Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409YBS4

Protein Details
Accession A0A409YBS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSRKTQSQKKRHTKPCRYFQVNRCPHSAHydrophilic
247-278APNVRVKPRNPSKPPSKQKLMKYKTKPCKFFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-263RNPSKPPSK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 7, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSRKTQSQKKRHTKPCRYFQVNRCPHSADVCDFAHIIVNPAAATSPLEPGSGVCHQYPTGHCQSGTICGYPHGLEGKGTSYFYDINRVHFGNVAPMKPIDTTMPFDGARDWAAVVSPDATYLESPTISSSYGYPPQWPHSPFLLNSNYPHFVEAALVGVPARSRDSIDTLATSTSFSTQDSDEISSSAVTDDPRYGEHSHSYQSQVCIVDEPPLVHVAPYYAVPSNSVPTNSGPSPPYEPYGTGYQAPNVRVKPRNPSKPPSKQKLMKYKTKPCKFFVTSRGCPNGSACTFIHDEMEYPSDDGLVSKEDMSKKNFFPIPWRVIGGGVLVGVKRDGDDKEEESSEIDRPHSSDSKQSSNMSPIKIVTRQRSNSIPPTPSTAQVKVEHLFSAESPGVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.94
4 0.92
5 0.91
6 0.9
7 0.9
8 0.88
9 0.81
10 0.75
11 0.68
12 0.6
13 0.56
14 0.51
15 0.42
16 0.38
17 0.34
18 0.31
19 0.27
20 0.26
21 0.24
22 0.19
23 0.2
24 0.15
25 0.15
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.1
30 0.11
31 0.09
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.16
38 0.18
39 0.2
40 0.17
41 0.18
42 0.19
43 0.23
44 0.26
45 0.29
46 0.32
47 0.32
48 0.31
49 0.31
50 0.32
51 0.34
52 0.34
53 0.27
54 0.2
55 0.19
56 0.21
57 0.2
58 0.21
59 0.16
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.13
67 0.13
68 0.16
69 0.16
70 0.24
71 0.22
72 0.25
73 0.28
74 0.29
75 0.27
76 0.26
77 0.26
78 0.25
79 0.28
80 0.24
81 0.22
82 0.22
83 0.22
84 0.2
85 0.21
86 0.15
87 0.14
88 0.18
89 0.17
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.19
94 0.17
95 0.16
96 0.12
97 0.11
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.12
118 0.17
119 0.18
120 0.2
121 0.22
122 0.26
123 0.32
124 0.32
125 0.31
126 0.29
127 0.31
128 0.28
129 0.32
130 0.32
131 0.28
132 0.28
133 0.29
134 0.27
135 0.25
136 0.25
137 0.19
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.08
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.19
189 0.17
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.15
218 0.14
219 0.16
220 0.15
221 0.16
222 0.2
223 0.19
224 0.21
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.2
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.19
233 0.21
234 0.22
235 0.24
236 0.24
237 0.29
238 0.33
239 0.35
240 0.42
241 0.49
242 0.58
243 0.6
244 0.66
245 0.7
246 0.75
247 0.83
248 0.81
249 0.81
250 0.78
251 0.81
252 0.83
253 0.8
254 0.8
255 0.8
256 0.82
257 0.83
258 0.84
259 0.8
260 0.73
261 0.75
262 0.7
263 0.66
264 0.66
265 0.64
266 0.6
267 0.62
268 0.64
269 0.54
270 0.5
271 0.45
272 0.42
273 0.33
274 0.32
275 0.24
276 0.23
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.16
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.14
295 0.19
296 0.23
297 0.28
298 0.33
299 0.32
300 0.39
301 0.41
302 0.37
303 0.4
304 0.45
305 0.45
306 0.42
307 0.42
308 0.35
309 0.32
310 0.32
311 0.24
312 0.16
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.13
323 0.17
324 0.19
325 0.23
326 0.24
327 0.24
328 0.23
329 0.24
330 0.24
331 0.21
332 0.21
333 0.18
334 0.18
335 0.24
336 0.27
337 0.27
338 0.32
339 0.36
340 0.41
341 0.45
342 0.47
343 0.44
344 0.48
345 0.52
346 0.46
347 0.42
348 0.37
349 0.38
350 0.41
351 0.46
352 0.46
353 0.51
354 0.53
355 0.56
356 0.6
357 0.62
358 0.64
359 0.64
360 0.59
361 0.51
362 0.55
363 0.52
364 0.52
365 0.5
366 0.45
367 0.43
368 0.43
369 0.46
370 0.39
371 0.39
372 0.33
373 0.28
374 0.26
375 0.2
376 0.23