FuNGI

A0A409W222

Protein Details

Accession

A0A409W222

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
265-414	SDDESEKRSKKRKKRVDDSSDDENASKSSKKKRKRRSHSTDDSDSSDDESSRKKSKRKRSKRKDGSDDESDSDRESKKSRKKKKRRQESSDSDSSSEDEGSRRKKYKKKKKKRAASDTEESSSSDSESEPQRERKRKKSVKHRSESPADA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
271-279	KRSKKRKKR
290-301	SKSSKKKRKRRS
316-329	RKKSKRKRSKRKDG
338-350	RESKKSRKKKKRR
365-378	SRRKKYKKKKKKRA
396-407	RERKRKKSVKHR

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSKRPPNEKESRLHQAAIASANKELTAKQAEAIVPDPTTRQNALNFLLSVGLFKPLANSSGQVSFRAISKEEVLATKDLSGEENLVLSHIKFSGNEGIWTKHLKTKTNLHQTIIDRCLKTLTQKRLIKRVQSVQHITRKIYMLEGLEPSISLTGGPWYTDNELDTEFIQNLMEACYRLISDITFPKVRGGSDNLLYPISNAPKYPTADQIRTSLRKARLTETELSVEHVEMLLNVLVLDGKIEKLPAFGNALWNTDAIPDGDKGSDDESEKRSKKRKKRVDDSSDDENASKSSKKKRKRRSHSTDDSDSSDDESSRKKSKRKRSKRKDGSDDESDSDRESKKSRKKKKRRQESSDSDSSSEDEGSRRKKYKKKKKKRAASDTEESSSSDSESEPQRERKRKKSVKHRSESPADALDLYDTSGGGSVYRALREYTAPLGLTEAPCGLCPSFEFCKDGGPVNPRECTYYGDWLVGGTLVNNEELLGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.47
3	0.43
4	0.41
5	0.36
6	0.27
7	0.25
8	0.24
9	0.23
10	0.22
11	0.19
12	0.18
13	0.2
14	0.19
15	0.19
16	0.23
17	0.23
18	0.25
19	0.26
20	0.22
21	0.18
22	0.19
23	0.2
24	0.19
25	0.23
26	0.22
27	0.24
28	0.25
29	0.28
30	0.3
31	0.32
32	0.28
33	0.24
34	0.24
35	0.2
36	0.18
37	0.14
38	0.14
39	0.11
40	0.1
41	0.13
42	0.13
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.22
48	0.23
49	0.21
50	0.22
51	0.21
52	0.23
53	0.25
54	0.23
55	0.18
56	0.2
57	0.2
58	0.21
59	0.22
60	0.22
61	0.2
62	0.19
63	0.18
64	0.17
65	0.15
66	0.15
67	0.13
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.1
72	0.09
73	0.1
74	0.08
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.09
79	0.12
80	0.19
81	0.19
82	0.22
83	0.23
84	0.25
85	0.27
86	0.3
87	0.3
88	0.28
89	0.31
90	0.34
91	0.37
92	0.45
93	0.53
94	0.6
95	0.6
96	0.57
97	0.6
98	0.58
99	0.6
100	0.56
101	0.52
102	0.41
103	0.38
104	0.39
105	0.33
106	0.38
107	0.39
108	0.42
109	0.46
110	0.52
111	0.56
112	0.64
113	0.68
114	0.66
115	0.65
116	0.65
117	0.62
118	0.64
119	0.66
120	0.64
121	0.67
122	0.63
123	0.57
124	0.52
125	0.47
126	0.39
127	0.32
128	0.26
129	0.19
130	0.19
131	0.18
132	0.15
133	0.13
134	0.12
135	0.11
136	0.09
137	0.08
138	0.05
139	0.04
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.07
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.09
168	0.11
169	0.16
170	0.17
171	0.17
172	0.19
173	0.2
174	0.2
175	0.19
176	0.21
177	0.19
178	0.19
179	0.21
180	0.19
181	0.18
182	0.18
183	0.16
184	0.15
185	0.15
186	0.14
187	0.12
188	0.14
189	0.18
190	0.2
191	0.21
192	0.26
193	0.28
194	0.3
195	0.31
196	0.33
197	0.35
198	0.36
199	0.36
200	0.35
201	0.35
202	0.38
203	0.39
204	0.38
205	0.36
206	0.38
207	0.38
208	0.33
209	0.31
210	0.26
211	0.25
212	0.22
213	0.17
214	0.12
215	0.1
216	0.08
217	0.05
218	0.06
219	0.04
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.09
235	0.09
236	0.13
237	0.14
238	0.15
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.11
243	0.11
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.12
255	0.15
256	0.23
257	0.27
258	0.33
259	0.42
260	0.5
261	0.59
262	0.67
263	0.74
264	0.77
265	0.84
266	0.88
267	0.88
268	0.86
269	0.81
270	0.76
271	0.68
272	0.58
273	0.48
274	0.37
275	0.28
276	0.22
277	0.2
278	0.19
279	0.28
280	0.36
281	0.46
282	0.56
283	0.67
284	0.77
285	0.84
286	0.9
287	0.89
288	0.91
289	0.91
290	0.89
291	0.84
292	0.75
293	0.68
294	0.57
295	0.47
296	0.38
297	0.29
298	0.21
299	0.16
300	0.17
301	0.19
302	0.26
303	0.32
304	0.38
305	0.47
306	0.58
307	0.68
308	0.76
309	0.83
310	0.86
311	0.92
312	0.95
313	0.96
314	0.95
315	0.92
316	0.87
317	0.83
318	0.74
319	0.65
320	0.56
321	0.46
322	0.36
323	0.32
324	0.26
325	0.22
326	0.24
327	0.31
328	0.39
329	0.5
330	0.6
331	0.68
332	0.78
333	0.86
334	0.92
335	0.94
336	0.95
337	0.94
338	0.94
339	0.92
340	0.89
341	0.86
342	0.76
343	0.66
344	0.55
345	0.47
346	0.37
347	0.28
348	0.2
349	0.15
350	0.2
351	0.25
352	0.32
353	0.38
354	0.47
355	0.55
356	0.66
357	0.74
358	0.8
359	0.85
360	0.89
361	0.92
362	0.94
363	0.96
364	0.96
365	0.95
366	0.92
367	0.89
368	0.83
369	0.74
370	0.64
371	0.53
372	0.43
373	0.33
374	0.25
375	0.17
376	0.12
377	0.14
378	0.18
379	0.23
380	0.27
381	0.37
382	0.46
383	0.56
384	0.65
385	0.71
386	0.77
387	0.81
388	0.86
389	0.88
390	0.89
391	0.9
392	0.91
393	0.9
394	0.87
395	0.85
396	0.79
397	0.72
398	0.63
399	0.52
400	0.43
401	0.34
402	0.26
403	0.19
404	0.15
405	0.1
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.14
417	0.16
418	0.17
419	0.2
420	0.19
421	0.19
422	0.18
423	0.17
424	0.19
425	0.21
426	0.19
427	0.18
428	0.16
429	0.14
430	0.14
431	0.17
432	0.14
433	0.12
434	0.13
435	0.18
436	0.21
437	0.23
438	0.26
439	0.23
440	0.29
441	0.3
442	0.33
443	0.32
444	0.35
445	0.4
446	0.42
447	0.45
448	0.41
449	0.44
450	0.41
451	0.4
452	0.37
453	0.38
454	0.35
455	0.32
456	0.31
457	0.26
458	0.25
459	0.2
460	0.16
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09

A0A409W222

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer