FuNGI

A0A409W7C7

Protein Details

Accession

A0A409W7C7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
314-335	GPSSEPPQTTRKRKRGPDDIDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9, cyto 4.5, plas 3, golg 3, mito 1, pero 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MRRYSRPNPFVDIEAEDSSESEDYTDSACSEEASLHMGNSNGMAQIVSSVVQKRWITLLTMFVFLDCEDFLNDGSDSDENGDGADIILGSERPRLSWNELNQRANAQDVHVPSDMDMLVESILSRAELGRGHEKRRATGSDFLGMDQYDDGLLEQILRGPKSAEDNFPLWRVRCEIGMEEEAVFFLLQSVQQDKHRVRSAFTRGSIRGWIYLESIMDSRLVKLLKQCPGIIKTRQGIIQQGIEDISEWTKLLTMKSPKNGSDSASSSISPGTWVQIRKGKYKGDVGLAIVVEDWGVEVLLVPRLALASLQWLDGPSSEPPQTTRKRKRGPDDIDSRDSSSPNLFDPCSFRATYGREPHRLGDNEYRVGSTVYEHGLIRKKFDYHSLSSAVSDIPLAQHRLFQQSKHPRLDTCIFPPPFEWLFEEADRVLIQTSKRSGFVVSNWDKKDPKTRNMIEVMCDDGELLSVSYLELQKDIKLGDYVEIRRGLLQGSMGWVDAVHDNGLIHIVNLGPPVSSSNHSDQPFQASTSSKSVQPLTQGYNITGTGADNNNALKLITEYDVHANSVKVSMSPFYQEVFASGGIPITTDSNKGKTQTGPQAKLSPRHKHVTREAWYHRHVIISKTKNPWKGHKGIVKNVVTGQQTSSGMKIEIELATFDPSHPFKRVTVDYDDILEVDTMKQLRLSRGHQSSDDGFKSLATSADIVPVESKKDLEVPHATSTLEAAWDPSSRTPVWNPVDSEAGRPSTSMNIESARSESAASTLVPQHPLLDRRLVGCKLRVDIVDDNSSSSKRDVPVSVEEIAGTICIRRELYKKSVPVDPQAVKILNPSATRDNGLLVVIHGEHCGKYVRRVHHRYQDGKATIILAVVNHMEGRADVLLGEQLELEAGELCLAMESKKNKGLSASIMSALREDARKSYDHSNRVNKSRDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.31
3	0.24
4	0.22
5	0.21
6	0.18
7	0.14
8	0.1
9	0.09
10	0.09
11	0.1
12	0.1
13	0.09
14	0.1
15	0.1
16	0.1
17	0.1
18	0.1
19	0.09
20	0.13
21	0.13
22	0.12
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.1
29	0.09
30	0.09
31	0.07
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.11
36	0.14
37	0.14
38	0.22
39	0.23
40	0.24
41	0.26
42	0.27
43	0.26
44	0.24
45	0.31
46	0.25
47	0.27
48	0.25
49	0.22
50	0.22
51	0.18
52	0.18
53	0.11
54	0.1
55	0.08
56	0.09
57	0.1
58	0.11
59	0.11
60	0.1
61	0.12
62	0.11
63	0.11
64	0.13
65	0.13
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.08
70	0.08
71	0.07
72	0.05
73	0.04
74	0.05
75	0.06
76	0.07
77	0.11
78	0.11
79	0.12
80	0.16
81	0.2
82	0.27
83	0.34
84	0.42
85	0.48
86	0.56
87	0.58
88	0.56
89	0.55
90	0.48
91	0.44
92	0.36
93	0.27
94	0.24
95	0.22
96	0.26
97	0.23
98	0.22
99	0.19
100	0.21
101	0.19
102	0.14
103	0.13
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.05
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.07
114	0.09
115	0.14
116	0.24
117	0.29
118	0.34
119	0.39
120	0.41
121	0.43
122	0.47
123	0.48
124	0.42
125	0.45
126	0.43
127	0.45
128	0.43
129	0.39
130	0.35
131	0.29
132	0.25
133	0.17
134	0.14
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.09
143	0.12
144	0.13
145	0.13
146	0.13
147	0.15
148	0.23
149	0.26
150	0.26
151	0.27
152	0.29
153	0.31
154	0.34
155	0.36
156	0.3
157	0.29
158	0.29
159	0.25
160	0.25
161	0.25
162	0.23
163	0.23
164	0.24
165	0.23
166	0.19
167	0.18
168	0.16
169	0.14
170	0.12
171	0.07
172	0.06
173	0.05
174	0.06
175	0.08
176	0.11
177	0.13
178	0.17
179	0.25
180	0.27
181	0.35
182	0.42
183	0.41
184	0.4
185	0.46
186	0.52
187	0.51
188	0.53
189	0.51
190	0.45
191	0.46
192	0.47
193	0.39
194	0.33
195	0.27
196	0.24
197	0.19
198	0.19
199	0.17
200	0.15
201	0.14
202	0.11
203	0.12
204	0.11
