Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VCG6

Protein Details
Accession A0A409VCG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-185IPPNRLYKPKGRRGRNMTLNNTRRPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-176RKDLPKPVKPPSAAKSIAPKPFGRKPGHIPPNRLYKPKGRRGRN
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MASSTEAQIRNEIERLTATINQHKARSSNPKRGGYAPYPSYHGAYPRSNTYVNPNYRPANKYIRPGLTVDGKTPTPASTSAPATSATSSNISPVAGPSTSTIDSSVKPLSSSGKKEVVLGGVAFESSGRSLVRKDLPKPVKPPSAAKSIAPKPFGRKPGHIPPNRLYKPKGRRGRNMTLNNTRRPFSSRKTSVRKTVDKPCPRFTTTGACSRGLTCMYQHDPTKIAICWNFLQDNCSNSAETCNLSHDPTPERTPLCMHFLNKGRCTREKCPFPHVNVGQRDGVCRDFAVLGYCEKGLDCDRQHVRECPDFAEKGTCGTKGCKLPHVIRANRSRKVAASSENKAASAGGTTLSSAEDKMDASSEVVTAPQGEIGDEYISLTFHESDSDSEEESEEESGSEEEEEEGSSADESESEDKDSMEGIQVHKSGMQSTFEESTANSQLPQFRQPDPVSSRPTIEQIAMGLHISRTPHLRPLGSSTYSFPPRHPNNYSSNPYDLHNHRSTPITLPPPPSRSSMKKPSATVVTSSSSSPALSPPFSHQSGSSTTMTSITPSSTNPPRPFSAIKSRMARFLPRSASMSATSTMVSTLDSPRSSTSVPPQKKAVRFTTDDAEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.22
4 0.25
5 0.27
6 0.33
7 0.4
8 0.43
9 0.44
10 0.45
11 0.44
12 0.48
13 0.54
14 0.55
15 0.58
16 0.64
17 0.68
18 0.68
19 0.71
20 0.7
21 0.65
22 0.65
23 0.58
24 0.51
25 0.49
26 0.47
27 0.44
28 0.38
29 0.38
30 0.34
31 0.35
32 0.37
33 0.38
34 0.41
35 0.39
36 0.38
37 0.43
38 0.47
39 0.48
40 0.5
41 0.5
42 0.52
43 0.58
44 0.6
45 0.57
46 0.57
47 0.55
48 0.58
49 0.61
50 0.58
51 0.54
52 0.52
53 0.51
54 0.49
55 0.45
56 0.39
57 0.35
58 0.31
59 0.3
60 0.29
61 0.25
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.21
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.2
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.2
92 0.21
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.23
97 0.28
98 0.32
99 0.34
100 0.37
101 0.37
102 0.38
103 0.38
104 0.32
105 0.27
106 0.21
107 0.17
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.07
112 0.07
113 0.05
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.15
119 0.23
120 0.29
121 0.33
122 0.42
123 0.5
124 0.56
125 0.61
126 0.63
127 0.63
128 0.6
129 0.64
130 0.57
131 0.57
132 0.52
133 0.48
134 0.49
135 0.49
136 0.51
137 0.48
138 0.46
139 0.45
140 0.51
141 0.57
142 0.53
143 0.5
144 0.53
145 0.6
146 0.67
147 0.66
148 0.65
149 0.63
150 0.69
151 0.69
152 0.66
153 0.59
154 0.59
155 0.63
156 0.67
157 0.7
158 0.67
159 0.73
160 0.77
161 0.83
162 0.83
163 0.82
164 0.8
165 0.81
166 0.8
167 0.78
168 0.72
169 0.63
170 0.54
171 0.51
172 0.48
173 0.44
174 0.48
175 0.49
176 0.56
177 0.64
178 0.68
179 0.72
180 0.75
181 0.76
182 0.72
183 0.74
184 0.75
185 0.75
186 0.75
187 0.73
188 0.7
189 0.65
190 0.6
191 0.52
192 0.51
193 0.45
194 0.47
195 0.42
196 0.37
197 0.35
198 0.34
199 0.33
200 0.25
201 0.21
202 0.14
203 0.17
204 0.19
205 0.22
206 0.23
207 0.22
208 0.23
209 0.23
210 0.25
211 0.19
212 0.21
213 0.18
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.19
219 0.22
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.17
225 0.15
226 0.17
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.19
236 0.21
237 0.23
238 0.23
239 0.23
240 0.22
241 0.23
242 0.23
243 0.25
244 0.25
245 0.23
246 0.26
247 0.33
248 0.38
249 0.41
250 0.45
251 0.44
252 0.48
253 0.54
254 0.55
255 0.56
256 0.58
257 0.56
258 0.6
259 0.61
260 0.58
261 0.6
262 0.56
263 0.55
264 0.49
265 0.48
266 0.42
267 0.37
268 0.34
269 0.27
270 0.24
271 0.16
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.13
286 0.13
287 0.2
288 0.22
289 0.26
290 0.28
291 0.3
292 0.33
293 0.31
294 0.32
295 0.27
296 0.28
297 0.25
298 0.23
299 0.22
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.14
306 0.19
307 0.22
308 0.23
309 0.25
310 0.28
311 0.3
312 0.38
313 0.46
314 0.44
315 0.46
316 0.55
317 0.57
318 0.57
319 0.56
320 0.49
321 0.41
322 0.42
323 0.37
324 0.33
325 0.33
326 0.32
327 0.34
328 0.34
329 0.32
330 0.28
331 0.25
332 0.18
333 0.12
334 0.09
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.06
399 0.08
400 0.08
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.16
418 0.14
419 0.16
420 0.18
421 0.16
422 0.16
423 0.14
424 0.17
425 0.16
426 0.15
427 0.13
428 0.14
429 0.18
430 0.21
431 0.26
432 0.26
433 0.26
434 0.33
435 0.33
436 0.39
437 0.42
438 0.46
439 0.46
440 0.44
441 0.44
442 0.38
443 0.4
444 0.33
445 0.27
446 0.2
447 0.15
448 0.14
449 0.12
450 0.11
451 0.09
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.14
457 0.15
458 0.21
459 0.24
460 0.25
461 0.25
462 0.31
463 0.35
464 0.33
465 0.33
466 0.31
467 0.35
468 0.41
469 0.4
470 0.35
471 0.39
472 0.44
473 0.5
474 0.52
475 0.5
476 0.51
477 0.59
478 0.63
479 0.56
480 0.53
481 0.46
482 0.43
483 0.46
484 0.41
485 0.41
486 0.39
487 0.36
488 0.35
489 0.37
490 0.37
491 0.33
492 0.37
493 0.36
494 0.36
495 0.42
496 0.46
497 0.47
498 0.47
499 0.48
500 0.48
501 0.49
502 0.54
503 0.58
504 0.6
505 0.62
506 0.61
507 0.63
508 0.62
509 0.56
510 0.49
511 0.42
512 0.36
513 0.32
514 0.3
515 0.26
516 0.2
517 0.18
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.18
523 0.23
524 0.28
525 0.3
526 0.3
527 0.27
528 0.27
529 0.3
530 0.33
531 0.28
532 0.23
533 0.22
534 0.22
535 0.22
536 0.2
537 0.17
538 0.14
539 0.14
540 0.14
541 0.21
542 0.29
543 0.38
544 0.41
545 0.45
546 0.46
547 0.5
548 0.52
549 0.52
550 0.55
551 0.52
552 0.56
553 0.59
554 0.58
555 0.59
556 0.59
557 0.6
558 0.54
559 0.56
560 0.53
561 0.49
562 0.51
563 0.45
564 0.45
565 0.38
566 0.36
567 0.29
568 0.24
569 0.2
570 0.17
571 0.16
572 0.12
573 0.11
574 0.11
575 0.14
576 0.19
577 0.19
578 0.21
579 0.23
580 0.26
581 0.27
582 0.29
583 0.35
584 0.41
585 0.47
586 0.49
587 0.56
588 0.62
589 0.67
590 0.7
591 0.68
592 0.64
593 0.63
594 0.64