Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YSJ2

Protein Details
Accession A0A409YSJ2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
808-828SMTLSSKKKNDEKNRKDSYSKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MAPFTTPEVVLSGLKERFESLTVQGKLYLGSSVGNLHIYNLVESTSEDGSVSEKVELVEVKKGLVKRSIDQIGFIRDVNSLVVLSDMTVTLFPLPSFSPATPLLKAKAAFSFAIYSYVEQQPLSAEELQGSPGFQRSQPIPCRVTMLLVGCRRKAVIYSWRDGEPQEVKEAPLPHSARSIVFLDQDAACFAYSPTEFAMFSIPSMTAAEITTPLPVAGSATAMTSAFTGLTGYMTLGLGAKAKPNVVQISQSEILIGKDVEGVFIGPNGRPTRPATIEWPVPPEEISFIKPYIFSVLPAGSIQTQNTEPTPGSSSGAGSSTQVQTNPTALVQIRSSLSMQITQTIFFPFNASEYSPIQNATIRLLTPSNPSQSRLYLLTTPTDKTAAANDGSSVWSFKMRPWSEQIDELVLNGLYADALELLDIVDNALLSDKDQRRTRIRALNAVAQFRASKFDAAIDTFIELDFNPAKVVALYPESVAGRLSVPRERWIPLYGGPEPEEERAPSSDNASEEGKSSSHEKSATEIFDSIVTSTTGSIGGRLRKGGLGMLIPGGAKDDDTASITARKRPPTDDTSRSIETLVRYLSDRRPKLRAALEAVNITPESQSHFASPLSEASVDELFELPNAPLAALTPEQLLRFAQLVDTALYKSYLVIRPGLLGPLCRITNWCEVSEVEEDLRTRKKYAELRDLYHGKKMHSKALDLLKELSDDETDMEDKLGPTIHYLQKLGPEYLDQIFKYARWVFETDSEMAFQIFTSEDVELPKKAVADYLEGLDPKLCAKYLEYQLQERQEETPAYHDRLAELYLSMTLSSKKKNDEKNRKDSYSKLLAFINTNQHISVERIYGQVAPTDLHEARAILLGRLGRHDQALETYVYRLQDFMKAEEYCKRIYEPGSPTSGVFLNLLRIYLRPTVQSSTDFLPPALELISRHSRRMDTVEALQLLPPLVTTDDIRAFLIEALRAPVFDTRVIRNIGKARNDQLARRLMVLQTKRVKITDSRICPQCHKRLGNSVIAVHAPRGEVTHYQCREPFTRRLHELRGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.23
7 0.21
8 0.29
9 0.3
10 0.3
11 0.3
12 0.28
13 0.27
14 0.25
15 0.21
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.11
30 0.12
31 0.14
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.16
44 0.16
45 0.21
46 0.2
47 0.21
48 0.24
49 0.27
50 0.29
51 0.34
52 0.35
53 0.33
54 0.42
55 0.48
56 0.43
57 0.44
58 0.44
59 0.42
60 0.4
61 0.37
62 0.29
63 0.22
64 0.22
65 0.19
66 0.16
67 0.1
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.13
83 0.16
84 0.16
85 0.19
86 0.22
87 0.26
88 0.27
89 0.29
90 0.28
91 0.3
92 0.3
93 0.28
94 0.28
95 0.27
96 0.25
97 0.23
98 0.23
99 0.19
100 0.21
101 0.2
102 0.18
103 0.2
104 0.22
105 0.21
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.18
110 0.2
111 0.16
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.13
120 0.15
121 0.14
122 0.19
123 0.21
124 0.3
125 0.37
126 0.43
127 0.42
128 0.41
129 0.45
130 0.41
131 0.39
132 0.34
133 0.31
134 0.31
135 0.36
136 0.4
137 0.35
138 0.36
139 0.34
140 0.31
141 0.29
142 0.28
143 0.3
144 0.33
145 0.37
146 0.39
147 0.4
148 0.41
149 0.39
150 0.39
151 0.35
152 0.3
153 0.3
154 0.27
155 0.27
156 0.31
157 0.33
158 0.29
159 0.32
160 0.32
161 0.28
162 0.31
163 0.31
164 0.27
165 0.27
166 0.27
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.16
172 0.16
173 0.13
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.16
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.08
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.14
231 0.17
232 0.2
233 0.19
234 0.23
235 0.2
236 0.26
237 0.26
238 0.25
239 0.21
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.14
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.09
252 0.1
253 0.07
254 0.14
255 0.16
256 0.17
257 0.19
258 0.22
259 0.28
260 0.29
261 0.31
262 0.3
263 0.34
264 0.38
265 0.36
266 0.37
267 0.31
268 0.28
269 0.26
270 0.22
271 0.19
272 0.16
273 0.17
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.16
280 0.15
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.12
296 0.13
297 0.17
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.12
305 0.1
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.15
313 0.14
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.16
328 0.16
329 0.15
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.13
334 0.14
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.16
354 0.19
355 0.23
356 0.22
357 0.25
358 0.26
359 0.26
360 0.27
361 0.23
362 0.23
363 0.19
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.18
369 0.18
370 0.15
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.21
386 0.21
387 0.24
388 0.28
389 0.33
390 0.32
391 0.34
392 0.33
393 0.25
394 0.23
395 0.21
396 0.16
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.13
419 0.16
420 0.23
421 0.27
422 0.32
423 0.38
424 0.43
425 0.5
426 0.49
427 0.49
428 0.49
429 0.48
430 0.5
431 0.47
432 0.43
433 0.36
434 0.29
435 0.27
436 0.2
437 0.21
438 0.14
439 0.12
440 0.1
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.07
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.1
471 0.12
472 0.13
473 0.16
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.19
478 0.19
479 0.18
480 0.22
481 0.2
482 0.19
483 0.19
484 0.18
485 0.18
486 0.18
487 0.15
488 0.11
489 0.12
490 0.11
491 0.12
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.12
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.1
503 0.13
504 0.11
505 0.12
506 0.13
507 0.12
508 0.14
509 0.16
510 0.16
511 0.14
512 0.13
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.09
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.07
525 0.09
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.11
533 0.09
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.06
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.13
550 0.14
551 0.2
552 0.24
553 0.27
554 0.28
555 0.31
556 0.35
557 0.37
558 0.44
559 0.42
560 0.42
561 0.44
562 0.43
563 0.41
564 0.36
565 0.3
566 0.23
567 0.2
568 0.16
569 0.11
570 0.11
571 0.14
572 0.2
573 0.27
574 0.3
575 0.32
576 0.36
577 0.36
578 0.41
579 0.41
580 0.38
581 0.34
582 0.34
583 0.32
584 0.29
585 0.28
586 0.23
587 0.19
588 0.16
589 0.11
590 0.07
591 0.09
592 0.09
593 0.1
594 0.1
595 0.11
596 0.11
597 0.12
598 0.12
599 0.1
600 0.09
601 0.09
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.06
609 0.06
610 0.07
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.07
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.11
639 0.13
640 0.13
641 0.14
642 0.14
643 0.15
644 0.16
645 0.17
646 0.13
647 0.1
648 0.11
649 0.13
650 0.13
651 0.12
652 0.13
653 0.15
654 0.22
655 0.24
656 0.23
657 0.21
658 0.21
659 0.24
660 0.24
661 0.2
662 0.13
663 0.13
664 0.13
665 0.15
666 0.2
667 0.18
668 0.18
669 0.19
670 0.26
671 0.32
672 0.39
673 0.46
674 0.45
675 0.47
676 0.54
677 0.58
678 0.52
679 0.51
680 0.46
681 0.37
682 0.41
683 0.4
684 0.39
685 0.35
686 0.35
687 0.35
688 0.41
689 0.41
690 0.34
691 0.34
692 0.27
693 0.26
694 0.25
695 0.19
696 0.11
697 0.1
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.09
706 0.09
707 0.07
708 0.09
709 0.16
710 0.19
711 0.2
712 0.21
713 0.21
714 0.26
715 0.28
716 0.26
717 0.2
718 0.17
719 0.18
720 0.2
721 0.22
722 0.16
723 0.15
724 0.16
725 0.15
726 0.2
727 0.2
728 0.19
729 0.19
730 0.21
731 0.2
732 0.24
733 0.27
734 0.23
735 0.21
736 0.21
737 0.18
738 0.16
739 0.14
740 0.1
741 0.07
742 0.06
743 0.06
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.1
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.13
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.12
756 0.13
757 0.14
758 0.15
759 0.16
760 0.15
761 0.16
762 0.14
763 0.13
764 0.11
765 0.11
766 0.09
767 0.08
768 0.1
769 0.18
770 0.24
771 0.31
772 0.32
773 0.36
774 0.4
775 0.45
776 0.44
777 0.37
778 0.33
779 0.29
780 0.27
781 0.23
782 0.25
783 0.24
784 0.26
785 0.27
786 0.25
787 0.23
788 0.23
789 0.23
790 0.17
791 0.13
792 0.1
793 0.09
794 0.09
795 0.08
796 0.08
797 0.12
798 0.15
799 0.2
800 0.23
801 0.3
802 0.38
803 0.49
804 0.59
805 0.66
806 0.73
807 0.78
808 0.84
809 0.82
810 0.77
811 0.71
812 0.68
813 0.66
814 0.58
815 0.49
816 0.43
817 0.39
818 0.38
819 0.38
820 0.38
821 0.3
822 0.3
823 0.27
824 0.26
825 0.25
826 0.25
827 0.22
828 0.16
829 0.15
830 0.14
831 0.15
832 0.16
833 0.15
834 0.14
835 0.13
836 0.11
837 0.11
838 0.17
839 0.16
840 0.16
841 0.16
842 0.15
843 0.15
844 0.19
845 0.18
846 0.12
847 0.14
848 0.15
849 0.15
850 0.19
851 0.2
852 0.17
853 0.17
854 0.18
855 0.16
856 0.17
857 0.18
858 0.16
859 0.15
860 0.15
861 0.17
862 0.17
863 0.16
864 0.15
865 0.14
866 0.18
867 0.19
868 0.2
869 0.24
870 0.24
871 0.26
872 0.32
873 0.34
874 0.3
875 0.3
876 0.3
877 0.27
878 0.29
879 0.34
880 0.33
881 0.34
882 0.37
883 0.36
884 0.34
885 0.33
886 0.31
887 0.24
888 0.19
889 0.16
890 0.16
891 0.15
892 0.16
893 0.14
894 0.14
895 0.16
896 0.2
897 0.2
898 0.19
899 0.22
900 0.24
901 0.26
902 0.28
903 0.27
904 0.26
905 0.29
906 0.27
907 0.23
908 0.21
909 0.19
910 0.17
911 0.15
912 0.13
913 0.09
914 0.16
915 0.26
916 0.27
917 0.3
918 0.32
919 0.33
920 0.35
921 0.4
922 0.38
923 0.32
924 0.35
925 0.38
926 0.36
927 0.35
928 0.32
929 0.27
930 0.22
931 0.17
932 0.13
933 0.09
934 0.09
935 0.1
936 0.1
937 0.14
938 0.16
939 0.17
940 0.18
941 0.17
942 0.16
943 0.17
944 0.17
945 0.14
946 0.12
947 0.14
948 0.14
949 0.14
950 0.14
951 0.16
952 0.16
953 0.19
954 0.22
955 0.23
956 0.28
957 0.33
958 0.32
959 0.36
960 0.42
961 0.45
962 0.49
963 0.5
964 0.49
965 0.54
966 0.57
967 0.55
968 0.54
969 0.55
970 0.49
971 0.46
972 0.44
973 0.38
974 0.43
975 0.44
976 0.45
977 0.47
978 0.5
979 0.51
980 0.49
981 0.5
982 0.48
983 0.53
984 0.54
985 0.53
986 0.57
987 0.61
988 0.65
989 0.7
990 0.73
991 0.73
992 0.72
993 0.71
994 0.68
995 0.71
996 0.72
997 0.7
998 0.64
999 0.56
1000 0.48
1001 0.45
1002 0.4
1003 0.3
1004 0.27
1005 0.2
1006 0.17
1007 0.17
1008 0.17
1009 0.21
1010 0.27
1011 0.36
1012 0.37
1013 0.41
1014 0.43
1015 0.47
1016 0.5
1017 0.51
1018 0.53
1019 0.51
1020 0.58
1021 0.61
1022 0.66