FuNGI

A0A409VM87

Protein Details

Accession

A0A409VM87

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
44-68	RLSGKRITARIRPKARRLEIHVPAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
48-59	KRITARIRPKAR

Subcellular Location(s)

plas 16, E.R. 4, nucl 2, mito 2, vacu 2, mito_nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006886 RNA_pol_III_Rpc5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04801 RPC5

Amino Acid Sequences

MDVDENDELVSVLPIHYSNSLNPDIQIHQFPLINRPLQVPPSARLSGKRITARIRPKARRLEIHVPADTRPEVSNLEKLKEFGRARLEDDREKNQEPKIKMQDDEDPRLSEVRLRSEEIPQKTVSILGIIRDGETTPTIIAIWSKFRPTLTYLDLLSQRSKRSRGGAGDDSDSDDGPPPDPDEAPLEVAVPKKEKKAAEAKEVHATARKVDDAGGPGAMGALSAVRRDMLLMIRTEEEEPWEDLTFCDVATEQSLEVFESLLSHKQEPLESEATITSFLKSIPDFSSTSLPANYNIESPDLGCQDALQFIDVLCRMNDEHTNQDFSIAALQRIEAAVNSLTLFVRNLATIFKDRQDTDAAVALVSIVDPRFIAVLLNLSGAFSRSLSPPMLEEAKGVTCLHILLASFSCTVPMIANGSAYTSKIEASMPGMLRVQREADMIYAAGRLPESWQDVPATLSSSRQSPYTKRIAINLLFAAYVMHPQLCQYLSIPSTNVPPPDLSQLVYQGIKCIFGNLHTMNQTHISPQRQSDAAMLLSLLASTFPLDTQVAEETPWVHSKSLLFTECRSHILHLFQAISGKPEGYQWLIPHEADSPSITIVLKWGSTIPWYWNFFHDEKKAYTEYLSAMTLVWLYHIDSPLFGWTNPNLDYERVTRWMFYNSDAANAMLFHSFHRLESTATNRIMDNSTMQVLRKLMDMYMLALAGSLLNLESCVCYMDIIIESLTYINAEQRAWVLLPLLHKEDHPFMLFLNSAMNDCIMHASVSRISVAMICILEILAVVTVSLPDNNALQNTAIDFIRSLIRYVKRDRQDPGLWNVFKKSLLLLTALGSTGRCDPTAIVEWDLVVRYLDSPCSDIFSAYIVAQYVLLAEQIEDPLVVRELWEHLQDALFVIMNNFSDFEESMRVFLKRWHILTSPWAQCLVRLLDSQSEKIETQDADAWTRKLQIQVSDHLSTVEAMDKEVRWTTNIGFCGHEGLIVVLQNDINVSLDNQVPPSNQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.1
3	0.13
4	0.14
5	0.16
6	0.21
7	0.25
8	0.24
9	0.24
10	0.26
11	0.27
12	0.29
13	0.3
14	0.26
15	0.26
16	0.28
17	0.28
18	0.32
19	0.35
20	0.34
21	0.32
22	0.34
23	0.35
24	0.36
25	0.41
26	0.36
27	0.33
28	0.38
29	0.4
30	0.38
31	0.38
32	0.41
33	0.41
34	0.45
35	0.49
36	0.48
37	0.51
38	0.59
39	0.64
40	0.7
41	0.74
42	0.76
43	0.79
44	0.84
45	0.85
46	0.84
47	0.83
48	0.83
49	0.81
50	0.78
51	0.73
52	0.64
53	0.57
54	0.54
55	0.45
56	0.37
57	0.29
58	0.24
59	0.24
60	0.25
61	0.31
62	0.29
63	0.32
64	0.31
65	0.32
66	0.31
67	0.37
68	0.35
69	0.33
70	0.38
71	0.37
72	0.4
73	0.48
74	0.53
75	0.52
76	0.57
77	0.6
78	0.58
79	0.6
80	0.6
81	0.58
82	0.6
83	0.55
84	0.59
85	0.6
86	0.58
87	0.55
88	0.54
89	0.57
90	0.56
91	0.6
92	0.53
93	0.45
94	0.42
95	0.42
96	0.38
97	0.34
98	0.3
99	0.3
100	0.3
101	0.32
102	0.33
103	0.41
104	0.48
105	0.48
106	0.47
107	0.4
108	0.38
109	0.34
110	0.33
111	0.24
112	0.19
113	0.15
114	0.13
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.14
120	0.13
121	0.12
122	0.12
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.11
128	0.11
129	0.16
130	0.17
131	0.2
132	0.21
133	0.22
134	0.24
135	0.25
136	0.29
137	0.27
138	0.28
139	0.26
140	0.3
141	0.32
142	0.32
143	0.35
144	0.34
145	0.37
146	0.39
147	0.42
148	0.42
149	0.44
150	0.48
151	0.47
152	0.52
153	0.51
154	0.48
155	0.47
156	0.44
157	0.41
158	0.35
159	0.29
160	0.22
161	0.19
162	0.17
163	0.15
164	0.15
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.16
170	0.16
171	0.17
172	0.16
173	0.15
174	0.15
175	0.18
176	0.19
177	0.21
178	0.23
179	0.26
180	0.31
181	0.31
182	0.36
183	0.44
184	0.46
185	0.51
186	0.54
187	0.53
188	0.55
189	0.55
190	0.49
191	0.45
192	0.4
193	0.32
194	0.29
195	0.27
196	0.19
197	0.2
198	0.21
199	0.18
200	0.18
201	0.15
202	0.12
203	0.11
204	0.11
205	0.09
206	0.06
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.08
216	0.1
217	0.13
218	0.13
219	0.15
220	0.16
221	0.17
222	0.18
223	0.16
224	0.16
225	0.15
226	0.16
227	0.16
228	0.15
229	0.14
230	0.13
231	0.15
232	0.13
233	0.1
234	0.09
235	0.07
236	0.07
237	0.09
238	0.09
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.07
245	0.05
246	0.06
247	0.08
248	0.12
249	0.14
250	0.14
251	0.16
252	0.17
253	0.18
254	0.19
255	0.23
256	0.21
257	0.19
258	0.19
259	0.18
260	0.17
261	0.17
262	0.15
263	0.1
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.12
269	0.12
270	0.15
271	0.15
272	0.17
273	0.21
274	0.2
275	0.21
276	0.2
277	0.19
278	0.18
279	0.19
280	0.18
281	0.15
282	0.14
283	0.14
284	0.12
285	0.12
286	0.14
287	0.12
288	0.12
289	0.1
290	0.1
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.11
304	0.15
305	0.15
306	0.21
307	0.22
308	0.25
309	0.24
310	0.24
311	0.22
312	0.19
313	0.23
314	0.16
315	0.15
316	0.12
317	0.12
318	0.11
319	0.12
320	0.11
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.09
336	0.12
337	0.14
338	0.15
339	0.18
340	0.19
341	0.2
342	0.22
343	0.21
344	0.19
345	0.2
346	0.17
347	0.14
348	0.13
349	0.11
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.04
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.13
377	0.14
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.12
384	0.09
385	0.08
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.06
402	0.07
403	0.06
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.07
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.13
418	0.13
419	0.14
420	0.14
421	0.14
422	0.1
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.04
434	0.05
435	0.07
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.13
450	0.16
451	0.17
452	0.22
453	0.28
454	0.31
455	0.3
456	0.33
457	0.35
458	0.33
459	0.32
460	0.26
461	0.19
462	0.15
463	0.14
464	0.12
465	0.07
466	0.07
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.07
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.09
476	0.09
477	0.1
478	0.1
479	0.09
480	0.12
481	0.13
482	0.13
483	0.11
484	0.11
485	0.12
486	0.14
487	0.14
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.12
494	0.11
495	0.11
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.08
500	0.08
501	0.13
502	0.12
503	0.14
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.16
508	0.15
509	0.14
510	0.17
511	0.18
512	0.18
513	0.19
514	0.2
515	0.19
516	0.19
517	0.17
518	0.15
519	0.12
520	0.1
521	0.09
522	0.07
523	0.06
524	0.05
525	0.04
526	0.03
527	0.02
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.06
540	0.08
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.11
545	0.11
546	0.13
547	0.16
548	0.17
549	0.15
550	0.15
551	0.19
552	0.2
553	0.21
554	0.2
555	0.18
556	0.18
557	0.18
558	0.18
559	0.16
560	0.15
561	0.13
562	0.14
563	0.13
564	0.12
565	0.11
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.1
570	0.1
571	0.11
572	0.1
573	0.13
574	0.14
575	0.14
576	0.14
577	0.14
578	0.13
579	0.12
580	0.12
581	0.09
582	0.08
583	0.09
584	0.08
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.06
589	0.06
590	0.07
591	0.06
592	0.07
593	0.08
594	0.11
595	0.16
596	0.19
597	0.2
598	0.21
599	0.26
600	0.26
601	0.3
602	0.3
603	0.28
604	0.26
605	0.29
606	0.28
607	0.24
608	0.23
609	0.19
610	0.17
611	0.15
612	0.14
613	0.1
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.06
619	0.05
620	0.06
621	0.08
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.09
626	0.11
627	0.11
628	0.1
629	0.11
630	0.1
631	0.13
632	0.14
633	0.15
634	0.14
635	0.14
636	0.16
637	0.16
638	0.18
639	0.2
640	0.19
641	0.18
642	0.19
643	0.22
644	0.2
645	0.2
646	0.23
647	0.19
648	0.2
649	0.2
650	0.18
651	0.15
652	0.14
653	0.13
654	0.08
655	0.08
656	0.07
657	0.11
658	0.11
659	0.11
660	0.13
661	0.13
662	0.14
663	0.18
664	0.22
665	0.24
666	0.24
667	0.25
668	0.23
669	0.24
670	0.24
671	0.21
672	0.17
673	0.13
674	0.14
675	0.14
676	0.15
677	0.15
678	0.14
679	0.14
680	0.14
681	0.13
682	0.11
683	0.11
684	0.11
685	0.1
686	0.1
687	0.09
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.05
692	0.04
693	0.03
694	0.03
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.04
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.06
705	0.06
706	0.07
707	0.07
708	0.05
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.05
713	0.05
714	0.06
715	0.07
716	0.07
717	0.08
718	0.08
719	0.1
720	0.09
721	0.1
722	0.09
723	0.09
724	0.12
725	0.14
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.19
730	0.21
731	0.21
732	0.2
733	0.17
734	0.15
735	0.17
736	0.16
737	0.13
738	0.13
739	0.11
740	0.1
741	0.1
742	0.1
743	0.08
744	0.08
745	0.09
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.09
750	0.1
751	0.1
752	0.1
753	0.09
754	0.09
755	0.1
756	0.1
757	0.09
758	0.08
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.06
763	0.05
764	0.05
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.04
770	0.04
771	0.05
772	0.05
773	0.06
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.09
779	0.09
780	0.09
781	0.11
782	0.1
783	0.09
784	0.09
785	0.09
786	0.14
787	0.14
788	0.14
789	0.2
790	0.26
791	0.31
792	0.39
793	0.47
794	0.49
795	0.54
796	0.56
797	0.57
798	0.58
799	0.57
800	0.58
801	0.58
802	0.53
803	0.5
804	0.49
805	0.42
806	0.36
807	0.31
808	0.25
809	0.17
810	0.16
811	0.16
812	0.14
813	0.13
814	0.14
815	0.13
816	0.12
817	0.1
818	0.1
819	0.13
820	0.13
821	0.12
822	0.12
823	0.12
824	0.17
825	0.23
826	0.23
827	0.21
828	0.19
829	0.19
830	0.2
831	0.2
832	0.15
833	0.1
834	0.08
835	0.09
836	0.1
837	0.11
838	0.11
839	0.13
840	0.12
841	0.16
842	0.16
843	0.15
844	0.14
845	0.14
846	0.14
847	0.12
848	0.13
849	0.09
850	0.09
851	0.09
852	0.08
853	0.07
854	0.06
855	0.06
856	0.05
857	0.05
858	0.06
859	0.06
860	0.07
861	0.06
862	0.07
863	0.08
864	0.09
865	0.08
866	0.07
867	0.08
868	0.11
869	0.14
870	0.15
871	0.14
872	0.14
873	0.15
874	0.15
875	0.14
876	0.12
877	0.1
878	0.09
879	0.08
880	0.09
881	0.09
882	0.1
883	0.1
884	0.09
885	0.1
886	0.11
887	0.11
888	0.15
889	0.14
890	0.16
891	0.18
892	0.18
893	0.17
894	0.22
895	0.29
896	0.31
897	0.33
898	0.37
899	0.36
900	0.38
901	0.44
902	0.49
903	0.44
904	0.39
905	0.4
906	0.35
907	0.34
908	0.37
909	0.33
910	0.26
911	0.23
912	0.24
913	0.29
914	0.32
915	0.33
916	0.29
917	0.29
918	0.26
919	0.26
920	0.28
921	0.21
922	0.21
923	0.25
924	0.25
925	0.27
926	0.3
927	0.3
928	0.28
929	0.31
930	0.3
931	0.3
932	0.31
933	0.34
934	0.35
935	0.4
936	0.45
937	0.43
938	0.41
939	0.36
940	0.33
941	0.26
942	0.22
943	0.21
944	0.14
945	0.14
946	0.17
947	0.17
948	0.2
949	0.23
950	0.23
951	0.2
952	0.23
953	0.25
954	0.28
955	0.3
956	0.28
957	0.26
958	0.26
959	0.28
960	0.25
961	0.22
962	0.16
963	0.14
964	0.15
965	0.14
966	0.14
967	0.11
968	0.11
969	0.1
970	0.1
971	0.09
972	0.08
973	0.08
974	0.09
975	0.1
976	0.13
977	0.14
978	0.16
979	0.18

A0A409VM87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer