FuNGI

A0A409WC63

Protein Details

Accession

A0A409WC63

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
262-288	SSKPSDGAKKGKRPKCSNCRRMGHLAE	Hydrophilic
318-339	SGGGSEKKKKPHAKAAAKRDSS	Basic
881-901	RPFVTKKKPYRVACRLWRPLY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
271-273	KGK
320-336	GGSEKKKKPHAKAAAKR

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 11, cyto 9, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR013103 RVT_2
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MGLSVDDSLYSESYSKTEAPTRLPMLDEDGTNWITWRDIVYGELLARGLFDNVEGLAIEALRPVVKDGKTYSATDTEFKNPLDENVAGKLVRDWKNWVRNEWSAKTLIFRSIPRTIMIEIRDKPSVAEIWKALCKTYESRTASGRQYLLATLFRTVFDAHKEGASLHAHFAQMMSLRQRYIESQRKLKAEDIFKEALIASLPTDVFGPTMDTLRLSYETTGQELTVETIIEKAYDHWERLYGPDALRKEFGTTASGSTALASSKPSDGAKKGKRPKCSNCRRMGHLAEKCFARGGGAEDVAPEWWKQTHDENGRLKVSGGGSEKKKKPHAKAAAKRDSSDSYESDDSDSDRMGMVSLLDRSPSPASPHHVATVSELKDQIAYRGSLLDGGANHHFTPLRHSLRDFRTVTPTDVDSAAGVAFPITGYGSMTIKLPPPKGSSTPCKVELRKVYYAPTCPWTLVSQAKLIKRGFRIALEPDGAAVINPSTHQVISFIPVHNDLYWIDRAKDQSGHRSAMVANISLLEFHRRMGHLNFDYCRKMVKHGMVEGVTVEDMGEQVGLCRECVEAKITRKPFPKASQSVFKVYGEKVVADVWGPAAVRRSSANPDETFIDIDSSTIPSHITNSNYIAEPIDPPEPHPQPNILDDAQNVQPPPAIDDIHPEPEPEPEVRQLRPRNVPEGHYKEPDLRKKLVAQLVSAVAALGDDYIRNTIKSSKESFVDICHFALAATAGDEPSIQQALSGPDRPKWVEAIKAELAQILKVHTWDIVLVEEEDQGRIIPCRWVLRIKRDALGNISRYKARLVAKGFKQQFGVDFNETFAPTIRPATLRFLLTFAATSNSVVEQADVKNAYLHGVLPPDEIIYMEIPPYFEEFHEIPPEVRPFVTKKKPYRVACRLWRPLYGSKQGANKWYEKLVQVVRSIGFTISQADEALFYRTWPEEHRYMLIGAATDDFTLVADSNITMKQVKESLNKEFELVELGPINWLLGVSVERNIESRTFALGQEAYIDQILARFNLSDAKTHSTPMEPGLDLTTDAPHVSSKSLSQEERRVYREGIGSLMYLSVMTRPDIAYAVSTLSQFLESPKTTHLNALWRVFKYLKGTKKLRLVIGGDSNEMDAFSDADWAQASHRHSISGYAFRVAGGVISWASKKQSLIALSSTESEYMALTFASRDISWINKLVTELVGIFKFPEFPITLWCDNQGAIQLSNNPVFHMRTKHIDVQFHYTRQVIRRGIVKLEYVQTEDQVADIFTKALGRVKLEKFRGMLGLRETH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.16
3	0.19
4	0.25
5	0.28
6	0.32
7	0.38
8	0.41
9	0.4
10	0.4
11	0.36
12	0.36
13	0.34
14	0.3
15	0.24
16	0.25
17	0.24
18	0.22
19	0.22
20	0.16
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.13
28	0.15
29	0.14
30	0.15
31	0.13
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.1
36	0.08
37	0.08
38	0.07
39	0.07
40	0.08
41	0.07
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.08
50	0.1
51	0.16
52	0.17
53	0.21
54	0.24
55	0.31
56	0.33
57	0.35
58	0.36
59	0.35
60	0.37
61	0.36
62	0.36
63	0.34
64	0.35
65	0.34
66	0.33
67	0.28
68	0.27
69	0.29
70	0.27
71	0.24
72	0.23
73	0.25
74	0.22
75	0.21
76	0.25
77	0.29
78	0.33
79	0.33
80	0.38
81	0.45
82	0.55
83	0.58
84	0.59
85	0.57
86	0.59
87	0.65
88	0.61
89	0.55
90	0.49
91	0.45
92	0.44
93	0.39
94	0.37
95	0.33
96	0.31
97	0.34
98	0.37
99	0.37
100	0.34
101	0.35
102	0.31
103	0.32
