Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409W0H2

Protein Details
Accession A0A409W0H2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-42DEYMPTRSTRRQRGKILPAKARSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
478-491AKLKLGKKNGRTRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR040684  HMUDK_hel  
Pfam View protein in Pfam  
PF18723  aGPT-Pplase1  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MPAIRTKRTGSSNTSENEDDEYMPTRSTRRQRGKILPAKARSGHTGSTGASIRRQATASDSSSLSSLSLSEDGECTHAPFTEPITVCGVELRPTVAFDTFWRFAAERKAIDDKRRAGMPPPWTEDKYLKQYFFCNTFRVLDKGCQFLIKEVIEKGPQDPVETVFRVILWNTFTKIETWELLDRELGPLTWASYDREKYRRVLSNAVNDGLTLYTGAYIKPAPHYGYPQNYMNHLVFLESLMEQNLASRLLAAQYMANVYEYLISYPSMGPFSTYQLMLSLSYTKYLNFHPNDFVVAGPGSISGLGKLFGRSMIQGRELVDDFDTEVMRYLTESQDLHFKRLGLKFSGLGPEGLPMTIADIEHTLCEVDKYCRGAHPHLKGKRTNLGRSYTPATNPPTLMPAVLPKAWSDPSRRVPRIREEKVFVDKRYVIDHLEGHEDTPDGRKYLVFWVGYSPSEATWEFESSLVEDAPALVEEYKAKLKLGKKNGRTRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.48
3 0.42
4 0.4
5 0.34
6 0.29
7 0.24
8 0.26
9 0.21
10 0.21
11 0.22
12 0.22
13 0.3
14 0.38
15 0.47
16 0.54
17 0.62
18 0.71
19 0.8
20 0.87
21 0.87
22 0.87
23 0.85
24 0.8
25 0.78
26 0.72
27 0.65
28 0.6
29 0.55
30 0.47
31 0.41
32 0.38
33 0.31
34 0.32
35 0.32
36 0.28
37 0.27
38 0.3
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.24
43 0.25
44 0.3
45 0.29
46 0.27
47 0.26
48 0.24
49 0.24
50 0.23
51 0.18
52 0.12
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.15
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.24
72 0.24
73 0.22
74 0.24
75 0.22
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.2
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.22
91 0.3
92 0.32
93 0.26
94 0.29
95 0.38
96 0.41
97 0.48
98 0.53
99 0.48
100 0.48
101 0.5
102 0.47
103 0.42
104 0.44
105 0.45
106 0.44
107 0.46
108 0.47
109 0.45
110 0.48
111 0.47
112 0.47
113 0.49
114 0.47
115 0.43
116 0.39
117 0.41
118 0.42
119 0.44
120 0.39
121 0.32
122 0.29
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.29
130 0.27
131 0.25
132 0.23
133 0.22
134 0.24
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.19
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.18
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.15
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.14
180 0.17
181 0.22
182 0.27
183 0.28
184 0.3
185 0.36
186 0.42
187 0.4
188 0.44
189 0.44
190 0.47
191 0.47
192 0.45
193 0.37
194 0.29
195 0.27
196 0.19
197 0.14
198 0.06
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.17
211 0.2
212 0.24
213 0.26
214 0.29
215 0.28
216 0.28
217 0.29
218 0.25
219 0.21
220 0.17
221 0.14
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.13
273 0.2
274 0.2
275 0.22
276 0.22
277 0.22
278 0.23
279 0.21
280 0.19
281 0.12
282 0.1
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.17
305 0.16
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.19
322 0.2
323 0.23
324 0.23
325 0.23
326 0.27
327 0.31
328 0.33
329 0.27
330 0.27
331 0.26
332 0.26
333 0.29
334 0.22
335 0.19
336 0.16
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.1
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.11
355 0.14
356 0.17
357 0.18
358 0.22
359 0.26
360 0.33
361 0.4
362 0.46
363 0.53
364 0.57
365 0.62
366 0.63
367 0.64
368 0.65
369 0.64
370 0.63
371 0.59
372 0.57
373 0.53
374 0.53
375 0.53
376 0.47
377 0.42
378 0.4
379 0.4
380 0.37
381 0.36
382 0.31
383 0.29
384 0.26
385 0.24
386 0.18
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.18
391 0.16
392 0.2
393 0.23
394 0.26
395 0.27
396 0.32
397 0.42
398 0.52
399 0.57
400 0.6
401 0.63
402 0.71
403 0.76
404 0.75
405 0.71
406 0.66
407 0.66
408 0.7
409 0.7
410 0.6
411 0.57
412 0.52
413 0.46
414 0.45
415 0.4
416 0.32
417 0.29
418 0.3
419 0.25
420 0.28
421 0.26
422 0.23
423 0.22
424 0.2
425 0.17
426 0.21
427 0.21
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.24
433 0.29
434 0.24
435 0.22
436 0.26
437 0.28
438 0.28
439 0.28
440 0.23
441 0.17
442 0.2
443 0.2
444 0.17
445 0.17
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.18
450 0.16
451 0.17
452 0.14
453 0.12
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.07
460 0.08
461 0.1
462 0.14
463 0.19
464 0.2
465 0.21
466 0.26
467 0.34
468 0.43
469 0.52
470 0.59
471 0.64