.51
517	0.52
518	0.53
519	0.49
520	0.46
521	0.46
522	0.4
523	0.34
524	0.31
525	0.31
526	0.28
527	0.26
528	0.21
529	0.16
530	0.12
531	0.11
532	0.14
533	0.12
534	0.14
535	0.16
536	0.21
537	0.22
538	0.23
539	0.26
540	0.23
541	0.24
542	0.31
543	0.3
544	0.32
545	0.32
546	0.34
547	0.32
548	0.35
549	0.34
550	0.27
551	0.27
552	0.22
553	0.2
554	0.18
555	0.17
556	0.14
557	0.15
558	0.16
559	0.2
560	0.22
561	0.24
562	0.27
563	0.29
564	0.28
565	0.29
566	0.33
567	0.36
568	0.39
569	0.42
570	0.39
571	0.37
572	0.39
573	0.37
574	0.34
575	0.29
576	0.25
577	0.2
578	0.26
579	0.28
580	0.3
581	0.39
582	0.41

A0A409X3N3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer