FuNGI

A0A409VGS6

Protein Details

Accession

A0A409VGS6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
988-1013	VEDGEEEKPKKKKRPGPKGGPGSRGA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
995-1011	KPKKKKRPGPKGGPGSR

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, pero 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

KSGDLEVEEVPFNIDSLRRQLASLTEARKFFDQDLHVRQRQLETSGYELAVEQLEHSIKSREEKGVQDSNALHCTDIQAWMWEWHQKLQVKLKETILRIKADKDNHSIAVAPYLTLLKPEKLSLITIFEVMRLQGSAGGSQGMKMTRMLISVGKAVESEYKANMCRANNIPFNSTSSDGDNASSKIDPNRFFTDMGYKHLHQRRVAAAQTMEDGEAWTASWTPAVRSRVGAVLVEALMDVAQVVRTKVDPTTNERLSESQPAFYSAYEYVRGQKLGVLKLNPAVSERIAKDKVGRTIHPRHLPMLVPPKPWVNYDDGGYLFSKSSAMRFKDSYEQEIYLKQATAAGSVEMVYAGLDVLGSTPWKINRPIFDIVVQVWNSGERMGKMPPATYDEPEPVLAEELIDDLEERSNHILRHRQWMQNRANNHSDRCSVNYKVEIARAFLADTFYLPHNVDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLLLFAEAKPLGERGFRWLKIHLANLYGYDKANFDERVEWVDKHIDNIIESAENPLEGSRWWLKADDPWQCLATCMELRNALALPDPTQYCSPLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDEQGAMQVNLAAADRPSDVYSHVGRAVEKLIEEEAAAGDAIAKLLKGKISRKVVKQTVMTTVYGVTFVGAREQIEGQLRDRGDVPEEHCWTAASYLAHKVLACIGDTFTGAKAIQTWLTLCARLISKSIPGERLGLVKSIADAASSASENGSVANTTPTSLTPVTRSQVKKQQMTSVIWTTALGLPIVQPYRKIARKQIMTAVQSIFIADPYAPSEVNSVKQSSAFPPNFVHSLDATHMMLSALECKNRGLTFAAVHDSYWTHPCDIDKMSTIIRDTFIALHSSDVLGKLQAEFRERYKDYVIPLESLGVGSANLVRQLHEAGTRISARPDQVPLLQDLEMLVSQTEDGTTSVRDAIYVPEPPAETKAKAKARSAETEDDVLLVEESEDVDADEAVEAVEDGEEEKPKKKKRPGPKGGPGSRGALSQTKFISLVDLMPPLPEKGTFKVENIKQSPYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.19
4	0.24
5	0.23
6	0.23
7	0.25
8	0.26
9	0.3
10	0.34
11	0.34
12	0.35
13	0.35
14	0.38
15	0.39
16	0.38
17	0.34
18	0.35
19	0.35
20	0.38
21	0.47
22	0.54
23	0.55
24	0.55
25	0.56
26	0.53
27	0.5
28	0.45
29	0.39
30	0.33
31	0.33
32	0.33
33	0.3
34	0.25
35	0.22
36	0.2
37	0.17
38	0.14
39	0.1
40	0.11
41	0.13
42	0.13
43	0.15
44	0.17
45	0.19
46	0.24
47	0.29
48	0.31
49	0.35
50	0.39
51	0.45
52	0.49
53	0.48
54	0.47
55	0.45
56	0.43
57	0.43
58	0.38
59	0.31
60	0.23
61	0.25
62	0.21
63	0.21
64	0.17
65	0.16
66	0.17
67	0.19
68	0.21
69	0.24
70	0.24
71	0.26
72	0.33
73	0.35
74	0.4
75	0.48
76	0.52
77	0.52
78	0.54
79	0.57
80	0.57
81	0.56
82	0.58
83	0.53
84	0.52
85	0.49
86	0.51
87	0.5
88	0.5
89	0.53
90	0.5
91	0.49
92	0.45
93	0.43
94	0.39
95	0.32
96	0.3
97	0.25
98	0.18
99	0.15
100	0.16
101	0.15
102	0.17
103	0.19
104	0.17
105	0.18
106	0.19
107	0.21
108	0.2
109	0.23
110	0.2
111	0.22
112	0.2
113	0.2
114	0.19
115	0.17
116	0.17
117	0.14
118	0.13
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.11
126	0.1
127	0.11
128	0.14
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.14
133	0.13
134	0.13
135	0.15
136	0.14
137	0.14
138	0.17
139	0.17
140	0.15
141	0.14
142	0.14
143	0.18
144	0.18
145	0.18
146	0.18
147	0.21
148	0.22
149	0.25
150	0.29
151	0.25
152	0.29
153	0.32
154	0.38
155	0.41
156	0.42
157	0.42
158	0.38
159	0.41
160	0.37
161	0.35
162	0.28
163	0.25
164	0.24
165	0.21
166	0.21
167	0.2
168	0.18
169	0.17
170	0.16
171	0.16
172	0.21
173	0.27
174	0.28
175	0.32
176	0.37
177	0.37
178	0.36
179	0.36
180	0.39
181	0.34
182	0.37
183	0.37
184	0.33
185	0.4
186	0.46
187	0.5
188	0.43
189	0.46
190	0.46
191	0.47
192	0.47
193	0.42
194	0.36
195	0.31
196	0.31
197	0.26
198	0.21
199	0.15
200	0.13
201	0.09
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.08
208	0.08
209	0.1
210	0.17
211	0.19
212	0.2
213	0.21
214	0.22
215	0.23
216	0.23
217	0.21
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.09
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.09
234	0.11
235	0.16
236	0.18
237	0.25
238	0.34
