FuNGI

A0A409WRH3

Protein Details

Accession

A0A409WRH3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1210-1230	NITSSKPSKKLDWKRLGPFEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 3.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MEDAIDDDDPNLLKYPPSPNNEILVEACSVPSLSTTSDSSTSPSVSTPAYSSVTPVAGDNSLPNSCMNSASSLFLRKLRTSKNKIELLQSWIKRCRWAEIDNKLVHFLDTADDNSAMTTLKQLQNDPFFLRSLSSKSLEVDTTIKTDNHSLIVKALIDSGATSCYISHDLVNKFNLSTSAVARPIAVYNADGSLNAAGAISSYCQLNISINDQSESLRCYVTNTGSSSVILGFSWLRHHNPLIDWKKGSLCFRNLATTVDDVPLAFLKPNAPPYVKPSKILSDSVPLANHDPDNLDDDTLNQDPLEEWHRAITDELTDEDESILVLDPQGFYEEVNNISVVEFIDDNVYSHRDGFSQVEDKTTIRLPDMRPSTSTLDVFTDYPDRYFSDYAKVFEKKNFDKLPPRRVWDHAIELKPDAKPVSAKIYPLARNQQEELDAFIKEHLETGRIRTSKSQFASPFFFVKKKDGSLRPVQDYRHLNEITIKNRYPLPLISELMDKLKGARFFTKLDIRWGYNNVRIKHGDEHKAAFITNRGLFEPLVMFFGLTNSPATFQTMMNELFKDLIDKGVVIVYMDDILIFTKDLASHRQIVNQVLQILQDNDLSLKPEKCLFEQSEVEYLGVIVSHNCIRMDPKKVEAIRDWPAPRNKKDVQQFLGFVNFYRRFIDRFSTMAKPLNNLCKNVPFLWSTDCQLAFENLKSGACAMRSLAIPVDDAPFRLEADSSGFATGATLSQFQNGEWKPISFLSKSLSETERNYKIHDRELLSIMRALSEWRHYLLGCSSPFEIWSDHLNLQYFMRNQKLNRRQARWSLELADFNFSLVHKAGSTMICADALSRRPDYDKGESDNDNITLLPSHLINKVTFDLDVPIIREIASFSNLSLEMFESHRNSPGWSFSDNLALWYNRIFVPNANDLRESIIRSNHDSPFSGHPGRAKTVELIQRDYWWPTLTKDVNRYVSGCLACQKAKPHRSKPVGLLSPNAVPTENWQIISVDMIVDLPRSRNYDSILVVVDRLSKMTRCIPTNKTLSSEGLARLYRDRIWKDFGFPARVISDRGSIFVSRFTKALNSLLNIDENTSTAFRPQTDGQTERMNQEIEQYLRFFVNDHQSDWSEWLACAEFSLNNRINKSTGYSPFFLNYGRHPLRPLTPLRSNSSNVQSASDFAQKMADLSEESKSALQLANSSMKRHFDSRHIPAPDYQKGDLVFIDASNITSSKPSKKLDWKRLGPFEILERIGSSAFKIDIPDDLQIHNVFNVAKLSPFITPMFASQRSSHRSSSSTSTNNKSSSNPMLQSLPIAQEILNHRSFRNNNTLFLVRLQNESSEDSCWLPFNKFSDPLHLIPKGGVM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.26
3	0.32
4	0.38
5	0.43
6	0.44
7	0.48
8	0.48
9	0.46
10	0.37
11	0.31
12	0.26
13	0.21
14	0.18
15	0.13
16	0.12
17	0.1
18	0.1
19	0.09
20	0.1
21	0.12
22	0.14
23	0.17
24	0.18
25	0.19
26	0.21
27	0.22
28	0.21
29	0.19
30	0.18
31	0.17
32	0.16
33	0.17
34	0.16
35	0.18
36	0.19
37	0.18
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.19
42	0.17
43	0.16
44	0.14
45	0.15
46	0.15
47	0.17
48	0.17
49	0.17
50	0.17
51	0.17
52	0.17
53	0.18
54	0.17
55	0.17
56	0.18
57	0.2
58	0.22
59	0.24
60	0.26
61	0.29
62	0.33
63	0.34
64	0.41
65	0.49
66	0.57
67	0.61
68	0.69
69	0.73
70	0.76
71	0.73
72	0.73
73	0.66
74	0.63
75	0.64
76	0.59
77	0.58
78	0.58
79	0.57
80	0.57
81	0.55
82	0.55
83	0.51
84	0.54
85	0.55
86	0.56
87	0.64
88	0.6
89	0.59
90	0.54
91	0.49
92	0.41
93	0.32
94	0.24
95	0.16
96	0.15
97	0.15
98	0.14
99	0.14
100	0.13
101	0.13
102	0.13
103	0.11
104	0.09
105	0.12
106	0.17
107	0.21
108	0.23
109	0.27
110	0.33
111	0.38
112	0.42
113	0.41
114	0.36
115	0.32
116	0.3
117	0.29
118	0.24
119	0.24
120	0.26
121	0.25
122	0.25
123	0.26
124	0.28
125	0.27
126	0.26
127	0.24
128	0.21
129	0.22
130	0.23
131	0.22
132	0.21
133	0.23
134	0.22
135	0.24
136	0.23
137	0.21
138	0.19
139	0.21
140	0.19
141	0.16
142	0.16
143	0.12
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.1
152	0.12
153	0.12
154	0.14
155	0.21
156	0.23
157	0.27
158	0.3
159	0.29
160	0.26
161	0.26
162	0.25
163	0.2
164	0.19
165	0.18
166	0.2
167	0.2
168	0.2
169	0.2
170	0.2
171	0.19
172	0.18
173	0.16
174	0.11
175	0.11
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.11
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.08
193	0.1
194	0.12
195	0.15
196	0.18
197	0.18
198	0.19
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.19
203	0.16
204	0.13
205	0.13
206	0.15
207	0.19
208	0.21
209	0.23
210	0.23
211	0.24
212	0.24
213	0.24
214	0.22
215	0.18
216	0.15
217	0.11
218	0.1
219	0.08
220	0.08
221	0.14
222	0.16
223	0.19
224	0.21
225	0.23
226	0.24
227	0.27
228	0.37
229	0.38
230	0.41
231	0.39
232	0.38
233	0.42
234	0.44
235	0.47
236	0.43
237	0.41
238	0.4
239	0.4
240	0.43
241	0.38
242	0.36
243	0.31
244	0.26
245	0.24
246	0.2
247	0.18
248	0.13
249	0.14
250	0.13
251	0.11
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.13
256	0.18
257	0.21
258	0.22
259	0.23
260	0.3
261	0.4
262	0.39
263	0.39
264	0.39
265	0.41
266	0.42
267	0.43
268	0.38
269	0.33
270	0.34
271	0.33
272	0.31
273	0.25
274	0.24
275	0.24
276	0.22
277	0.17
278	0.16
279	0.14
280	0.18
281	0.17
282	0.15
283	0.12
284	0.13
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.13
292	0.16
293	0.12
294	0.12
295	0.14
296	0.14
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.12
301	0.12
302	0.12
303	0.14
304	0.13
305	0.13
306	0.12
307	0.11
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.1
321	0.1
322	0.11
323	0.1
324	0.09
325	0.09
326	0.1
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.08
332	0.07
333	0.08
334	0.09
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.11
339	0.1
340	0.12
341	0.13
342	0.15
343	0.19
344	0.19
345	0.2
346	0.21
347	0.21
348	0.21
349	0.22
350	0.19
351	0.16
352	0.21
353	0.21
354	0.28
355	0.32
356	0.31
357	0.3
358	0.34
359	0.36
360	0.33
361	0.32
362	0.24
363	0.22
364	0.21
365	0.2
366	0.18
367	0.18
368	0.15
369	0.15
370	0.15
371	0.15
372	0.17
373	0.18
374	0.17
375	0.21
376	0.23
377	0.24
378	0.29
379	0.3
380	0.29
381	0.32
382	0.39
383	0.35
384	0.42
385	0.44
386	0.44
387	0.52
388	0.58
389	0.65
390	0.62
391	0.64
392	0.59
393	0.58
394	0.58
395	0.52
396	0.52
397	0.49
398	0.45
399	0.41
400	0.39
401	0.38
402	0.33
403	0.3
404	0.23
405	0.16
406	0.15
407	0.16
408	0.22
409	0.2
410	0.21
411	0.22
412	0.29
413	0.32
414	0.36
415	0.42
416	0.37
417	0.38
418	0.39
419	0.37
420	0.32
421	0.28
422	0.26
423	0.19
424	0.17
425	0.14
426	0.13
427	0.13
428	0.11
429	0.12
430	0.09
431	0.1
432	0.1
433	0.14
434	0.21
435	0.21
436	0.22
437	0.27
438	0.31
439	0.36
440	0.37
441	0.4
442	0.35
443	0.38
444	0.42
445	0.37
446	0.37
447	0.33
448	0.34
449	0.29
450	0.31
451	0.3
452	0.29
453	0.35
454	0.36
455	0.4
456	0.46
457	0.5
458	0.51
459	0.52
460	0.49
461	0.49
462	0.48
463	0.44
464	0.42
465	0.37
466	0.31
467	0.35
468	0.39
469	0.36
470	0.37
471	0.35
472	0.29
473	0.31
474	0.31
475	0.26
476	0.22
477	0.22
478	0.2
479	0.21
480	0.2
481	0.2
482	0.2
483	0.19
484	0.18
485	0.13
486	0.11
487	0.14
488	0.15
489	0.16
490	0.19
491	0.2
492	0.22
493	0.27
494	0.32
495	0.3
496	0.34
497	0.34
498	0.32
499	0.32
500	0.35
501	0.33
502	0.33
503	0.38
504	0.33
505	0.34
506	0.34
507	0.35
508	0.37
509	0.41
510	0.41
511	0.36
512	0.37
513	0.34
514	0.33
515	0.3
516	0.23
517	0.19
518	0.17
519	0.16
520	0.15
521	0.14
522	0.15
523	0.15
524	0.14
525	0.13
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.07
532	0.07
533	0.06
534	0.07
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.1
542	0.12
543	0.13
544	0.13
545	0.13
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.11
550	0.08
551	0.08
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.03
564	0.03
565	0.04
566	0.04
567	0.03
568	0.04
569	0.05
570	0.07
571	0.1
572	0.12
573	0.16
574	0.17
575	0.2
576	0.21
577	0.22
578	0.23
579	0.21
580	0.19
581	0.15
582	0.15
583	0.12
584	0.11
585	0.1
586	0.08
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.09
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.15
595	0.16
596	0.16
597	0.21
598	0.2
599	0.22
600	0.23
601	0.24
602	0.23
603	0.22
604	0.2
605	0.15
606	0.13
607	0.09
608	0.07
609	0.06
610	0.03
611	0.04
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.11
617	0.15
618	0.21
619	0.21
620	0.22
621	0.28
622	0.29
623	0.31
624	0.29
625	0.3
626	0.28
627	0.33
628	0.32
629	0.32
630	0.39
631	0.44
632	0.44
633	0.47
634	0.46
635	0.47
636	0.52
637	0.53
638	0.48
639	0.44
640	0.43
641	0.36
642	0.35
643	0.28
644	0.21
645	0.22
646	0.19
647	0.17
648	0.18
649	0.18
650	0.17
651	0.19
652	0.21
653	0.15
654	0.16
655	0.19
656	0.19
657	0.2
658	0.23
659	0.22
660	0.2
661	0.22
662	0.3
663	0.29
664	0.28
665	0.28
666	0.27
667	0.29
668	0.28
669	0.27
670	0.18
671	0.17
672	0.18
673	0.18
674	0.16
675	0.16
676	0.15
677	0.14
678	0.14
679	0.14
680	0.12
681	0.11
682	0.11
683	0.09
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.06
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.07
696	0.07
697	0.08
698	0.09
699	0.07
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.07
705	0.07
706	0.05
707	0.08
708	0.09
709	0.08
710	0.08
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.07
715	0.05
716	0.05
717	0.06
718	0.06
719	0.07
720	0.08
721	0.08
722	0.15
723	0.15
724	0.18
725	0.17
726	0.17
727	0.17
728	0.18
729	0.21
730	0.13
731	0.14
732	0.14
733	0.16
734	0.17
735	0.19
736	0.19
737	0.19
738	0.22
739	0.27
740	0.31
741	0.29
742	0.31
743	0.34
744	0.34
745	0.35
746	0.37
747	0.33
748	0.3
749	0.32
750	0.29
751	0.24
752	0.23
753	0.19
754	0.14
755	0.12
756	0.1
757	0.08
758	0.1
759	0.11
760	0.1
761	0.11
762	0.11
763	0.12
764	0.13
765	0.16
766	0.13
767	0.14
768	0.14
769	0.13
770	0.13
771	0.14
772	0.13
773	0.1
774	0.12
775	0.13
776	0.14
777	0.16
778	0.16
779	0.15
780	0.15
781	0.18
782	0.18
783	0.17
784	0.2
785	0.22
786	0.24
787	0.34
788	0.43
789	0.49
790	0.55
791	0.57
792	0.58
793	0.63
794	0.68
795	0.6
796	0.53
797	0.47
798	0.4
799	0.38
800	0.34
801	0.27
802	0.21
803	0.18
804	0.16
805	0.12
806	0.12
807	0.09
808	0.09
809	0.06
810	0.07
811	0.09
812	0.09
813	0.1
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.09
820	0.12
821	0.14
822	0.14
823	0.15
824	0.17
825	0.2
826	0.25
827	0.28
828	0.28
829	0.3
830	0.33
831	0.33
832	0.33
833	0.31
834	0.26
835	0.21
836	0.17
837	0.13
838	0.09
839	0.09
840	0.07
841	0.06
842	0.08
843	0.1
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.14
848	0.14
849	0.13
850	0.12
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.1
855	0.1
856	0.09
857	0.09
858	0.09
859	0.08
860	0.08
861	0.09
862	0.08
863	0.08
864	0.1
865	0.1
866	0.1
867	0.09
868	0.08
869	0.08
870	0.09
871	0.12
872	0.13
873	0.14
874	0.17
875	0.17
876	0.18
877	0.18
878	0.2
879	0.2
880	0.18
881	0.19
882	0.17
883	0.22
884	0.2
885	0.21
886	0.2
887	0.17
888	0.17
889	0.15
890	0.16
891	0.12
892	0.13
893	0.12
894	0.11
895	0.16
896	0.23
897	0.25
898	0.25
899	0.25
900	0.24
901	0.27
902	0.27
903	0.24
904	0.19
905	0.21
906	0.21
907	0.27
908	0.31
909	0.3
910	0.3
911	0.29
912	0.29
913	0.31
914	0.35
915	0.31
916	0.27
917	0.29
918	0.3
919	0.31
920	0.3
921	0.25
922	0.21
923	0.26
924	0.3
925	0.29
926	0.3
927	0.28
928	0.29
929	0.3
930	0.31
931	0.25
932	0.21
933	0.2
934	0.17
935	0.24
936	0.26
937	0.29
938	0.33
939	0.38
940	0.4
941	0.4
942	0.4
943	0.33
944	0.34
945	0.3
946	0.25
947	0.22
948	0.22
949	0.22
950	0.24
951	0.3
952	0.35
953	0.44
954	0.53
955	0.58
956	0.65
957	0.7
958	0.72
959	0.7
960	0.7
961	0.67
962	0.59
963	0.53
964	0.44
965	0.4
966	0.37
967	0.31
968	0.21
969	0.15
970	0.17
971	0.23
972	0.22
973	0.19
974	0.19
975	0.19
976	0.18
977	0.19
978	0.16
979	0.07
980	0.06
981	0.06
982	0.05
983	0.06
984	0.07
985	0.08
986	0.11
987	0.14
988	0.15
989	0.17
990	0.2
991	0.22
992	0.22
993	0.22
994	0.21
995	0.18
996	0.17
997	0.15
998	0.15
999	0.11
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.11
1003	0.14
1004	0.21
1005	0.26
1006	0.28
1007	0.34
1008	0.38
1009	0.44
1010	0.49
1011	0.47
1012	0.44
1013	0.41
1014	0.38
1015	0.33
1016	0.32
1017	0.25
1018	0.24
1019	0.23
1020	0.21
1021	0.22
1022	0.23
1023	0.25
1024	0.29
1025	0.32
1026	0.31
1027	0.37
1028	0.37
1029	0.38
1030	0.43
1031	0.44
1032	0.41
1033	0.37
1034	0.36
1035	0.32
1036	0.31
1037	0.29
1038	0.24
1039	0.24
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.18
1044	0.17
1045	0.22
1046	0.23
1047	0.19
1048	0.19
1049	0.19
1050	0.19
1051	0.2
1052	0.24
1053	0.19
1054	0.19
1055	0.2
1056	0.21
1057	0.22
1058	0.2
1059	0.19
1060	0.15
1061	0.13
1062	0.14
1063	0.12
1064	0.11
1065	0.12
1066	0.14
1067	0.13
1068	0.17
1069	0.19
1070	0.25
1071	0.3
1072	0.32
1073	0.32
1074	0.38
1075	0.39
1076	0.37
1077	0.37
1078	0.31
1079	0.24
1080	0.27
1081	0.29
1082	0.23
1083	0.23
1084	0.23
1085	0.21
1086	0.2
1087	0.21
1088	0.17
1089	0.17
1090	0.25
1091	0.25
1092	0.25
1093	0.28
1094	0.29
1095	0.3
1096	0.31
1097	0.27
1098	0.18
1099	0.16
1100	0.16
1101	0.14
1102	0.12
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.11
1106	0.12
1107	0.21
1108	0.25
1109	0.28
1110	0.3
1111	0.31
1112	0.31
1113	0.3
1114	0.33
1115	0.32
1116	0.34
1117	0.35
1118	0.35
1119	0.35
1120	0.35
1121	0.35
1122	0.32
1123	0.26
1124	0.23
1125	0.29
1126	0.3
1127	0.3
1128	0.31
1129	0.34
1130	0.37
1131	0.42
1132	0.44
1133	0.42
1134	0.47
1135	0.5
1136	0.54
1137	0.55
1138	0.53
1139	0.52
1140	0.52
1141	0.49
1142	0.41
1143	0.39
1144	0.33
1145	0.3
1146	0.3
1147	0.3
1148	0.24
1149	0.19
1150	0.2
1151	0.18
1152	0.18
1153	0.17
1154	0.14
1155	0.1
1156	0.12
1157	0.14
1158	0.13
1159	0.14
1160	0.14
1161	0.14
1162	0.14
1163	0.14
1164	0.13
1165	0.13
1166	0.16
1167	0.24
1168	0.25
1169	0.28
1170	0.29
1171	0.31
1172	0.35
1173	0.38
1174	0.37
1175	0.37
1176	0.45
1177	0.5
1178	0.56
1179	0.55
1180	0.54
1181	0.55
1182	0.59
1183	0.57
1184	0.53
1185	0.46
1186	0.4
1187	0.37
1188	0.37
1189	0.31
1190	0.25
1191	0.18
1192	0.13
1193	0.15
1194	0.11
1195	0.12
1196	0.12
1197	0.12
1198	0.1
1199	0.14
1200	0.19
1201	0.24
1202	0.31
1203	0.34
1204	0.42
1205	0.53
1206	0.63
1207	0.7
1208	0.76
1209	0.78
1210	0.8
1211	0.85
1212	0.79
1213	0.7
1214	0.61
1215	0.56
1216	0.51
1217	0.43
1218	0.34
1219	0.26
1220	0.24
1221	0.22
1222	0.2
1223	0.16
1224	0.12
1225	0.12
1226	0.12
1227	0.13
1228	0.13
1229	0.15
1230	0.17
1231	0.2
1232	0.19
1233	0.19
1234	0.21
1235	0.21
1236	0.21
1237	0.18
1238	0.18
1239	0.14
1240	0.14
1241	0.16
1242	0.13
1243	0.13
1244	0.13
1245	0.14
1246	0.13
1247	0.16
1248	0.15
1249	0.15
1250	0.16
1251	0.19
1252	0.25
1253	0.25
1254	0.28
1255	0.3
1256	0.37
1257	0.42
1258	0.45
1259	0.45
1260	0.42
1261	0.42
1262	0.43
1263	0.45
1264	0.45
1265	0.47
1266	0.49
1267	0.53
1268	0.55
1269	0.56
1270	0.54
1271	0.5
1272	0.48
1273	0.48
1274	0.48
1275	0.43
1276	0.4
1277	0.4
1278	0.38
1279	0.38
1280	0.33
1281	0.27
1282	0.21
1283	0.2
1284	0.17
1285	0.2
1286	0.26
1287	0.29
1288	0.32
1289	0.31
1290	0.31
1291	0.4
1292	0.44
1293	0.44
1294	0.5
1295	0.46
1296	0.44
1297	0.48
1298	0.5
1299	0.42
1300	0.43
1301	0.44
1302	0.35
1303	0.36
1304	0.34
1305	0.3
1306	0.3
1307	0.32
1308	0.29
1309	0.24
1310	0.24
1311	0.22
1312	0.22
1313	0.23
1314	0.23
1315	0.22
1316	0.24
1317	0.26
1318	0.31
1319	0.35
1320	0.35
1321	0.41
1322	0.44
1323	0.44
1324	0.48
1325	0.45
1326	0.4

A0A409WRH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer