Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YCI2

Protein Details
Accession A0A409YCI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-159GNGGGKGKGKWRRKKKDLSDVTCWCCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-149GGNGGGKGKGKWRRKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MISVYPSVYDRWRWIVKEFTEKSKFTQTSMKAAFLNSKCPDKSDVRKFLDALRIKKEELITYGIHVSDEDFLSTIIKSLPQYLSHFASNLLANARLWSATGTIDPHRFIAIVSEEYDRTAIIPASKNGGNGGGGNGGGKGKGKWRRKKKDLSDVTCWCCKKKVEDDDSDGINLFAAVKDEGSLVDGDVGEMSREEWEEALDKELWELWTKMIFEGYENDSEDEDFEAVYYDGPNSRPTTPITYSVSTSQNNNNIRVTFYDSGSTPHITPYRENLYEFQATPPYSLRAANQGSFDATGIGKIDIDVPNGTETSKIQLTDVLYSPEVGYSLVSIGQLDEMGYTCTFGKGRCIIEDPDGVKVGEVWKNVREGDRAKEFGDEVHSDLWGPAPVETLRGKKYYVSFIDDKTRLTSIHFLRAKSDTFEAYKEYEACQGEDKLDERAKEVRWLGLDEKLKGVRVYWPGQRKVSMERNVYYDKSLGSTHSFEGENWHFKTKVSDPNVPSTSLNPPLDPPSIPTPPSPISESNQSQIVGNEQHPTPPIPDEVDNLTSPPQTQQTEPRRGTRVRNPGPLIQEMLAGQGTHSPYKNRDGQLPRGVHIPGSFEGEEEEANEIEEDWFESVMVGLSDEVAMAATMEEEDALEPRTIAEAKRRRDWPMWQKAIVEELETLKRTGTWELVDYNPMGYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.48
4 0.55
5 0.55
6 0.57
7 0.59
8 0.58
9 0.58
10 0.6
11 0.56
12 0.48
13 0.53
14 0.47
15 0.49
16 0.51
17 0.49
18 0.4
19 0.41
20 0.47
21 0.39
22 0.45
23 0.39
24 0.43
25 0.4
26 0.42
27 0.47
28 0.46
29 0.55
30 0.57
31 0.63
32 0.62
33 0.65
34 0.64
35 0.63
36 0.64
37 0.61
38 0.56
39 0.54
40 0.51
41 0.48
42 0.51
43 0.48
44 0.4
45 0.36
46 0.34
47 0.26
48 0.25
49 0.27
50 0.22
51 0.2
52 0.17
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.15
66 0.18
67 0.2
68 0.24
69 0.28
70 0.31
71 0.29
72 0.29
73 0.25
74 0.25
75 0.22
76 0.2
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.13
89 0.17
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.14
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.16
110 0.17
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.21
116 0.17
117 0.14
118 0.14
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.17
128 0.27
129 0.37
130 0.47
131 0.59
132 0.69
133 0.78
134 0.88
135 0.89
136 0.91
137 0.91
138 0.88
139 0.87
140 0.83
141 0.78
142 0.74
143 0.66
144 0.57
145 0.51
146 0.47
147 0.45
148 0.46
149 0.52
150 0.53
151 0.57
152 0.62
153 0.61
154 0.59
155 0.52
156 0.42
157 0.31
158 0.23
159 0.16
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.23
226 0.23
227 0.27
228 0.29
229 0.27
230 0.28
231 0.3
232 0.32
233 0.27
234 0.28
235 0.28
236 0.31
237 0.32
238 0.33
239 0.31
240 0.27
241 0.27
242 0.26
243 0.28
244 0.22
245 0.2
246 0.19
247 0.17
248 0.19
249 0.2
250 0.2
251 0.14
252 0.16
253 0.18
254 0.18
255 0.19
256 0.22
257 0.26
258 0.26
259 0.27
260 0.25
261 0.26
262 0.27
263 0.26
264 0.22
265 0.2
266 0.19
267 0.19
268 0.19
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.17
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.1
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.08
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.16