104	0.33
105	0.34
106	0.32
107	0.35
108	0.36
109	0.33
110	0.32
111	0.3
112	0.31
113	0.24
114	0.25
115	0.23
116	0.26
117	0.3
118	0.3
119	0.28
120	0.25
121	0.27
122	0.28
123	0.32
124	0.37
125	0.37
126	0.39
127	0.43
128	0.47
129	0.48
130	0.49
131	0.44
132	0.35
133	0.32
134	0.3
135	0.29
136	0.26
137	0.22
138	0.19
139	0.19
140	0.18
141	0.18
142	0.18
143	0.18
144	0.19
145	0.21
146	0.19
147	0.19
148	0.19
149	0.18
150	0.21
151	0.22
152	0.19
153	0.18
154	0.19
155	0.19
156	0.18
157	0.18
158	0.16
159	0.15
160	0.17
161	0.2
162	0.2
163	0.2
164	0.21
165	0.23
166	0.25
167	0.34
168	0.4
169	0.42
170	0.49
171	0.55
172	0.59
173	0.6
174	0.6
175	0.57
176	0.55
177	0.52
178	0.5
179	0.45
180	0.41
181	0.39
182	0.34
183	0.26
184	0.19
185	0.15
186	0.09
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.1
195	0.09
196	0.1
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.13
201	0.15
202	0.13
203	0.13
204	0.16
205	0.17
206	0.18
207	0.18
208	0.16
209	0.15
210	0.14
211	0.15
212	0.1
213	0.09
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.14
221	0.17
222	0.18
223	0.18
224	0.19
225	0.2
226	0.22
227	0.24
228	0.2
229	0.19
230	0.24
231	0.26
232	0.27
233	0.27
234	0.26
235	0.25
236	0.23
237	0.23
238	0.19
239	0.18
240	0.17
241	0.16
242	0.16
243	0.13
244	0.12
245	0.11
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.13
252	0.14
253	0.18
254	0.23
255	0.33
256	0.4
257	0.49
258	0.59
259	0.62
260	0.71
261	0.77
262	0.83
263	0.84
264	0.86
265	0.86
266	0.85
267	0.86
268	0.82
269	0.8
270	0.77
271	0.76
272	0.71
273	0.64
274	0.58
275	0.53
276	0.47
277	0.39
278	0.31
279	0.22
280	0.16
281	0.16
282	0.15
283	0.14
284	0.14
285	0.13
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.09
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.13
294	0.17
295	0.26
296	0.32
297	0.4
298	0.44
299	0.49
300	0.49
301	0.47
302	0.42
303	0.36
304	0.3
305	0.27
306	0.26
307	0.27
308	0.33
309	0.42
310	0.47
311	0.5
312	0.59
313	0.63
314	0.66
315	0.7
316	0.74
317	0.75
318	0.8
319	0.84
320	0.85
321	0.78
322	0.72
323	0.65
324	0.57
325	0.5
326	0.44
327	0.34
328	0.29
329	0.28
330	0.27
331	0.24
332	0.22
333	0.19
334	0.16
335	0.15
336	0.1
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.13
349	0.14
350	0.16
351	0.17
352	0.23
353	0.26
354	0.27
355	0.26
356	0.26
357	0.25
358	0.26
359	0.3
360	0.25
361	0.24
362	0.23
363	0.21
364	0.22
365	0.22
366	0.19
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.08
376	0.1
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.15
382	0.13
383	0.19
384	0.25
385	0.28
386	0.29
387	0.31
388	0.38
389	0.41
390	0.49
391	0.45
392	0.39
393	0.41
394	0.42
395	0.41
396	0.35
397	0.31
398	0.24
399	0.22
400	0.2
401	0.12
402	0.11
