FuNGI

A0A409YCB1

Protein Details

Accession

A0A409YCB1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
598-621	DSPSPQKEAKRLKEKRRLSNSTAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
607-613	KRLKEKR

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 6, cyto 4, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039771 Csl4 IPR019495 EXOSC1_C IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR006964 NUDE_dom IPR003029 S1_domain
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000178 C:exosome (RNase complex) GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF10447 EXOSC1 PF04880 NUDE_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd05791 S1_CSL4

Amino Acid Sequences

MNSDPTIFIPGQPITLPARSPVPELSTGVYQRDGQIRASLSGLPQVDGNKLRIPRLQPHPPSPGSIVLGFVTRLSPIQASLSINVVDGIPLPSGEEFQGMIRVQDVRATEKDKIKIGDCFRAGDVVRCQVISLGDARSYFVTTARNDLGVIFATSEAGGTLEPVSWQEMRCSMTGKIEKRKCAKPLYFPPNTDWKEKYNEVLDMLSETRQELDDFHQASKELEAELESELARTEKSQKDLMMKVSRAETERDDWKGKFMSLQTTHNTTTTSLQRELDQLRQEYQKTKVYLRELEMGNDDLERNERAVSSSLADLEAKYSRVLEEKILLEHELLEKATLEEQMQRLKDELRDANVEISIFKDQLDALKALKSDSSSVKSSTDDLLTTAPLPGLDLEDISPASESGGSEISPPSALSTPKASLSRSTVASSFLPRTFAQDRPSPLTALRTSSVIRSTTLPSLASPSTSSPRGLMRPTAIKSASTIATSTTSASASLSKNKGVQMVSEMRARVKNLEQKIHTRVPRLRMGSMVNRQTSVSGVAPSTPITSSSSSAASNASTAKTSLESQRKSMESRLSADSGSDKNFKRDDSSGWVLIMEDSPSPQKEAKRLKEKRRLSNSTAAPTSYRSTMSSTTRDTSPTLRSTPANPLAASTGSTLRRPHSRLSGGGASSSTSTSRPQTPTFLPIPSSSSYTPSASVGLKRSMGPSSSTQMKRSSLGKSHAVPVPPLPQTYRERPLTMPPLTNTTNSKALPTVPSDTHPNVTLRSKMSASSSTSTILSKSRIGRPSGGGISGRRSAGVEPSGALDLSDLQP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.23
3	0.22
4	0.2
5	0.25
6	0.25
7	0.28
8	0.27
9	0.28
10	0.28
11	0.29
12	0.3
13	0.3
14	0.31
15	0.3
16	0.29
17	0.26
18	0.28
19	0.32
20	0.31
21	0.26
22	0.29
23	0.29
24	0.28
25	0.29
26	0.26
27	0.2
28	0.24
29	0.23
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.24
34	0.25
35	0.28
36	0.28
37	0.3
38	0.33
39	0.37
40	0.41
41	0.45
42	0.51
43	0.58
44	0.6
45	0.65
46	0.69
47	0.65
48	0.63
49	0.57
50	0.51
51	0.44
52	0.36
53	0.31
54	0.23
55	0.22
56	0.18
57	0.16
58	0.12
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.1
64	0.12
65	0.15
66	0.16
67	0.16
68	0.18
69	0.17
70	0.16
71	0.16
72	0.13
73	0.1
74	0.09
75	0.1
76	0.08
77	0.07
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.1
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.14
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.14
90	0.14
91	0.16
92	0.18
93	0.18
94	0.22
95	0.26
96	0.31
97	0.37
98	0.41
99	0.42
100	0.44
101	0.42
102	0.45
103	0.46
104	0.48
105	0.42
106	0.41
107	0.36
108	0.38
109	0.36
110	0.33
111	0.32
112	0.28
113	0.28
114	0.25
115	0.25
116	0.21
117	0.21
118	0.17
119	0.16
120	0.12
121	0.13
122	0.13
123	0.15
124	0.14
125	0.15
126	0.14
127	0.13
128	0.16
129	0.16
130	0.21
131	0.21
132	0.2
133	0.19
134	0.19
135	0.18
136	0.14
137	0.13
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.05
148	0.05
149	0.05
150	0.06
151	0.09
152	0.11
153	0.11
154	0.12
155	0.15
156	0.17
157	0.18
158	0.2
159	0.18
160	0.25
161	0.32
162	0.38
163	0.45
164	0.49
165	0.57
166	0.62
167	0.68
168	0.66
169	0.69
170	0.67
171	0.67
172	0.72
173	0.73
174	0.72
175	0.67
176	0.64
177	0.64
178	0.62
179	0.57
180	0.49
181	0.43
182	0.44
183	0.43
184	0.43
185	0.35
186	0.33
187	0.29
188	0.27
189	0.23
190	0.18
191	0.18
192	0.14
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.13
200	0.19
201	0.2
202	0.2
203	0.21
204	0.2
205	0.21
206	0.2
207	0.17
208	0.1
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.15
221	0.17
222	0.21
223	0.23
224	0.26
225	0.31
226	0.34
227	0.4
228	0.4
229	0.37
230	0.35
231	0.35
232	0.34
233	0.3
234	0.3
235	0.25
236	0.23
237	0.27
238	0.29
239	0.31
240	0.29
241	0.31
242	0.3
243	0.27
244	0.26
245	0.23
246	0.27
247	0.27
248	0.31
249	0.3
250	0.33
251	0.34
252	0.31
253	0.3
254	0.23
255	0.24
256	0.25
257	0.26
258	0.24
259	0.24
260	0.24
261	0.28
262	0.29
263	0.3
264	0.29
265	0.26
266	0.28
267	0.31
268	0.32
269	0.31
270	0.33
271	0.34
272	0.32
273	0.34
274	0.36
275	0.37
276	0.39
277	0.38
278	0.39
279	0.34
280	0.32
281	0.31
282	0.26
283	0.21
284	0.18
285	0.15
286	0.09
287	0.11
288	0.1
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.11
308	0.12
309	0.1
310	0.13
311	0.13
312	0.13
313	0.14
314	0.14
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.09
327	0.11
328	0.15
329	0.15
330	0.15
331	0.16
332	0.17
333	0.17
334	0.2
335	0.2
336	0.18
337	0.19
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.16
342	0.11
343	0.11
344	0.09
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.08
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.11
357	0.1
358	0.11
359	0.13
360	0.16
361	0.15
362	0.16
363	0.17
364	0.17
365	0.18
366	0.17
367	0.14
368	0.11
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.11
404	0.14
405	0.15
406	0.14
407	0.15
408	0.18
409	0.2
410	0.19
411	0.19
412	0.17
413	0.17
414	0.18
415	0.18
416	0.17
417	0.15
418	0.16
419	0.15
420	0.2
421	0.21
422	0.23
423	0.24
424	0.26
425	0.28
426	0.31
427	0.32
428	0.27
429	0.24
430	0.26
431	0.23
432	0.21
433	0.19
434	0.15
435	0.15
436	0.16
437	0.18
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.15
447	0.14
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.14
452	0.15
453	0.15
454	0.13
455	0.16
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.22
461	0.23
462	0.26
463	0.24
464	0.22
465	0.21
466	0.22
467	0.2
468	0.15
469	0.13
470	0.1
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.11
479	0.11
480	0.17
481	0.18
482	0.18
483	0.2
484	0.21
485	0.24
486	0.2
487	0.19
488	0.19
489	0.22
490	0.23
491	0.24
492	0.23
493	0.22
494	0.24
495	0.24
496	0.22
497	0.24
498	0.29
499	0.31
500	0.37
501	0.38
502	0.42
503	0.48
504	0.52
505	0.49
506	0.48
507	0.48
508	0.47
509	0.51
510	0.49
511	0.43
512	0.38
513	0.39
514	0.4
515	0.42
516	0.42
517	0.36
518	0.34
519	0.33
520	0.31
521	0.28
522	0.22
523	0.16
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.11
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.12
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.13
538	0.14
539	0.13
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.12
549	0.2
550	0.28
551	0.28
552	0.3
553	0.36
554	0.37
555	0.38
556	0.4
557	0.38
558	0.32
559	0.34
560	0.35
561	0.31
562	0.28
563	0.27
564	0.26
565	0.21
566	0.22
567	0.25
568	0.23
569	0.27
570	0.29
571	0.29
572	0.3
573	0.3
574	0.3
575	0.31
576	0.35
577	0.3
578	0.29
579	0.28
580	0.23
581	0.22
582	0.19
583	0.12
584	0.07
585	0.08
586	0.1
587	0.11
588	0.13
589	0.16
590	0.19
591	0.27
592	0.37
593	0.46
594	0.54
595	0.64
596	0.72
597	0.79
598	0.86
599	0.87
600	0.88
601	0.85
602	0.8
603	0.8
604	0.74
605	0.7
606	0.62
607	0.53
608	0.43
609	0.38
610	0.35
611	0.27
612	0.23
613	0.18
614	0.2
615	0.23
616	0.27
617	0.28
618	0.3
619	0.31
620	0.31
621	0.31
622	0.3
623	0.3
624	0.31
625	0.31
626	0.29
627	0.29
628	0.3
629	0.31
630	0.38
631	0.4
632	0.37
633	0.32
634	0.31
635	0.3
636	0.28
637	0.26
638	0.19
639	0.19
640	0.18
641	0.21
642	0.23
643	0.25
644	0.32
645	0.34
646	0.37
647	0.4
648	0.42
649	0.41
650	0.45
651	0.46
652	0.39
653	0.37
654	0.32
655	0.24
656	0.21
657	0.2
658	0.15
659	0.11
660	0.14
661	0.17
662	0.23
663	0.27
664	0.28
665	0.33
666	0.34
667	0.39
668	0.39
669	0.37
670	0.33
671	0.3
672	0.31
673	0.27
674	0.29
675	0.24
676	0.25
677	0.25
678	0.25
679	0.24
680	0.21
681	0.22
682	0.2
683	0.23
684	0.24
685	0.24
686	0.25
687	0.25
688	0.26
689	0.26
690	0.25
691	0.25
692	0.24
693	0.27
694	0.35
695	0.37
696	0.38
697	0.4
698	0.41
699	0.41
700	0.42
701	0.43
702	0.41
703	0.43
704	0.46
705	0.44
706	0.48
707	0.48
708	0.46
709	0.4
710	0.37
711	0.38
712	0.34
713	0.34
714	0.3
715	0.33
716	0.39
717	0.45
718	0.49
719	0.47
720	0.48
721	0.48
722	0.54
723	0.56
724	0.53
725	0.5
726	0.44
727	0.46
728	0.45
729	0.46
730	0.42
731	0.38
732	0.4
733	0.35
734	0.35
735	0.3
736	0.31
737	0.3
738	0.31
739	0.31
740	0.27
741	0.3
742	0.35
743	0.36
744	0.36
745	0.36
746	0.34
747	0.33
748	0.36
749	0.38
750	0.33
751	0.35
752	0.33
753	0.32
754	0.34
755	0.34
756	0.35
757	0.33
758	0.31
759	0.29
760	0.29
761	0.28
762	0.26
763	0.24
764	0.22
765	0.25
766	0.3
767	0.37
768	0.42
769	0.45
770	0.47
771	0.47
772	0.51
773	0.48
774	0.44
775	0.4
776	0.36
777	0.38
778	0.38
779	0.34
780	0.27
781	0.26
782	0.24
783	0.27
784	0.26
785	0.22
786	0.18
787	0.2
788	0.21
789	0.19
790	0.18
791	0.12

A0A409YCB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer