FuNGI

A0A409VQD8

Protein Details

Accession

A0A409VQD8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-136	EAGLSKSRTSKKKKAGKQKRRTNKPSKWADKCMY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
107-129	SKSRTSKKKKAGKQKRRTNKPSK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.833, cyto 6, cyto_mito 4.833, extr 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017336 Snurportin-1
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0061015 P:snRNA import into nucleus

Amino Acid Sequences

KRAQKIDSARQLDLFADLTLGASDDEEPAIAVGVAQEDEVEDGDQDARLAPGSIAQYAAMLAEGHRSIPSSAPSISPPQRPFFTIQAQPVPRADVQPDAERPEAGLSKSRTSKKKKAGKQKRRTNKPSKWADKCMYAELLEMSADELWDQTFGVEGKDPDEFADGLPKDLETAWVAVAPVPAGKRCLAVTHTSAGVSGLVPNTTLRSRLLGKTLLARFPSILPPLTVLDCILDKRWRENGILHVLDVIRWKGQDVGDCEAGFRFWWRDTRLAELGQPTKAEFQTFHPPSSDTSSASSLHQSNAPAAPPNKSTFSYPISFIPVPYHSSTTLAALDTEIIPAAKSWRWFNVPLPTHLRLNTVGETSSTGQAPMESGMDIEVASQSAPAFAPISPPPTPYLRSVQSTSSSTIPAFVEPDGLLLYVSEASYEPGTSPLSSWIPIHSYDSAPADEEGDSPGQLATSNASQRTEGPLNLFHRYIHVFQNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.18
3	0.13
4	0.11
5	0.1
6	0.09
7	0.09
8	0.07
9	0.06
10	0.07
11	0.07
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.06
16	0.07
17	0.06
18	0.05
19	0.04
20	0.05
21	0.06
22	0.05
23	0.05
24	0.05
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.06
29	0.07
30	0.07
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.07
35	0.07
36	0.08
37	0.07
38	0.1
39	0.12
40	0.12
41	0.12
42	0.11
43	0.11
44	0.1
45	0.1
46	0.07
47	0.06
48	0.05
49	0.08
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.11
54	0.12
55	0.14
56	0.16
57	0.16
58	0.17
59	0.18
60	0.2
61	0.28
62	0.32
63	0.38
64	0.4
65	0.42
66	0.43
67	0.45
68	0.46
69	0.43
70	0.44
71	0.41
72	0.42
73	0.46
74	0.46
75	0.45
76	0.42
77	0.4
78	0.34
79	0.31
80	0.27
81	0.24
82	0.25
83	0.29
84	0.31
85	0.31
86	0.31
87	0.29
88	0.28
89	0.26
90	0.25
91	0.2
92	0.25
93	0.23
94	0.29
95	0.37
96	0.44
97	0.5
98	0.57
99	0.66
100	0.69
101	0.77
102	0.79
103	0.83
104	0.87
105	0.89
106	0.9
107	0.92
108	0.92
109	0.93
110	0.95
111	0.94
112	0.92
113	0.91
114	0.91
115	0.91
116	0.87
117	0.85
118	0.77
119	0.73
120	0.66
121	0.59
122	0.49
123	0.39
124	0.32
125	0.23
126	0.2
127	0.13
128	0.1
129	0.08
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.11
148	0.1
149	0.08
150	0.15
151	0.14
152	0.15
153	0.15
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.14
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.12
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.16
178	0.16
179	0.15
180	0.15
181	0.13
182	0.11
183	0.08
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.06
188	0.06
189	0.08
190	0.08
191	0.09
192	0.08
193	0.11
194	0.14
195	0.15
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.24
200	0.25
201	0.25
202	0.23
203	0.22
204	0.2
205	0.19
206	0.21
207	0.16
208	0.14
209	0.11
210	0.12
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.11
220	0.12
221	0.15
222	0.18
223	0.2
224	0.21
225	0.22
226	0.24
227	0.27
228	0.27
229	0.23
230	0.21
231	0.19
232	0.18
233	0.17
234	0.13
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.1
240	0.13
241	0.15
242	0.17
243	0.18
244	0.18
245	0.18
246	0.15
247	0.15
248	0.11
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.12
253	0.15
254	0.19
255	0.2
256	0.25
257	0.26
258	0.25
259	0.25
260	0.25
261	0.25
262	0.22
263	0.21
264	0.16
265	0.17
266	0.17
267	0.16
268	0.12
269	0.15
270	0.25
271	0.26
272	0.26
273	0.24
274	0.25
275	0.26
276	0.31
277	0.28
278	0.18
279	0.18
280	0.2
281	0.2
282	0.2
283	0.21
284	0.16
285	0.16
286	0.16
287	0.15
288	0.15
289	0.15
290	0.15
291	0.17
292	0.17
293	0.19
294	0.19
295	0.22
296	0.23
297	0.22
298	0.24
299	0.23
300	0.26
301	0.25
302	0.24
303	0.23
304	0.26
305	0.25
306	0.23
307	0.22
308	0.2
309	0.22
310	0.22
311	0.22
312	0.17
313	0.18
314	0.18
315	0.17
316	0.16
317	0.13
318	0.11
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.08
328	0.09
329	0.11
330	0.13
331	0.17
332	0.21
333	0.23
334	0.27
335	0.35
336	0.36
337	0.39
338	0.44
339	0.42
340	0.41
341	0.4
342	0.38
343	0.3
344	0.31
345	0.27
346	0.21
347	0.18
348	0.16
349	0.18
350	0.17
351	0.18
352	0.14
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.1
358	0.08
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.11
376	0.12
377	0.18
378	0.18
379	0.19
380	0.21
381	0.24
382	0.27
383	0.27
384	0.32
385	0.31
386	0.35
387	0.35
388	0.36
389	0.37
390	0.37
391	0.35
392	0.3
393	0.28
394	0.23
395	0.23
396	0.2
397	0.17
398	0.16
399	0.13
400	0.14
401	0.12
402	0.13
403	0.1
404	0.1
405	0.08
406	0.07
407	0.08
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.1
417	0.12
418	0.11
419	0.12
420	0.15
421	0.16
422	0.18
423	0.18
424	0.18
425	0.19
426	0.2
427	0.23
428	0.21
429	0.21
430	0.22
431	0.24
432	0.23
433	0.22
434	0.21
435	0.18
436	0.16
437	0.15
438	0.15
439	0.13
440	0.13
441	0.11
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.15
448	0.2
449	0.22
450	0.23
451	0.24
452	0.25
453	0.33
454	0.33
455	0.29
456	0.28
457	0.34
458	0.36
459	0.4
460	0.39
461	0.31
462	0.33
463	0.36
464	0.35

A0A409VQD8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer