Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VBP5

Protein Details
Accession A0A409VBP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
533-559IPGAWTPRLRGRRRRKRMRLLQVGDPFHydrophilic
745-775LSHFRALRPRVPPRVKSTKERRKALYSQLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
540-550RLRGRRRRKRM
753-767PRVPPRVKSTKERRK
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 4, nucl 3, plas 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLQRSFFVQKRRLELSICVSKHIACRPLSGSGRRPSPQHARAAGLPSTAAGVPSDLSKGVSKYLTSPRIGHPEFERVIRALASDLGEEKILQFIKRSPSLSSVFSDRKRLREQVKDLARSTTPHFALQLLNIAAKLGCTLNASAYESVSFHLAQSSHWDIILAVVASAANHIGHTTLRLLNWRALALLESQHFSRLERILEEFQAAGISPTRRTYHIILSGHMRNYNMEGAKTCLQDMQSAGFRMDATTHSLIGNLYRRFGADPKVCQNVLDSLSELHCGARTTVVNRLMQSFLDCDDIPSTARLLMLFDPDGVSRIIAILTRYRSKGANLSTPLTLPDLSASPLPPDANTCAVFMNYLIRKSAFDDAIALGKDMISTGMTASSNLVASFMHAYFLCEQGNVAIRIVSKLSVPSAVTAFQNLAVGFSGGEPPSLDLSRVSLTPRICNVLLRGILNRQGLNFVPTVFSIMHSNNVRPNTRTLEILLSFMNKTNVARPRTLFQILRKLSSKLGLSLTHIHHIAARIFRDEKYMFIPGAWTPRLRGRRRRKRMRLLQVGDPFDPTGGIAFDRHLSYHALAKPLLSSLKAKGVMSDSVMVFLRIRRHSVLHKDVESAHRVLRTLMARGMHPNAYHFGALVEGYSLSGNFDGADEVMRTAEASGVKPNAAMYTSIIAAYARHRDAKLAFQTFKKMIAVGIAPDIASIDALVSAFYTSGAHETAHTLLIKLWGYIQPFPRALETADLSTLLSHFRALRPRVPPRVKSTKERRKALYSQLKAVLKAYEQFFVSSSRLRKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.54
4 0.49
5 0.45
6 0.41
7 0.41
8 0.44
9 0.45
10 0.43
11 0.34
12 0.38
13 0.38
14 0.46
15 0.5
16 0.51
17 0.53
18 0.54
19 0.61
20 0.59
21 0.59
22 0.59
23 0.62
24 0.62
25 0.62
26 0.58
27 0.54
28 0.55
29 0.58
30 0.5
31 0.4
32 0.33
33 0.24
34 0.23
35 0.19
36 0.15
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.09
43 0.11
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.23
50 0.33
51 0.37
52 0.37
53 0.4
54 0.43
55 0.51
56 0.51
57 0.49
58 0.43
59 0.45
60 0.44
61 0.43
62 0.39
63 0.3
64 0.3
65 0.26
66 0.23
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.14
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.2
81 0.27
82 0.31
83 0.33
84 0.3
85 0.34
86 0.37
87 0.37
88 0.35
89 0.36
90 0.39
91 0.4
92 0.49
93 0.47
94 0.51
95 0.55
96 0.6
97 0.61
98 0.63
99 0.67
100 0.67
101 0.72
102 0.71
103 0.66
104 0.62
105 0.55
106 0.48
107 0.45
108 0.43
109 0.36
110 0.31
111 0.3
112 0.27
113 0.26
114 0.24
115 0.25
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.09
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.17
142 0.21
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.16
147 0.16
148 0.18
149 0.11
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.22
169 0.21
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.19
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.17
190 0.15
191 0.14
192 0.12
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.22
201 0.24
202 0.27
203 0.33
204 0.33
205 0.31
206 0.35
207 0.38
208 0.36
209 0.34
210 0.28
211 0.22
212 0.23
213 0.26
214 0.21
215 0.18
216 0.17
217 0.2
218 0.24
219 0.23
220 0.21
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.16
241 0.22
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.19
247 0.21
248 0.26
249 0.24
250 0.28
251 0.32
252 0.36
253 0.36
254 0.34
255 0.33
256 0.28
257 0.25
258 0.21
259 0.17
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.18
272 0.22
273 0.22
274 0.22
275 0.24
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.15
280 0.11
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.07
307 0.09
308 0.12
309 0.15
310 0.16
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.24
315 0.23
316 0.26
317 0.26
318 0.27
319 0.26
320 0.25
321 0.25
322 0.2
323 0.17
324 0.11
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.14
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.15
350 0.18
351 0.13
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.11
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.07
415 0.05
416 0.06
417 0.05
418 0.06
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.06
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.12
428 0.13
429 0.15
430 0.16
431 0.18
432 0.17
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.18
437 0.16
438 0.16
439 0.15
440 0.19
441 0.2
442 0.19
443 0.15
444 0.15
445 0.15
446 0.16
447 0.14
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.15
457 0.16
458 0.17
459 0.2
460 0.24
461 0.25
462 0.24
463 0.27
464 0.27
465 0.27
466 0.26
467 0.23
468 0.23
469 0.22
470 0.21
471 0.18
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.14
476 0.11
477 0.11
478 0.16
479 0.23
480 0.24
481 0.27
482 0.27
483 0.28
484 0.32
485 0.36
486 0.33
487 0.3
488 0.38
489 0.36
490 0.39
491 0.39
492 0.36
493 0.32
494 0.32
495 0.29
496 0.21
497 0.22
498 0.19
499 0.2
500 0.24
501 0.24
502 0.23
503 0.23
504 0.2
505 0.19
506 0.2
507 0.2
508 0.17
509 0.17
510 0.18
511 0.19
512 0.2
513 0.24
514 0.22
515 0.21
516 0.21
517 0.22
518 0.18
519 0.16
520 0.18
521 0.14
522 0.19
523 0.19
524 0.16
525 0.16
526 0.24
527 0.34
528 0.41
529 0.5
530 0.56
531 0.66
532 0.77
533 0.87
534 0.9
535 0.91
536 0.94
537 0.94
538 0.93
539 0.87
540 0.84
541 0.8
542 0.72
543 0.61
544 0.52
545 0.41
546 0.3
547 0.25
548 0.16
549 0.09
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.1
558 0.11
559 0.12
560 0.18
561 0.2
562 0.2
563 0.2
564 0.2
565 0.19
566 0.19
567 0.19
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.2
572 0.22
573 0.21
574 0.21
575 0.22
576 0.22
577 0.21
578 0.22
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.15
583 0.13
584 0.15
585 0.21
586 0.19
587 0.23
588 0.23
589 0.26
590 0.33
591 0.42
592 0.47
593 0.45
594 0.45
595 0.44
596 0.45
597 0.46
598 0.42
599 0.35
600 0.29
601 0.25
602 0.24
603 0.23
604 0.25
605 0.23
606 0.21
607 0.22
608 0.21
609 0.21
610 0.24
611 0.27
612 0.24
613 0.22
614 0.22
615 0.22
616 0.22
617 0.21
618 0.17
619 0.14
620 0.12
621 0.11
622 0.09
623 0.07
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.06
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.09
643 0.09
644 0.1
645 0.14
646 0.15
647 0.15
648 0.15
649 0.16
650 0.14
651 0.13
652 0.13
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.1
659 0.1
660 0.13
661 0.18
662 0.18
663 0.22
664 0.22
665 0.26
666 0.28
667 0.36
668 0.41
669 0.42
670 0.43
671 0.42
672 0.48
673 0.46
674 0.46
675 0.38
676 0.3
677 0.23
678 0.22
679 0.21
680 0.15
681 0.16
682 0.13
683 0.12
684 0.11
685 0.12
686 0.08
687 0.07
688 0.06
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.07
700 0.08
701 0.08
702 0.09
703 0.11
704 0.12
705 0.15
706 0.15
707 0.14
708 0.14
709 0.18
710 0.18
711 0.16
712 0.17
713 0.17
714 0.2
715 0.26
716 0.29
717 0.31
718 0.32
719 0.34
720 0.33
721 0.32
722 0.3
723 0.29
724 0.27
725 0.23
726 0.22
727 0.2
728 0.18
729 0.17
730 0.16
731 0.13
732 0.11
733 0.11
734 0.13
735 0.18
736 0.27
737 0.31
738 0.38
739 0.46
740 0.55
741 0.64
742 0.71
743 0.73
744 0.74
745 0.8
746 0.79
747 0.8
748 0.82
749 0.82
750 0.83
751 0.85
752 0.82
753 0.8
754 0.81
755 0.81
756 0.81
757 0.75
758 0.72
759 0.72
760 0.68
761 0.6
762 0.55
763 0.46
764 0.38
765 0.39
766 0.33
767 0.28
768 0.26
769 0.26
770 0.25
771 0.25
772 0.26
773 0.27