Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YSK8

Protein Details
Accession A0A409YSK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-107LTAPPSIRPRDKTKHKKRKPKQRARQSQPETSETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-98RPRDKTKHKKRKPKQRAR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046938  DNA_clamp_sf  
IPR003021  Rad1_Rec1_Rad17  
IPR003027  Rec1_exonuc_Ustilaginaceae  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000077  P:DNA damage checkpoint signaling  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02144  Rad1  
Amino Acid Sequences MHEDDAIPPVLTASVHDVRYFAALLRGVQFSSRATVTVTDTGLTITVEEARTLLGTAFIFADVFDEYAYHPETLTAPPSIRPRDKTKHKKRKPKQRARQSQPETSETESDSGEDENDKSYAPDEEDDDEAEKDDYMPENSAFEVPLDTLIECLNIFGTAGSLAGAFSESSNAGRGKARARVRSGRQGGMRGNNDDSDAQENDAEEGNARGLDAFFGGKAEKKTSMRLSYPGSGYPLTLIVAEDASGPTTTCEITVFDPEPHLELDFDNSKIVLKIILKSSWLRDALSELDPSCEKLTFVGNPPIAQDQNTNGRQKGKQRALLKPMLRIQANGTFGSTEMDYPNDRDVLETFECTRNVAFSYRFGHISRTLKALANSTKTSLRIDEDGLLSLQFLMPSPKPKTAGSRSDAFIEFRCLALDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.23
7 0.22
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.18
16 0.19
17 0.16
18 0.18
19 0.17
20 0.14
21 0.14
22 0.16
23 0.19
24 0.21
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.13
31 0.09
32 0.07
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.09
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.09
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.13
60 0.14
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.19
65 0.27
66 0.34
67 0.38
68 0.42
69 0.49
70 0.58
71 0.68
72 0.75
73 0.79
74 0.82
75 0.87
76 0.93
77 0.94
78 0.95
79 0.95
80 0.96
81 0.95
82 0.95
83 0.96
84 0.94
85 0.95
86 0.9
87 0.87
88 0.81
89 0.73
90 0.65
91 0.56
92 0.49
93 0.38
94 0.33
95 0.24
96 0.19
97 0.16
98 0.13
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.13
162 0.16
163 0.23
164 0.29
165 0.31
166 0.37
167 0.44
168 0.47
169 0.55
170 0.56
171 0.53
172 0.49
173 0.48
174 0.45
175 0.44
176 0.41
177 0.33
178 0.31
179 0.26
180 0.25
181 0.21
182 0.19
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.04
203 0.05
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.14
208 0.15
209 0.2
210 0.24
211 0.27
212 0.26
213 0.29
214 0.3
215 0.29
216 0.29
217 0.26
218 0.23
219 0.19
220 0.18
221 0.15
222 0.12
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.11
242 0.12
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.09
250 0.07
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.12
262 0.15
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.2
267 0.22
268 0.22
269 0.19
270 0.17
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.14
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.16
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.14
285 0.18
286 0.24
287 0.23
288 0.23
289 0.25
290 0.27
291 0.25
292 0.23
293 0.2
294 0.18
295 0.26
296 0.31
297 0.33
298 0.32
299 0.37
300 0.41
301 0.48
302 0.55
303 0.54
304 0.56
305 0.6
306 0.66
307 0.68
308 0.72
309 0.65
310 0.62
311 0.6
312 0.58
313 0.51
314 0.44
315 0.4
316 0.37
317 0.37
318 0.31
319 0.25
320 0.19
321 0.19
322 0.2
323 0.16
324 0.11
325 0.1
326 0.12
327 0.13
328 0.14
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.18
335 0.18
336 0.19
337 0.2
338 0.23
339 0.24
340 0.24
341 0.23
342 0.18
343 0.19
344 0.21
345 0.19
346 0.19
347 0.23
348 0.25
349 0.28
350 0.27
351 0.3
352 0.33
353 0.37
354 0.35
355 0.34
356 0.35
357 0.35
358 0.36
359 0.39
360 0.38
361 0.39
362 0.38
363 0.38
364 0.38
365 0.37
366 0.38
367 0.33
368 0.3
369 0.27
370 0.27
371 0.27
372 0.25
373 0.24
374 0.22
375 0.19
376 0.16
377 0.14
378 0.12
379 0.08
380 0.08
381 0.12
382 0.15
383 0.23
384 0.28
385 0.33
386 0.36
387 0.39
388 0.48
389 0.52
390 0.57
391 0.54
392 0.56
393 0.52
394 0.54
395 0.53
396 0.46
397 0.39
398 0.36
399 0.32
400 0.26
401 0.25
402 0.21