FuNGI

A0A409YT42

Protein Details

Accession

A0A409YT42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
110-130	APAASRQKSKSKQRGNADLFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
505-536	RPRNESKEERKARKAAVKAERQAKRAEKKTLK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1 IPR019404 Mediator_Med11
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV PF10280 Med11

Amino Acid Sequences

MPPKSKSIFRQPGARHFQLVHRSQRDPLINDPEASTHVLKPFERENAKKGKSRADLESLLSSEEIGEGRANVGEASLYGIYFDDTEYDYMKHLRPVGVQEEGVESVLIEAPAASRQKSKSKQRGNADLFDLPEGVLASTSELPRTYESQQAIPESIAGFQPDMDAHLRQVLEALEDDAFVDDDLEDNFFSELVADGERGSNEGVDFPFSEEGVDENADQYEPVEEDGEVSWEKRFSEFKKSQATRPGSEDGYSSEGGDTVGTLPAISVIGGKKRRKGTSNASGYSMSSSSMYRNEALQTLDERFDQMISKEYNEDDEEEPDTDESDDEAPELITSREDFDSMVNTFLNDFEILGRKMKPKLEGDSGVEKLDILRRAMGQDERVRVANEDEEEDEDKDLFPEEDDKKDRWDCETILSKCCDLFLSCFVDHFLKATYTNLENHPRLIRARDSKPVPKIVLDRKTGLPSVLKASDKEKTPNRVSFTSTSEDTEESEDDDRVRGHIITRPRNESKEERKARKAAVKAERQAKRAEKKTLKEQFGAEVKDQKKRLVAQQSSDMASAQEQETTASEVDPIWTTSRTARQIYALCQVDKDITRLLQLAASSISLLTLPQTDAPNDNLPQGEERSEQFVLEVSEYFERLDSIQEAIRSQLAHIRHSRIAPSAINAPPPGFIPPSLGVGLPSDGSASKRNQGLQEERVERDAWHGILAALTRIKEVRDKETEEFANAAKMEDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.55
4	0.58
5	0.58
6	0.59
7	0.59
8	0.56
9	0.56
10	0.56
11	0.62
12	0.61
13	0.55
14	0.54
15	0.53
16	0.49
17	0.48
18	0.45
19	0.38
20	0.34
21	0.34
22	0.29
23	0.23
24	0.25
25	0.28
26	0.28
27	0.31
28	0.34
29	0.39
30	0.45
31	0.46
32	0.5
33	0.57
34	0.62
35	0.65
36	0.64
37	0.65
38	0.64
39	0.65
40	0.63
41	0.59
42	0.56
43	0.52
44	0.51
45	0.42
46	0.35
47	0.29
48	0.23
49	0.16
50	0.14
51	0.11
52	0.08
53	0.08
54	0.07
55	0.08
56	0.09
57	0.09
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.09
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.11
74	0.11
75	0.13
76	0.17
77	0.18
78	0.21
79	0.22
80	0.24
81	0.25
82	0.29
83	0.31
84	0.3
85	0.29
86	0.26
87	0.25
88	0.23
89	0.2
90	0.15
91	0.11
92	0.09
93	0.1
94	0.09
95	0.06
96	0.05
97	0.06
98	0.11
99	0.13
100	0.14
101	0.18
102	0.23
103	0.33
104	0.43
105	0.53
106	0.59
107	0.68
108	0.76
109	0.79
110	0.86
111	0.81
112	0.77
113	0.7
114	0.62
115	0.52
116	0.44
117	0.35
118	0.24
119	0.19
120	0.14
121	0.1
122	0.07
123	0.06
124	0.08
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.12
129	0.13
130	0.15
131	0.19
132	0.2
133	0.23
134	0.25
135	0.26
136	0.28
137	0.29
138	0.27
139	0.23
140	0.22
141	0.16
142	0.15
143	0.13
144	0.11
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.08
149	0.1
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.14
154	0.14
155	0.13
156	0.14
157	0.12
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.05
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.07
202	0.07
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.09
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.12
221	0.17
222	0.18
223	0.28
224	0.32
225	0.37
226	0.47
227	0.49
228	0.52
229	0.57
230	0.59
231	0.51
232	0.52
233	0.49
234	0.39
235	0.37
236	0.32
237	0.24
238	0.22
239	0.2
240	0.15
241	0.12
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.04
254	0.05
255	0.06
256	0.13
257	0.21
258	0.24
259	0.3
260	0.37
261	0.42
262	0.44
263	0.5
264	0.53
265	0.56
266	0.61
267	0.56
268	0.52
269	0.48
270	0.44
271	0.38
272	0.29
273	0.19
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.09
294	0.12
295	0.12
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.16
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.11
308	0.11
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.08
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.12
342	0.15
343	0.18
344	0.2
345	0.23
346	0.24
347	0.27
348	0.29
349	0.3
350	0.3
351	0.31
352	0.3
353	0.25
354	0.22
355	0.18
356	0.15
357	0.16
358	0.14
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.17
367	0.18
368	0.19
369	0.19
370	0.19
371	0.18
372	0.18
373	0.15
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.12
380	0.11
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.06
386	0.05
387	0.11
388	0.12
389	0.17
390	0.2
391	0.21
392	0.25
393	0.27
394	0.28
395	0.25
396	0.26
397	0.21
398	0.24
399	0.33
400	0.3
401	0.31
402	0.32
403	0.29
404	0.26
405	0.26
406	0.2
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.15
411	0.15
412	0.15
413	0.16
414	0.17
415	0.16
416	0.15
417	0.12
418	0.08
419	0.09
420	0.1
421	0.11
422	0.12
423	0.14
424	0.18
425	0.23
426	0.23
427	0.25
428	0.26
429	0.25
430	0.25
431	0.26
432	0.29
433	0.3
434	0.33
435	0.38
436	0.42
437	0.47
438	0.5
439	0.51
440	0.45
441	0.41
442	0.45
443	0.46
444	0.48
445	0.43
446	0.42
447	0.4
448	0.41
449	0.38
450	0.33
451	0.25
452	0.19
453	0.21
454	0.22
455	0.2
456	0.19
457	0.22
458	0.24
459	0.26
460	0.31
461	0.34
462	0.38
463	0.43
464	0.47
465	0.49
466	0.47
467	0.49
468	0.44
469	0.42
470	0.37
471	0.32
472	0.28
473	0.25
474	0.23
475	0.2
476	0.19
477	0.15
478	0.13
479	0.13
480	0.12
481	0.11
482	0.12
483	0.11
484	0.1
485	0.11
486	0.09
487	0.1
488	0.14
489	0.22
490	0.3
491	0.35
492	0.43
493	0.46
494	0.48
495	0.52
496	0.57
497	0.58
498	0.61
499	0.66
500	0.65
501	0.68
502	0.71
503	0.71
504	0.69
505	0.65
506	0.63
507	0.63
508	0.64
509	0.64
510	0.69
511	0.68
512	0.63
513	0.64
514	0.64
515	0.64
516	0.63
517	0.66
518	0.64
519	0.65
520	0.73
521	0.75
522	0.7
523	0.63
524	0.57
525	0.53
526	0.51
527	0.48
528	0.4
529	0.39
530	0.38
531	0.43
532	0.43
533	0.39
534	0.38
535	0.38
536	0.44
537	0.46
538	0.47
539	0.43
540	0.49
541	0.5
542	0.46
543	0.43
544	0.35
545	0.24
546	0.21
547	0.19
548	0.12
549	0.1
550	0.08
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.09
556	0.09
557	0.08
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.11
563	0.12
564	0.16
565	0.23
566	0.27
567	0.28
568	0.28
569	0.31
570	0.33
571	0.35
572	0.4
573	0.37
574	0.32
575	0.3
576	0.3
577	0.29
578	0.27
579	0.26
580	0.2
581	0.16
582	0.17
583	0.18
584	0.18
585	0.15
586	0.14
587	0.13
588	0.11
589	0.1
590	0.09
591	0.08
592	0.07
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.1
599	0.12
600	0.13
601	0.16
602	0.2
603	0.24
604	0.23
605	0.25
606	0.22
607	0.22
608	0.23
609	0.23
610	0.22
611	0.19
612	0.2
613	0.23
614	0.23
615	0.21
616	0.18
617	0.18
618	0.16
619	0.15
620	0.14
621	0.12
622	0.13
623	0.13
624	0.13
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.12
629	0.11
630	0.12
631	0.14
632	0.15
633	0.15
634	0.16
635	0.17
636	0.15
637	0.15
638	0.18
639	0.18
640	0.23
641	0.28
642	0.32
643	0.35
644	0.37
645	0.39
646	0.37
647	0.39
648	0.34
649	0.31
650	0.33
651	0.31
652	0.32
653	0.31
654	0.27
655	0.24
656	0.24
657	0.24
658	0.18
659	0.17
660	0.18
661	0.18
662	0.21
663	0.21
664	0.2
665	0.17
666	0.17
667	0.18
668	0.13
669	0.12
670	0.1
671	0.1
672	0.13
673	0.18
674	0.19
675	0.24
676	0.28
677	0.32
678	0.36
679	0.43
680	0.47
681	0.48
682	0.55
683	0.54
684	0.52
685	0.51
686	0.47
687	0.39
688	0.37
689	0.35
690	0.25
691	0.21
692	0.19
693	0.17
694	0.18
695	0.18
696	0.16
697	0.15
698	0.15
699	0.16
700	0.17
701	0.19
702	0.24
703	0.28
704	0.32
705	0.37
706	0.43
707	0.44
708	0.51
709	0.5
710	0.46
711	0.44
712	0.36
713	0.34
714	0.28

A0A409YT42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer