Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VWM8

Protein Details
Accession A0A409VWM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-105LDYRPQRSKEPALKNPEKTRVIHydrophilic
1030-1049LLMQKRLQQQHQQQQQQQAQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSGYNRTRYVEQLLEKTESSPPSFTVHLYPEYWVLNNGSKFLYHNQIASLLDDIRAHRIPVDFLHLFDQARVPFYEGCMIVELLDYRPQRSKEPALKNPEKTRVILHPNAETLYEDICTMNAQHGSKWTDRDALEIEAKLLLVTSQPLCLDPDPHLTRIVNHVIRVSTPSMPMSLKRKASIMEPEDDGPEKAKRDRLMGFMAPRGLKPHPEYKLLDAMHKGRVAKAAEASAPPSNSQFSLPHQSTPSQHIPPSQDTPASHTPAPLISSAPSPAESVDKKGSKIKKGETPQMPFNVAFTRSNGSQTPVPVPPQPTQHQFINQNPPTPSSNPMMQPQTYPSVQAAQAASRVQATGQAPQHYIPQFQIPNVPQMQAQAQQQQQAQQPPTPNQLQPPRPPSQPVNPTPPATTPASHAPAPPGQSPKPTVQSIQPSPTPQPGAQPYSTTPTFQAATPHQPFVQQPPMRRPPTAMGTPAQTHAQLPMSPNTNPGQVQGYNSQMQVNQQMQAQQQQQQQLIQQRMALANMQKNGRMTPQVSQGGGVMQTPTMASATVTPSPVRNSPILVNQQQGAVNRGSPMPAKAQIPIQNQGGAQQAIQPGQPQQQVQQNAQQLRMFPAQYPSNLRPHPTQAQVIAQATSGGTPANMAGSPMMNARPITPAVAVGPDGKPIAMGRRTPMPGQAQQQQQQQMQGVNAGSPRSQTPSVIQHSSPAQAHALLQQQAQMAVLQQQQQAQARAQAATTPQPTMTPRQQAAQLQQVSSQAHAQAQAAQAQIHQQQQAQQQQQQAQNAGQQGQAQQMQGQQQGQGQAAGQFAGMYGYPGFQVPMNSSASYFQQVNRNMLTPAQQAQLQQMQQQHIQNQQAQAQAQGQGQQQQQQQQVQGGQGGPSQTVVPQNIVQQMGILQAQINSVTASFNNILTTTGGHLDPQQQAMCQQLQGRREFMLKQLGMLKMQVQVANAAGQGGGAGQAQAQAQMLAQAASAGGGGGMGNMQMAGHGGVQTAQQQAQAAAMMKLASAQGQMMGAGQGYTQQQMALLMQKRLQQQHQQQQQQQAQAQALQQQQQKALAMKGVAGKKPGQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.41
4 0.4
5 0.37
6 0.34
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.28
11 0.28
12 0.27
13 0.27
14 0.28
15 0.27
16 0.27
17 0.27
18 0.27
19 0.26
20 0.23
21 0.23
22 0.26
23 0.26
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.25
28 0.28
29 0.32
30 0.27
31 0.27
32 0.27
33 0.29
34 0.29
35 0.27
36 0.24
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.21
42 0.22
43 0.21
44 0.21
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.29
49 0.23
50 0.24
51 0.27
52 0.26
53 0.25
54 0.24
55 0.28
56 0.2
57 0.23
58 0.22
59 0.22
60 0.2
61 0.21
62 0.25
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.12
71 0.19
72 0.19
73 0.21
74 0.28
75 0.3
76 0.33
77 0.39
78 0.48
79 0.51
80 0.6
81 0.66
82 0.7
83 0.76
84 0.81
85 0.82
86 0.81
87 0.74
88 0.66
89 0.62
90 0.6
91 0.6
92 0.56
93 0.52
94 0.46
95 0.44
96 0.43
97 0.39
98 0.31
99 0.24
100 0.19
101 0.15
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.12
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.22
112 0.27
113 0.3
114 0.33
115 0.32
116 0.33
117 0.33
118 0.35
119 0.32
120 0.31
121 0.31
122 0.27
123 0.25
124 0.19
125 0.19
126 0.15
127 0.13
128 0.09
129 0.06
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.26
140 0.28
141 0.28
142 0.31
143 0.29
144 0.29
145 0.34
146 0.4
147 0.32
148 0.3
149 0.32
150 0.29
151 0.29
152 0.31
153 0.28
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.25
160 0.28
161 0.33
162 0.34
163 0.34
164 0.35
165 0.34
166 0.37
167 0.41
168 0.39
169 0.35
170 0.34
171 0.33
172 0.34
173 0.34
174 0.29
175 0.23
176 0.22
177 0.23
178 0.24
179 0.29
180 0.28
181 0.32
182 0.35
183 0.36
184 0.38
185 0.4
186 0.38
187 0.36
188 0.39
189 0.34
190 0.32
191 0.32
192 0.28
193 0.29
194 0.31
195 0.37
196 0.35
197 0.4
198 0.42
199 0.42
200 0.48
201 0.43
202 0.42
203 0.38
204 0.37
205 0.36
206 0.36
207 0.33
208 0.26
209 0.31
210 0.29
211 0.27
212 0.26
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.24
217 0.21
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.19
226 0.28
227 0.28
228 0.3
229 0.31
230 0.33
231 0.33
232 0.39
233 0.4
234 0.34
235 0.35
236 0.36
237 0.38
238 0.4
239 0.42
240 0.37
241 0.34
242 0.31
243 0.37
244 0.38
245 0.37
246 0.33
247 0.28
248 0.27
249 0.25
250 0.26
251 0.19
252 0.14
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.16
261 0.16
262 0.19
263 0.26
264 0.27
265 0.28
266 0.36
267 0.42
268 0.44
269 0.49
270 0.51
271 0.52
272 0.57
273 0.65
274 0.65
275 0.64
276 0.62
277 0.58
278 0.55
279 0.45
280 0.41
281 0.34
282 0.29
283 0.24
284 0.21
285 0.21
286 0.19
287 0.22
288 0.21
289 0.21
290 0.21
291 0.22
292 0.24
293 0.23
294 0.25
295 0.25
296 0.29
297 0.28
298 0.33
299 0.36
300 0.36
301 0.38
302 0.39
303 0.41
304 0.43
305 0.47
306 0.51
307 0.48
308 0.49
309 0.45
310 0.45
311 0.43
312 0.39
313 0.35
314 0.28
315 0.3
316 0.27
317 0.31
318 0.32
319 0.29
320 0.28
321 0.28
322 0.29
323 0.25
324 0.23
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.2
329 0.17
330 0.13
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.11
335 0.11
336 0.08
337 0.12
338 0.13
339 0.17
340 0.2
341 0.21
342 0.22
343 0.23
344 0.29
345 0.25
346 0.25
347 0.19
348 0.23
349 0.21
350 0.21
351 0.26
352 0.22
353 0.26
354 0.26
355 0.26
356 0.2
357 0.2
358 0.22
359 0.2
360 0.21
361 0.22
362 0.22
363 0.26
364 0.26
365 0.3
366 0.32
367 0.34
368 0.34
369 0.31
370 0.33
371 0.32
372 0.37
373 0.36
374 0.33
375 0.34
376 0.41
377 0.44
378 0.47
379 0.51
380 0.49
381 0.47
382 0.51
383 0.48
384 0.48
385 0.51
386 0.48
387 0.5
388 0.49
389 0.48
390 0.46
391 0.42
392 0.37
393 0.3
394 0.26
395 0.2
396 0.22
397 0.24
398 0.23
399 0.22
400 0.21
401 0.22
402 0.24
403 0.25
404 0.25
405 0.23
406 0.25
407 0.28
408 0.29
409 0.31
410 0.3
411 0.28
412 0.27
413 0.34
414 0.34
415 0.34
416 0.33
417 0.3
418 0.31
419 0.33
420 0.31
421 0.23
422 0.25
423 0.26
424 0.27
425 0.25
426 0.25
427 0.23
428 0.26
429 0.26
430 0.22
431 0.19
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.19
436 0.16
437 0.24
438 0.26
439 0.26
440 0.24
441 0.25
442 0.25
443 0.27
444 0.34
445 0.28
446 0.29
447 0.37
448 0.46
449 0.47
450 0.46
451 0.43
