Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YJD9

Protein Details
Accession A0A409YJD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-277SQRSTSNSGKKGKKKSRDSKTKPKYHCDNCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-270GKKGKKKSRDSKTKP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MGPGKSDSSYSTFLKLKEDGTNWPAYKVETLQHMYARGIVDNLDGTVYPPEQLVAHDKQIYLASDSKFKNPLDRETVKSLQAERKEYFKNEGLGTEILIATVPVSTFVQLRHHNTLSERWNALCAIYEHRGEDVSFDMWDRFNNLHFTGGSVHAFISRMSDMRDQLIINDADLTDKQFVAAIRRAFRQSEYNEYLASVCAGIRNAGKEITPAVLIQELKTEANSRHGASAISPNVKTSEALASSGSDSQRSTSNSGKKGKKKSRDSKTKPKYHCDNCGLDGHSQERCWGPGGGSHDSSPQWWRDKQAELQKKKSNFNANVAESHESACAFTESASSKPEHVALLSAFTHTPNTPLDSTTPTSNVDTTHPAQQLDYDSLLKAYITLVNSLGEGAFPYTESLDAKPEHVALVLHNLPCTRDVEPLKAPSYALQSLTSQYLGTVLDCGASDHYTPRRDLLTNFTPVKEATRVADGRIVDALGKGDLTIQVPCGKLGSTKVTLSNVYFVPSFSFTLVSIARILLNSDCQILFKKSPNPTAILLTSSNVISSLVKPGRYLGPDEQSRGIRVYWPSRHTITVEREVFLDIPDRLSPLLHDVIVEGEIPSDNHQQYIQVNIDDVSSDDDKSPPSNNNPVNFPQEDEDAASDAEVENQLLDDNQQTPPPSPPITPPPVSPPPPKPRRIMGLEVPEHLNIDINAPRQTRPRNNSVTMPGFYSDKNQESRGSGRAALLQSNISSIRAMHDEIRDQYGEDFIGISEITKAISFALASGAPGLSTMASTLRHQAGRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.33
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.38
8 0.46
9 0.42
10 0.41
11 0.39
12 0.33
13 0.34
14 0.3
15 0.28
16 0.27
17 0.3
18 0.32
19 0.34
20 0.34
21 0.31
22 0.32
23 0.29
24 0.23
25 0.19
26 0.16
27 0.15
28 0.13
29 0.13
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.19
41 0.2
42 0.24
43 0.27
44 0.26
45 0.27
46 0.3
47 0.29
48 0.26
49 0.28
50 0.25
51 0.31
52 0.33
53 0.36
54 0.39
55 0.38
56 0.43
57 0.42
58 0.48
59 0.49
60 0.52
61 0.53
62 0.55
63 0.58
64 0.52
65 0.52
66 0.5
67 0.49
68 0.5
69 0.51
70 0.44
71 0.48
72 0.5
73 0.5
74 0.5
75 0.47
76 0.45
77 0.39
78 0.38
79 0.35
80 0.29
81 0.27
82 0.22
83 0.17
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.09
94 0.11
95 0.18
96 0.24
97 0.31
98 0.36
99 0.37
100 0.39
101 0.4
102 0.46
103 0.44
104 0.44
105 0.39
106 0.32
107 0.33
108 0.31
109 0.28
110 0.23
111 0.2
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.22
117 0.22
118 0.19
119 0.19
120 0.15
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.13
129 0.15
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.12
143 0.13
144 0.11
145 0.12
146 0.15
147 0.18
148 0.18
149 0.2
150 0.22
151 0.18
152 0.18
153 0.22
154 0.19
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.21
168 0.23
169 0.25
170 0.29
171 0.32
172 0.31
173 0.33
174 0.35
175 0.33
176 0.38
177 0.39
178 0.36
179 0.34
180 0.33
181 0.31
182 0.24
183 0.2
184 0.11
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.15
208 0.13
209 0.19
210 0.21
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.24
217 0.22
218 0.23
219 0.22
220 0.22
221 0.23
222 0.23
223 0.22
224 0.16
225 0.16
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.16
232 0.15
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.16
237 0.17
238 0.2
239 0.25
240 0.32
241 0.38
242 0.47
243 0.55
244 0.59
245 0.68
246 0.74
247 0.77
248 0.81
249 0.84
250 0.86
251 0.89
252 0.9
253 0.9
254 0.91
255 0.9
256 0.86
257 0.84
258 0.84
259 0.79
260 0.79
261 0.73
262 0.66
263 0.59
264 0.57
265 0.49
266 0.4
267 0.35
268 0.29
269 0.24
270 0.2
271 0.19
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.11
277 0.13
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.22
288 0.22
289 0.25
290 0.27
291 0.3
292 0.36
293 0.43
294 0.49
295 0.51
296 0.58
297 0.61
298 0.62
299 0.63
300 0.63
301 0.63
302 0.55
303 0.56
304 0.54
305 0.48
306 0.45
307 0.42
308 0.38
309 0.28
310 0.26
311 0.19
312 0.13
313 0.11
314 0.1
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.11
327 0.09
328 0.1
329 0.08
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.13
352 0.15
353 0.16
354 0.21
355 0.21
356 0.2
357 0.19
358 0.19
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.06
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.06
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.15
404 0.11
405 0.15
406 0.16
407 0.19
408 0.22
409 0.25
410 0.25
411 0.23
412 0.22
413 0.18
414 0.21
415 0.18
416 0.16
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.1
436 0.14
437 0.16
438 0.16
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.21
443 0.24
444 0.24
445 0.29
446 0.3
447 0.28
448 0.27
449 0.26
450 0.27
451 0.21
452 0.17
453 0.12
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.2
458 0.17
459 0.17
460 0.16
461 0.15
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.1
479 0.12
480 0.16
481 0.15
482 0.16
483 0.18
484 0.19
485 0.2
486 0.19
487 0.2
488 0.15
489 0.15
490 0.14
491 0.12
492 0.12
493 0.13
494 0.13
495 0.11
496 0.11
497 0.09
498 0.12
499 0.12
500 0.11
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.07
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.12
513 0.15
514 0.17
515 0.2
516 0.27
517 0.31
518 0.37
519 0.38
520 0.38
521 0.36
522 0.37
523 0.32
524 0.28
525 0.23
526 0.18
527 0.17
528 0.14
529 0.12
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.16
535 0.17
536 0.17
537 0.17
538 0.2
539 0.23
540 0.23
541 0.27
542 0.23
543 0.28
544 0.3
545 0.33
546 0.35
547 0.32
548 0.32
549 0.29
550 0.25
551 0.21
552 0.24
553 0.3
554 0.32
555 0.34
556 0.37
557 0.38
558 0.39
559 0.38
560 0.4
561 0.38
562 0.41
563 0.39
564 0.35
565 0.34
566 0.33
567 0.31
568 0.24
569 0.21
570 0.12
571 0.13
572 0.12
573 0.13
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.12
578 0.13
579 0.11
580 0.11
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.1
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.16
594 0.18
595 0.19
596 0.23
597 0.22
598 0.15
599 0.16
600 0.15
601 0.15
602 0.13
603 0.13
604 0.12
605 0.11
606 0.11
607 0.12
608 0.13
609 0.14
610 0.16
611 0.19
612 0.2
613 0.25
614 0.33
615 0.37
616 0.39
617 0.43
618 0.45
619 0.48
620 0.44
621 0.4
622 0.33
623 0.29
624 0.27
625 0.23
626 0.2
627 0.15
628 0.14
629 0.12
630 0.1
631 0.08
632 0.09
633 0.08
634 0.07
635 0.05
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.08
641 0.09
642 0.11
643 0.13
644 0.15
645 0.17
646 0.2
647 0.25
648 0.25
649 0.24
650 0.29
651 0.35
652 0.41
653 0.41
654 0.39
655 0.42
656 0.48
657 0.53
658 0.54
659 0.56
660 0.6
661 0.68
662 0.71
663 0.68
664 0.67
665 0.69
666 0.68
667 0.65
668 0.62
669 0.62
670 0.59
671 0.56
672 0.52
673 0.43
674 0.38
675 0.31
676 0.24
677 0.15
678 0.16
679 0.17
680 0.18
681 0.23
682 0.24
683 0.27
684 0.33
685 0.43
686 0.5
687 0.53
688 0.6
689 0.63
690 0.65
691 0.68
692 0.68
693 0.64
694 0.55
695 0.5
696 0.42
697 0.36
698 0.32
699 0.33
700 0.31
701 0.31
702 0.33
703 0.33
704 0.34
705 0.37
706 0.4
707 0.38
708 0.35
709 0.31
710 0.29
711 0.32
712 0.31
713 0.28
714 0.26
715 0.23
716 0.2
717 0.22
718 0.21
719 0.16
720 0.15
721 0.13
722 0.15
723 0.16
724 0.18
725 0.19
726 0.23
727 0.27
728 0.29
729 0.33
730 0.3
731 0.29
732 0.27
733 0.24
734 0.21
735 0.16
736 0.13
737 0.09
738 0.1
739 0.08
740 0.08
741 0.08
742 0.07
743 0.08
744 0.08
745 0.08
746 0.07
747 0.08
748 0.08
749 0.07
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.1
754 0.09
755 0.08
756 0.09
757 0.09
758 0.06
759 0.06
760 0.07
761 0.08
762 0.1
763 0.12
764 0.19
765 0.24