Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y5Z4

Protein Details
Accession A0A409Y5Z4    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-369DKNAQIKRPRGRPRKSPSPPPABasic
462-484VASPPIKRGRPKKQQTQVLPTSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-321KKSK
354-394KRPRGRPRKSPSPPPATRIPVTSPVPPSPKSRVGRPKANSI
398-420LPPGAPAPAITPKRGPGRPPKAK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MPARRAVSRPAIINHSFPPFYACYLLKSIQSPDSTSVYIGSTPSPPRRIRQHNGEITAGARKTASKRPWVMQMIVHGFPSRLSALQFEWAWQHPHRSRHLRDGDKNIFGNRAARILSKNILIVRNMIALHPFNTWPLHVKLFTEEAVKFWEASANKSLSLPPGFTCTIELEGVDGKSGNSGSGRKGPIDVTDGPIVISTLPYLELYCSFPPSLLVHCLPCTSNTWLGPEVYNTKRWPLRAKPSEHPDVDPDDLYVSDEDNLELLMLPEKTPSRIKSISSKRSASSDSEHESTKSRVRKSNKGRNVGGEPTLDDQSKSKKSKGKQRAVLSAEENASDSGSSLFLSDSDDKNAQIKRPRGRPRKSPSPPPATRIPVTSPVPPSPKSRVGRPKANSILNHLPPGAPAPAITPKRGPGRPPKAKVQSINSVQVSLNPQAEKQTSLASPISLKTNVCLPSIPNEVEVASPPIKRGRPKKQQTQVLPTSPIHKQSAKTDTPGNDVPLRTPESTKKKGKIKAIPSPAFDTSSGETFDFSGISDIDSEVGMELFKSPKRPRGTPSKAPVVTPMRKITTVATTQMQSPDIANAGCWMDLIHKSPTKTLDKALEGLTLGGSKPSPSRSNRKGPGPNDEVIELSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.39
4 0.34
5 0.34
6 0.28
7 0.28
8 0.29
9 0.26
10 0.24
11 0.29
12 0.31
13 0.29
14 0.3
15 0.32
16 0.32
17 0.34
18 0.33
19 0.31
20 0.33
21 0.31
22 0.28
23 0.25
24 0.21
25 0.2
26 0.18
27 0.16
28 0.18
29 0.25
30 0.32
31 0.39
32 0.42
33 0.48
34 0.58
35 0.66
36 0.69
37 0.73
38 0.76
39 0.76
40 0.76
41 0.7
42 0.61
43 0.53
44 0.5
45 0.4
46 0.29
47 0.22
48 0.22
49 0.26
50 0.34
51 0.39
52 0.41
53 0.47
54 0.51
55 0.59
56 0.6
57 0.57
58 0.5
59 0.52
60 0.48
61 0.43
62 0.4
63 0.31
64 0.26
65 0.24
66 0.24
67 0.17
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.2
73 0.2
74 0.18
75 0.21
76 0.22
77 0.26
78 0.26
79 0.35
80 0.36
81 0.42
82 0.51
83 0.57
84 0.6
85 0.66
86 0.74
87 0.74
88 0.75
89 0.79
90 0.75
91 0.71
92 0.68
93 0.59
94 0.52
95 0.43
96 0.39
97 0.3
98 0.26
99 0.21
100 0.22
101 0.23
102 0.24
103 0.25
104 0.23
105 0.25
106 0.26
107 0.27
108 0.25
109 0.24
110 0.22
111 0.22
112 0.21
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.18
123 0.2
124 0.22
125 0.2
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.2
132 0.17
133 0.2
134 0.2
135 0.17
136 0.15
137 0.19
138 0.16
139 0.19
140 0.23
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.22
145 0.21
146 0.22
147 0.19
148 0.15
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.19
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.13
169 0.19
170 0.21
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.24
176 0.23
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.17
181 0.16
182 0.15
183 0.09
184 0.08
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.17
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.2
215 0.19
216 0.22
217 0.2
218 0.24
219 0.22
220 0.27
221 0.29
222 0.31
223 0.37
224 0.38
225 0.47
226 0.51
227 0.56
228 0.58
229 0.63
230 0.67
231 0.61
232 0.54
233 0.46
234 0.41
235 0.37
236 0.29
237 0.22
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.08
256 0.11
257 0.15
258 0.16
259 0.2
260 0.22
261 0.24
262 0.32
263 0.42
264 0.48
265 0.5
266 0.51
267 0.45
268 0.47
269 0.47
270 0.39
271 0.33
272 0.28
273 0.26
274 0.26
275 0.25
276 0.23
277 0.23
278 0.23
279 0.26
280 0.28
281 0.28
282 0.34
283 0.4
284 0.49
285 0.58
286 0.66
287 0.68
288 0.69
289 0.66
290 0.63
291 0.61
292 0.53
293 0.44
294 0.33
295 0.26
296 0.21
297 0.21
298 0.16
299 0.13
300 0.12
301 0.17
302 0.24
303 0.25
304 0.29
305 0.33
306 0.39
307 0.49
308 0.59
309 0.62
310 0.62
311 0.65
312 0.68
313 0.65
314 0.61
315 0.52
316 0.43
317 0.34
318 0.26
319 0.22
320 0.14
321 0.11
322 0.08
323 0.07
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.18
337 0.2
338 0.21
339 0.26
340 0.32
341 0.37
342 0.46
343 0.57
344 0.63
345 0.68
346 0.74
347 0.76
348 0.81
349 0.8
350 0.8
351 0.79
352 0.79
353 0.74
354 0.68
355 0.66
356 0.59
357 0.53
358 0.45
359 0.39
360 0.35
361 0.35
362 0.34
363 0.31
364 0.3
365 0.33
366 0.33
367 0.34
368 0.34
369 0.41
370 0.39
371 0.45
372 0.52
373 0.55
374 0.62
375 0.6
376 0.64
377 0.61
378 0.64
379 0.56
380 0.53
381 0.54
382 0.46
383 0.44
384 0.35
385 0.29
386 0.24
387 0.25
388 0.18
389 0.1
390 0.08
391 0.09
392 0.17
393 0.19
394 0.2
395 0.2
396 0.24
397 0.32
398 0.34
399 0.37
400 0.4
401 0.5
402 0.58
403 0.62
404 0.67
405 0.68
406 0.71
407 0.71
408 0.66
409 0.63
410 0.58
411 0.59
412 0.5
413 0.43
414 0.37
415 0.35
416 0.32
417 0.26
418 0.25
419 0.19
420 0.19
421 0.2
422 0.21
423 0.2
424 0.17
425 0.18
426 0.15
427 0.18
428 0.18
429 0.15
430 0.15
431 0.15
432 0.18
433 0.16
434 0.16
435 0.14
436 0.19
437 0.2
438 0.2
439 0.19
440 0.17
441 0.2
442 0.25
443 0.25
444 0.19
445 0.18
446 0.18
447 0.17
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.15
452 0.16
453 0.22
454 0.26
455 0.34
456 0.43
457 0.49
458 0.58
459 0.67
460 0.76
461 0.8
462 0.85
463 0.85
464 0.84
465 0.81
466 0.74
467 0.69
468 0.59
469 0.54
470 0.47
471 0.44
472 0.39
473 0.35
474 0.33
475 0.36
476 0.44
477 0.41
478 0.41
479 0.42
480 0.4
481 0.42
482 0.42
483 0.38
484 0.34
485 0.32
486 0.31
487 0.29
488 0.32
489 0.27
490 0.29
491 0.35
492 0.4
493 0.49
494 0.56
495 0.6
496 0.64
497 0.7
498 0.76
499 0.76
500 0.75
501 0.76
502 0.79
503 0.75
504 0.7
505 0.68
506 0.6
507 0.53
508 0.44
509 0.37
510 0.29
511 0.26
512 0.24
513 0.18
514 0.17
515 0.15
516 0.15
517 0.11
518 0.1
519 0.09
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.05
531 0.07
532 0.1
533 0.12
534 0.21
535 0.26
536 0.34
537 0.42
538 0.46
539 0.52
540 0.59
541 0.67
542 0.68
543 0.71
544 0.74
545 0.68
546 0.64
547 0.66
548 0.64
549 0.61
550 0.57
551 0.55
552 0.48
553 0.47
554 0.48
555 0.42
556 0.39
557 0.36
558 0.34
559 0.31
560 0.28
561 0.3
562 0.31
563 0.29
564 0.23
565 0.21
566 0.19
567 0.17
568 0.16
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.12
573 0.11
574 0.1
575 0.12
576 0.14
577 0.18
578 0.23
579 0.26
580 0.28
581 0.32
582 0.4
583 0.42
584 0.42
585 0.45
586 0.45
587 0.44
588 0.45
589 0.42
590 0.37
591 0.3
592 0.28
593 0.23
594 0.17
595 0.14
596 0.13
597 0.12
598 0.12
599 0.15
600 0.21
601 0.29
602 0.36
603 0.46
604 0.54
605 0.64
606 0.7
607 0.77
608 0.8
609 0.77
610 0.79
611 0.74
612 0.68
613 0.6
614 0.53