452 0.37
453 0.4
454 0.39
455 0.32
456 0.24
457 0.24
458 0.25
459 0.23
460 0.2
461 0.15
462 0.13
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.15
469 0.15
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.14
477 0.16
478 0.16
479 0.18
480 0.18
481 0.18
482 0.18
483 0.15
484 0.15
485 0.17
486 0.16
487 0.14
488 0.13
489 0.16
490 0.16
491 0.21
492 0.22
493 0.24
494 0.26
495 0.28
496 0.28
497 0.26
498 0.29
499 0.29
500 0.29
501 0.23
502 0.21
503 0.19
504 0.18
505 0.18
506 0.16
507 0.13
508 0.14
509 0.17
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.17
515 0.16
516 0.15
517 0.14
518 0.2
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.18
523 0.16
524 0.15
525 0.13
526 0.06
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.07
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.12
541 0.14
542 0.15
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.19
547 0.24
548 0.23
549 0.23
550 0.21
551 0.22
552 0.22
553 0.21
554 0.18
555 0.13
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.17
567 0.23
568 0.26
569 0.27
570 0.26
571 0.25
572 0.24
573 0.25
574 0.23
575 0.16
576 0.13
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.12
581 0.11
582 0.11
583 0.14
584 0.16
585 0.14
586 0.17
587 0.22
588 0.25
589 0.26
590 0.3
591 0.31
592 0.3
593 0.32
594 0.29
595 0.24
596 0.25
597 0.26
598 0.21
599 0.17
600 0.2
601 0.19
602 0.2
603 0.26
604 0.24
605 0.29
606 0.29
607 0.31
608 0.29
609 0.33
610 0.36
611 0.33
612 0.31
613 0.25
614 0.26
615 0.26
616 0.25
617 0.19
618 0.15
619 0.12
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.05
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.07
636 0.08
637 0.08
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.13
654 0.14
655 0.15
656 0.16
657 0.21
658 0.24
659 0.24
660 0.28
661 0.28
662 0.29
663 0.33
664 0.38
665 0.38
666 0.42
667 0.46
668 0.46
669 0.42
670 0.4
671 0.37
672 0.32
673 0.26
674 0.23
675 0.18
676 0.14
677 0.14
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.13
683 0.14
684 0.14
685 0.16
686 0.23
687 0.27
688 0.29
689 0.28
690 0.26
691 0.27
692 0.29
693 0.26
694 0.2
695 0.16
696 0.14
697 0.14
698 0.15
699 0.18
700 0.16
701 0.16
702 0.16
703 0.16
704 0.16
705 0.15
706 0.12
707 0.08
708 0.11
709 0.13
710 0.14
711 0.15
712 0.17
713 0.2
714 0.23
715 0.25
716 0.21
717 0.23
718 0.21
719 0.2
720 0.18
721 0.16
722 0.15
723 0.18
724 0.19
725 0.16
726 0.15
727 0.17
728 0.19
729 0.24
730 0.28
731 0.29
732 0.29
733 0.3
734 0.34
735 0.36
736 0.38
737 0.39
738 0.35
739 0.29
740 0.3
741 0.31
742 0.27
743 0.25
744 0.22
745 0.15
746 0.14
747 0.15
748 0.13
749 0.13
750 0.14
751 0.15
752 0.15
753 0.14
754 0.13
755 0.16
756 0.19
757 0.19
758 0.2
759 0.18
760 0.23
761 0.3
762 0.38
763 0.39
764 0.39
765 0.41
766 0.46
767 0.49
768 0.46
769 0.41
770 0.34
771 0.33
772 0.31
773 0.27
774 0.22
775 0.19
776 0.17
777 0.19
778 0.2
779 0.17
780 0.16
781 0.18
782 0.2
783 0.22
784 0.21
785 0.19
786 0.19
787 0.21
788 0.2
789 0.17
790 0.14
791 0.13
792 0.13
793 0.11
794 0.09
795 0.07
796 0.06
797 0.06
798 0.06
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.06
803 0.06
804 0.07
805 0.07
806 0.08
807 0.09
808 0.12
809 0.14
810 0.14
811 0.15
812 0.16
813 0.17
814 0.19
815 0.18
816 0.18
817 0.23
818 0.26
819 0.29
820 0.29
821 0.29
822 0.27
823 0.27
824 0.27
825 0.22
826 0.22
827 0.2
828 0.2
829 0.2
830 0.23
831 0.28
832 0.25
833 0.26
834 0.28
835 0.29
836 0.32
837 0.35
838 0.35
839 0.36
840 0.4
841 0.39
842 0.37
843 0.38
844 0.36
845 0.33
846 0.31
847 0.26
848 0.25
849 0.23
850 0.25
851 0.23
852 0.26
853 0.27
854 0.31
855 0.33
856 0.36
857 0.41
858 0.39
859 0.4
860 0.37
861 0.37
862 0.31
863 0.31
864 0.24
865 0.2
866 0.18
867 0.17
868 0.14
869 0.13
870 0.12
871 0.11
872 0.15
873 0.15
874 0.16
875 0.17
876 0.2
877 0.23
878 0.23
879 0.21
880 0.17
881 0.16
882 0.16
883 0.14
884 0.11
885 0.08
886 0.08
887 0.09
888 0.09
889 0.09
890 0.07
891 0.07
892 0.08
893 0.07
894 0.11
895 0.11
896 0.12
897 0.12
898 0.12
899 0.13
900 0.12
901 0.13
902 0.11
903 0.12
904 0.11
905 0.11
906 0.14
907 0.18
908 0.19
909 0.22
910 0.21
911 0.19
912 0.21
913 0.24
914 0.23
915 0.21
916 0.24
917 0.26
918 0.31
919 0.33
920 0.34
921 0.32
922 0.34
923 0.32
924 0.31
925 0.36
926 0.3
927 0.3
928 0.34
929 0.34
930 0.31
931 0.31
932 0.28
933 0.22
934 0.25
935 0.23
936 0.18
937 0.17
938 0.17
939 0.17
940 0.15
941 0.12
942 0.09
943 0.07
944 0.07
945 0.05
946 0.05
947 0.04
948 0.04
949 0.04
950 0.06
951 0.07
952 0.08
953 0.08
954 0.07
955 0.07
956 0.09
957 0.09
958 0.07
959 0.07
960 0.06
961 0.06
962 0.06
963 0.06
964 0.04
965 0.03
966 0.03
967 0.03
968 0.03
969 0.03
970 0.03
971 0.03
972 0.03
973 0.03
974 0.03
975 0.04
976 0.05
977 0.05
978 0.06
979 0.06
980 0.07
981 0.08
982 0.12
983 0.14
984 0.14
985 0.14
986 0.15
987 0.15
988 0.15
989 0.16
990 0.15
991 0.12
992 0.12
993 0.11
994 0.1
995 0.11
996 0.1
997 0.09
998 0.08
999 0.08
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.08
1003 0.08
1004 0.08
1005 0.07
1006 0.06
1007 0.06
1008 0.09
1009 0.1
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.1
1013 0.1
1014 0.12
1015 0.14
1016 0.18
1017 0.21
1018 0.24
1019 0.27
1020 0.32
1021 0.39
1022 0.45
1023 0.5
1024 0.53
1025 0.59
1026 0.67
1027 0.74
1028 0.78
1029 0.77
1030 0.81
1031 0.79
1032 0.77
1033 0.69
1034 0.63
1035 0.55
1036 0.48
1037 0.44
1038 0.41
1039 0.39
1040 0.39
1041 0.4
1042 0.39
1043 0.39
1044 0.39
1045 0.41
1046 0.37
1047 0.34
1048 0.31
1049 0.26
1050 0.26
1051 0.31
1052 0.35
1053 0.34
1054 0.34