FuNGI

A0A409Y6T4

Protein Details

Accession

A0A409Y6T4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-52	ITKQMTSRTRLKRKEVDDVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11, nucl 7, mito 7, mito_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022657 De-COase2_CS IPR001529 DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu IPR045055 DNA2/NAM7-like IPR041679 DNA2/NAM7-like_C IPR041677 DNA2/NAM7_AAA_11 IPR027417 P-loop_NTPase IPR047187 SF1_C_Upf1 IPR034014 Zn_ribbon_RPC11_C IPR001222 Znf_TFIIS
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0004386 F:helicase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0042779 P:tRNA 3'-trailer cleavage
Pfam	View protein in Pfam PF13086 AAA_11 PF13087 AAA_12 PF02150 RNA_POL_M_15KD PF01096 TFIIS_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00879 ODR_DC_2_2 PS51133 ZF_TFIIS_2
CDD	cd18808 SF1_C_Upf1 cd10509 Zn-ribbon_RPC11

Amino Acid Sequences

MLFCPTCANLLVISAETGLNKWACNTCPYEFPITKQMTSRTRLKRKEVDDVLGGEEMWAHADHTQASCDKCNHNSAYFYQLQIRSADEPMTTFYRYNLSNPILYSVADNILAVAIAPTNGVKIKIVLIFFHEPYTLTFSIDTYNLASAVLCFYKKNVMNRYQSSLALLFNTRPFSSLIIQHTKTSHNLSYFTSKRHATTATKPNTRFTYHDIHEALSSTSSDSRLPISQSRKTSQFSATSQGAAEQEWLQEGGDVENVFVENTPTQPASGAFDWRKRASSRQTTSSSPSSSIPAYKRRIFPPQLSSEPDEQLSQAIRSYTEQFLELLSLEEAEDEAVLRERLSTWSLHRLQLEGYCLTAMSAYWLQENQFGRPVATFARGPGVTLPEHKLENGTQVLISRIDPLQEVPRRGSVLSTSSTHISICFPDMFDLDGEWRLDLGRPNLVYERMRSAIGHMNHDPEAISNLNSPTSPVQFILQGTGLRDVLLRSFKAPLSDPEASELNSAEPSATSAVEEGHDSSPVPSESQLPTSPLGAFREDMRIQSWANRYSQPNPLVIEGDPVFEHMNPSQIRAMATMIGQRISLIQGPPGTGKTKTIIETVKLLKLHFEVPQPILLCTYTNVAVDNLVEGLVKAGVKALRVGFSGNVKSSLIHTTLDYKLEQHALHPKLCSSIDKEAQLASQKKELSKSVLALDYKLSLQSRPRKDTLARLVKMKEALVALENRHKKSKAKIYAIQQQMLREVVADADVICTTCVTSACNALNVIDFPVVFLDEASMSTEPASLIPIMKGSQHISLIGDHKQLPPVIVSKEAEEGGLGVSLFERLTEEGLTPSVILDVQYRMHPAISRFPSQEFYNLALSDGTIDAGGNILPSLDPPNSKHLSQCSTITHRPSVVFLDHAGNEAPKGRSMVNVLEAQIVASVVEDLLLNNPQLRGHDIGIIAPYAAQISLLTRMLNSDAKYQARFRSVLGDQRAMHLEHIEVKTVDGFEGREKEVIIFSTVRNNERGTIGFLADKRRLNVGLTRAKRGLFVVGSIKTLQAGAKGVVKALKEGAVKMKMTRMTKTVASVEGGAGRSGPDGERRSEGSEGADVAMPTQVGRGGMKRDEAYASSGVIRDGACGRADVDVDGMESLSVGGGLGKEQVSVDSGSSEDAVVTSIVTPNEVVRTKRTATTSKVVGARRGGGGVGRKGADSWGRYADYVVRSGLVVRLSGENLESALYEHLDASRGSMAVQQRRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.1
4	0.11
5	0.14
6	0.14
7	0.13
8	0.17
9	0.2
10	0.21
11	0.26
12	0.3
13	0.28
14	0.33
15	0.37
16	0.42
17	0.4
18	0.42
19	0.47
20	0.46
21	0.46
22	0.46
23	0.5
24	0.48
25	0.53
26	0.59
27	0.6
28	0.66
29	0.72
30	0.77
31	0.78
32	0.77
33	0.82
34	0.77
35	0.71
36	0.64
37	0.58
38	0.51
39	0.41
40	0.35
41	0.24
42	0.19
43	0.13
44	0.11
45	0.09
46	0.07
47	0.08
48	0.09
49	0.12
50	0.12
51	0.16
52	0.18
53	0.21
54	0.26
55	0.3
56	0.35
57	0.37
58	0.43
59	0.44
60	0.44
61	0.45
62	0.41
63	0.45
64	0.41
65	0.39
66	0.39
67	0.37
68	0.35
69	0.32
70	0.33
71	0.28
72	0.27
73	0.27
74	0.19
75	0.18
76	0.2
77	0.22
78	0.21
79	0.19
80	0.19
81	0.22
82	0.23
83	0.25
84	0.28
85	0.28
86	0.28
87	0.29
88	0.3
89	0.26
90	0.25
91	0.24
92	0.18
93	0.16
94	0.14
95	0.13
96	0.1
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.05
101	0.04
102	0.04
103	0.05
104	0.05
105	0.07
106	0.08
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.14
111	0.17
112	0.17
113	0.16
114	0.21
115	0.25
116	0.25
117	0.26
118	0.23
119	0.2
120	0.21
121	0.27
122	0.21
123	0.18
124	0.17
125	0.16
126	0.18
127	0.18
128	0.17
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.1
134	0.08
135	0.11
136	0.12
137	0.11
138	0.11
139	0.12
140	0.21
141	0.26
142	0.34
143	0.4
144	0.47
145	0.55
146	0.59
147	0.65
148	0.59
149	0.54
150	0.49
151	0.42
152	0.34
153	0.27
154	0.24
155	0.2
156	0.2
157	0.24
158	0.2
159	0.2
160	0.2
161	0.21
162	0.23
163	0.26
164	0.3
165	0.34
166	0.36
167	0.38
168	0.39
169	0.39
170	0.39
171	0.39
172	0.36
173	0.3
174	0.31
175	0.32
176	0.39
177	0.39
178	0.4
179	0.39
180	0.37
181	0.36
182	0.38
183	0.4
184	0.36
185	0.43
186	0.49
187	0.53
188	0.59
189	0.59
190	0.62
191	0.61
192	0.59
193	0.53
194	0.48
195	0.48
196	0.42
197	0.47
198	0.42
199	0.38
200	0.35
201	0.32
202	0.28
203	0.19
204	0.18
205	0.12
206	0.13
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.15
211	0.16
212	0.2
213	0.25
214	0.31
215	0.37
216	0.42
217	0.46
218	0.49
219	0.5
220	0.5
221	0.47
222	0.46
223	0.41
224	0.41
225	0.37
226	0.33
227	0.3
228	0.28
229	0.23
230	0.18
231	0.17
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.11
254	0.12
255	0.15
256	0.15
257	0.22
258	0.24
259	0.29
260	0.35
261	0.36
262	0.4
263	0.37
264	0.44
265	0.47
266	0.53
267	0.54
268	0.56
269	0.58
270	0.57
271	0.6
272	0.57
273	0.49
274	0.4
275	0.35
276	0.3
277	0.28
278	0.3
279	0.3
280	0.33
281	0.38
282	0.43
283	0.47
284	0.49
285	0.57
286	0.57
287	0.58
288	0.58
289	0.58
290	0.56
291	0.55
292	0.55
293	0.48
294	0.45
295	0.39
296	0.31
297	0.24
298	0.21
299	0.18
300	0.14
301	0.12
302	0.11
303	0.11
304	0.13
305	0.16
306	0.16
307	0.16
308	0.16
309	0.15
310	0.14
311	0.14
312	0.12
313	0.09
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.09
329	0.11
330	0.12
331	0.14
332	0.23
333	0.26
334	0.29
335	0.28
336	0.27
337	0.27
338	0.27
339	0.27
340	0.18
341	0.16
342	0.13
343	0.12
344	0.11
345	0.1
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.17
354	0.18
355	0.16
356	0.19
357	0.19
358	0.18
359	0.18
360	0.19
361	0.15
362	0.17
363	0.16
364	0.12
365	0.16
366	0.16
367	0.16
368	0.16
369	0.17
370	0.15
371	0.18
372	0.2
373	0.17
374	0.17
375	0.17
376	0.18
377	0.16
378	0.19
379	0.17
380	0.15
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.13
385	0.13
386	0.11
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.19
392	0.22
393	0.24
394	0.24
395	0.25
396	0.26
397	0.26
398	0.25
399	0.18
400	0.16
401	0.17
402	0.17
403	0.16
404	0.17
405	0.17
406	0.16
407	0.15
408	0.13
409	0.11
410	0.12
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.11
426	0.12
427	0.13
428	0.13
429	0.15
430	0.17
431	0.2
432	0.2
433	0.19
434	0.21
435	0.19
436	0.19
437	0.17
438	0.19
439	0.23
440	0.23
441	0.26
442	0.23
443	0.24
444	0.24
445	0.24
446	0.21
447	0.14
448	0.15
449	0.11
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.12
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.11
469	0.09
470	0.1
471	0.08
472	0.1
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.16
480	0.15
481	0.2
482	0.21
483	0.2
484	0.21
485	0.21
486	0.2
487	0.19
488	0.17
489	0.1
490	0.09
491	0.09
492	0.06
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.06
502	0.08
503	0.07
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.1
512	0.11
513	0.14
514	0.14
515	0.14
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.14
520	0.14
521	0.12
522	0.12
523	0.11
524	0.16
525	0.16
526	0.16
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.2
531	0.23
532	0.2
533	0.22
534	0.25
535	0.27
536	0.29
537	0.36
538	0.32
539	0.3
540	0.28
541	0.27
542	0.24
543	0.21
544	0.2
545	0.14
546	0.13
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.1
552	0.07
553	0.13
554	0.12
555	0.14
556	0.14
557	0.15
558	0.15
559	0.14
560	0.14
561	0.09
562	0.09
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.07
572	0.08
573	0.08
574	0.09
575	0.09
576	0.11
577	0.11
578	0.1
579	0.11
580	0.12
581	0.13
582	0.14
583	0.17
584	0.16
585	0.15
586	0.2
587	0.2
588	0.21
589	0.2
590	0.19
591	0.17
592	0.17
593	0.18
594	0.15
595	0.15
596	0.15
597	0.15
598	0.17
599	0.16
600	0.15
601	0.14
602	0.12
603	0.1
604	0.09
605	0.09
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.04
615	0.04
616	0.03
617	0.03
618	0.04
619	0.04
620	0.03
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.08
625	0.08
626	0.08
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.11
631	0.12
632	0.11
633	0.12
634	0.11
635	0.11
636	0.12
637	0.13
638	0.11
639	0.1
640	0.1
641	0.13
642	0.14
643	0.15
644	0.14
645	0.13
646	0.13
647	0.15
648	0.15
649	0.13
650	0.21
651	0.22
652	0.23
653	0.22
654	0.21
655	0.21
656	0.22
657	0.21
658	0.17
659	0.2
660	0.22
661	0.22
662	0.22
663	0.2
664	0.21
665	0.26
666	0.25
667	0.2
668	0.22
669	0.23
670	0.24
671	0.26
672	0.26
673	0.24
674	0.22
675	0.22
676	0.2
677	0.22
678	0.21
679	0.19
680	0.18
681	0.14
682	0.13
683	0.14
684	0.12
685	0.1
686	0.17
687	0.26
688	0.33
689	0.37
690	0.38
691	0.4
692	0.42
693	0.48
694	0.51
695	0.52
696	0.47
697	0.46
698	0.45
699	0.43
700	0.42
701	0.34
702	0.25
703	0.15
704	0.14
705	0.12
706	0.13
707	0.13
708	0.19
709	0.24
710	0.24
711	0.29
712	0.3
713	0.32
714	0.38
715	0.47
716	0.49
717	0.51
718	0.55
719	0.58
720	0.65
721	0.65
722	0.6
723	0.51
724	0.42
725	0.36
726	0.31
727	0.23
728	0.15
729	0.11
730	0.08
731	0.06
732	0.06
733	0.04
734	0.04
735	0.05
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.06
744	0.09
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.1
749	0.1
750	0.1
751	0.1
752	0.07
753	0.07
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.05
758	0.05
759	0.04
760	0.04
761	0.05
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.07
767	0.06
768	0.06
769	0.07
770	0.06
771	0.06
772	0.06
773	0.07
774	0.07
775	0.07
776	0.09
777	0.1
778	0.11
779	0.11
780	0.11
781	0.11
782	0.13
783	0.15
784	0.16
785	0.16
786	0.16
787	0.17
788	0.19
789	0.18
790	0.16
791	0.15
792	0.16
793	0.15
794	0.16
795	0.16
796	0.15
797	0.16
798	0.16
799	0.14
800	0.11
801	0.1
802	0.07
803	0.07
804	0.06
805	0.04
806	0.04
807	0.04
808	0.04
809	0.04
810	0.05
811	0.05
812	0.06
813	0.06
814	0.07
815	0.07
816	0.08
817	0.08
818	0.07
819	0.06
820	0.06
821	0.05
822	0.05
823	0.06
824	0.07
825	0.08
826	0.09
827	0.11
828	0.11
829	0.11
830	0.13
831	0.14
832	0.22
833	0.25
834	0.28
835	0.28
836	0.29
837	0.31
838	0.3
839	0.31
840	0.24
841	0.22
842	0.21
843	0.2
844	0.19
845	0.15
846	0.14
847	0.12
848	0.1
849	0.08
850	0.05
851	0.05
852	0.04
853	0.04
854	0.04
855	0.03
856	0.03
857	0.03
858	0.03
859	0.04
860	0.07
861	0.08
862	0.1
863	0.12
864	0.2
865	0.23
866	0.23
867	0.26
868	0.28
869	0.31
870	0.31
871	0.32
872	0.31
873	0.35
874	0.4
875	0.41
876	0.38
877	0.35
878	0.33
879	0.32
880	0.29
881	0.23
882	0.19
883	0.16
884	0.18
885	0.16
886	0.16
887	0.15
888	0.12
889	0.12
890	0.15
891	0.14
892	0.12
893	0.14
894	0.13
895	0.14
896	0.17
897	0.18
898	0.18
899	0.18
900	0.18
901	0.17
902	0.17
903	0.15
904	0.12
905	0.1
906	0.07
907	0.05
908	0.04
909	0.03
910	0.04
911	0.04
912	0.04
913	0.05
914	0.07
915	0.07
916	0.08
917	0.09
918	0.09
919	0.1
920	0.13
921	0.14
922	0.14
923	0.17
924	0.16
925	0.16
926	0.16
927	0.15
928	0.12
929	0.09
930	0.08
931	0.06
932	0.05
933	0.04
934	0.04
935	0.05
936	0.08
937	0.09
938	0.09
939	0.08
940	0.09
941	0.12
942	0.16
943	0.16
944	0.18
945	0.23
946	0.26
947	0.29
948	0.32
949	0.33
950	0.34
951	0.33
952	0.29
953	0.31
954	0.32
955	0.36
956	0.37
957	0.38
958	0.34
959	0.36
960	0.38
961	0.32
962	0.29
963	0.22
964	0.18
965	0.2
966	0.21
967	0.2
968	0.17
969	0.17
970	0.18
971	0.17
972	0.17
973	0.11
974	0.11
975	0.13
976	0.16
977	0.17
978	0.17
979	0.17
980	0.17
981	0.17
982	0.17
983	0.16
984	0.14
985	0.13
986	0.21
987	0.24
988	0.25
989	0.26
990	0.27
991	0.26
992	0.26
993	0.27
994	0.22
995	0.2
996	0.2
997	0.21
998	0.22
999	0.27
1000	0.3
1001	0.31
1002	0.29
1003	0.3
1004	0.3
1005	0.29
1006	0.32
1007	0.35
1008	0.4
1009	0.4
1010	0.45
1011	0.44
1012	0.43
1013	0.42
1014	0.38
1015	0.33
1016	0.24
1017	0.23
1018	0.23
1019	0.22
1020	0.23
1021	0.22
1022	0.21
1023	0.17
1024	0.17
1025	0.15
1026	0.11
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.16
1030	0.16
1031	0.17
1032	0.19
1033	0.19
1034	0.19
1035	0.18
1036	0.22
1037	0.18
1038	0.2
1039	0.26
1040	0.28
1041	0.28
1042	0.29
1043	0.33
1044	0.35
1045	0.37
1046	0.38
1047	0.33
1048	0.33
1049	0.33
1050	0.36
1051	0.32
1052	0.28
1053	0.26
1054	0.24
1055	0.22
1056	0.21
1057	0.2
1058	0.16
1059	0.13
1060	0.12
1061	0.11
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.16
1065	0.18
1066	0.21
1067	0.24
1068	0.26
1069	0.29
1070	0.3
1071	0.29
1072	0.24
1073	0.22
1074	0.2
1075	0.18
1076	0.17
1077	0.13
1078	0.13
1079	0.13
1080	0.1
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.1
1086	0.13
1087	0.17
1088	0.2
1089	0.24
1090	0.24
1091	0.25
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.26
1095	0.22
1096	0.21
1097	0.19
1098	0.18
1099	0.16
1100	0.16
1101	0.14
1102	0.13
1103	0.14
1104	0.14
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.14
1108	0.14
1109	0.14
1110	0.12
1111	0.11
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.09
1115	0.08
1116	0.07
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.04
1120	0.04
1121	0.03
1122	0.04
1123	0.04
1124	0.05
1125	0.07
1126	0.07
1127	0.08
1128	0.08
1129	0.09
1130	0.1
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.09
1134	0.1
1135	0.1
1136	0.1
1137	0.1
1138	0.08
1139	0.07
1140	0.07
1141	0.06
1142	0.07
1143	0.07
1144	0.09
1145	0.09
1146	0.1
1147	0.1
1148	0.11
1149	0.18
1150	0.21
1151	0.23
1152	0.25
1153	0.31
1154	0.33
1155	0.38
1156	0.43
1157	0.43
1158	0.46
1159	0.51
1160	0.5
1161	0.5
1162	0.54
1163	0.52
1164	0.51
1165	0.48
1166	0.45
1167	0.39
1168	0.35
1169	0.29
1170	0.27
1171	0.3
1172	0.29
1173	0.29
1174	0.27
1175	0.26
1176	0.26
1177	0.3
1178	0.31
1179	0.27
1180	0.27
1181	0.28
1182	0.29
1183	0.29
1184	0.3
1185	0.32
1186	0.29
1187	0.28
1188	0.25
1189	0.2
1190	0.19
1191	0.2
1192	0.21
1193	0.16
1194	0.14
1195	0.14
1196	0.15
1197	0.16
1198	0.16
1199	0.16
1200	0.13
1201	0.12
1202	0.12
1203	0.1
1204	0.09
1205	0.1
1206	0.1
1207	0.1
1208	0.1
1209	0.1
1210	0.12
1211	0.11
1212	0.13
1213	0.13
1214	0.13
1215	0.13
1216	0.17
1217	0.25

A0A409Y6T4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer