Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VAR3

Protein Details
Accession A0A409VAR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-434YGGSMRRKSTRRGNPRTSRIQSTYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00564  PB1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51745  PB1  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLKAELETWAAALKAYDEEDFETALELFSRIADTSKILTNMGLIYATLGEHQAAIERFIEATQLDQFLAVAYFQCGVSRFLIEQFEGALNDFEQALLYLRGNQAINYEQLGLKFRLFSAEVHFNIGLCKIYLGDVAAGLQDMEEARGDKATEEHNVIDDAIKDRGDGYTVFSIPVGILYRPSEKKLKNSTQRDYMGKAKLVATSDASDAITTFSGVSRLKQGMTPAGLKLDRPDLLDTAPTSNLLRSATVPPVMPTYQGSEGPRSAGVERSKTIAGNPGMSSLRDGPKPLSPQSAQGPGIKRSNTQITPGRPSPANAGITAPVRGLSVRRPGNSPASPNPPPPPGKEERMTEFYDDYIDSYAGAEQSPPPLPSGGSGSSDRVGSWARNTANVQRNGSRSAPSSNYAPSSYGGSMRRKSTRRGNPRTSRIQSTYEEEEEGYGSGEYDDGPLELSLIRVKLHYEDDIRGMTLPPDISFNEFMDKVTAKFNKSMKLKFTDEDGGKVTLRDDSDFELAIETARENSKGRSEGKLEVWCTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.14
7 0.14
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.12
22 0.14
23 0.18
24 0.19
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.17
29 0.16
30 0.13
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.1
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.08
61 0.07
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.16
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.11
87 0.12
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.15
95 0.16
96 0.14
97 0.15
98 0.19
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.19
107 0.25
108 0.25
109 0.28
110 0.28
111 0.24
112 0.24
113 0.24
114 0.18
115 0.1
116 0.1
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.12
163 0.1
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.16
168 0.18
169 0.22
170 0.28
171 0.29
172 0.38
173 0.47
174 0.55
175 0.59
176 0.66
177 0.68
178 0.68
179 0.7
180 0.64
181 0.58
182 0.55
183 0.48
184 0.41
185 0.37
186 0.3
187 0.27
188 0.25
189 0.22
190 0.17
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.14
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.12
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.17
261 0.16
262 0.18
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.16
269 0.17
270 0.14
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.15
275 0.19
276 0.22
277 0.22
278 0.24
279 0.22
280 0.24
281 0.27
282 0.3
283 0.27
284 0.28
285 0.29
286 0.28
287 0.32
288 0.29
289 0.27
290 0.25
291 0.3
292 0.27
293 0.29
294 0.32
295 0.31
296 0.37
297 0.37
298 0.37
299 0.31
300 0.31
301 0.3
302 0.29
303 0.26
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.19
308 0.18
309 0.14
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.18
316 0.21
317 0.23
318 0.25
319 0.28
320 0.35
321 0.36
322 0.37
323 0.34
324 0.38
325 0.39
326 0.4
327 0.41
328 0.4
329 0.4
330 0.37
331 0.4
332 0.37
333 0.4
334 0.41
335 0.42
336 0.41
337 0.43
338 0.41
339 0.36
340 0.31
341 0.26
342 0.22
343 0.19
344 0.14
345 0.11
346 0.09
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.15
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.16
369 0.14
370 0.14
371 0.12
372 0.14
373 0.18
374 0.18
375 0.21
376 0.24
377 0.31
378 0.38
379 0.42
380 0.43
381 0.42
382 0.44
383 0.44
384 0.44
385 0.37
386 0.31
387 0.31
388 0.29
389 0.27
390 0.27
391 0.25
392 0.26
393 0.25
394 0.24
395 0.2
396 0.2
397 0.19
398 0.22
399 0.25
400 0.3
401 0.33
402 0.38
403 0.46
404 0.46
405 0.53
406 0.58
407 0.63
408 0.68
409 0.74
410 0.79
411 0.8
412 0.85
413 0.88
414 0.83
415 0.8
416 0.73
417 0.68
418 0.6
419 0.56
420 0.53
421 0.44
422 0.39
423 0.31
424 0.27
425 0.23
426 0.2
427 0.14
428 0.09
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.13
447 0.16
448 0.2
449 0.21
450 0.22
451 0.25
452 0.25
453 0.25
454 0.23
455 0.2
456 0.17
457 0.16
458 0.14
459 0.12
460 0.14
461 0.14
462 0.17
463 0.19
464 0.19
465 0.21
466 0.21
467 0.21
468 0.22
469 0.22
470 0.19
471 0.26
472 0.29
473 0.28
474 0.35
475 0.38
476 0.43
477 0.49
478 0.54
479 0.52
480 0.55
481 0.56
482 0.5
483 0.52
484 0.52
485 0.46
486 0.44
487 0.4
488 0.35
489 0.32
490 0.31
491 0.26
492 0.21
493 0.21
494 0.2
495 0.19
496 0.2
497 0.21
498 0.21
499 0.21
500 0.18
501 0.16
502 0.15
503 0.14
504 0.11
505 0.12
506 0.14
507 0.16
508 0.17
509 0.2
510 0.27
511 0.32
512 0.34
513 0.38
514 0.4
515 0.44
516 0.49
517 0.53