Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YNW0

Protein Details
Accession A0A409YNW0    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-47NKSRAAPPAKGRRIFRRRGRARDELDSDBasic
155-183ERLPTAPKSKKAKQKAKRAAKRQAHSDPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-40KSRAAPPAKGRRIFRRRGRA
160-177APKSKKAKQKAKRAAKRQ
277-288GRGRGRGGFRGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MPTTAVKQSSSNSTNKSTNNKSRAAPPAKGRRIFRRRGRARDELDSDDELEREAATDSDSDNTDLSLTDSATDDSDTEPASDDVIPHDRTHLPTPRNSQSPDSIAKESTRQMNGDSSTFFAASTNWSDNVEREEAEGANEVPVIDFADFDAKTVERLPTAPKSKKAKQKAKRAAKRQAHSDPATAGSQQPSVPSKKRESPPKDDSAPLDNSKLSASSAAQESSPSTYVSPARQAYQQRLETDPSYVPKIGNFWGHDDRLIDADLRSLSFWWNSQRGGRGRGRGGFRGRGGHHHGDNIHKSAEEQDRDQQADQVPPIERTWTHDGFEELKRKEEQRRSQAAARQESASKRGALTGARGGFGARGRGGFTRGGLLSPGGRNSLPQNRIRFIMKPEVMWTKQSETFLFLDPAMKPRHGQGPGFRVRIPGNDGEVVRAPLGSSKLEVSPAKASQPTTSNFTVRLPRAQPNADVKAASEAPVEVPEQEPHDEHPIGLEERPTSITPHQAPTPLEPTVQPSSSALPLPSIRTQLEQITLEPAAPSPERQALTEQAVLRKPSVDLGTTQTPAMEQAAATERPTLPPLQTTFTPPPPPQPQVVQPAPGYGPPYGYPPQLPPGIGLNPHGMPYELTTGRPVYLPHPPPMYNPRPMMHSHNPSMTFVPGHMHHPSSGTPDFLAQPPHTPPVNGFIDPVTGNPMFSFPRPNARIEIRPPGEESSKSTTSKSSAAPRTSTNLRTVAPPFQPSAYNNDPTRQAGGYYTPSDASLPAYDNSNGHMPIDDATQGMPNGMMSYPPYQQPYYYPEPYGYSQQYMDMSQHGHYDMYNMDQVPQGTVYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.59
4 0.61
5 0.66
6 0.67
7 0.67
8 0.65
9 0.66
10 0.71
11 0.68
12 0.65
13 0.65
14 0.69
15 0.74
16 0.77
17 0.76
18 0.77
19 0.8
20 0.83
21 0.83
22 0.84
23 0.84
24 0.87
25 0.88
26 0.87
27 0.83
28 0.82
29 0.77
30 0.71
31 0.66
32 0.57
33 0.51
34 0.42
35 0.36
36 0.27
37 0.22
38 0.16
39 0.12
40 0.11
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.14
71 0.2
72 0.21
73 0.19
74 0.23
75 0.25
76 0.29
77 0.36
78 0.41
79 0.39
80 0.45
81 0.53
82 0.56
83 0.6
84 0.59
85 0.56
86 0.52
87 0.54
88 0.53
89 0.5
90 0.45
91 0.41
92 0.39
93 0.39
94 0.38
95 0.39
96 0.35
97 0.31
98 0.31
99 0.34
100 0.34
101 0.32
102 0.28
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.18
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.18
114 0.19
115 0.2
116 0.24
117 0.23
118 0.18
119 0.17
120 0.18
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.16
142 0.12
143 0.14
144 0.19
145 0.26
146 0.35
147 0.4
148 0.47
149 0.55
150 0.62
151 0.71
152 0.77
153 0.79
154 0.79
155 0.85
156 0.87
157 0.89
158 0.91
159 0.91
160 0.91
161 0.89
162 0.86
163 0.84
164 0.81
165 0.78
166 0.7
167 0.62
168 0.52
169 0.46
170 0.4
171 0.32
172 0.26
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.18
177 0.2
178 0.26
179 0.31
180 0.36
181 0.41
182 0.48
183 0.56
184 0.64
185 0.67
186 0.7
187 0.71
188 0.73
189 0.69
190 0.63
191 0.58
192 0.53
193 0.5
194 0.43
195 0.37
196 0.29
197 0.26
198 0.24
199 0.21
200 0.16
201 0.12
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.13
214 0.16
215 0.17
216 0.22
217 0.21
218 0.22
219 0.27
220 0.31
221 0.35
222 0.41
223 0.43
224 0.39
225 0.41
226 0.42
227 0.37
228 0.36
229 0.31
230 0.25
231 0.25
232 0.23
233 0.21
234 0.18
235 0.2
236 0.19
237 0.21
238 0.2
239 0.23
240 0.26
241 0.26
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.2
246 0.19
247 0.14
248 0.09
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.12
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.21
261 0.27
262 0.29
263 0.36
264 0.39
265 0.39
266 0.4
267 0.44
268 0.46
269 0.45
270 0.46
271 0.43
272 0.41
273 0.41
274 0.39
275 0.39
276 0.42
277 0.41
278 0.37
279 0.36
280 0.36
281 0.36
282 0.38
283 0.33
284 0.27
285 0.22
286 0.21
287 0.25
288 0.29
289 0.25
290 0.24
291 0.28
292 0.31
293 0.32
294 0.32
295 0.29
296 0.24
297 0.24
298 0.23
299 0.2
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.16
304 0.15
305 0.18
306 0.25
307 0.23
308 0.22
309 0.22
310 0.23
311 0.25
312 0.31
313 0.33
314 0.27
315 0.28
316 0.3
317 0.33
318 0.41
319 0.46
320 0.5
321 0.52
322 0.58
323 0.59
324 0.62
325 0.62
326 0.61
327 0.55
328 0.48
329 0.4
330 0.37
331 0.34
332 0.32
333 0.29
334 0.22
335 0.18
336 0.17
337 0.17
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.13
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.12
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.14
367 0.21
368 0.24
369 0.29
370 0.32
371 0.32
372 0.34
373 0.35
374 0.33
375 0.29
376 0.33
377 0.28
378 0.25
379 0.27
380 0.3
381 0.29
382 0.28
383 0.26
384 0.21
385 0.23
386 0.23
387 0.2
388 0.18
389 0.19
390 0.18
391 0.17
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.14
399 0.15
400 0.21
401 0.21
402 0.22
403 0.23
404 0.3
405 0.35
406 0.37
407 0.35
408 0.31
409 0.29
410 0.29
411 0.28
412 0.2
413 0.16
414 0.17
415 0.16
416 0.15
417 0.15
418 0.14
419 0.11
420 0.1
421 0.08
422 0.07
423 0.09
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.14
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.16
437 0.19
438 0.19
439 0.21
440 0.22
441 0.21
442 0.2
443 0.22
444 0.26
445 0.23
446 0.27
447 0.25
448 0.29
449 0.32
450 0.32
451 0.34
452 0.34
453 0.36
454 0.32
455 0.28
456 0.24
457 0.23
458 0.22
459 0.18
460 0.12
461 0.09
462 0.08
463 0.09
464 0.09
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.09
481 0.1
482 0.12
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.18
487 0.19
488 0.21
489 0.22
490 0.23
491 0.24
492 0.24
493 0.26
494 0.21
495 0.2
496 0.18
497 0.22
498 0.21
499 0.2
500 0.18
501 0.15
502 0.16
503 0.17
504 0.17
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.15
509 0.16
510 0.17
511 0.16
512 0.17
513 0.18
514 0.18
515 0.2
516 0.17
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.13
521 0.12
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.15
528 0.16
529 0.16
530 0.19
531 0.19
532 0.21
533 0.25
534 0.24
535 0.24
536 0.26
537 0.26
538 0.24
539 0.22
540 0.19
541 0.18
542 0.17
543 0.14
544 0.13
545 0.17
546 0.2
547 0.2
548 0.19
549 0.16
550 0.15
551 0.15
552 0.14
553 0.09
554 0.06
555 0.07
556 0.11
557 0.12
558 0.12
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.17
563 0.16
564 0.13
565 0.16
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.25
570 0.28
571 0.32
572 0.37
573 0.33
574 0.4
575 0.42
576 0.44
577 0.4
578 0.39
579 0.39
580 0.42
581 0.43
582 0.39
583 0.33
584 0.32
585 0.3
586 0.28
587 0.24
588 0.16
589 0.16
590 0.13
591 0.18
592 0.18
593 0.18
594 0.19
595 0.19
596 0.23
597 0.23
598 0.22
599 0.18
600 0.2
601 0.21
602 0.2
603 0.2
604 0.19
605 0.18
606 0.18
607 0.17
608 0.14
609 0.12
610 0.13
611 0.18
612 0.15
613 0.16
614 0.17
615 0.17
616 0.17
617 0.18
618 0.17
619 0.14
620 0.23
621 0.26
622 0.28
623 0.32
624 0.32
625 0.37
626 0.45
627 0.48
628 0.45
629 0.45
630 0.42
631 0.41
632 0.44
633 0.47
634 0.47
635 0.48
636 0.45
637 0.47
638 0.47
639 0.45
640 0.44
641 0.36
642 0.27
643 0.2
644 0.21
645 0.17
646 0.19
647 0.2
648 0.2
649 0.19
650 0.21
651 0.21
652 0.24
653 0.23
654 0.2
655 0.18
656 0.18
657 0.2
658 0.2
659 0.24
660 0.18
661 0.21
662 0.23
663 0.28
664 0.27
665 0.25
666 0.24
667 0.26
668 0.29
669 0.26
670 0.23
671 0.19
672 0.21
673 0.2
674 0.2
675 0.18
676 0.14
677 0.14
678 0.13
679 0.16
680 0.15
681 0.16
682 0.22
683 0.18
684 0.29
685 0.31
686 0.33
687 0.37
688 0.4
689 0.46
690 0.46
691 0.55
692 0.47
693 0.47
694 0.47
695 0.45
696 0.43
697 0.38
698 0.38
699 0.35
700 0.37
701 0.36
702 0.35
703 0.34
704 0.33
705 0.35
706 0.35
707 0.37
708 0.41
709 0.43
710 0.45
711 0.45
712 0.48
713 0.51
714 0.48
715 0.43
716 0.39
717 0.35
718 0.38
719 0.39
720 0.39
721 0.37
722 0.36
723 0.34
724 0.32
725 0.35
726 0.31
727 0.36
728 0.35
729 0.38
730 0.37
731 0.39
732 0.4
733 0.39
734 0.4
735 0.32
736 0.27
737 0.22
738 0.24
739 0.26
740 0.25
741 0.24
742 0.21
743 0.21
744 0.21
745 0.19
746 0.18
747 0.15
748 0.15
749 0.15
750 0.18
751 0.18
752 0.18
753 0.21
754 0.22
755 0.21
756 0.18
757 0.18
758 0.15
759 0.15
760 0.17
761 0.14
762 0.1
763 0.11
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.09
769 0.1
770 0.09
771 0.1
772 0.1
773 0.14
774 0.17
775 0.21
776 0.25
777 0.25
778 0.26
779 0.29
780 0.34
781 0.38
782 0.39
783 0.37
784 0.35
785 0.38
786 0.4
787 0.44
788 0.4
789 0.34
790 0.31
791 0.33
792 0.32
793 0.29
794 0.28
795 0.22
796 0.21
797 0.19
798 0.21
799 0.19
800 0.17
801 0.16
802 0.17
803 0.15
804 0.17
805 0.2
806 0.18
807 0.18
808 0.21
809 0.21
810 0.21