403	0.09
404	0.06
405	0.06
406	0.04
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.04
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.08
418	0.12
419	0.17
420	0.18
421	0.2
422	0.23
423	0.26
424	0.3
425	0.35
426	0.39
427	0.4
428	0.43
429	0.46
430	0.49
431	0.47
432	0.5
433	0.53
434	0.51
435	0.5
436	0.46
437	0.46
438	0.42
439	0.44
440	0.38
441	0.33
442	0.27
443	0.23
444	0.23
445	0.19
446	0.2
447	0.2
448	0.19
449	0.22
450	0.26
451	0.27
452	0.32
453	0.32
454	0.33
455	0.32
456	0.34
457	0.3
458	0.27
459	0.28
460	0.25
461	0.26
462	0.22
463	0.2
464	0.16
465	0.15
466	0.13
467	0.1
468	0.07
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.07
477	0.07
478	0.1
479	0.13
480	0.12
481	0.12
482	0.14
483	0.15
484	0.13
485	0.14
486	0.11
487	0.12
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.15
492	0.17
493	0.17
494	0.23
495	0.22
496	0.28
497	0.3
498	0.31
499	0.28
500	0.28
501	0.26
502	0.24
503	0.23
504	0.14
505	0.11
506	0.1
507	0.1
508	0.09
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.11
514	0.11
515	0.14
516	0.15
517	0.22
518	0.2
519	0.24
520	0.25
521	0.26
522	0.27
523	0.25
524	0.27
525	0.21
526	0.22
527	0.24
528	0.27
529	0.27
530	0.27
531	0.29
532	0.26
533	0.25
534	0.21
535	0.16
536	0.11
537	0.08
538	0.06
539	0.04
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.02
544	0.03
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.06
550	0.07
551	0.07
552	0.1
553	0.13
554	0.18
555	0.26
556	0.29
557	0.35
558	0.39
559	0.42
560	0.46
561	0.47
562	0.51
563	0.49
564	0.5
565	0.52
566	0.5
567	0.51
568	0.46
569	0.41
570	0.34
571	0.29
572	0.28
573	0.2
574	0.17
575	0.13
576	0.11
577	0.11
578	0.08
579	0.08
580	0.05
581	0.06
582	0.05
583	0.05
584	0.08
585	0.08
586	0.09
587	0.1
588	0.12
589	0.15
590	0.17
591	0.21
592	0.18
593	0.19
594	0.2
595	0.2
596	0.18
597	0.14
598	0.12
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.05
607	0.08
608	0.1
609	0.11
610	0.11
611	0.13
612	0.14
613	0.14
614	0.14
615	0.12
616	0.1
617	0.09
618	0.1
619	0.11
620	0.1
621	0.12
622	0.19
623	0.2
624	0.21
625	0.21
626	0.21
627	0.2
628	0.21
629	0.22
630	0.15
631	0.14
632	0.13
633	0.16
634	0.15
635	0.15
636	0.14
637	0.1
638	0.11
639	0.1
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.08
644	0.13
645	0.15
646	0.17
647	0.17
648	0.15
649	0.14
650	0.14
651	0.16
652	0.12
653	0.12
654	0.14
655	0.17
656	0.18
657	0.25
658	0.29
659	0.33
660	0.4
661	0.4
662	0.42
663	0.41
664	0.43
665	0.44
666	0.47
667	0.45
668	0.39
669	0.38
670	0.38
671	0.44
672	0.48
673	0.44
674	0.38
675	0.36
676	0.37
677	0.42
678	0.39
679	0.32
680	0.25
681	0.22
682	0.21
683	0.19
684	0.17
685	0.1
686	0.06
687	0.05
688	0.05
689	0.03
690	0.03
691	0.02
692	0.03
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.07
697	0.11
698	0.14
699	0.18
700	0.21
701	0.22
702	0.23
703	0.24
704	0.24
705	0.22
706	0.23
707	0.2
708	0.16
709	0.14
710	0.13
711	0.11
712	0.11
713	0.08
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.05
723	0.04
724	0.04
725	0.06
726	0.09
727	0.11
728	0.16
729	0.16
730	0.18
731	0.2
732	0.21
733	0.21
734	0.21
735	0.2
736	0.2
737	0.2
738	0.23
739	0.22
740	0.22
741	0.21
742	0.2
743	0.18
744	0.14
745	0.14
746	0.09
747	0.08
748	0.08
749	0.08
750	0.07
751	0.07
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.06
763	0.06
764	0.07
765	0.07
766	0.08
767	0.1
768	0.12
769	0.15
770	0.23
771	0.27
772	0.35
773	0.42
774	0.42
775	0.43
776	0.42
777	0.41
778	0.39
779	0.39
780	0.34
781	0.29
782	0.29
783	0.27
784	0.26
785	0.25
786	0.25
787	0.23
788	0.25
789	0.28
790	0.35
791	0.39
792	0.48
793	0.49
794	0.45
795	0.43
796	0.38
797	0.35
798	0.3
799	0.29
800	0.21
801	0.2
802	0.19
803	0.19
804	0.18
805	0.17
806	0.14
807	0.11
808	0.1
809	0.11
810	0.11
811	0.11
812	0.12
813	0.18
814	0.19
815	0.19
816	0.19
817	0.19
818	0.18
819	0.17
820	0.15
821	0.1
822	0.1
823	0.09
824	0.08
825	0.08
826	0.08
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.08
831	0.08
832	0.11
833	0.11
834	0.11
835	0.11
836	0.11
837	0.11
838	0.1
839	0.1
840	0.08
841	0.09
842	0.1
843	0.09
844	0.09
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.07
849	0.07
850	0.06
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.09
856	0.08
857	0.08
858	0.12
859	0.13
860	0.15
861	0.17
862	0.17
863	0.16
864	0.2
865	0.22
866	0.18
867	0.17
868	0.18
869	0.2
870	0.29
871	0.38
872	0.43
873	0.5
874	0.59
875	0.69
876	0.73
877	0.79
878	0.79
879	0.78
880	0.8
881	0.81
882	0.8
883	0.73
884	0.69
885	0.64
886	0.62
887	0.59
888	0.56
889	0.49
890	0.44
891	0.48
892	0.48
893	0.49
894	0.45
895	0.41
896	0.36
897	0.36
898	0.34
899	0.29
900	0.32
901	0.3
902	0.3
903	0.28
904	0.28
905	0.25
906	0.23
907	0.23
908	0.17
909	0.13
910	0.1
911	0.11
912	0.1
913	0.1
914	0.09
915	0.08
916	0.09
917	0.1
918	0.12
919	0.1
920	0.09
921	0.11
922	0.11
923	0.13
924	0.15
925	0.2
926	0.2
927	0.22
928	0.23
929	0.23
930	0.22
931	0.22
932	0.19
933	0.14
934	0.11
935	0.1
936	0.09
937	0.07
938	0.07
939	0.06
940	0.06
941	0.06
942	0.05
943	0.05
944	0.04
945	0.05
946	0.07
947	0.07
948	0.08
949	0.09
950	0.09
951	0.12
952	0.16
953	0.21
954	0.26
955	0.3
956	0.36
957	0.39
958	0.39
959	0.38
960	0.33
961	0.28
962	0.25
963	0.21
964	0.15
965	0.12
966	0.12
967	0.11
968	0.11
969	0.11
970	0.06
971	0.06
972	0.04
973	0.04
974	0.06
975	0.06
976	0.09
977	0.09
978	0.1
979	0.11
980	0.13
981	0.13
982	0.13
983	0.13
984	0.14
985	0.15
986	0.15
987	0.17
988	0.16
989	0.15
990	0.15
991	0.14
992	0.12
993	0.1
994	0.1
995	0.07
996	0.09
997	0.09
998	0.07
999	0.08
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.14
1003	0.15
1004	0.16
1005	0.19
1006	0.26
1007	0.26
1008	0.27
1009	0.28
1010	0.23
1011	0.24
1012	0.23
1013	0.24
1014	0.17
1015	0.17
1016	0.17
1017	0.16
1018	0.15
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.1
1022	0.09
1023	0.09
1024	0.09
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.12
1029	0.18
1030	0.23
1031	0.26
1032	0.31
1033	0.38
1034	0.44
1035	0.49
1036	0.5
1037	0.47
1038	0.43
1039	0.44
1040	0.42
1041	0.35
1042	0.29
1043	0.23
1044	0.2
1045	0.17
1046	0.16
1047	0.11
1048	0.07
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.1
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.16
1069	0.16
1070	0.18
1071	0.21
1072	0.24
1073	0.24
1074	0.28
1075	0.3
1076	0.32
1077	0.37
1078	0.42
1079	0.43
1080	0.4
1081	0.44
1082	0.41
1083	0.41
1084	0.41
1085	0.44
1086	0.45
1087	0.49
1088	0.54
1089	0.57
1090	0.65
1091	0.67
1092	0.62
1093	0.6
1094	0.53
1095	0.5
1096	0.51
1097	0.45
1098	0.37
1099	0.32
1100	0.3
1101	0.24
1102	0.21
1103	0.16
1104	0.09
1105	0.08
1106	0.07
1107	0.09
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.1
1113	0.14
1114	0.17
1115	0.2
1116	0.21
1117	0.21
1118	0.21
1119	0.27
1120	0.3
1121	0.33
1122	0.32
1123	0.27
1124	0.27
1125	0.26
1126	0.26
1127	0.2
1128	0.15
1129	0.08
1130	0.08
1131	0.06
1132	0.08
1133	0.09
1134	0.11
1135	0.14
1136	0.16
1137	0.16
1138	0.18
1139	0.23
1140	0.23
1141	0.26
1142	0.26
1143	0.26
1144	0.25
1145	0.26
1146	0.24
1147	0.19
1148	0.17
1149	0.14
1150	0.12
1151	0.1
1152	0.09
1153	0.07
1154	0.06
1155	0.06
1156	0.07
1157	0.09
1158	0.09
1159	0.1
1160	0.11
1161	0.15
1162	0.18
1163	0.21
1164	0.22
1165	0.2
1166	0.21
1167	0.21
1168	0.2
1169	0.17
1170	0.15
1171	0.15
1172	0.15
1173	0.13
1174	0.14
1175	0.13
1176	0.15
1177	0.13
1178	0.17
1179	0.15
1180	0.15
1181	0.21
1182	0.27
1183	0.29
1184	0.28
1185	0.3
1186	0.27
1187	0.25
1188	0.25
1189	0.24
1190	0.2
1191	0.18
1192	0.19
1193	0.22
1194	0.25
1195	0.29
1196	0.28
1197	0.25
1198	0.25
1199	0.28
1200	0.3
1201	0.33
1202	0.33
1203	0.37
1204	0.43
1205	0.5
1206	0.53
1207	0.57
1208	0.55
1209	0.58
1210	0.6
1211	0.54
1212	0.51
1213	0.45
1214	0.45
1215	0.44
1216	0.49
1217	0.43
1218	0.41
1219	0.45
1220	0.46
1221	0.48
1222	0.45
1223	0.42
1224	0.39
1225	0.4
1226	0.38
1227	0.36
1228	0.33
1229	0.29
1230	0.28
1231	0.24
1232	0.19
1233	0.15
1234	0.13
1235	0.1
1236	0.1
1237	0.09
1238	0.08
1239	0.1
1240	0.11
1241	0.16
1242	0.18
1243	0.22
1244	0.3
1245	0.38
1246	0.47
1247	0.49
1248	0.53
1249	0.49
1250	0.5
1251	0.52
1252	0.45
1253	0.42

A0A409WC63

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer