Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YIJ5

Protein Details
Accession A0A409YIJ5    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-76PSKIQEFHGKKRKQTDEKESSSKTSKRTKTSDKATLKNHydrophilic
80-110VDNTPKSPVKDKKTKEKKGKGKEKELQPITDBasic
472-495LDQDKLKFAKRKLRVQRCKTLPGSHydrophilic
546-582TDADRVARRLAKKKARNAMKPSTKPIKSGKERKRVRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-51KKRK
85-103KSPVKDKKTKEKKGKGKEK
246-257PSKKPSKEPRAH
539-582ERKKVKSTDADRVARRLAKKKARNAMKPSTKPIKSGKERKRVRS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLSTLLLASAPGIDTELDSLFKSSVSLAPNPAPPSPGPSKIQEFHGKKRKQTDEKESSSKTSKRTKTSDKATLKNAHSVDNTPKSPVKDKKTKEKKGKGKEKELQPITDAADVEHAETKEKSGETESLVQPHSEADADNEEEDDEVDLTKLVHESLDPKAKSSRKAKTKVVPEDETPERRNQRTIFIGNLPLEVASKRPLSKQLQRHIISFVPSAKVESIRFRSIPFQAPTAKLPTSDDEDSGKPSKKPSKEPRAHDKERTSAWRSKVDQQDEESVKKDEKRYLTPGQKKKVAYINQEFHTTADTVNAYIVFAHPPNTENRPANLPPLPPVLDPYEAARLAVEKADGTIFMERMIRVDLVSKDKRFAPDTAKEGDKASAIVTEDPKLSVFVGNLDFASKEEDLRVFFEGIVAGERGPPDVALKGEAEGDPQKPLTWVTRVRIVRDKDTQLGKGFAYVQFADRVCVDELLALDQDKLKFAKRKLRVQRCKTLPGSSHSIPINTGSTKEKAGSSVARPVVVVPKGNPQLGAALVGLSKEERKKVKSTDADRVARRLAKKKARNAMKPSTKPIKSGKERKRVRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.14
13 0.17
14 0.19
15 0.22
16 0.26
17 0.32
18 0.34
19 0.33
20 0.32
21 0.29
22 0.34
23 0.35
24 0.37
25 0.36
26 0.39
27 0.45
28 0.45
29 0.52
30 0.55
31 0.55
32 0.6
33 0.67
34 0.67
35 0.67
36 0.75
37 0.78
38 0.78
39 0.81
40 0.82
41 0.81
42 0.83
43 0.85
44 0.78
45 0.74
46 0.72
47 0.67
48 0.64
49 0.64
50 0.64
51 0.64
52 0.69
53 0.73
54 0.75
55 0.79
56 0.82
57 0.8
58 0.78
59 0.78
60 0.78
61 0.7
62 0.68
63 0.6
64 0.54
65 0.48
66 0.46
67 0.47
68 0.46
69 0.44
70 0.41
71 0.44
72 0.43
73 0.5
74 0.55
75 0.56
76 0.58
77 0.65
78 0.71
79 0.79
80 0.85
81 0.86
82 0.88
83 0.89
84 0.9
85 0.93
86 0.92
87 0.91
88 0.9
89 0.88
90 0.88
91 0.81
92 0.72
93 0.62
94 0.55
95 0.46
96 0.4
97 0.3
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.17
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.18
112 0.19
113 0.26
114 0.26
115 0.26
116 0.27
117 0.25
118 0.22
119 0.21
120 0.18
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.09
143 0.14
144 0.23
145 0.22
146 0.24
147 0.32
148 0.35
149 0.43
150 0.5
151 0.54
152 0.55
153 0.62
154 0.68
155 0.69
156 0.75
157 0.76
158 0.75
159 0.68
160 0.6
161 0.59
162 0.58
163 0.55
164 0.48
165 0.46
166 0.45
167 0.44
168 0.48
169 0.42
170 0.42
171 0.42
172 0.41
173 0.37
174 0.33
175 0.35
176 0.3
177 0.28
178 0.23
179 0.17
180 0.15
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.12
185 0.13
186 0.15
187 0.23
188 0.3
189 0.38
190 0.46
191 0.51
192 0.59
193 0.59
194 0.58
195 0.53
196 0.48
197 0.41
198 0.35
199 0.28
200 0.2
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.2
207 0.23
208 0.24
209 0.24
210 0.25
211 0.28
212 0.29
213 0.34
214 0.29
215 0.28
216 0.28
217 0.29
218 0.3
219 0.3
220 0.27
221 0.2
222 0.21
223 0.2
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.18
228 0.19
229 0.22
230 0.25
231 0.25
232 0.21
233 0.27
234 0.33
235 0.36
236 0.45
237 0.52
238 0.59
239 0.65
240 0.72
241 0.76
242 0.78
243 0.79
244 0.76
245 0.69
246 0.62
247 0.58
248 0.57
249 0.52
250 0.48
251 0.46
252 0.46
253 0.45
254 0.49
255 0.52
256 0.49
257 0.45
258 0.42
259 0.46
260 0.41
261 0.39
262 0.33
263 0.27
264 0.25
265 0.26
266 0.26
267 0.24
268 0.25
269 0.28
270 0.32
271 0.39
272 0.47
273 0.54
274 0.59
275 0.6
276 0.62
277 0.58
278 0.56
279 0.55
280 0.51
281 0.49
282 0.49
283 0.48
284 0.44
285 0.46
286 0.42
287 0.34
288 0.3
289 0.22
290 0.14
291 0.11
292 0.1
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.16
306 0.2
307 0.21
308 0.22
309 0.25
310 0.26
311 0.28
312 0.28
313 0.25
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.18
318 0.19
319 0.18
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.15
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.11
346 0.13
347 0.2
348 0.25
349 0.25
350 0.26
351 0.28
352 0.31
353 0.31
354 0.31
355 0.3
356 0.31
357 0.33
358 0.35
359 0.34
360 0.32
361 0.3
362 0.28
363 0.21
364 0.16
365 0.13
366 0.1
367 0.1
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.12
386 0.1
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.15
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.11
413 0.1
414 0.12
415 0.14
416 0.14
417 0.15
418 0.15
419 0.14
420 0.14
421 0.16
422 0.16
423 0.2
424 0.24
425 0.26
426 0.34
427 0.36
428 0.4
429 0.46
430 0.47
431 0.47
432 0.49
433 0.5
434 0.48
435 0.5
436 0.49
437 0.43
438 0.41
439 0.34
440 0.29
441 0.27
442 0.22
443 0.21
444 0.18
445 0.17
446 0.19
447 0.2
448 0.19
449 0.17
450 0.18
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.1
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.15
464 0.21
465 0.27
466 0.33
467 0.43
468 0.48
469 0.59
470 0.67
471 0.77
472 0.82
473 0.83
474 0.88
475 0.84
476 0.85
477 0.79
478 0.75
479 0.68
480 0.63
481 0.62
482 0.53
483 0.51
484 0.43
485 0.4
486 0.33
487 0.31
488 0.29
489 0.22
490 0.23
491 0.21
492 0.22
493 0.23
494 0.24
495 0.22
496 0.2
497 0.24
498 0.26
499 0.25
500 0.32
501 0.32
502 0.3
503 0.29
504 0.3
505 0.32
506 0.3
507 0.3
508 0.23
509 0.31
510 0.35
511 0.36
512 0.34
513 0.27
514 0.27
515 0.24
516 0.24
517 0.14
518 0.11
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.15
524 0.18
525 0.26
526 0.32
527 0.36
528 0.44
529 0.5
530 0.59
531 0.63
532 0.66
533 0.69
534 0.72
535 0.76
536 0.72
537 0.7
538 0.67
539 0.63
540 0.64
541 0.62
542 0.63
543 0.66
544 0.71
545 0.77
546 0.8
547 0.84
548 0.86
549 0.86
550 0.87
551 0.87
552 0.84
553 0.84
554 0.84
555 0.76
556 0.73
557 0.73
558 0.73
559 0.73
560 0.77
561 0.78
562 0.78