205	0.1
206	0.13
207	0.13
208	0.13
209	0.2
210	0.27
211	0.31
212	0.33
213	0.34
214	0.37
215	0.4
216	0.45
217	0.42
218	0.42
219	0.38
220	0.38
221	0.4
222	0.36
223	0.36
224	0.32
225	0.3
226	0.24
227	0.22
228	0.19
229	0.16
230	0.15
231	0.12
232	0.1
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.17
240	0.24
241	0.29
242	0.36
243	0.4
244	0.4
245	0.43
246	0.43
247	0.39
248	0.36
249	0.33
250	0.3
251	0.27
252	0.26
253	0.21
254	0.2
255	0.18
256	0.14
257	0.11
258	0.1
259	0.13
260	0.14
261	0.18
262	0.24
263	0.27
264	0.31
265	0.36
266	0.37
267	0.37
268	0.42
269	0.4
270	0.39
271	0.37
272	0.31
273	0.29
274	0.25
275	0.2
276	0.14
277	0.11
278	0.07
279	0.06
280	0.05
281	0.02
282	0.02
283	0.02
284	0.03
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.11
302	0.08
303	0.11
304	0.12
305	0.12
306	0.15
307	0.24
308	0.32
309	0.42
310	0.51
311	0.58
312	0.67
313	0.75
314	0.81
315	0.83
316	0.81
317	0.79
318	0.78
319	0.74
320	0.7
321	0.63
322	0.57
323	0.48
324	0.41
325	0.32
326	0.24
327	0.19
328	0.15
329	0.16
330	0.13
331	0.13
332	0.17
333	0.18
334	0.19
335	0.18
336	0.18
337	0.2
338	0.25
339	0.31
340	0.36
341	0.4
342	0.41
343	0.42
344	0.44
345	0.46
346	0.43
347	0.41
348	0.4
349	0.38
350	0.36
351	0.35
352	0.33
353	0.26
354	0.25
355	0.2
356	0.12
357	0.1
358	0.08
359	0.1
360	0.1
361	0.13
362	0.2
363	0.2
364	0.22
365	0.22
366	0.23
367	0.23
368	0.3
369	0.31
370	0.27
371	0.3
372	0.29
373	0.28
374	0.26
375	0.26
376	0.19
377	0.14
378	0.1
379	0.07
380	0.06
381	0.08
382	0.1
383	0.09
384	0.12
385	0.13
386	0.21
387	0.22
388	0.21
389	0.3
390	0.38
391	0.45
392	0.47
393	0.48
394	0.4
395	0.45
396	0.48
397	0.41
398	0.35
399	0.37
400	0.32
401	0.31
402	0.31
403	0.3
404	0.27
405	0.25
406	0.22
407	0.15
408	0.17
409	0.17
410	0.17
411	0.13
412	0.12
413	0.11
414	0.1
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.1
419	0.12
420	0.13
421	0.14
422	0.14
423	0.15
424	0.14
425	0.15
426	0.22
427	0.24
428	0.3
429	0.31
430	0.34
431	0.34
432	0.35
433	0.43
434	0.39
435	0.4
436	0.43
437	0.43
438	0.44
439	0.48
440	0.47
441	0.39
442	0.33
443	0.3
444	0.2
445	0.18
446	0.13
447	0.08
448	0.07
449	0.06
450	0.05
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.08
466	0.12
467	0.12
468	0.14
469	0.15
470	0.14
471	0.14
472	0.14
473	0.12
474	0.09
475	0.09
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.05
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.06
500	0.07
501	0.09
502	0.12
503	0.15
504	0.22
505	0.23
506	0.24
507	0.23
508	0.27
509	0.25
510	0.23
511	0.21
512	0.16
513	0.18
514	0.21
515	0.22
516	0.18
517	0.19
518	0.2
519	0.19
520	0.21
521	0.21
522	0.2
523	0.22
524	0.21
525	0.2
526	0.2
527	0.19
528	0.16
529	0.13
530	0.1
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.11
546	0.11
547	0.12
548	0.12
549	0.11
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.07
554	0.07
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.1
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.08
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.09
574	0.11
575	0.14
576	0.16
577	0.18
578	0.2
579	0.2
580	0.26
581	0.33
582	0.4
583	0.4
584	0.41
585	0.47
586	0.48
587	0.55
588	0.56
589	0.55
590	0.52
591	0.58
592	0.59
593	0.58
594	0.63
595	0.64
596	0.61
597	0.62
598	0.63
599	0.61
600	0.59
601	0.56
602	0.48
603	0.42
604	0.38
605	0.34
606	0.38
607	0.38
608	0.42
609	0.48
610	0.53
611	0.57
612	0.59
613	0.64
614	0.62
615	0.6
616	0.62
617	0.61
618	0.61
619	0.6
620	0.65
621	0.57
622	0.51
623	0.47
624	0.44
625	0.37
626	0.32
627	0.25
628	0.2
629	0.2
630	0.19
631	0.18
632	0.14
633	0.13
634	0.12
635	0.12
636	0.1
637	0.09
638	0.09
639	0.09
640	0.08
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.12
645	0.14
646	0.17
647	0.19
648	0.2
649	0.19
650	0.25
651	0.28
652	0.28
653	0.31
654	0.31
655	0.29
656	0.29
657	0.28
658	0.21
659	0.19
660	0.15
661	0.1
662	0.07
663	0.1
664	0.08
665	0.08
666	0.11
667	0.13
668	0.17
669	0.22
670	0.25
671	0.32
672	0.36
673	0.39
674	0.37
675	0.39
676	0.38
677	0.4
678	0.37
679	0.29
680	0.24
681	0.21
682	0.21
683	0.18
684	0.15
685	0.09
686	0.1
687	0.09
688	0.13
689	0.13
690	0.12
691	0.14
692	0.14
693	0.15
694	0.14
695	0.15
696	0.11
697	0.15
698	0.16
699	0.19
700	0.23
701	0.25
702	0.27
703	0.27
704	0.27
705	0.22
706	0.22
707	0.17
708	0.13
709	0.09
710	0.08
711	0.09
712	0.1
713	0.11
714	0.12
715	0.16
716	0.16
717	0.19
718	0.2
719	0.27
720	0.31
721	0.34
722	0.34
723	0.32
724	0.38
725	0.35
726	0.36
727	0.3
728	0.27
729	0.23
730	0.21
731	0.2
732	0.18
733	0.2
734	0.18
735	0.17
736	0.16
737	0.17
738	0.18
739	0.19
740	0.16
741	0.14
742	0.14
743	0.12
744	0.11
745	0.11
746	0.1
747	0.11
748	0.15
749	0.16
750	0.18
751	0.18
752	0.19
753	0.23
754	0.26
755	0.26
756	0.27
757	0.26
758	0.28
759	0.34
760	0.35
761	0.34
762	0.36
763	0.36
764	0.33
765	0.35
766	0.32
767	0.31
768	0.32
769	0.33
770	0.32
771	0.29
772	0.3
773	0.29
774	0.29
775	0.25
776	0.22
777	0.22
778	0.19
779	0.23
780	0.22
781	0.25
782	0.3
783	0.31
784	0.31
785	0.27
786	0.25
787	0.21
788	0.19
789	0.15
790	0.1
791	0.07
792	0.07
793	0.09
794	0.1
795	0.14
796	0.2
797	0.26
798	0.34
799	0.41
800	0.45
801	0.46
802	0.52
803	0.52
804	0.53
805	0.55
806	0.49
807	0.45
808	0.46
809	0.43
810	0.36
811	0.35
812	0.33
813	0.29
814	0.28
815	0.29
816	0.28
817	0.3
818	0.31
819	0.29
820	0.26
821	0.22
822	0.21
823	0.16
824	0.12
825	0.12
826	0.1
827	0.1
828	0.1
829	0.11
830	0.1
831	0.12
832	0.18
833	0.17
834	0.25
835	0.33
836	0.41
837	0.51
838	0.59
839	0.67
840	0.71
841	0.79
842	0.77
843	0.76
844	0.77
845	0.68
846	0.61
847	0.53
848	0.44
849	0.34
850	0.28
851	0.22
852	0.12
853	0.12
854	0.1
855	0.1
856	0.09
857	0.09
858	0.08
859	0.07
860	0.1
861	0.08
862	0.08
863	0.07
864	0.08
865	0.1
866	0.1
867	0.1
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.07
872	0.07
873	0.05
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.06
879	0.06
880	0.07
881	0.13
882	0.16
883	0.21
884	0.28
885	0.29
886	0.3
887	0.32
888	0.35
889	0.35
890	0.38
891	0.35
892	0.33
893	0.33
894	0.32
895	0.3
896	0.27
897	0.25
898	0.22
899	0.21
900	0.22
901	0.23
902	0.25
903	0.29
904	0.38
905	0.43
906	0.49
907	0.56
908	0.63
909	0.69
910	0.75

A0A409W7C7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer