Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YXM1

Protein Details
Accession A0A409YXM1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-116DQSRSGPTRRRSRSQAINPTRSSHydrophilic
863-885TTNRLPFHRTRHLRNPWNHDREVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MVESQARVQPNLRSERPSSGGYFDQIHFPSNRNTSFASPGFSSAFPAGADDNENITTPTLTSVQSIPSNSHNTTPQNSVAIHASMDMSDQSHGDQSRSGPTRRRSRSQAINPTRSSTSRTPQSPSAHGYPSSSTTADHRHPTAFQGPTTPYANPTSVQYSHRPDMLTQYTMSTPPGSMGIAHSPSYVFPPTFHPSMDHSQSLHGSYTSMMQSPPMYQFPANTVDHSASSVPPYSGTRSPSMFASTTVNPQPPPGSAPHLLTNQQQGTTISGAYMNTGSFQTMGYPPASPYPYPSAMFPARYAPTSFSRPYPQTTESEPQGTWFYLPHPSSLPSSQQYDSNPSYPTHFPVHFAQMGRSRVENQFAVATSSQHATQQYSMPPNPTYRPHFSQTHTPTSPDGHQPSGQGPQTAHQPPSTPTVSSGSERLPSGDRAVLRRPYHPNPPAHRSEWVMWAGNVPSDATHDELWKFFNQLPSDSTSEVYHSGVLSIFLISRSSCAFVNYDTEVTLLAAINRFNGVPLRSHDPRCPRMVCRVRKKDDDLKAGVGGQRGMGMHTRWIKHQKGKAKETSADQIEASTASDPSLSPSASVSERLTYAISSISLSSDEDGKPPGKQSSGSGSFTSTNSGFLVRYFPKRFFILKSLTQDDLDLSVERGVWATQKHNEGILDQAYRTSKDVFLIFSVNKSGEFYGYARMSGPVRRGEQTVAWASRRSEPSGPRGNLPSSGGPAFLASDGRQVDTSPLPLHSPLSPAGDFPGQRDDHYATAPPLLGKRYHLPTVETPGATYSLDPRYHMLEVQPSSSRFELDDSAPARAVRRRQAAKSRSGAQELDGEGSPEPDHSEEQLVGPSRQENWGDCFSVEWVTTNRLPFHRTRHLRNPWNHDREVKVSRDGTELEPSVGQRLVDEWEKLADLTVPLASSSGASGSGKPSGGKKASKQPQTSNSMALPSSST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.53
4 0.51
5 0.45
6 0.4
7 0.39
8 0.35
9 0.36
10 0.3
11 0.33
12 0.3
13 0.32
14 0.29
15 0.3
16 0.35
17 0.38
18 0.39
19 0.35
20 0.37
21 0.36
22 0.42
23 0.4
24 0.36
25 0.3
26 0.31
27 0.31
28 0.28
29 0.28
30 0.21
31 0.2
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.16
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.18
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.26
55 0.32
56 0.31
57 0.34
58 0.35
59 0.37
60 0.39
61 0.41
62 0.37
63 0.35
64 0.34
65 0.32
66 0.29
67 0.25
68 0.21
69 0.17
70 0.15
71 0.12
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.18
83 0.27
84 0.32
85 0.37
86 0.4
87 0.49
88 0.59
89 0.65
90 0.71
91 0.7
92 0.74
93 0.79
94 0.81
95 0.83
96 0.83
97 0.84
98 0.77
99 0.73
100 0.68
101 0.59
102 0.55
103 0.5
104 0.49
105 0.48
106 0.5
107 0.5
108 0.54
109 0.58
110 0.56
111 0.55
112 0.51
113 0.46
114 0.43
115 0.4
116 0.35
117 0.34
118 0.32
119 0.26
120 0.22
121 0.22
122 0.28
123 0.31
124 0.33
125 0.32
126 0.31
127 0.32
128 0.36
129 0.39
130 0.35
131 0.31
132 0.31
133 0.31
134 0.32
135 0.34
136 0.29
137 0.25
138 0.26
139 0.27
140 0.22
141 0.23
142 0.25
143 0.26
144 0.29
145 0.33
146 0.37
147 0.38
148 0.4
149 0.38
150 0.33
151 0.38
152 0.38
153 0.33
154 0.26
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.25
159 0.18
160 0.14
161 0.12
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.18
173 0.19
174 0.14
175 0.13
176 0.19
177 0.24
178 0.25
179 0.25
180 0.24
181 0.27
182 0.33
183 0.36
184 0.32
185 0.28
186 0.29
187 0.3
188 0.29
189 0.25
190 0.18
191 0.14
192 0.13
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.18
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.19
206 0.24
207 0.23
208 0.2
209 0.21
210 0.2
211 0.19
212 0.2
213 0.18
214 0.13
215 0.14
216 0.14
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.17
221 0.2
222 0.23
223 0.24
224 0.24
225 0.25
226 0.24
227 0.26
228 0.22
229 0.2
230 0.21
231 0.19
232 0.23
233 0.26
234 0.27
235 0.23
236 0.24
237 0.24
238 0.2
239 0.21
240 0.19
241 0.21
242 0.21
243 0.23
244 0.26
245 0.28
246 0.29
247 0.29
248 0.33
249 0.28
250 0.26
251 0.25
252 0.21
253 0.21
254 0.19
255 0.17
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.15
274 0.17
275 0.15
276 0.18
277 0.22
278 0.24
279 0.24
280 0.24
281 0.26
282 0.26
283 0.27
284 0.24
285 0.23
286 0.22
287 0.23
288 0.23
289 0.2
290 0.23
291 0.27
292 0.27
293 0.26
294 0.3
295 0.31
296 0.34
297 0.35
298 0.34
299 0.31
300 0.36
301 0.37
302 0.33
303 0.34
304 0.3
305 0.26
306 0.25
307 0.23
308 0.17
309 0.13
310 0.13
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.18
316 0.21
317 0.22
318 0.25
319 0.2
320 0.24
321 0.23
322 0.25
323 0.25
324 0.28
325 0.29
326 0.27
327 0.26
328 0.23
329 0.26
330 0.24
331 0.26
332 0.24
333 0.22
334 0.23
335 0.24
336 0.28
337 0.27
338 0.26
339 0.26
340 0.28
341 0.3
342 0.28
343 0.26
344 0.25
345 0.24
346 0.27
347 0.23
348 0.17
349 0.17
350 0.16
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.17
363 0.21
364 0.22
365 0.23
366 0.24
367 0.25
368 0.27
369 0.29
370 0.32
371 0.33
372 0.36
373 0.39
374 0.41
375 0.41
376 0.48
377 0.48
378 0.5
379 0.45
380 0.41
381 0.38
382 0.36
383 0.36
384 0.32
385 0.29
386 0.23
387 0.23
388 0.23
389 0.24
390 0.26
391 0.24
392 0.19
393 0.17
394 0.17
395 0.23
396 0.25
397 0.24
398 0.19
399 0.2
400 0.2
401 0.25
402 0.25
403 0.18
404 0.17
405 0.18
406 0.2
407 0.19
408 0.19
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.14
414 0.13
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.16
419 0.21
420 0.27
421 0.27
422 0.31
423 0.37
424 0.38
425 0.46
426 0.49
427 0.52
428 0.52
429 0.56
430 0.55
431 0.5
432 0.48
433 0.42
434 0.37
435 0.33
436 0.29
437 0.23
438 0.19
439 0.18
440 0.16
441 0.13
442 0.11
443 0.07
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.11
454 0.12
455 0.12
456 0.16
457 0.15
458 0.16
459 0.17
460 0.19
461 0.2
462 0.19
463 0.18
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.09
469 0.08
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.05
478 0.04
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.09
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.09
505 0.12
506 0.18
507 0.22
508 0.24
509 0.29
510 0.35
511 0.38
512 0.42
513 0.42
514 0.38
515 0.45
516 0.52
517 0.56
518 0.6
519 0.66
520 0.67
521 0.69
522 0.73
523 0.71
524 0.69
525 0.66
526 0.57
527 0.48
528 0.43
529 0.39
530 0.34
531 0.25
532 0.18
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.08
539 0.13
540 0.17
541 0.18
542 0.22
543 0.3
544 0.35
545 0.41
546 0.47
547 0.5
548 0.55
549 0.61
550 0.62
551 0.59
552 0.56
553 0.52
554 0.52
555 0.45
556 0.37
557 0.3
558 0.23
559 0.19
560 0.16
561 0.14
562 0.08
563 0.06
564 0.05
565 0.06
566 0.05
567 0.07
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.1
573 0.11
574 0.13
575 0.11
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.09
581 0.09
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.15
597 0.16
598 0.14
599 0.15
600 0.16
601 0.22
602 0.26
603 0.28
604 0.26
605 0.26
606 0.27
607 0.26
608 0.27
609 0.18
610 0.14
611 0.13
612 0.13
613 0.11
614 0.1
615 0.15
616 0.16
617 0.24
618 0.26
619 0.27
620 0.29
621 0.32
622 0.34
623 0.32
624 0.34
625 0.32
626 0.35
627 0.39
628 0.39
629 0.37
630 0.35
631 0.32
632 0.26
633 0.22
634 0.17
635 0.12
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.07
642 0.08
643 0.1
644 0.13
645 0.17
646 0.2
647 0.21
648 0.22
649 0.22
650 0.2
651 0.21
652 0.2
653 0.17
654 0.14
655 0.16
656 0.16
657 0.17
658 0.18
659 0.17
660 0.15
661 0.16
662 0.17
663 0.14
664 0.14
665 0.17
666 0.16
667 0.15
668 0.16
669 0.14
670 0.13
671 0.14
672 0.13
673 0.1
674 0.11
675 0.11
676 0.16
677 0.16
678 0.16
679 0.15
680 0.17
681 0.18
682 0.19
683 0.22
684 0.21
685 0.24
686 0.26
687 0.27
688 0.27
689 0.26
690 0.28
691 0.31
692 0.29
693 0.27
694 0.28
695 0.29
696 0.34
697 0.36
698 0.35
699 0.34
700 0.35
701 0.42
702 0.49
703 0.49
704 0.45
705 0.46
706 0.43
707 0.39
708 0.38
709 0.31
710 0.25
711 0.23
712 0.2
713 0.16
714 0.15
715 0.14
716 0.11
717 0.11
718 0.08
719 0.12
720 0.12
721 0.13
722 0.13
723 0.13
724 0.16
725 0.15
726 0.18
727 0.14
728 0.15
729 0.15
730 0.16
731 0.17
732 0.15
733 0.16
734 0.16
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.19
739 0.21
740 0.2
741 0.2
742 0.26
743 0.22
744 0.22
745 0.26
746 0.26
747 0.24
748 0.25
749 0.25
750 0.18
751 0.19
752 0.19
753 0.17
754 0.17
755 0.18
756 0.18
757 0.19
758 0.25
759 0.29
760 0.32
761 0.32
762 0.34
763 0.35
764 0.42
765 0.43
766 0.36
767 0.31
768 0.28
769 0.28
770 0.23
771 0.2
772 0.17
773 0.19
774 0.2
775 0.21
776 0.21
777 0.24
778 0.25
779 0.25
780 0.23
781 0.24
782 0.24
783 0.27
784 0.29
785 0.27
786 0.3
787 0.29
788 0.27
789 0.2
790 0.21
791 0.21
792 0.18
793 0.24
794 0.22
795 0.23
796 0.24
797 0.24
798 0.25
799 0.27
800 0.32
801 0.34
802 0.42
803 0.48
804 0.55
805 0.65
806 0.68
807 0.71
808 0.72
809 0.71
810 0.66
811 0.63
812 0.54
813 0.45
814 0.43
815 0.36
816 0.32
817 0.24
818 0.21
819 0.17
820 0.18
821 0.16
822 0.12
823 0.13
824 0.11
825 0.13
826 0.13
827 0.16
828 0.15
829 0.16
830 0.2
831 0.21
832 0.2
833 0.2
834 0.21
835 0.2
836 0.24
837 0.26
838 0.23
839 0.26
840 0.29
841 0.29
842 0.27
843 0.26
844 0.23
845 0.23
846 0.2
847 0.17
848 0.16
849 0.19
850 0.23
851 0.25
852 0.29
853 0.29
854 0.34
855 0.37
856 0.44
857 0.49
858 0.55
859 0.6
860 0.66
861 0.74
862 0.8
863 0.84
864 0.85
865 0.85
866 0.84
867 0.8
868 0.74
869 0.69
870 0.67
871 0.65
872 0.58
873 0.55
874 0.49
875 0.47
876 0.44
877 0.42
878 0.36
879 0.36
880 0.33
881 0.27
882 0.27
883 0.25
884 0.25
885 0.24
886 0.2
887 0.14
888 0.15
889 0.17
890 0.19
891 0.2
892 0.18
893 0.18
894 0.19
895 0.18
896 0.18
897 0.14
898 0.11
899 0.12
900 0.11
901 0.1
902 0.09
903 0.1
904 0.09
905 0.08
906 0.08
907 0.07
908 0.08
909 0.09
910 0.11
911 0.13
912 0.16
913 0.17
914 0.19
915 0.22
916 0.29
917 0.35
918 0.41
919 0.45
920 0.54
921 0.62
922 0.7
923 0.73
924 0.73
925 0.76
926 0.76
927 0.72
928 0.66
929 0.58
930 0.52
931 0.44