FuNGI

A0A409Y9U9

Protein Details

Accession

A0A409Y9U9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
559-578	TDPAPPKRPKPKYFDINLHI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044641 Lsm7/SmG-like IPR010920 LSM_dom_sf IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR034098 Sm_G
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
CDD	cd01719 Sm_G

Amino Acid Sequences

MSKASQPELKKFMDKKLFIHLQGGRKVSGVLRGYDLFLNLVIDDAVEETTPAQKHPIGSVVIREMPGRSLQLLNSLTHRSFRQPIRLSSSLSLPPDLVQSTFNSDSLSYAQRASLRDLTSALAGDTSPSDVWSVYTNALSSLGSQSLPLEVHKQVLRRCIPTKNELKARTVARLSMGKWQFEPPSFEPRLQALMSNILALGARPALEDYNYVLERFAAVGYYEGCLNLYEEVKRVGHTPNHATFGYCLQAIAYRLTMPIPSDTRETTVARMQKIFRLLISDMRTYGVPLTGVHVDLTMRILKETLDYEGLEAILRRGYGIDLSHPDRIALEYSERSSSKDDDPLSKPATPFRFTTAALNTTIDILGQLGNVSKLVQAFEVLTQPLPRAGQHFFNSFESDEEDDYGVDVDVSPPSQLWPICARPNTTTYNLLIRHLCHHGHAILARHYLIQARMKHSMIAHKLHNAVISFASQGIPLSRICAPHLAIGRLTFLPVLGESNRDKNLGLMRWLSTKVPSVIEKQKRDLYMFTSLAEYLQLEDSSTSAPVSKPEPNVSDLDVTDPAPPKRPKPKYFDINLHIRILRRNILELEVFNERLSYVLGRTFQRVKERLGRRVWDGKNIYLSTDGDRVFVSKEDWKDIVNFRPKKADYEPPRHGPILIMPPIFRSRLQPTDPRPPGVQRPSSEP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.56
3	0.6
4	0.63
5	0.54
6	0.58
7	0.55
8	0.53
9	0.56
10	0.56
11	0.46
12	0.4
13	0.4
14	0.34
15	0.36
16	0.3
17	0.25
18	0.26
19	0.27
20	0.28
21	0.27
22	0.26
23	0.18
24	0.16
25	0.15
26	0.11
27	0.1
28	0.08
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.06
33	0.05
34	0.06
35	0.06
36	0.12
37	0.13
38	0.13
39	0.16
40	0.18
41	0.19
42	0.21
43	0.25
44	0.22
45	0.23
46	0.26
47	0.27
48	0.28
49	0.27
50	0.26
51	0.22
52	0.21
53	0.22
54	0.2
55	0.18
56	0.18
57	0.17
58	0.24
59	0.25
60	0.24
61	0.26
62	0.29
63	0.27
64	0.29
65	0.31
66	0.29
67	0.36
68	0.4
69	0.46
70	0.48
71	0.53
72	0.58
73	0.59
74	0.57
75	0.51
76	0.51
77	0.45
78	0.4
79	0.35
80	0.27
81	0.25
82	0.23
83	0.22
84	0.18
85	0.14
86	0.14
87	0.2
88	0.21
89	0.2
90	0.19
91	0.18
92	0.18
93	0.2
94	0.22
95	0.16
96	0.16
97	0.18
98	0.2
99	0.22
100	0.26
101	0.29
102	0.27
103	0.26
104	0.27
105	0.25
106	0.22
107	0.21
108	0.15
109	0.1
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.09
119	0.11
120	0.12
121	0.11
122	0.12
123	0.11
124	0.11
125	0.12
126	0.11
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.11
135	0.11
136	0.13
137	0.12
138	0.17
139	0.19
140	0.24
141	0.26
142	0.34
143	0.38
144	0.41
145	0.44
146	0.48
147	0.5
148	0.55
149	0.6
150	0.6
151	0.64
152	0.6
153	0.6
154	0.58
155	0.56
156	0.53
157	0.45
158	0.38
159	0.33
160	0.34
161	0.31
162	0.34
163	0.34
164	0.29
165	0.3
166	0.32
167	0.32
168	0.3
169	0.37
170	0.3
171	0.37
172	0.37
173	0.36
174	0.34
175	0.32
176	0.34
177	0.26
178	0.24
179	0.16
180	0.18
181	0.17
182	0.15
183	0.13
184	0.1
185	0.1
186	0.08
187	0.08
188	0.05
189	0.04
190	0.05
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.1
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.12
219	0.12
220	0.12
221	0.14
222	0.17
223	0.19
224	0.23
225	0.28
226	0.29
227	0.32
228	0.32
229	0.3
230	0.26
231	0.25
232	0.22
233	0.15
234	0.12
235	0.08
236	0.1
237	0.11
238	0.11
239	0.09
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.08
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.15
249	0.15
250	0.17
251	0.19
252	0.19
253	0.18
254	0.22
255	0.24
256	0.23
257	0.26
258	0.25
259	0.25
260	0.27
261	0.25
262	0.2
263	0.2
264	0.19
265	0.21
266	0.24
267	0.21
268	0.18
269	0.19
270	0.19
271	0.15
272	0.15
273	0.1
274	0.07
275	0.06
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.1
309	0.13
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.13
314	0.14
315	0.12
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.17
325	0.16
326	0.2
327	0.2
328	0.23
329	0.25
330	0.28
331	0.29
332	0.28
333	0.27
334	0.28
335	0.3
336	0.27
337	0.25
338	0.24
339	0.24
340	0.23
341	0.26
342	0.22
343	0.2
344	0.19
345	0.19
346	0.15
347	0.13
348	0.12
349	0.08
350	0.06
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.1
375	0.11
376	0.16
377	0.17
378	0.19
379	0.21
380	0.22
381	0.23
382	0.2
383	0.19
384	0.16
385	0.15
386	0.14
387	0.12
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.06
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.05
401	0.08
402	0.08
403	0.1
404	0.14
405	0.18
406	0.23
407	0.25
408	0.27
409	0.26
410	0.31
411	0.32
412	0.31
413	0.29
414	0.25
415	0.3
416	0.28
417	0.28
418	0.25
419	0.22
420	0.23
421	0.24
422	0.23
423	0.18
424	0.19
425	0.17
426	0.17
427	0.19
428	0.18
429	0.17
430	0.18
431	0.17
432	0.15
433	0.16
434	0.16
435	0.17
436	0.2
437	0.22
438	0.25
439	0.29
440	0.29
441	0.3
442	0.3
443	0.34
444	0.32
445	0.33
446	0.3
447	0.3
448	0.31
449	0.3
450	0.3
451	0.23
452	0.19
453	0.16
454	0.14
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.07
459	0.08
460	0.07
461	0.08
462	0.07
463	0.1
464	0.11
465	0.12
466	0.13
467	0.15
468	0.16
469	0.19
470	0.22
471	0.2
472	0.19
473	0.18
474	0.2
475	0.17
476	0.17
477	0.12
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.1
482	0.08
483	0.12
484	0.13
485	0.18
486	0.19
487	0.19
488	0.19
489	0.19
490	0.25
491	0.23
492	0.24
493	0.22
494	0.22
495	0.24
496	0.26
497	0.24
498	0.2
499	0.22
500	0.2
501	0.21
502	0.22
503	0.26
504	0.35
505	0.43
506	0.46
507	0.48
508	0.51
509	0.51
510	0.51
511	0.46
512	0.39
513	0.38
514	0.34
515	0.29
516	0.25
517	0.23
518	0.21
519	0.19
520	0.15
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.09
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.1
533	0.14
534	0.19
535	0.21
536	0.26
537	0.28
538	0.29
539	0.31
540	0.31
541	0.29
542	0.24
543	0.23
544	0.2
545	0.18
546	0.2
547	0.23
548	0.23
549	0.3
550	0.33
551	0.39
552	0.49
553	0.59
554	0.62
555	0.66
556	0.75
557	0.76
558	0.8
559	0.81
560	0.76
561	0.76
562	0.71
563	0.67
564	0.59
565	0.51
566	0.48
567	0.43
568	0.42
569	0.34
570	0.34
571	0.31
572	0.31
573	0.31
574	0.27
575	0.26
576	0.24
577	0.23
578	0.19
579	0.18
580	0.15
581	0.13
582	0.14
583	0.12
584	0.09
585	0.12
586	0.17
587	0.18
588	0.24
589	0.29
590	0.33
591	0.42
592	0.43
593	0.46
594	0.53
595	0.59
596	0.62
597	0.65
598	0.64
599	0.62
600	0.69
601	0.65
602	0.64
603	0.6
604	0.56
605	0.55
606	0.51
607	0.45
608	0.38
609	0.37
610	0.3
611	0.32
612	0.28
613	0.21
614	0.21
615	0.2
616	0.19
617	0.19
618	0.19
619	0.2
620	0.23
621	0.27
622	0.28
623	0.28
624	0.32
625	0.37
626	0.43
627	0.46
628	0.49
629	0.47
630	0.56
631	0.55
632	0.57
633	0.58
634	0.59
635	0.58
636	0.64
637	0.69
638	0.67
639	0.71
640	0.65
641	0.59
642	0.5
643	0.47
644	0.45
645	0.42
646	0.37
647	0.32
648	0.35
649	0.39
650	0.39
651	0.33
652	0.31
653	0.33
654	0.39
655	0.45
656	0.5
657	0.54
658	0.63
659	0.67
660	0.65
661	0.62
662	0.61
663	0.65
664	0.65
665	0.66

A0A409Y9U9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer