FuNGI

A0A409YTV4

Protein Details

Accession

A0A409YTV4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-42	SQQERRQKALEDQKKRRAQRIDSSRQLD	Hydrophilic
105-136	APLPPSEPVKKSKKRKGKKQRQGSKANAKWAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
113-130	VKKSKKRKGKKQRQGSKA

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017336 Snurportin-1
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0061015 P:snRNA import into nucleus

Amino Acid Sequences

MDARKATYKLPPLASQQERRQKALEDQKKRRAQRIDSSRQLDIFASLNLGESDDEEEEAETAHAHPGSLAAYASMLNQPATSDQVPNAISSPELDLSAPSSSSAAPLPPSEPVKKSKKRKGKKQRQGSKANAKWADKCMYAELLEMRPNLPWASDGTVLDHSQAEFDDGLPLDLEHGWVAVAPIPVGKRCLAVTHQSAGVAGLVPNTTLRSRLLGKCLLRFPSPLPPLTVLDCILDSNWRQNGILHVLDVVRWKGQDVSDCEAAFRFWWRDTRLTEMQQGAPLSTTFVQEPRVPAPLSLNTASSSASETPPSNFRYPTTFVPVPFHSDTSLHSLLTQVIPAARAWRSIQVSLPPIVSVSAGDNDVKQSEVEMSVEQSSPTFPFGFGNQQASGAFSPPPPPVFGKAIQINERGTTVANTPPDGMLLYVSAAAYEPGTSPLACWVPATVLDKGDKEEMKDPLSTPCEEPPLDVFERLVQIRLARQQEGNYPAIGSINHVQSATDDSMDI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.65
3	0.67
4	0.7
5	0.7
6	0.69
7	0.65
8	0.59
9	0.61
10	0.63
11	0.63
12	0.64
13	0.7
14	0.77
15	0.83
16	0.85
17	0.84
18	0.82
19	0.8
20	0.8
21	0.81
22	0.81
23	0.81
24	0.79
25	0.73
26	0.64
27	0.57
28	0.47
29	0.38
30	0.29
31	0.19
32	0.16
33	0.12
34	0.13
35	0.11
36	0.11
37	0.09
38	0.09
39	0.11
40	0.1
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.1
46	0.09
47	0.07
48	0.07
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.1
56	0.09
57	0.06
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.09
62	0.1
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.1
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.14
71	0.19
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.14
76	0.13
77	0.13
78	0.15
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.12
85	0.11
86	0.09
87	0.09
88	0.09
89	0.1
90	0.1
91	0.09
92	0.1
93	0.11
94	0.12
95	0.16
96	0.21
97	0.24
98	0.27
99	0.34
100	0.44
101	0.53
102	0.62
103	0.68
104	0.75
105	0.81
106	0.89
107	0.92
108	0.93
109	0.94
110	0.94
111	0.94
112	0.93
113	0.92
114	0.91
115	0.9
116	0.84
117	0.82
118	0.78
119	0.7
120	0.64
121	0.59
122	0.53
123	0.43
124	0.39
125	0.31
126	0.26
127	0.23
128	0.21
129	0.19
130	0.17
131	0.19
132	0.18
133	0.16
134	0.15
135	0.16
136	0.14
137	0.12
138	0.1
139	0.09
140	0.12
141	0.14
142	0.13
143	0.15
144	0.17
145	0.17
146	0.17
147	0.15
148	0.12
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.05
163	0.05
164	0.04
165	0.04
166	0.05
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.1
177	0.13
178	0.13
179	0.18
180	0.2
181	0.2
182	0.2
183	0.19
184	0.18
185	0.16
186	0.14
187	0.09
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.08
197	0.1
198	0.15
199	0.17
200	0.21
201	0.25
202	0.27
203	0.3
204	0.33
205	0.33
206	0.29
207	0.28
208	0.26
209	0.3
210	0.3
211	0.27
212	0.25
213	0.24
214	0.24
215	0.25
216	0.23
217	0.14
218	0.12
219	0.12
220	0.1
221	0.08
222	0.09
223	0.08
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.14
230	0.15
231	0.15
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.1
238	0.07
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.13
244	0.15
245	0.19
246	0.2
247	0.2
248	0.2
249	0.19
250	0.18
251	0.14
252	0.13
253	0.1
254	0.09
255	0.14
256	0.16
257	0.2
258	0.21
259	0.28
260	0.3
261	0.31
262	0.33
263	0.31
264	0.29
265	0.27
266	0.26
267	0.18
268	0.15
269	0.12
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.09
275	0.11
276	0.12
277	0.14
278	0.14
279	0.16
280	0.15
281	0.15
282	0.17
283	0.17
284	0.19
285	0.18
286	0.17
287	0.15
288	0.15
289	0.15
290	0.12
291	0.13
292	0.11
293	0.11
294	0.12
295	0.12
296	0.13
297	0.17
298	0.21
299	0.21
300	0.2
301	0.21
302	0.24
303	0.27
304	0.27
305	0.31
306	0.29
307	0.28
308	0.31
309	0.31
310	0.32
311	0.3
312	0.28
313	0.21
314	0.2
315	0.2
316	0.24
317	0.24
318	0.17
319	0.16
320	0.16
321	0.16
322	0.16
323	0.14
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.08
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.12
332	0.18
333	0.2
334	0.2
335	0.22
336	0.22
337	0.25
338	0.24
339	0.23
340	0.17
341	0.15
342	0.15
343	0.13
344	0.09
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.12
367	0.11
368	0.09
369	0.1
370	0.12
371	0.19
372	0.2
373	0.23
374	0.21
375	0.21
376	0.21
377	0.22
378	0.21
379	0.15
380	0.14
381	0.12
382	0.15
383	0.16
384	0.17
385	0.17
386	0.19
387	0.22
388	0.25
389	0.26
390	0.29
391	0.33
392	0.37
393	0.38
394	0.39
395	0.36
396	0.33
397	0.32
398	0.25
399	0.21
400	0.17
401	0.15
402	0.17
403	0.17
404	0.17
405	0.17
406	0.17
407	0.16
408	0.15
409	0.13
410	0.09
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.14
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.13
430	0.13
431	0.17
432	0.21
433	0.17
434	0.19
435	0.21
436	0.22
437	0.24
438	0.29
439	0.27
440	0.27
441	0.31
442	0.32
443	0.32
444	0.33
445	0.31
446	0.33
447	0.35
448	0.34
449	0.31
450	0.31
451	0.34
452	0.32
453	0.33
454	0.28
455	0.31
456	0.3
457	0.28
458	0.25
459	0.22
460	0.27
461	0.26
462	0.25
463	0.2
464	0.2
465	0.25
466	0.32
467	0.34
468	0.32
469	0.34
470	0.36
471	0.41
472	0.45
473	0.41
474	0.34
475	0.3
476	0.27
477	0.25
478	0.22
479	0.2
480	0.2
481	0.21
482	0.22
483	0.21
484	0.21
485	0.2
486	0.26
487	0.23

A0A409YTV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer