Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409YBM0

Protein Details
Accession A0A409YBM0    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
645-665EERMRAREKRQQKMAERQAKEBasic
789-817ENIAPIPPSERPRPRPRPRLAQVPHQTPHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-330ARRRAMRLFRKS
395-399RKRKK
634-665AKKAATAKRQEEERMRAREKRQQKMAERQAKE
670-700ERQQKQAEERERKKAEKEAREEARQSNKRLK
802-803PR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MTFSRSHEQDRARSYRNLQAAREKAAVKKNYDSAGTRAQLSDVFRARHGSDPHEWQLDVSEALLLGLDCVVISGTGTGKTMPFMMPLLLDDNKKTVVISPLKILQEDQAGRFARMKLPAAAVNGDSWSSQLQKGLKEGRYRGILTSPEMCLKHDPFRQVLTGSDFRDISMLVVDEAHCIPQWGGDFRTTYSEVGKLRSFFPSHIPVLATSATLTPAALHEVRSQLGIDADTSFFLNQGNDRPNIAFSTQTINSATDYEALRPLLLSNDKPRGPQDLVKSIVFVNSVAQAQHVAREIRSWLPDDLHPYVGYLHAHRTRQARRRAMRLFRKSKTKILIATEAAGMGADIPDIQQVIQFGVPSSLAVWIQRAGRAGRSTDINARAVLLVEKSMFQFRRKRKKTGGSSGDQGEDVARDPWEDDEGREGELDGEGDDGNAEETQSVVFDESIHEWCKKVDKDLRKWIVTEGCRRDVADEYFSNPPNRKPPTHICCDNCERRPADVLTAPLRPSTPHSSPSISPHCTPSKVPDENNKRKMVTTGPRTRQRELLHTAHDALLSWRVRTMLARYCPSPITSAALLPDSILKSLASARYLQSIEDIKQHTGWPFAERHGEEVLNILRRVDESFFDSRAAAAAAKKAATAKRQEEERMRAREKRQQKMAERQAKEQQESERQQKQAEERERKKAEKEAREEARQSNKRLKRTFEQPLEGCSVFNLGFQSSSSPASSSSPFSMMKAHLMPQGTPLNFQVWQLILPLIKAHKYRQAVNSTPLQVQTPLQQHQQHLSTSDSENIAPIPPSERPRPRPRPRLAQVPHQTPHLPPATSLLFPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.62
3 0.65
4 0.62
5 0.58
6 0.6
7 0.59
8 0.59
9 0.59
10 0.54
11 0.52
12 0.56
13 0.57
14 0.52
15 0.54
16 0.53
17 0.51
18 0.53
19 0.49
20 0.45
21 0.47
22 0.44
23 0.39
24 0.34
25 0.32
26 0.31
27 0.31
28 0.34
29 0.31
30 0.31
31 0.3
32 0.34
33 0.36
34 0.4
35 0.4
36 0.38
37 0.39
38 0.44
39 0.48
40 0.47
41 0.45
42 0.37
43 0.36
44 0.31
45 0.25
46 0.18
47 0.13
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.07
52 0.05
53 0.05
54 0.04
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.03
59 0.04
60 0.05
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.15
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.17
83 0.23
84 0.27
85 0.28
86 0.3
87 0.35
88 0.36
89 0.36
90 0.33
91 0.27
92 0.29
93 0.3
94 0.27
95 0.29
96 0.29
97 0.3
98 0.33
99 0.32
100 0.29
101 0.31
102 0.32
103 0.27
104 0.29
105 0.31
106 0.29
107 0.29
108 0.25
109 0.21
110 0.19
111 0.17
112 0.14
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.19
119 0.2
120 0.27
121 0.34
122 0.37
123 0.42
124 0.44
125 0.46
126 0.48
127 0.47
128 0.42
129 0.39
130 0.36
131 0.32
132 0.32
133 0.28
134 0.29
135 0.28
136 0.28
137 0.3
138 0.31
139 0.36
140 0.37
141 0.39
142 0.36
143 0.38
144 0.38
145 0.33
146 0.32
147 0.31
148 0.31
149 0.29
150 0.29
151 0.26
152 0.24
153 0.24
154 0.21
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.22
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.22
179 0.21
180 0.24
181 0.26
182 0.23
183 0.23
184 0.27
185 0.26
186 0.23
187 0.27
188 0.29
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.22
193 0.23
194 0.22
195 0.16
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.06
202 0.07
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.11
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.13
225 0.17
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.15
233 0.12
234 0.18
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.16
253 0.2
254 0.26
255 0.27
256 0.29
257 0.3
258 0.32
259 0.32
260 0.34
261 0.34
262 0.34
263 0.37
264 0.35
265 0.35
266 0.29
267 0.27
268 0.22
269 0.16
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.16
288 0.18
289 0.22
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.17
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.11
298 0.16
299 0.2
300 0.21
301 0.25
302 0.32
303 0.4
304 0.47
305 0.56
306 0.59
307 0.59
308 0.68
309 0.72
310 0.74
311 0.76
312 0.78
313 0.78
314 0.73
315 0.79
316 0.73
317 0.71
318 0.66
319 0.59
320 0.52
321 0.47
322 0.46
323 0.36
324 0.34
325 0.27
326 0.22
327 0.17
328 0.13
329 0.09
330 0.04
331 0.04
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.16
362 0.16
363 0.19
364 0.21
365 0.19
366 0.18
367 0.17
368 0.16
369 0.14
370 0.13
371 0.08
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.11
377 0.13
378 0.18
379 0.26
380 0.36
381 0.47
382 0.51
383 0.58
384 0.62
385 0.71
386 0.74
387 0.76
388 0.73
389 0.65
390 0.63
391 0.57
392 0.49
393 0.38
394 0.29
395 0.19
396 0.13
397 0.1
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.05
432 0.07
433 0.09
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.18
439 0.17
440 0.23
441 0.29
442 0.36
443 0.44
444 0.55
445 0.6
446 0.55
447 0.55
448 0.51
449 0.5
450 0.45
451 0.45
452 0.39
453 0.36
454 0.36
455 0.35
456 0.33
457 0.3
458 0.27
459 0.23
460 0.19
461 0.19
462 0.23
463 0.25
464 0.27
465 0.25
466 0.26
467 0.3
468 0.34
469 0.33
470 0.36
471 0.44
472 0.47
473 0.54
474 0.58
475 0.52
476 0.54
477 0.6
478 0.61
479 0.54
480 0.53
481 0.46
482 0.41
483 0.42
484 0.36
485 0.31
486 0.25
487 0.25
488 0.22
489 0.23
490 0.22
491 0.19
492 0.18
493 0.16
494 0.19
495 0.23
496 0.22
497 0.23
498 0.25
499 0.28
500 0.29
501 0.36
502 0.37
503 0.33
504 0.32
505 0.35
506 0.35
507 0.34
508 0.33
509 0.33
510 0.35
511 0.36
512 0.38
513 0.43
514 0.51
515 0.59
516 0.66
517 0.63
518 0.55
519 0.51
520 0.5
521 0.48
522 0.46
523 0.46
524 0.49
525 0.55
526 0.63
527 0.67
528 0.67
529 0.65
530 0.59
531 0.56
532 0.52
533 0.48
534 0.42
535 0.39
536 0.38
537 0.32
538 0.29
539 0.22
540 0.16
541 0.19
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.15
548 0.19
549 0.2
550 0.25
551 0.28
552 0.28
553 0.3
554 0.3
555 0.3
556 0.27
557 0.2
558 0.18
559 0.16
560 0.16
561 0.14
562 0.14
563 0.13
564 0.11
565 0.13
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.11
572 0.13
573 0.11
574 0.12
575 0.13
576 0.17
577 0.17
578 0.17
579 0.18
580 0.19
581 0.19
582 0.23
583 0.25
584 0.21
585 0.22
586 0.24
587 0.22
588 0.22
589 0.22
590 0.2
591 0.19
592 0.2
593 0.26
594 0.24
595 0.25
596 0.24
597 0.24
598 0.2
599 0.22
600 0.23
601 0.2
602 0.2
603 0.17
604 0.15
605 0.16
606 0.18
607 0.16
608 0.14
609 0.15
610 0.18
611 0.18
612 0.19
613 0.18
614 0.16
615 0.15
616 0.15
617 0.11
618 0.1
619 0.11
620 0.12
621 0.12
622 0.13
623 0.17
624 0.2
625 0.24
626 0.31
627 0.34
628 0.38
629 0.42
630 0.48
631 0.51
632 0.56
633 0.59
634 0.61
635 0.61
636 0.63
637 0.65
638 0.68
639 0.7
640 0.71
641 0.72
642 0.72
643 0.75
644 0.79
645 0.83
646 0.84
647 0.77
648 0.74
649 0.73
650 0.7
651 0.64
652 0.57
653 0.53
654 0.53
655 0.56
656 0.59
657 0.57
658 0.53
659 0.53
660 0.54
661 0.54
662 0.55
663 0.59
664 0.61
665 0.6
666 0.69
667 0.73
668 0.72
669 0.69
670 0.69
671 0.68
672 0.66
673 0.67
674 0.67
675 0.67
676 0.69
677 0.69
678 0.66
679 0.68
680 0.64
681 0.63
682 0.64
683 0.64
684 0.67
685 0.69
686 0.69
687 0.66
688 0.69
689 0.74
690 0.71
691 0.72
692 0.64
693 0.62
694 0.6
695 0.52
696 0.43
697 0.32
698 0.27
699 0.18
700 0.18
701 0.15
702 0.1
703 0.1
704 0.11
705 0.13
706 0.13
707 0.15
708 0.14
709 0.13
710 0.14
711 0.17
712 0.19
713 0.19
714 0.2
715 0.22
716 0.22
717 0.22
718 0.25
719 0.23
720 0.26
721 0.24
722 0.25
723 0.25
724 0.26
725 0.25
726 0.27
727 0.34
728 0.29
729 0.29
730 0.28
731 0.27
732 0.26
733 0.26
734 0.23
735 0.16
736 0.16
737 0.16
738 0.16
739 0.13
740 0.13
741 0.16
742 0.16
743 0.21
744 0.24
745 0.27
746 0.33
747 0.37
748 0.43
749 0.48
750 0.54
751 0.53
752 0.55
753 0.59
754 0.54
755 0.52
756 0.47
757 0.4
758 0.33
759 0.3
760 0.33
761 0.32
762 0.32
763 0.38
764 0.41
765 0.42
766 0.47
767 0.49
768 0.43
769 0.39
770 0.38
771 0.34
772 0.31
773 0.32
774 0.27
775 0.23
776 0.22
777 0.21
778 0.2
779 0.17
780 0.16
781 0.16
782 0.21
783 0.27
784 0.36
785 0.46
786 0.53
787 0.64
788 0.74
789 0.81
790 0.86
791 0.89
792 0.9
793 0.87
794 0.89
795 0.83
796 0.83
797 0.82
798 0.8
799 0.73
800 0.67
801 0.62
802 0.52
803 0.54
804 0.49
805 0.4
806 0.31
807 0.35
808 0.33