Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X929

Protein Details
Accession A0A409X929    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
351-373ASNHSGYCRRHRGRGRGRGQGNGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-245KGNSGKGSTRDKGKSR
360-371RHRGRGRGRGQG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNIGSSLLTLSQQVDPLTDSNWHTWKEDLLMVLRADGLTAGIIDGTIARPSDPPEAGQTWDVKDSAATAIIWSRLSPSLRHLARGEKSGKALFAKLKAKFEASTWSRRIALRSAFHRVQHDASQPVDQYIQTLRDLKGQLAALGEEISDVYFKDVLLAGLDPAYESVRNSLLSQLTADKKEVDLDTTISMISGATYIQLNVESAADRVLDSMQAVKSEPIDAALATRFKKGNSGKGSTRDKGKSRPPPSHDSDHDHGFEDSHGHTWCSPANEGCCHRCGRFGHIAARCYSKMPEEVESWLCDRAKDTSNIITESSHFVRPVHANFRSPSPTNSDNTSIQSSFTATSSCGNASNHSGYCRRHRGRGRGRGQGNGRKYRDDEVVFEKCI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.18
6 0.2
7 0.24
8 0.29
9 0.3
10 0.29
11 0.29
12 0.3
13 0.28
14 0.27
15 0.24
16 0.22
17 0.23
18 0.22
19 0.21
20 0.2
21 0.16
22 0.14
23 0.11
24 0.09
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.05
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.13
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.27
45 0.27
46 0.24
47 0.25
48 0.24
49 0.18
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.12
54 0.1
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.12
61 0.15
62 0.17
63 0.17
64 0.2
65 0.28
66 0.29
67 0.33
68 0.32
69 0.36
70 0.38
71 0.44
72 0.42
73 0.35
74 0.38
75 0.36
76 0.36
77 0.3
78 0.31
79 0.27
80 0.32
81 0.37
82 0.37
83 0.4
84 0.39
85 0.39
86 0.36
87 0.33
88 0.35
89 0.32
90 0.37
91 0.35
92 0.36
93 0.37
94 0.38
95 0.39
96 0.35
97 0.37
98 0.34
99 0.37
100 0.42
101 0.42
102 0.44
103 0.44
104 0.42
105 0.38
106 0.37
107 0.36
108 0.3
109 0.28
110 0.28
111 0.25
112 0.23
113 0.21
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.17
120 0.16
121 0.21
122 0.22
123 0.2
124 0.22
125 0.2
126 0.19
127 0.16
128 0.15
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.15
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.11
212 0.11
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.22
217 0.24
218 0.31
219 0.34
220 0.38
221 0.4
222 0.48
223 0.54
224 0.49
225 0.54
226 0.52
227 0.5
228 0.52
229 0.58
230 0.6
231 0.61
232 0.67
233 0.65
234 0.67
235 0.68
236 0.68
237 0.63
238 0.6
239 0.56
240 0.51
241 0.46
242 0.4
243 0.34
244 0.26
245 0.22
246 0.17
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.18
258 0.23
259 0.27
260 0.28
261 0.3
262 0.3
263 0.28
264 0.32
265 0.31
266 0.33
267 0.37
268 0.38
269 0.43
270 0.45
271 0.47
272 0.43
273 0.47
274 0.4
275 0.33
276 0.31
277 0.25
278 0.24
279 0.24
280 0.25
281 0.22
282 0.25
283 0.25
284 0.26
285 0.24
286 0.25
287 0.23
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.27
295 0.29
296 0.3
297 0.3
298 0.26
299 0.23
300 0.26
301 0.26
302 0.22
303 0.2
304 0.19
305 0.24
306 0.28
307 0.32
308 0.35
309 0.36
310 0.38
311 0.39
312 0.45
313 0.46
314 0.43
315 0.4
316 0.38
317 0.39
318 0.38
319 0.41
320 0.39
321 0.35
322 0.37
323 0.4
324 0.32
325 0.29
326 0.27
327 0.24
328 0.21
329 0.19
330 0.16
331 0.12
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.17
336 0.17
337 0.19
338 0.24
339 0.28
340 0.27
341 0.3
342 0.35
343 0.37
344 0.46
345 0.54
346 0.54
347 0.59
348 0.67
349 0.74
350 0.79
351 0.84
352 0.82
353 0.81
354 0.8
355 0.79
356 0.8
357 0.78
358 0.77
359 0.76
360 0.72
361 0.68
362 0.67
363 0.63
364 0.61
365 0.54
366 0.49
367 0.47