Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YNJ2

Protein Details
Accession A0A409YNJ2    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-42APSPDIASPKDQKRKRKQRTEDAPIESDHydrophilic
60-86SEEPVLSHKEKRKRKKEEKLAAKLAEEBasic
360-384FKSSDDSPKKFRPQKFQHDREEPAEHydrophilic
391-414LVAEQKETSKRPQKERHSHSESQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-31KRKRK
68-94KEKRKRKKEEKLAAKLAEEGKAVKKRK
343-362RRGAPKGPKTDRPRGDKFKS
416-430VRHKGPKNRPKPGAA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSDSSSSSSVSSRAPSPDIASPKDQKRKRKQRTEDAPIESDSSDSDSSEDETEEPSVESEEPVLSHKEKRKRKKEEKLAAKLAEEGKAVKKRKLQNGTAKEVTNTARKNSVWVGNMSFKTEQDDLRRFFKDVGEITRINLPTKAPTGPGVKPQNRGFAYVDFATPESKAAAIALSEQPLLGRKLLIKDGDDFSGRPAAINFGESTFSDPALAHKTHSKTAQKILRAQKQPPAPTLFFGNLGFDTTDESLRELLDAHRPPQPKQKDAQKANDEEEGTEPKKKQENWIRKIRLGTFEDSGVCKGFGFVDFTSIEHATAALINPRNHQLNGRKLVVEYAGADAVRRGAPKGPKTDRPRGDKFKSSDDSPKKFRPQKFQHDREEPAELDEAAPLVAEQKETSKRPQKERHSHSESQDGVRHKGPKNRPKPGAALALAKRESAAIMPSQGKKIVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.29
5 0.34
6 0.37
7 0.39
8 0.42
9 0.47
10 0.55
11 0.64
12 0.67
13 0.71
14 0.77
15 0.84
16 0.87
17 0.9
18 0.9
19 0.91
20 0.95
21 0.94
22 0.92
23 0.87
24 0.79
25 0.69
26 0.61
27 0.5
28 0.39
29 0.29
30 0.24
31 0.17
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.12
51 0.16
52 0.17
53 0.25
54 0.33
55 0.42
56 0.52
57 0.63
58 0.71
59 0.78
60 0.87
61 0.9
62 0.93
63 0.94
64 0.94
65 0.93
66 0.91
67 0.81
68 0.71
69 0.65
70 0.56
71 0.47
72 0.37
73 0.29
74 0.29
75 0.35
76 0.38
77 0.38
78 0.44
79 0.51
80 0.6
81 0.67
82 0.68
83 0.7
84 0.75
85 0.77
86 0.74
87 0.66
88 0.56
89 0.51
90 0.45
91 0.42
92 0.36
93 0.3
94 0.31
95 0.3
96 0.33
97 0.34
98 0.36
99 0.31
100 0.31
101 0.32
102 0.34
103 0.35
104 0.35
105 0.31
106 0.25
107 0.27
108 0.27
109 0.27
110 0.27
111 0.34
112 0.33
113 0.37
114 0.39
115 0.36
116 0.35
117 0.33
118 0.31
119 0.27
120 0.28
121 0.29
122 0.27
123 0.27
124 0.32
125 0.31
126 0.26
127 0.25
128 0.21
129 0.18
130 0.21
131 0.2
132 0.15
133 0.19
134 0.23
135 0.23
136 0.31
137 0.38
138 0.4
139 0.46
140 0.47
141 0.52
142 0.48
143 0.5
144 0.43
145 0.34
146 0.33
147 0.27
148 0.25
149 0.17
150 0.16
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.12
172 0.15
173 0.16
174 0.15
175 0.16
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.15
180 0.14
181 0.16
182 0.15
183 0.12
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.11
198 0.14
199 0.14
200 0.12
201 0.17
202 0.19
203 0.21
204 0.28
205 0.3
206 0.28
207 0.36
208 0.4
209 0.38
210 0.44
211 0.5
212 0.52
213 0.52
214 0.52
215 0.5
216 0.51
217 0.5
218 0.45
219 0.42
220 0.33
221 0.3
222 0.3
223 0.24
224 0.2
225 0.18
226 0.15
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.21
245 0.23
246 0.26
247 0.35
248 0.39
249 0.35
250 0.41
251 0.49
252 0.54
253 0.59
254 0.66
255 0.62
256 0.6
257 0.59
258 0.56
259 0.46
260 0.36
261 0.32
262 0.28
263 0.23
264 0.25
265 0.23
266 0.24
267 0.3
268 0.3
269 0.38
270 0.43
271 0.53
272 0.57
273 0.67
274 0.66
275 0.63
276 0.67
277 0.6
278 0.57
279 0.5
280 0.44
281 0.35
282 0.31
283 0.3
284 0.26
285 0.24
286 0.17
287 0.13
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.11
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.15
298 0.15
299 0.14
300 0.1
301 0.1
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.16
307 0.17
308 0.19
309 0.24
310 0.26
311 0.26
312 0.33
313 0.35
314 0.39
315 0.45
316 0.45
317 0.41
318 0.39
319 0.4
320 0.33
321 0.26
322 0.17
323 0.13
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.16
333 0.24
334 0.3
335 0.4
336 0.45
337 0.53
338 0.61
339 0.7
340 0.72
341 0.73
342 0.77
343 0.77
344 0.77
345 0.77
346 0.72
347 0.71
348 0.67
349 0.63
350 0.64
351 0.64
352 0.65
353 0.64
354 0.69
355 0.7
356 0.74
357 0.77
358 0.77
359 0.78
360 0.81
361 0.85
362 0.85
363 0.85
364 0.83
365 0.81
366 0.73
367 0.68
368 0.57
369 0.48
370 0.41
371 0.31
372 0.24
373 0.18
374 0.15
375 0.09
376 0.09
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.15
383 0.22
384 0.26
385 0.36
386 0.44
387 0.52
388 0.62
389 0.72
390 0.76
391 0.8
392 0.86
393 0.87
394 0.86
395 0.84
396 0.78
397 0.77
398 0.7
399 0.64
400 0.61
401 0.54
402 0.49
403 0.48
404 0.52
405 0.49
406 0.55
407 0.61
408 0.66
409 0.73
410 0.79
411 0.8
412 0.77
413 0.77
414 0.74
415 0.72
416 0.64
417 0.62
418 0.56
419 0.57
420 0.52
421 0.45
422 0.39
423 0.3
424 0.28
425 0.2
426 0.19
427 0.13
428 0.18
429 0.25
430 0.28
431 0.31