Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409Y4U4

Protein Details
Accession A0A409Y4U4    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-123LENQKASEEPPKKKRKRHTSGVLAEDMHydrophilic
162-195EEKKVKPSAVGKPDKKKKKKVKDPDTRARRRVIDBasic
549-577EEVKGDLTRDWKRRHREALKVSRRKRGGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-113EPPKKKRKR
162-192EEKKVKPSAVGKPDKKKKKKVKDPDTRARRR
558-575DWKRRHREALKVSRRKRG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSSDAPITKRLIISGLTPSISVDDISRRLSTFGTVKAADGFGLPDGVGQPRKFGYVTLETTVGKLAKCMNLLSGSTWKGAKLRFGEAKPDFRERIALENQKASEEPPKKKRKRHTSGVLAEDMSLVTPENAAERPGWKVSSLGRITRPIKMRPAHPLVEPQEEKKVKPSAVGKPDKKKKKKVKDPDTRARRRVIDMTKYGSTHLKGVFLDLEVTVPSKKKDEPPMESVDVDTADSSESEAEETPVVAPVANPSRSLPEAPKTIAGPSKLPVQSTPLSPPPPKPSAVQPTSTTVATSAAEAPSDILQEKLQSLNLLSSLFGTAGDGDDWTGYESVGSDIDVDELTKGDVMLVDEDDNPGFEIVPKEGKSVSKSKKTAMHPASAEEDEATMDVEQPSPTMPPPKQQETPAQAQKSTLKDLFAPREEEGGFSLLGHLNADIELDDSIPFLIDEPTQETGQQREPTAPSTLPVHAPPAAAITLQAQPSRAPIVLDPKRPLFFPIPEDSTLNRARQRDIFDIIKDNGWNWRDPAVGFFPSSAPNAEEEIKKRWEEVKGDLTRDWKRRHREALKVSRRKRGGVEDAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.22
4 0.21
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.17
9 0.13
10 0.15
11 0.18
12 0.21
13 0.22
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.25
18 0.24
19 0.24
20 0.27
21 0.26
22 0.26
23 0.27
24 0.26
25 0.21
26 0.18
27 0.15
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.14
34 0.19
35 0.18
36 0.21
37 0.22
38 0.24
39 0.24
40 0.23
41 0.25
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.3
46 0.28
47 0.29
48 0.31
49 0.26
50 0.19
51 0.17
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.21
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.24
63 0.24
64 0.23
65 0.24
66 0.25
67 0.29
68 0.27
69 0.33
70 0.38
71 0.39
72 0.48
73 0.49
74 0.56
75 0.54
76 0.57
77 0.51
78 0.44
79 0.48
80 0.39
81 0.41
82 0.42
83 0.45
84 0.41
85 0.44
86 0.44
87 0.41
88 0.39
89 0.34
90 0.36
91 0.36
92 0.43
93 0.48
94 0.59
95 0.67
96 0.76
97 0.85
98 0.86
99 0.87
100 0.88
101 0.88
102 0.88
103 0.86
104 0.82
105 0.74
106 0.62
107 0.53
108 0.42
109 0.31
110 0.21
111 0.13
112 0.08
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.27
128 0.29
129 0.3
130 0.31
131 0.38
132 0.4
133 0.45
134 0.47
135 0.42
136 0.48
137 0.48
138 0.48
139 0.49
140 0.53
141 0.48
142 0.44
143 0.48
144 0.44
145 0.48
146 0.46
147 0.4
148 0.43
149 0.43
150 0.42
151 0.4
152 0.41
153 0.32
154 0.36
155 0.41
156 0.4
157 0.49
158 0.58
159 0.6
160 0.66
161 0.76
162 0.81
163 0.84
164 0.86
165 0.86
166 0.88
167 0.91
168 0.92
169 0.93
170 0.93
171 0.94
172 0.94
173 0.94
174 0.92
175 0.86
176 0.8
177 0.72
178 0.65
179 0.63
180 0.59
181 0.55
182 0.49
183 0.5
184 0.46
185 0.43
186 0.41
187 0.35
188 0.29
189 0.25
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.13
196 0.13
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.12
205 0.15
206 0.21
207 0.3
208 0.36
209 0.4
210 0.44
211 0.49
212 0.48
213 0.45
214 0.39
215 0.3
216 0.23
217 0.18
218 0.13
219 0.07
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.08
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.16
241 0.17
242 0.18
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.19
247 0.2
248 0.17
249 0.19
250 0.2
251 0.19
252 0.16
253 0.15
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.19
258 0.21
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.2
263 0.24
264 0.25
265 0.28
266 0.29
267 0.3
268 0.3
269 0.28
270 0.31
271 0.36
272 0.37
273 0.36
274 0.32
275 0.33
276 0.33
277 0.31
278 0.24
279 0.16
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.16
354 0.19
355 0.28
356 0.34
357 0.39
358 0.41
359 0.45
360 0.51
361 0.53
362 0.6
363 0.53
364 0.52
365 0.43
366 0.44
367 0.43
368 0.35
369 0.31
370 0.21
371 0.18
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.15
385 0.16
386 0.22
387 0.29
388 0.35
389 0.38
390 0.41
391 0.48
392 0.47
393 0.55
394 0.55
395 0.51
396 0.45
397 0.44
398 0.46
399 0.41
400 0.4
401 0.33
402 0.26
403 0.28
404 0.33
405 0.37
406 0.34
407 0.34
408 0.29
409 0.31
410 0.3
411 0.27
412 0.22
413 0.17
414 0.14
415 0.11
416 0.12
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.1
438 0.13
439 0.13
440 0.15
441 0.16
442 0.18
443 0.25
444 0.26
445 0.24
446 0.25
447 0.27
448 0.28
449 0.3
450 0.27
451 0.22
452 0.23
453 0.24
454 0.22
455 0.21
456 0.22
457 0.19
458 0.19
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.12
463 0.12
464 0.11
465 0.14
466 0.16
467 0.16
468 0.15
469 0.15
470 0.17
471 0.19
472 0.17
473 0.15
474 0.15
475 0.25
476 0.32
477 0.38
478 0.4
479 0.43
480 0.43
481 0.43
482 0.45
483 0.4
484 0.37
485 0.36
486 0.38
487 0.37
488 0.38
489 0.4
490 0.36
491 0.38
492 0.39
493 0.39
494 0.37
495 0.35
496 0.38
497 0.41
498 0.45
499 0.43
500 0.45
501 0.43
502 0.4
503 0.44
504 0.42
505 0.39
506 0.34
507 0.3
508 0.32
509 0.3
510 0.29
511 0.25
512 0.26
513 0.25
514 0.24
515 0.28
516 0.25
517 0.25
518 0.24
519 0.23
520 0.21
521 0.22
522 0.23
523 0.2
524 0.16
525 0.16
526 0.18
527 0.21
528 0.25
529 0.27
530 0.32
531 0.36
532 0.35
533 0.37
534 0.4
535 0.43
536 0.41
537 0.45
538 0.49
539 0.49
540 0.52
541 0.52
542 0.55
543 0.57
544 0.62
545 0.64
546 0.63
547 0.66
548 0.73
549 0.8
550 0.81
551 0.83
552 0.85
553 0.87
554 0.89
555 0.9
556 0.88
557 0.87
558 0.83
559 0.77
560 0.72
561 0.7