239	0.36
240	0.37
241	0.37
242	0.37
243	0.35
244	0.4
245	0.34
246	0.27
247	0.25
248	0.27
249	0.26
250	0.23
251	0.23
252	0.16
253	0.17
254	0.16
255	0.17
256	0.19
257	0.2
258	0.21
259	0.18
260	0.19
261	0.21
262	0.24
263	0.27
264	0.24
265	0.23
266	0.26
267	0.27
268	0.25
269	0.22
270	0.19
271	0.16
272	0.2
273	0.2
274	0.24
275	0.24
276	0.24
277	0.29
278	0.32
279	0.38
280	0.37
281	0.39
282	0.4
283	0.48
284	0.56
285	0.57
286	0.54
287	0.48
288	0.47
289	0.44
290	0.43
291	0.44
292	0.4
293	0.35
294	0.35
295	0.38
296	0.36
297	0.37
298	0.32
299	0.27
300	0.24
301	0.23
302	0.24
303	0.2
304	0.2
305	0.19
306	0.17
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.13
312	0.18
313	0.2
314	0.23
315	0.24
316	0.26
317	0.34
318	0.35
319	0.36
320	0.32
321	0.31
322	0.28
323	0.29
324	0.28
325	0.2
326	0.18
327	0.14
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.02
343	0.02
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.07
349	0.09
350	0.12
351	0.16
352	0.19
353	0.22
354	0.27
355	0.29
356	0.28
357	0.27
358	0.26
359	0.23
360	0.24
361	0.21
362	0.16
363	0.13
364	0.12
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.07
369	0.09
370	0.1
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.14
375	0.19
376	0.2
377	0.2
378	0.21
379	0.19
380	0.2
381	0.19
382	0.18
383	0.12
384	0.11
385	0.09
386	0.07
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.09
397	0.11
398	0.12
399	0.16
400	0.23
401	0.23
402	0.33
403	0.38
404	0.43
405	0.46
406	0.55
407	0.59
408	0.57
409	0.59
410	0.54
411	0.55
412	0.52
413	0.49
414	0.42
415	0.37
416	0.33
417	0.34
418	0.33
419	0.27
420	0.26
421	0.26
422	0.25
423	0.23
424	0.25
425	0.21
426	0.18
427	0.17
428	0.15
429	0.13
430	0.11
431	0.11
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.09
437	0.09
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.13
444	0.14
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.18
449	0.21
450	0.25
451	0.23
452	0.23
453	0.25
454	0.25
455	0.23
456	0.21
457	0.18
458	0.13
459	0.13
460	0.1
461	0.08
462	0.07
463	0.06
464	0.05
465	0.04
466	0.04
467	0.06
468	0.05
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.12
478	0.18
479	0.19
480	0.2
481	0.21
482	0.24
483	0.25
484	0.27
485	0.22
486	0.18
487	0.17
488	0.17
489	0.17
490	0.14
491	0.12
492	0.11
493	0.1
494	0.09
495	0.11
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.14
501	0.15
502	0.15
503	0.14
504	0.17
505	0.17
506	0.16
507	0.17
508	0.13
509	0.12
510	0.12
511	0.11
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.06
516	0.06
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.08
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.12
526	0.12
527	0.16
528	0.23
529	0.25
530	0.25
531	0.25
532	0.25
533	0.25
534	0.25
535	0.21
536	0.17
537	0.12
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.11
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.11
552	0.12
553	0.11
554	0.14
555	0.14
556	0.15
557	0.18
558	0.19
559	0.21
560	0.21
561	0.23
562	0.2
563	0.24
564	0.21
565	0.18
566	0.16
567	0.15
568	0.13
569	0.11
570	0.11
571	0.07
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.07
595	0.1
596	0.11
597	0.12
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.13
602	0.14
603	0.11
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.04
614	0.04
615	0.03
616	0.04
617	0.03
618	0.03
619	0.04
620	0.05
621	0.07
622	0.11
623	0.15
624	0.23
625	0.32
626	0.38
627	0.44
628	0.52
629	0.54
630	0.55
631	0.55
632	0.49
633	0.46
634	0.42
635	0.36
636	0.27
637	0.23
638	0.18
639	0.16
640	0.13
641	0.07
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.07
