Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VXQ4

Protein Details
Accession A0A409VXQ4    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-354DEWEKKLARKRRRAEFEFNNDHydrophilic
441-464SKINKDIEKKGKFHRKRLNEEEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-127PRSKKGKKAAKG
339-346KLARKRRR
450-455KGKFHR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7.5, cyto_mito 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences NISSVSVVSGQPTLLSWSGGKAPYHLVGIRAYLAYVNALVKTDVTTTVEDLGFHAGTSFTWDTDLPAGTEVNFEVIDKKHDIAESAPVVIQVPSVRTTAFRKPHNILNPYLSIMPPRSKKGKKAAKGGAGSVEPHAQIPDATSATRTDEDNNAMETDHPEPSTSSSIAEATSHLVEASEKAISHAVEASEHAMAHAAESVKQTVGNVVEAAKVFADDMTGIEASGSSSSGKSGENTPAEGGAESKSKAEGHKMTMEERKAKFEELRKKTAASSRANRVSMVEEAAKAKITAREAARLERQRKLAETLRLKADAEERGEDVERQKNWEYTIEENDEWEKKLARKRRRAEFEFNNDADAARRKYKKDLDFIKPDLEAYNKQKALALGQNAGALVAFNPSGESSELSVISQEQRLAAENLYRDANTLIYGDNKPSEEAIDKMVSKINKDIEKKGKFHRKRLNEEEGDITYINEHNRVFNKKVRRIMLYFSLWNVYRLFFNQIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.14
5 0.2
6 0.23
7 0.23
8 0.21
9 0.24
10 0.24
11 0.28
12 0.26
13 0.23
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.18
18 0.16
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.18
35 0.18
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.09
43 0.09
44 0.16
45 0.15
46 0.12
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.17
51 0.18
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.11
62 0.12
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.18
70 0.23
71 0.2
72 0.19
73 0.18
74 0.16
75 0.17
76 0.15
77 0.15
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.14
84 0.2
85 0.28
86 0.34
87 0.37
88 0.42
89 0.45
90 0.53
91 0.59
92 0.58
93 0.52
94 0.49
95 0.46
96 0.41
97 0.38
98 0.3
99 0.24
100 0.24
101 0.29
102 0.28
103 0.33
104 0.41
105 0.45
106 0.53
107 0.6
108 0.67
109 0.67
110 0.74
111 0.75
112 0.73
113 0.7
114 0.64
115 0.56
116 0.47
117 0.4
118 0.31
119 0.25
120 0.17
121 0.15
122 0.14
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.16
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.17
150 0.15
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.09
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.14
236 0.15
237 0.17
238 0.2
239 0.21
240 0.24
241 0.28
242 0.31
243 0.33
244 0.32
245 0.33
246 0.3
247 0.31
248 0.31
249 0.35
250 0.42
251 0.4
252 0.46
253 0.42
254 0.42
255 0.44
256 0.45
257 0.44
258 0.4
259 0.4
260 0.42
261 0.46
262 0.46
263 0.43
264 0.39
265 0.33
266 0.27
267 0.23
268 0.16
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.15
278 0.15
279 0.2
280 0.21
281 0.25
282 0.31
283 0.37
284 0.39
285 0.39
286 0.42
287 0.38
288 0.38
289 0.4
290 0.38
291 0.39
292 0.4
293 0.39
294 0.38
295 0.38
296 0.36
297 0.32
298 0.3
299 0.24
300 0.21
301 0.19
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.2
308 0.19
309 0.22
310 0.24
311 0.24
312 0.25
313 0.27
314 0.26
315 0.23
316 0.28
317 0.27
318 0.25
319 0.25
320 0.26
321 0.24
322 0.22
323 0.2
324 0.19
325 0.2
326 0.28
327 0.36
328 0.44
329 0.53
330 0.6
331 0.69
332 0.76
333 0.78
334 0.8
335 0.8
336 0.79
337 0.76
338 0.68
339 0.58
340 0.48
341 0.41
342 0.34
343 0.31
344 0.25
345 0.26
346 0.3
347 0.31
348 0.39
349 0.48
350 0.51
351 0.55
352 0.6
353 0.61
354 0.64
355 0.64
356 0.59
357 0.5
358 0.45
359 0.37
360 0.32
361 0.3
362 0.28
363 0.34
364 0.32
365 0.32
366 0.33
367 0.32
368 0.33
369 0.31
370 0.28
371 0.21
372 0.21
373 0.21
374 0.19
375 0.18
376 0.14
377 0.09
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.14
399 0.15
400 0.14
401 0.16
402 0.15
403 0.17
404 0.18
405 0.17
406 0.15
407 0.14
408 0.14
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.13
413 0.14
414 0.16
415 0.17
416 0.18
417 0.18
418 0.17
419 0.19
420 0.16
421 0.16
422 0.18
423 0.2
424 0.19
425 0.2
426 0.24
427 0.23
428 0.23
429 0.27
430 0.31
431 0.35
432 0.39
433 0.47
434 0.53
435 0.59
436 0.62
437 0.68
438 0.72
439 0.73
440 0.79
441 0.8
442 0.8
443 0.83
444 0.87
445 0.87
446 0.79
447 0.74
448 0.68
449 0.59
450 0.51
451 0.41
452 0.32
453 0.23
454 0.21
455 0.2
456 0.18
457 0.17
458 0.2
459 0.27
460 0.33
461 0.37
462 0.42
463 0.51
464 0.56
465 0.64
466 0.65
467 0.66
468 0.62
469 0.63
470 0.64
471 0.59
472 0.52
473 0.45
474 0.45
475 0.39
476 0.37
477 0.32
478 0.25
479 0.22
480 0.22
481 0.26
482 0.24
483 0.28
484 0.32
485 0.35
486 0.39
487 0.41
488 0.43
489 0.42
490 0.44
491 0.42
492 0.39
493 0.38
494 0.39
495 0.39
496 0.37
497 0.36
498 0.36
499 0.37
500 0.34