Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VTF6

Protein Details
Accession A0A409VTF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-40AAIPEAKRRKANRSRPTSNALSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-28RRK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
Amino Acid Sequences MPFVEITNEFRRLVEEQEAAIPEAKRRKANRSRPTSNALSLDSTYIAEAYNILKHINTLTGMLFSIRTAYLNIDSRHSPLSRQGNRNIDFSEDASSWANTRHLTNEERDQIDLQARVILKRCSDRVKEMEAIEKRRAELVASKTNPLARLLPARLRQDESTLSSDVIAAHHSSITWYLSRRLTEASQMQKELQEERIKRQLERTRSLASTAGQDALTMSSRNITSVSSSSNTKTPGSWLESTIAATIGIPSSPDSQKVSSYVPPESAYASEEDDEEIELSASQIMQFEAENANILKGVQDTLESVQQAEARLMDISALQMELVTHLTRQTELTDQLYEDALATTSTVEKGNEQLREAKRRAKDGRIFVLIFLIGASLSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.24
4 0.27
5 0.29
6 0.26
7 0.29
8 0.26
9 0.26
10 0.34
11 0.38
12 0.42
13 0.46
14 0.56
15 0.63
16 0.73
17 0.77
18 0.79
19 0.81
20 0.79
21 0.81
22 0.76
23 0.7
24 0.62
25 0.54
26 0.46
27 0.39
28 0.34
29 0.27
30 0.22
31 0.17
32 0.13
33 0.11
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.08
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.15
58 0.21
59 0.22
60 0.24
61 0.25
62 0.26
63 0.3
64 0.28
65 0.25
66 0.27
67 0.37
68 0.43
69 0.48
70 0.54
71 0.59
72 0.61
73 0.62
74 0.54
75 0.46
76 0.39
77 0.33
78 0.29
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.17
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.19
90 0.21
91 0.25
92 0.3
93 0.34
94 0.34
95 0.34
96 0.31
97 0.29
98 0.29
99 0.26
100 0.19
101 0.17
102 0.17
103 0.18
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.24
108 0.28
109 0.32
110 0.34
111 0.39
112 0.39
113 0.42
114 0.43
115 0.4
116 0.44
117 0.42
118 0.44
119 0.42
120 0.39
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.23
125 0.24
126 0.26
127 0.31
128 0.31
129 0.31
130 0.31
131 0.33
132 0.32
133 0.27
134 0.23
135 0.16
136 0.19
137 0.21
138 0.26
139 0.3
140 0.33
141 0.33
142 0.35
143 0.33
144 0.31
145 0.3
146 0.28
147 0.25
148 0.21
149 0.19
150 0.16
151 0.16
152 0.14
153 0.12
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.19
171 0.23
172 0.25
173 0.25
174 0.25
175 0.25
176 0.25
177 0.25
178 0.23
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.26
183 0.33
184 0.32
185 0.32
186 0.39
187 0.41
188 0.41
189 0.44
190 0.44
191 0.4
192 0.39
193 0.4
194 0.32
195 0.26
196 0.22
197 0.18
198 0.15
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.22
224 0.21
225 0.2
226 0.2
227 0.19
228 0.2
229 0.18
230 0.14
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.1
239 0.11
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.22
248 0.21
249 0.2
250 0.2
251 0.2
252 0.19
253 0.17
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.15
318 0.18
319 0.2
320 0.2
321 0.19
322 0.2
323 0.19
324 0.17
325 0.13
326 0.11
327 0.09
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.17
337 0.23
338 0.25
339 0.26
340 0.34
341 0.4
342 0.49
343 0.53
344 0.55
345 0.55
346 0.63
347 0.68
348 0.69
349 0.7
350 0.69
351 0.72
352 0.7
353 0.65
354 0.55
355 0.5
356 0.4
357 0.31
358 0.22
359 0.14
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.04
364 0.04
365 0.04