337 0.17
338 0.18
339 0.22
340 0.19
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.13
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.15
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.17
356 0.21
357 0.24
358 0.24
359 0.23
360 0.23
361 0.22
362 0.19
363 0.2
364 0.15
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.07
372 0.07
373 0.05
374 0.07
375 0.07
376 0.1
377 0.12
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.21
384 0.24
385 0.24
386 0.26
387 0.26
388 0.27
389 0.35
390 0.33
391 0.31
392 0.27
393 0.26
394 0.2
395 0.2
396 0.25
397 0.19
398 0.28
399 0.3
400 0.29
401 0.3
402 0.33
403 0.32
404 0.27
405 0.26
406 0.19
407 0.17
408 0.18
409 0.17
410 0.16
411 0.17
412 0.15
413 0.15
414 0.18
415 0.17
416 0.17
417 0.17
418 0.17
419 0.16
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.18
424 0.18
425 0.18
426 0.21
427 0.21
428 0.25
429 0.25
430 0.22
431 0.21
432 0.23
433 0.22
434 0.25
435 0.26
436 0.22
437 0.25
438 0.24
439 0.24
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.22
444 0.26
445 0.29
446 0.37
447 0.4
448 0.42
449 0.44
450 0.4
451 0.44
452 0.48
453 0.49
454 0.45
455 0.42
456 0.45
457 0.46
458 0.44
459 0.37
460 0.29
461 0.22
462 0.2
463 0.19
464 0.16
465 0.15
466 0.17
467 0.16
468 0.17
469 0.18
470 0.16
471 0.22
472 0.25
473 0.27
474 0.27
475 0.3
476 0.28
477 0.27
478 0.33
479 0.32
480 0.37
481 0.37
482 0.43
483 0.42
484 0.51
485 0.52
486 0.48
487 0.43
488 0.36
489 0.35
490 0.35
491 0.33
492 0.25
493 0.25
494 0.27
495 0.29
496 0.26
497 0.25
498 0.24
499 0.26
500 0.27
501 0.25
502 0.27
503 0.27
504 0.3
505 0.3
506 0.27
507 0.27
508 0.34
509 0.35
510 0.32
511 0.32
512 0.3
513 0.26
514 0.24
515 0.24
516 0.19
517 0.18
518 0.2
519 0.18
520 0.19
521 0.2
522 0.21
523 0.19
524 0.17
525 0.18
526 0.17
527 0.18
528 0.19
529 0.22
530 0.23
531 0.21
532 0.2
533 0.2
534 0.18
535 0.17
536 0.18
537 0.19
538 0.19
539 0.21
540 0.31
541 0.38
542 0.48
543 0.51
544 0.55
545 0.57
546 0.59
547 0.65
548 0.65
549 0.66
550 0.64
551 0.69
552 0.67
553 0.65
554 0.65
555 0.58
556 0.51
557 0.4
558 0.34
559 0.25
560 0.22
561 0.17
562 0.13
563 0.11
564 0.12
565 0.14
566 0.17
567 0.19
568 0.21
569 0.24
570 0.32
571 0.39
572 0.37
573 0.45
574 0.48
575 0.54
576 0.59
577 0.58
578 0.52
579 0.48
580 0.46
581 0.38
582 0.32
583 0.28
584 0.2
585 0.23
586 0.22
587 0.18
588 0.19
589 0.18
590 0.17
591 0.14
592 0.15
593 0.09
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.06
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.09
628 0.12
629 0.13
630 0.15
631 0.25
632 0.31
633 0.38
634 0.47
635 0.51
636 0.55
637 0.6
638 0.68
639 0.69
640 0.72
641 0.72
642 0.66
643 0.64
644 0.58
645 0.57
646 0.46
647 0.37
648 0.28
649 0.25
650 0.28
651 0.27
652 0.26
653 0.21
654 0.22
655 0.22
656 0.23
657 0.22
658 0.2
659 0.21
660 0.25
661 0.26
662 0.28
663 0.26