648	0.08
649	0.1
650	0.14
651	0.15
652	0.15
653	0.19
654	0.19
655	0.18
656	0.19
657	0.18
658	0.16
659	0.18
660	0.19
661	0.22
662	0.25
663	0.24
664	0.23
665	0.23
666	0.21
667	0.18
668	0.18
669	0.11
670	0.11
671	0.13
672	0.14
673	0.14
674	0.13
675	0.13
676	0.12
677	0.12
678	0.11
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.09
683	0.09
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.09
692	0.09
693	0.11
694	0.12
695	0.13
696	0.12
697	0.13
698	0.14
699	0.14
700	0.15
701	0.12
702	0.15
703	0.19
704	0.22
705	0.21
706	0.21
707	0.22
708	0.21
709	0.23
710	0.2
711	0.16
712	0.14
713	0.12
714	0.11
715	0.11
716	0.1
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.05
729	0.05
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.08
734	0.08
735	0.12
736	0.13
737	0.13
738	0.15
739	0.18
740	0.2
741	0.28
742	0.31
743	0.34
744	0.42
745	0.49
746	0.52
747	0.51
748	0.56
749	0.53
750	0.53
751	0.51
752	0.45
753	0.38
754	0.32
755	0.29
756	0.24
757	0.2
758	0.18
759	0.12
760	0.09
761	0.09
762	0.13
763	0.15
764	0.13
765	0.12
766	0.16
767	0.25
768	0.31
769	0.35
770	0.39
771	0.46
772	0.51
773	0.53
774	0.57
775	0.56
776	0.51
777	0.51
778	0.43
779	0.34
780	0.29
781	0.27
782	0.19
783	0.12
784	0.1
785	0.07
786	0.06
787	0.07
788	0.09
789	0.08
790	0.09
791	0.12
792	0.12
793	0.16
794	0.17
795	0.17
796	0.16
797	0.18
798	0.2
799	0.21
800	0.3
801	0.27
802	0.27
803	0.28
804	0.3
805	0.31
806	0.29
807	0.27
808	0.17
809	0.18
810	0.18
811	0.18
812	0.15
813	0.13
814	0.13
815	0.11
816	0.11
817	0.09
818	0.14
819	0.14
820	0.15
821	0.15
822	0.16
823	0.2
824	0.19
825	0.21
826	0.17
827	0.17
828	0.17
829	0.19
830	0.23
831	0.19
832	0.19
833	0.18
834	0.17
835	0.17
836	0.19
837	0.18
838	0.15
839	0.17
840	0.18
841	0.21
842	0.22
843	0.22
844	0.21
845	0.22
846	0.22
847	0.23
848	0.24
849	0.21
850	0.19
851	0.17
852	0.16
853	0.15
854	0.15
855	0.14
856	0.13
857	0.12
858	0.12
859	0.12
860	0.11
861	0.11
862	0.11
863	0.09
864	0.1
865	0.1
866	0.14
867	0.16
868	0.19
869	0.21
870	0.24
871	0.33
872	0.33
873	0.35
874	0.36
875	0.36
876	0.35
877	0.4
878	0.38
879	0.3
880	0.29
881	0.27
882	0.23
883	0.2
884	0.17
885	0.09
886	0.07
887	0.06
888	0.08
889	0.07
890	0.1
891	0.1
892	0.11
893	0.12
894	0.14
895	0.15
896	0.16
897	0.17
898	0.15
899	0.2
900	0.22
901	0.21
902	0.23
903	0.25
904	0.25
905	0.26
906	0.28
907	0.26
908	0.27
909	0.28
910	0.26
911	0.26
912	0.24
913	0.21
914	0.18
915	0.16
916	0.13
917	0.11
918	0.09
919	0.07
920	0.07
921	0.07
922	0.07
923	0.06
924	0.06
925	0.07
926	0.08
927	0.09
928	0.11
929	0.1
930	0.11
931	0.11
932	0.14
933	0.16
934	0.18
935	0.18
936	0.19
937	0.2
938	0.21
939	0.26
940	0.26
941	0.25
942	0.28
943	0.37
944	0.42
945	0.46
946	0.51
947	0.54
948	0.56
949	0.62
950	0.62
951	0.59
952	0.54
953	0.51
954	0.45
955	0.37
956	0.31
957	0.23
958	0.17
959	0.11
960	0.08
961	0.06
962	0.06
963	0.06
964	0.06
965	0.05
966	0.05
967	0.05
968	0.06
969	0.05
970	0.05
971	0.05
972	0.04
973	0.04
974	0.04
975	0.04
976	0.04
977	0.05
978	0.08
979	0.13
980	0.16
981	0.23
982	0.32
983	0.42
984	0.52
985	0.61
986	0.69
987	0.75
988	0.85
989	0.88
990	0.9
991	0.92
992	0.93
993	0.9
994	0.86
995	0.78
996	0.71
997	0.6
998	0.51
999	0.44
1000	0.4
1001	0.33
1002	0.32
1003	0.31
1004	0.28
1005	0.27
1006	0.26
1007	0.25
1008	0.19
1009	0.2
1010	0.17
1011	0.18
1012	0.16
1013	0.17
1014	0.19
1015	0.17
1016	0.17
1017	0.18
1018	0.19
1019	0.22
1020	0.3
1021	0.3
1022	0.33
1023	0.42
1024	0.45
1025	0.53
1026	0.52
1027	0.55
1028	0.5

A0A409VGS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer