Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YLZ1

Protein Details
Accession A0A409YLZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-166QPESHWNPSRNKKSKKQKAHPVNTQKLRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-155NKKSKKQK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MFKRKREDSDDEEEASYGRQILPVANLPDDFDQEPMDGMQYLFTVRRAARQLPDIVRVPNPFEKPEPTNLPESIVQPSSDSTILPSEEWRQQFEMRFHNFRKNFDQPTLRIGPAVELSQRLMPAKKERDLWWAFICGQPESHWNPSRNKKSKKQKAHPVNTQKLRAWADEPSEPPTDLPTYGPVDEDSHDATENPTGSLPSPVTTPLPLDLLEELSQPVTTSVATTPGNAPMPTYREPNTTLLKRIDHPTAIHLLMYFTHWLNLYLHPPFDKAFLPTQTHARWILCLLSRVDDVVCADDMNLLRNLARAILAFLKATRTNPEPSQNLSGAMTESWCWIIITVVADVWKQRDLWMDAEQELCRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.3
3 0.23
4 0.16
5 0.12
6 0.1
7 0.1
8 0.12
9 0.15
10 0.2
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.23
15 0.24
16 0.26
17 0.22
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.15
32 0.15
33 0.21
34 0.26
35 0.3
36 0.33
37 0.37
38 0.44
39 0.42
40 0.47
41 0.44
42 0.42
43 0.42
44 0.39
45 0.4
46 0.39
47 0.38
48 0.36
49 0.36
50 0.39
51 0.38
52 0.44
53 0.45
54 0.41
55 0.43
56 0.39
57 0.4
58 0.36
59 0.34
60 0.31
61 0.25
62 0.22
63 0.18
64 0.19
65 0.18
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.22
75 0.23
76 0.25
77 0.25
78 0.28
79 0.33
80 0.36
81 0.4
82 0.41
83 0.47
84 0.48
85 0.55
86 0.54
87 0.53
88 0.57
89 0.56
90 0.53
91 0.52
92 0.55
93 0.46
94 0.51
95 0.5
96 0.42
97 0.35
98 0.3
99 0.25
100 0.2
101 0.2
102 0.13
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.17
110 0.25
111 0.29
112 0.31
113 0.34
114 0.35
115 0.43
116 0.43
117 0.43
118 0.35
119 0.32
120 0.3
121 0.28
122 0.27
123 0.18
124 0.17
125 0.14
126 0.17
127 0.19
128 0.26
129 0.3
130 0.33
131 0.41
132 0.5
133 0.6
134 0.65
135 0.69
136 0.72
137 0.78
138 0.84
139 0.87
140 0.87
141 0.87
142 0.88
143 0.89
144 0.89
145 0.88
146 0.87
147 0.82
148 0.76
149 0.66
150 0.61
151 0.54
152 0.45
153 0.35
154 0.28
155 0.25
156 0.23
157 0.23
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.18
162 0.17
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.15
216 0.14
217 0.15
218 0.13
219 0.18
220 0.19
221 0.22
222 0.21
223 0.22
224 0.25
225 0.28
226 0.34
227 0.31
228 0.34
229 0.34
230 0.34
231 0.35
232 0.36
233 0.34
234 0.29
235 0.27
236 0.25
237 0.26
238 0.24
239 0.21
240 0.17
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.17
252 0.16
253 0.18
254 0.17
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.16
260 0.19
261 0.23
262 0.26
263 0.27
264 0.33
265 0.32
266 0.34
267 0.34
268 0.29
269 0.26
270 0.23
271 0.25
272 0.21
273 0.23
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.1
294 0.11
295 0.08
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.14
301 0.18
302 0.2
303 0.21
304 0.24
305 0.25
306 0.3
307 0.34
308 0.41
309 0.39
310 0.42
311 0.47
312 0.42
313 0.4
314 0.35
315 0.31
316 0.24
317 0.21
318 0.17
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.14
336 0.16
337 0.22
338 0.24
339 0.27
340 0.3
341 0.31
342 0.31
343 0.34