FuNGI

A0A409YEX0

Protein Details

Accession

A0A409YEX0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
226-251	VVIPRVNMSKKRKRCRPSPALFQPDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1

Amino Acid Sequences

MPQKKPAVAQFLDLEAVVDREHEDDSTEDEFDKEFIDDYDLDIDYEPRPMDIDHAAQNNIFEQVIKEKTGQEGQGSGDSEIGIEERSDVDPQLQAIVQSIVDMGDSPCWRVACKPKMEGAVGDMLIQQSQISGCSVHPTLHTGWLYVQGKLDTRIHAVLSRMPGVLRNRSGVIIHPLTRDEMLQIHNPCAPDHDLAVSQWVRIKDGPYKDDPAVVIAVDEHSTDVVVIPRVNMSKKRKRCRPSPALFQPDEFKKHRPAKSIRQHSESNFSVGSFDFQCGLLVRTFGLRSLTVLDIKLTSLMLQLFEKSQHPIVKLSAKIPKLVEWCLDIGDEVIIPRAQAQAQAQAHGIIVAQGVDFVEVKLDNGELVRSGWKGLRKAVGVGEYVEVTHGVQSALSGWIVDINEDHYATIIQAEGNESGKMDIEEMVFHVNRLRVTVPPTIFIPPSRVIDSVVKEYIPWRGTKILVTKKQHAYKGYYGYVVDITRHSSNSQQCIKLVIQLDGAYNPNTPYPRIHLDSEDVVEASTGLLLKWYNLPGSNFVRNLGPLPLQPIFMPIPSPYPLSNPSTTITTPAWDPGASTPLHQSDSQPLPAPIPLTAATSSTPEPPLFQLDHALLDRRLMDIHLKVFVTDGQRYKNSPLSVNVIETDGQLSFVHKVFNKWVPLKPEWVKPAEPNISRDNSLLVVTNGSHTGLFVRRIDNVRIDDKDVMFLAVVRRLEGKRDELTPDTLYLPPSDLCICVESDKEKKLNKGLMDILRRDAREGRLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.15
3	0.15
4	0.11
5	0.09
6	0.09
7	0.09
8	0.1
9	0.1
10	0.11
11	0.11
12	0.15
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.16
17	0.16
18	0.15
19	0.15
20	0.11
21	0.1
22	0.1
23	0.13
24	0.12
25	0.13
26	0.16
27	0.15
28	0.15
29	0.15
30	0.16
31	0.13
32	0.16
33	0.15
34	0.12
35	0.13
36	0.12
37	0.15
38	0.17
39	0.2
40	0.23
41	0.26
42	0.27
43	0.26
44	0.27
45	0.24
46	0.22
47	0.18
48	0.13
49	0.11
50	0.17
51	0.19
52	0.2
53	0.21
54	0.22
55	0.26
56	0.3
57	0.3
58	0.25
59	0.24
60	0.24
61	0.27
62	0.27
63	0.23
64	0.18
65	0.17
66	0.15
67	0.13
68	0.12
69	0.08
70	0.06
71	0.06
72	0.08
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.12
77	0.12
78	0.13
79	0.14
80	0.12
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.07
88	0.06
89	0.07
90	0.06
91	0.11
92	0.12
93	0.13
94	0.16
95	0.16
96	0.17
97	0.24
98	0.34
99	0.37
100	0.43
101	0.45
102	0.48
103	0.52
104	0.52
105	0.46
106	0.38
107	0.34
108	0.28
109	0.24
110	0.2
111	0.16
112	0.14
113	0.13
114	0.1
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.12
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.17
126	0.18
127	0.24
128	0.24
129	0.2
130	0.2
131	0.28
132	0.28
133	0.26
134	0.26
135	0.21
136	0.23
137	0.26
138	0.28
139	0.21
140	0.22
141	0.22
142	0.21
143	0.22
144	0.22
145	0.22
146	0.22
147	0.22
148	0.19
149	0.18
150	0.23
151	0.25
152	0.31
153	0.29
154	0.28
155	0.27
156	0.28
157	0.28
158	0.25
159	0.28
160	0.25
161	0.25
162	0.24
163	0.24
164	0.25
165	0.24
166	0.22
167	0.16
168	0.15
169	0.15
170	0.21
171	0.21
172	0.21
173	0.23
174	0.23
175	0.22
176	0.23
177	0.23
178	0.17
179	0.17
180	0.17
181	0.15
182	0.14
183	0.21
184	0.17
185	0.16
186	0.18
187	0.18
188	0.18
189	0.19
190	0.22
191	0.23
192	0.28
193	0.32
194	0.33
195	0.37
196	0.35
197	0.35
198	0.32
199	0.27
200	0.22
201	0.17
202	0.12
203	0.08
204	0.09
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.1
217	0.13
218	0.16
219	0.24
220	0.33
221	0.42
222	0.52
223	0.63
224	0.7
225	0.76
226	0.82
227	0.84
228	0.85
229	0.83
230	0.84
231	0.83
232	0.81
233	0.74
234	0.66
235	0.61
236	0.55
237	0.53
238	0.45
239	0.39
240	0.41
241	0.49
242	0.52
243	0.55
244	0.58
245	0.63
246	0.7
247	0.77
248	0.73
249	0.69
250	0.69
251	0.63
252	0.62
253	0.52
254	0.44
255	0.33
256	0.27
257	0.23
258	0.18
259	0.18
260	0.11
261	0.11
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.08
275	0.08
276	0.11
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.15
296	0.16
297	0.17
298	0.18
299	0.2
300	0.24
301	0.24
302	0.27
303	0.29
304	0.27
305	0.29
306	0.28
307	0.29
308	0.27
309	0.27
310	0.23
311	0.18
312	0.18
313	0.15
314	0.15
315	0.1
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.04
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.08
328	0.15
329	0.15
330	0.16
331	0.16
332	0.15
333	0.15
334	0.13
335	0.12
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.04
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.09
359	0.12
360	0.14
361	0.16
362	0.18
363	0.17
364	0.18
365	0.19
366	0.18
367	0.15
368	0.14
369	0.12
370	0.09
371	0.09
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.03
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.04
398	0.03
399	0.04
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.12
420	0.12
421	0.11
422	0.15
423	0.2
424	0.19
425	0.18
426	0.2
427	0.2
428	0.2
429	0.19
430	0.19
431	0.16
432	0.18
433	0.18
434	0.17
435	0.18
436	0.21
437	0.22
438	0.21
439	0.2
440	0.17
441	0.16
442	0.17
443	0.2
444	0.17
445	0.16
446	0.15
447	0.16
448	0.17
449	0.2
450	0.28
451	0.32
452	0.39
453	0.43
454	0.49
455	0.54
456	0.6
457	0.6
458	0.55
459	0.52
460	0.48
461	0.49
462	0.43
463	0.36
464	0.3
465	0.27
466	0.25
467	0.2
468	0.16
469	0.11
470	0.13
471	0.13
472	0.14
473	0.14
474	0.18
475	0.22
476	0.29
477	0.33
478	0.31
479	0.3
480	0.33
481	0.32
482	0.31
483	0.28
484	0.21
485	0.17
486	0.17
487	0.17
488	0.15
489	0.16
490	0.12
491	0.11
492	0.11
493	0.13
494	0.13
495	0.14
496	0.14
497	0.17
498	0.22
499	0.25
500	0.26
501	0.25
502	0.27
503	0.27
504	0.26
505	0.22
506	0.16
507	0.13
508	0.11
509	0.09
510	0.06
511	0.05
512	0.04
513	0.03
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.08
518	0.09
519	0.1
520	0.12
521	0.13
522	0.18
523	0.23
524	0.27
525	0.25
526	0.25
527	0.24
528	0.23
529	0.23
530	0.2
531	0.16
532	0.12
533	0.17
534	0.16
535	0.16
536	0.15
537	0.17
538	0.16
539	0.15
540	0.16
541	0.11
542	0.14
543	0.15
544	0.17
545	0.14
546	0.16
547	0.2
548	0.24
549	0.24
550	0.23
551	0.23
552	0.24
553	0.24
554	0.24
555	0.21
556	0.18
557	0.17
558	0.16
559	0.16
560	0.12
561	0.14
562	0.11
563	0.14
564	0.13
565	0.13
566	0.16
567	0.17
568	0.19
569	0.19
570	0.19
571	0.23
572	0.27
573	0.28
574	0.27
575	0.25
576	0.24
577	0.25
578	0.24
579	0.16
580	0.15
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.14
587	0.16
588	0.15
589	0.17
590	0.15
591	0.16
592	0.17
593	0.2
594	0.19
595	0.18
596	0.18
597	0.17
598	0.19
599	0.19
600	0.21
601	0.17
602	0.17
603	0.17
604	0.15
605	0.14
606	0.13
607	0.16
608	0.16
609	0.17
610	0.19
611	0.19
612	0.18
613	0.18
614	0.21
615	0.21
616	0.23
617	0.26
618	0.28
619	0.31
620	0.33
621	0.37
622	0.4
623	0.38
624	0.35
625	0.35
626	0.36
627	0.35
628	0.34
629	0.3
630	0.25
631	0.23
632	0.2
633	0.18
634	0.12
635	0.11
636	0.1
637	0.11
638	0.12
639	0.12
640	0.17
641	0.17
642	0.2
643	0.25
644	0.31
645	0.37
646	0.4
647	0.44
648	0.47
649	0.48
650	0.55
651	0.54
652	0.56
653	0.53
654	0.53
655	0.51
656	0.48
657	0.55
658	0.55
659	0.53
660	0.49
661	0.5
662	0.49
663	0.47
664	0.43
665	0.36
666	0.28
667	0.25
668	0.22
669	0.16
670	0.14
671	0.13
672	0.14
673	0.13
674	0.12
675	0.11
676	0.1
677	0.13
678	0.15
679	0.19
680	0.19
681	0.21
682	0.26
683	0.31
684	0.34
685	0.37
686	0.38
687	0.41
688	0.41
689	0.43
690	0.42
691	0.38
692	0.36
693	0.31
694	0.26
695	0.2
696	0.19
697	0.18
698	0.18
699	0.18
700	0.16
701	0.22
702	0.22
703	0.28
704	0.3
705	0.33
706	0.32
707	0.35
708	0.39
709	0.37
710	0.4
711	0.36
712	0.34
713	0.31
714	0.29
715	0.27
716	0.23
717	0.22
718	0.18
719	0.19
720	0.18
721	0.16
722	0.16
723	0.16
724	0.17
725	0.16
726	0.19
727	0.23
728	0.28
729	0.34
730	0.4
731	0.44
732	0.49
733	0.55
734	0.58
735	0.55
736	0.55
737	0.56
738	0.58
739	0.6
740	0.56
741	0.55
742	0.55
743	0.53
744	0.5
745	0.48

A0A409YEX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer