Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X6A2

Protein Details
Accession A0A409X6A2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-460NSDKSKTSDKEKKPWADKLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-164PPGPRR
450-472KEKKPWADKLDKGGKLTPEERKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MPRKTNNSQQAIDYLPGGFDELPRRRADSVLSESRDYEAAESEVAEHLTGIPEVISRPAQALIREGIAVTAYRDVPDFDDVPQPSKRRKPTSAWVEDARDEGDTWGPSASRPSTPTQPRTKSNPVPRPVRQDPPDDDDPGDSDGSDDDQGNGGGPPRGPPGPRRSRSASRGQSESNDDRLVNILEKLLDRSSRPASTSSDVKSKVREPQVFDGKDRNKLHTWLTLMAINFNDRPKTFASDEKKVNFAISYLSGTALDWFEPGIMAKINGQRCPKWVYDYSEFVRILKQQFGPWDPEEDAEEQLENLTMGEKADINVYQTEFSRIMARLPENYGEAPLVRQFYRGLPDRIKDEICRVGKPKSLLVMRQMAWEIDHRWHERNREIRRAAKTHGSSSSQNSSNHVRHHTNSNQGSNSSTSQPQKSQNFNQPKTSSTSGSGKGQNSDKSKTSDKEKKPWADKLDKGGKLTPEERKRRAENNLCNYCGAPGHKAADCPKPTSRSAKARAAQVQPTSESESVKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.19
3 0.17
4 0.16
5 0.12
6 0.13
7 0.22
8 0.27
9 0.31
10 0.32
11 0.36
12 0.35
13 0.36
14 0.37
15 0.35
16 0.38
17 0.43
18 0.45
19 0.43
20 0.42
21 0.43
22 0.39
23 0.32
24 0.24
25 0.17
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.07
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.12
45 0.15
46 0.17
47 0.17
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.09
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.17
64 0.17
65 0.15
66 0.22
67 0.23
68 0.27
69 0.32
70 0.35
71 0.4
72 0.48
73 0.56
74 0.58
75 0.63
76 0.67
77 0.71
78 0.77
79 0.76
80 0.73
81 0.68
82 0.63
83 0.57
84 0.51
85 0.41
86 0.3
87 0.23
88 0.19
89 0.17
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.15
96 0.17
97 0.17
98 0.19
99 0.23
100 0.32
101 0.41
102 0.49
103 0.54
104 0.58
105 0.62
106 0.67
107 0.72
108 0.72
109 0.75
110 0.75
111 0.73
112 0.76
113 0.75
114 0.77
115 0.73
116 0.72
117 0.65
118 0.63
119 0.6
120 0.59
121 0.57
122 0.49
123 0.44
124 0.35
125 0.33
126 0.27
127 0.22
128 0.14
129 0.11
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.13
144 0.15
145 0.17
146 0.23
147 0.32
148 0.42
149 0.45
150 0.49
151 0.54
152 0.59
153 0.64
154 0.68
155 0.66
156 0.59
157 0.6
158 0.55
159 0.5
160 0.5
161 0.47
162 0.39
163 0.32
164 0.28
165 0.24
166 0.24
167 0.22
168 0.16
169 0.13
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.16
178 0.19
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.23
183 0.25
184 0.28
185 0.26
186 0.29
187 0.3
188 0.3
189 0.31
190 0.31
191 0.35
192 0.39
193 0.41
194 0.39
195 0.45
196 0.54
197 0.52
198 0.5
199 0.52
200 0.46
201 0.52
202 0.48
203 0.44
204 0.37
205 0.38
206 0.38
207 0.33
208 0.32
209 0.24
210 0.24
211 0.21
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.18
223 0.19
224 0.25
225 0.3
226 0.34
227 0.39
228 0.38
229 0.38
230 0.34
231 0.32
232 0.24
233 0.19
234 0.13
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.07
253 0.12
254 0.14
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.24
259 0.28
260 0.26
261 0.26
262 0.28
263 0.3
264 0.31
265 0.35
266 0.34
267 0.36
268 0.35
269 0.3
270 0.28
271 0.25
272 0.23
273 0.22
274 0.22
275 0.17
276 0.2
277 0.22
278 0.25
279 0.22
280 0.23
281 0.2
282 0.19
283 0.19
284 0.18
285 0.16
286 0.12
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.16
313 0.17
314 0.16
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.13
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.2
330 0.24
331 0.26
332 0.27
333 0.29
334 0.32
335 0.34
336 0.34
337 0.29
338 0.28
339 0.32
340 0.31
341 0.33
342 0.33
343 0.33
344 0.35
345 0.36
346 0.34
347 0.32
348 0.34
349 0.32
350 0.34
351 0.36
352 0.33
353 0.33
354 0.31
355 0.25
356 0.22
357 0.23
358 0.2
359 0.18
360 0.24
361 0.25
362 0.3
363 0.34
364 0.39
365 0.44
366 0.51
367 0.54
368 0.58
369 0.61
370 0.63
371 0.67
372 0.65
373 0.61
374 0.61
375 0.56
376 0.5
377 0.5
378 0.46
379 0.41
380 0.43
381 0.45
382 0.41
383 0.39
384 0.39
385 0.41
386 0.41
387 0.44
388 0.45
389 0.42
390 0.4
391 0.48
392 0.49
393 0.51
394 0.53
395 0.53
396 0.49
397 0.45
398 0.45
399 0.39
400 0.36
401 0.3
402 0.3
403 0.31
404 0.33
405 0.38
406 0.44
407 0.48
408 0.54
409 0.58
410 0.63
411 0.68
412 0.68
413 0.72
414 0.64
415 0.59
416 0.58
417 0.54
418 0.46
419 0.39
420 0.42
421 0.36
422 0.41
423 0.44
424 0.39
425 0.41
426 0.44
427 0.47
428 0.46
429 0.47
430 0.45
431 0.45
432 0.5
433 0.5
434 0.55
435 0.59
436 0.62
437 0.67
438 0.73
439 0.77
440 0.77
441 0.81
442 0.8
443 0.79
444 0.75
445 0.75
446 0.76
447 0.69
448 0.65
449 0.61
450 0.55
451 0.53
452 0.55
453 0.55
454 0.55
455 0.62
456 0.65
457 0.69
458 0.72
459 0.73
460 0.77
461 0.78
462 0.78
463 0.79
464 0.8
465 0.73
466 0.67
467 0.59
468 0.5
469 0.44
470 0.36
471 0.29
472 0.26
473 0.28
474 0.29
475 0.33
476 0.37
477 0.42
478 0.43
479 0.45
480 0.47
481 0.48
482 0.52
483 0.56
484 0.6
485 0.61
486 0.65
487 0.69
488 0.67
489 0.71
490 0.74
491 0.71
492 0.69
493 0.64
494 0.6
495 0.53
496 0.51
497 0.49
498 0.42